Đây là lệnh độ sâu mapMers có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình mô phỏng trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
mapMers-độ sâu - báo cáo thông tin về ánh xạ kmers theo trình tự
SYNOPSIS
bản đồMers-độ sâu {-đếm|-chiều sâu|-số liệu thống kê} -mers MERYL -m MESIZE -seq IN.FASTA
LỰA CHỌN
Chế độ of hoạt động
Đối với chuỗi thứ tự 's' và vị trí trong chuỗi đó 'p':
-đếm báo cáo số đếm (c) của một kmer bắt đầu ở vị trí (p).
Định dạng: 'spc'
-chiều sâu báo cáo số (n) km số người trải dài vị trí (p).
Định dạng: 'spn'
-số liệu thống kê báo cáo số lượng tối thiểu (m), tối đa (M) và trung bình (a) của tất cả các mers trải dài
vị trí (p). cũng báo cáo tổng số (t) và số km (n)
Định dạng: 'spm M atn'
Tổng quan
-m MESIZE
-mers MERYL
thủy tinh(1) cơ sở dữ liệu
-seq IN.FASTA
trình tự đầu vào fasta
Sử dụng trực tuyến chuyên sâu về mapMers bằng dịch vụ onworks.net
