mia-3ddistance-stats - Trực tuyến trên đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

mia-3ddistance-stats - Đánh giá thống kê khoảng cách cho hai hình ảnh được gắn nhãn.

SYNOPSIS

mia-3d distance-thống kê -i -r -o [tùy chọn]

MÔ TẢ

mia-3d distance-thống kê Chương trình này được sử dụng để đánh giá khoảng cách giữa các
các khu vực được gắn nhãn trong hai hình ảnh. Tệp đầu ra là tệp csv chứa các khoảng cách cho
mỗi tọa độ được gắn nhãn trong hình ảnh thử nghiệm ở dạng sau:

nhãn, n-mẫu, khoảng cách, khoảng cách, ...

Một chương trình R đơn giản để nhận một số thống kê trên mỗi nhãn từ dữ liệu này sẽ trông giống như

args <- commandArgs (TRUE)
data <- read.csv (args [1], header = FALSE)
for (i in 1: dim (data) [1]) {
dòng <- data [i,]
nhãn <- as.integer (dòng [1])
end_range <- 2 + as.numeric (dòng [2])
s <- as.numeric (dòng [3: end_range])
kết quả <- sprintf ("% d% 8.4f% 8.4f% 8.4f% 8.4f0
label, mean (s), sqrt (var (s)), median (s), max (s))
con mèo (kết quả)
}

LỰA CHỌN

Tệp-IO
-i --in-label = (đầu vào, bắt buộc); io
hình ảnh nhãn đầu vào Đối với các loại tệp được hỗ trợ, hãy xem PLUGINS: 3dimage / io

-r --ref-label = (đầu vào, bắt buộc); io
hình ảnh nhãn tham chiếu Để biết các loại tệp được hỗ trợ, hãy xem PLUGINS: 3dimage / io

-l --label-map = (đầu vào); dây
ánh xạ tùy chọn của số nhãn

-o --out-file = (đầu ra, bắt buộc); dây
tên tệp đầu ra để ghi khoảng cách tới. Tệp đầu ra là tệp csv,
chứa các khoảng cách được liệt kê cho mỗi nhãn.

Trợ giúp & Thông tin
-V --verbose = cảnh báo
tính chi tiết của đầu ra, in các thông báo ở cấp độ đã cho và mức độ ưu tiên cao hơn.
Các ưu tiên được hỗ trợ bắt đầu từ cấp thấp nhất là:
Thông tin - Tin nhắn cấp thấp
theo dõi - Chức năng theo dõi cuộc gọi
không - Báo cáo lỗi kiểm tra
cảnh báo - Cảnh báo
lôi - Báo cáo lỗi
gỡ lỗi - Đầu ra gỡ lỗi
tin nhắn - Tin nhắn bình thường
gây tử vong - Chỉ báo cáo các lỗi nghiêm trọng

- bản quyền
in thông tin bản quyền

-h - trợ giúp
in cái này giúp

-? --sử dụng
in một trợ giúp ngắn

--phiên bản
in số phiên bản và thoát

Đang xử lý
--threads = -1
Số luồng tối đa cần sử dụng để xử lý, Con số này phải thấp hơn
hoặc bằng số lõi xử lý logic trong máy. (-1:
ước tính tự động). Số luồng tối đa để sử dụng để xử lý, Điều này
số phải thấp hơn hoặc bằng số lõi bộ xử lý logic trong
máy. (-1: ước tính tự động).

BỔ SUNG: 3dimage / io

phân tích Phân tích hình ảnh 7.5

Các phần mở rộng tệp được công nhận: .HDR, .hdr

Các loại phần tử được hỗ trợ:
không dấu 8 bit, có dấu 16 bit, có dấu 32 bit, dấu phẩy động 32 bit,
dấu phẩy động 64 bit

kho dữ liệu IO ảo đến và đi từ nhóm dữ liệu nội bộ

Phần mở rộng tệp được công nhận:. @

đi đôi Chuỗi hình ảnh Dicom dưới dạng 3D

Các phần mở rộng tệp được công nhận: .DCM, .dcm

Các loại phần tử được hỗ trợ:
đã ký 16 bit, 16 bit chưa ký

hdf5 IO hình ảnh HDF5 3D

Các phần mở rộng tệp được công nhận: .H5, .h5

Các loại phần tử được hỗ trợ:
dữ liệu nhị phân, có dấu 8 bit, 8 bit không dấu, 16 bit có dấu, 16 bit chưa dấu,
có dấu 32 bit, không dấu 32 bit, có dấu 64 bit, không dấu 64 bit, nổi
dấu phẩy 32 bit, dấu phẩy động 64 bit

inria INRIA hình ảnh

Các phần mở rộng tệp được công nhận: .INR, .inr

Các loại phần tử được hỗ trợ:
đã ký 8 bit, chưa ký 8 bit, đã ký 16 bit, chưa ký 16 bit, đã ký 32
bit, không dấu 32 bit, dấu phẩy động 32 bit, dấu phẩy động 64 bit

mhd IO hình ảnh MetaIO 3D sử dụng triển khai VTK (thử nghiệm).

Các phần mở rộng tệp được công nhận: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Các loại phần tử được hỗ trợ:
đã ký 8 bit, chưa ký 8 bit, đã ký 16 bit, chưa ký 16 bit, đã ký 32
bit, không dấu 32 bit, dấu phẩy động 32 bit, dấu phẩy động 64 bit

nifti IO hình ảnh 1D NIFTI-3

Phần mở rộng tệp được công nhận: .NII, .nii

Các loại phần tử được hỗ trợ:
đã ký 8 bit, chưa ký 8 bit, đã ký 16 bit, chưa ký 16 bit, đã ký 32
bit, không dấu 32 bit, có dấu 64 bit, không dấu 64 bit, dấu phẩy động 32
bit, dấu phẩy động 64 bit

vff Định dạng raster VFF Sun

Các phần mở rộng tệp được công nhận: .VFF, .vff

Các loại phần tử được hỗ trợ:
không dấu 8 bit, có dấu 16 bit

vista Chế độ xem 3D

Các phần mở rộng tệp được công nhận: .V, .VISTA, .v, .vista

Các loại phần tử được hỗ trợ:
dữ liệu nhị phân, có dấu 8 bit, 8 bit không dấu, 16 bit có dấu, 16 bit chưa dấu,
có dấu 32 bit, không dấu 32 bit, dấu phẩy động 32 bit, dấu phẩy động 64
bit

vti Hình ảnh 3D VTK-XML vào và ra (thử nghiệm).

Các phần mở rộng tệp được công nhận: .VTI, .vti

Các loại phần tử được hỗ trợ:
đã ký 8 bit, chưa ký 8 bit, đã ký 16 bit, chưa ký 16 bit, đã ký 32
bit, không dấu 32 bit, dấu phẩy động 32 bit, dấu phẩy động 64 bit

vtk Di sản hình ảnh 3D VTK vào và ra (thử nghiệm).

Các phần mở rộng tệp được công nhận: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Các loại phần tử được hỗ trợ:
dữ liệu nhị phân, có dấu 8 bit, 8 bit không dấu, 16 bit có dấu, 16 bit chưa dấu,
có dấu 32 bit, không dấu 32 bit, dấu phẩy động 32 bit, dấu phẩy động 64
bit

THÍ DỤ

Đánh giá khoảng cách cho mỗi nhãn có sẵn trong hình ảnh ..v. Với các nhãn tương ứng trong
tham chiếu hình ảnh.v ans lưu trữ kết quả một danh sách các giá trị được phân tách theo kiểu hôn mê, tức là
khoảng cách.csv.

mia-3ddistance-stats -i image.v -r reference.v -o distance.csv

(Các) TÁC GIẢ

Gert Wollny

BẢN QUYỀN

Phần mềm này là Bản quyền (c) 1999‐2015 Leipzig, Đức và Madrid, Tây Ban Nha. Nó đến
với TUYỆT ĐỐI KHÔNG CÓ BẢO HÀNH và bạn có thể phân phối lại nó theo các điều khoản của GNU
GIẤY PHÉP CÔNG CỘNG CHUNG Phiên bản 3 (hoặc mới hơn). Để biết thêm thông tin, hãy chạy chương trình với
tùy chọn '--copyright'.

Sử dụng mia-3ddistance-stats trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net