Đây là cơ lệnh có thể được chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
cơ - Căn chỉnh trình tự nhiều protein
SYNOPSIS
cơ bắp -trong đầu vào hồ sơ (nhanh) [-ngoài đầu ra hồ sơ (vỡ nợ nhanh)] [-diags] [-log đăng nhập hồ sơ]
[-tối đa n] [-tối đa n] [-maxmb m] [-html] [-msf] [-clw] [-clwstrict]
[-log [a] tệp nhật ký] [-Yên lặng] [-ổn định] [-nhóm] [-phiên bản]
MÔ TẢ
Trang hướng dẫn sử dụng này tài liệu ngắn gọn về cơ bắp chỉ huy.
cơ bắp sắp xếp các trình tự protein và được coi là cao hơn và nhanh hơn Clustal W.
LỰA CHỌN
-trong đầu vào hồ sơ
Đường dẫn đến tệp đầu vào được định dạng FASTA
-ngoài đầu ra hồ sơ
Đường dẫn đến tệp đầu ra, được định dạng FASTA theo mặc định
-diags
Tìm đường chéo (nhanh hơn đối với các chuỗi tương tự)
-tối đa n
Số lần lặp tối đa (số nguyên, mặc định 16)
-tối đa n
Thời gian tối đa để lặp lại tính bằng giờ (mặc định không có giới hạn)
-maxmb m
Bộ nhớ tối đa để phân bổ tính bằng Mb (mặc định 80% RAM)
-html
Viết đầu ra ở định dạng HTML (FASTA mặc định)
-msf
Ghi đầu ra ở định dạng MSF (FASTA mặc định)
-clw
Ghi đầu ra ở định dạng Clustal W (FASTA mặc định)
-clwstrict
Dưới dạng -clw, với tiêu đề ´CLUSTAL W (1.81) ´
-log [a] tệp nhật ký
Đăng nhập vào tệp (nối nếu -loga, ghi đè nếu -log)
-Yên lặng
Không viết thông báo tiến độ cho stderr
-ổn định
Trình tự đầu ra theo thứ tự đầu vào (mặc định là -group)
-nhóm
Nhóm các chuỗi theo độ giống nhau (đây là mặc định)
-phiên bản
Thông tin phiên bản màn hình và thoát
Sử dụng cơ trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
