Đây là lệnh Oddcompe có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình mô phỏng trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
Oddcomp - Xác định các protein có thành phần từ theo trình tự được chỉ định
SYNOPSIS
kỳ quặc -sự nối tiếp tiếp theo -trong tập tin trong tập tin -fullwindow bật lên -thông tin số nguyên
-bỏ qua boolean -outfile ô uế
kỳ quặc -Cứu giúp
MÔ TẢ
kỳ quặc là một chương trình dòng lệnh từ EMBOSS (“Tổ chức Sinh học Phân tử Châu Âu Mở rộng
Bộ phần mềm"). Nó là một phần của (các) nhóm lệnh "Protein: Composition".
LỰA CHỌN
Đầu vào phần
-sự nối tiếp tiếp theo
-trong tập tin trong tập tin
Đây là một tệp ở định dạng đầu ra được tạo bởi 'compseq' được sử dụng để đặt
tần số tối thiểu của các từ trong phân tích này.
Yêu cầu phần
-fullwindow bật lên
Bật tùy chọn này lên (Y) nếu bạn muốn đặt kích thước cửa sổ theo chiều dài của
chất đạm hiện nay. Nếu không, hãy không đặt tùy chọn này, trong trường hợp đó bạn sẽ được nhắc
để sử dụng kích thước cửa sổ. Giá trị mặc định: N
-thông tin số nguyên
Đây là kích thước của cửa sổ để đếm. Vì vậy, nếu bạn muốn đếm tần số trong
đoạn 40 aa bạn nên nhập 40 vào đây. Giá trị mặc định: 30
Nâng cao phần
-bỏ qua boolean
Mã axit amin B đại diện cho Asparagine hoặc axit Aspartic và mã Z đại diện cho
Glutamine hoặc axit Glutamic. Đây không phải là những mã thường được sử dụng và bạn có thể không muốn
đếm các từ có chứa chúng, chỉ cần ghi nhận chúng trong số các từ 'Khác'. Vỡ nợ
giá trị: Y
Đầu ra phần
-outfile ô uế
Đây là tệp kết quả.
Sử dụng Oddcompe trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net
