Đây là lệnh được đề xuất có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
được lập bản đồ - tính toán tỷ lệ số lần đọc / phân đoạn được ánh xạ
SỬ DỤNG
tiến thoái lưỡng nan [tùy chọn] -i
Các đối số bắt buộc:
-i
Một tệp đầu vào chứa các kết quả ánh xạ đã đọc. Cả hai định dạng SAM hoặc BAM đều
được hỗ trợ.
Các đối số tùy chọn:
-o
Tên của tệp đầu ra bao gồm thống kê ánh xạ.
-f Nếu được chỉ định, các phân đoạn (các cặp đọc) sẽ được tính thay vì các lần đọc riêng lẻ.
Tùy chọn này chỉ áp dụng cho các lần đọc kết thúc được ghép nối.
-p Nếu được chỉ định, chỉ những lần đọc được ghép nối thích hợp mới được tính. Tùy chọn này chỉ là
áp dụng cho các lần đọc kết thúc được ghép nối.
Sử dụng trực tuyến được đề xuất bằng các dịch vụ onworks.net
