Đây là lệnh psize có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
psize - Nhận kích thước và thông tin khác từ tệp PQR
SYNOPSIS
kích cỡ [--cfact =giá trị] [--fadd =giá trị] [- không gian =giá trị] [--gememfac =giá trị]
[--gememceil =giá trị] [--ofrac =giá trị] [--redfac =giá trị] {tập tin pqr}
kích cỡ {--Cứu giúp | -h}
MÔ TẢ
kích cỡ lấy thông tin từ các tệp PQR để chuẩn bị trước các mô hình của protein và hóa chất
để tính toán tĩnh điện. Công cụ tính toán kích thước cho lưới thô và lưới mịn,
khoảng cách lưới, kích thước hộp và ước tính bộ nhớ cần thiết để thực hiện tĩnh điện
phép tính.
Việc tính toán thông tin này có thể bị ảnh hưởng bởi việc đưa ra các ràng buộc đối với kích cỡ as
thông số.
LỰA CHỌN
kích cỡ chấp nhận các tùy chọn sau:
--Cứu giúp, -h
In thông báo trợ giúp và thoát.
--cfact =giá trị
Yếu tố để mở rộng kích thước phân tử để có được kích thước lưới thô
--fadd =giá trị
Số lượng cần thêm vào kích thước phân tử để có được kích thước lưới tốt.
- không gian =giá trị
Độ phân giải lưới mịn mong muốn.
--gememfac =giá trị
Số byte trên mỗi điểm lưới cần thiết để tính toán MG tuần tự.
--gememceil =giá trị
MB tối đa được phép cho phép tính MG tuần tự. Điều chỉnh điều này để buộc tập lệnh
thực hiện các phép tính nhanh hơn (đòi hỏi nhiều tính song song hơn).
--ofrac =giá trị
Hệ số chồng chéo giữa các phân vùng lưới.
--redfac =giá trị
Hệ số tối đa mà kích thước miền có thể được giảm bớt trong quá trình lấy nét.
Sử dụng psize trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
