pynifti_pst - Trực tuyến trên đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

pynifti_pst - tính toán thời gian chờ của dữ liệu fMRI

SYNOPSIS

pynifti_pst [lựa chọn] <4dimage> <tập_id | tên tệp> [...]

MÔ TẢ

pynifti_pst tính toán thời gian diễn ra tín hiệu peristimulus cho tất cả các voxel trong một khối lượng tại
Một lần. Thời gian bắt đầu kích thích có thể được chỉ định dưới dạng số lượng hoặc thời gian (sẽ được chuyển đổi thành
số âm lượng sử dụng thời gian lặp lại được cung cấp). Bộ khởi động có thể được chỉ định trực tiếp trên
dòng lệnh, nhưng cũng có thể được đọc từ (nhiều) tệp. Tệp như vậy được giả định là danh sách
một lần khởi động trên mỗi dòng (như giá trị đầu tiên). Các dòng trống được bỏ qua. Điều này cho phép pynifti_pst
để sử dụng, ví dụ: các tệp EV tùy chỉnh của FSL. Nếu một số tệp được chỉ định, phần khởi động đọc là
được kết hợp thành một vectơ khởi phát duy nhất. pynifti_pst ghi một hình ảnh thời gian 4d làm đầu ra.
Ví dụ, hình ảnh này có thể được tải vào FSLView để xem từng nguồn thời gian tín hiệu voxels trong
điều kiện nhất định bằng cách chỉ cần nhấp vào nó.

LỰA CHỌN

--phiên bản
hiển thị số phiên bản của chương trình và thoát

-h, --Cứu giúp
hiển thị thông báo trợ giúp này và thoát

--dài dòng
in thông báo trạng thái

-n NVOL, --nvols=NVOL
Đặt độ dài của thời gian diễn ra tín hiệu peristimulus được tính toán (theo khối lượng).
Mặc định: 10

-t, - thời gian
Nếu được cung cấp, các giá trị đọc được coi là thời gian bắt đầu và sẽ được chuyển đổi thành
số lượng. Đối với mỗi lần bắt đầu, âm lượng gần thời gian nhất sẽ được chọn.
Các khối lượng được giả định là được ghi chính xác (và hoàn toàn) sau tr / 2, ví dụ: nếu
'tr' là 2 giây, tập đầu tiên được ghi vào đúng một giây. Xin vui lòng xem
--tr và --bù lại các tùy chọn để tìm hiểu cách điều chỉnh chuyển đổi.

--tr=TR
Thời gian lặp lại của hình ảnh 4d (chênh lệch thời gian của hai tập liên tiếp).
Điều này có thể được sử dụng để ghi đè cài đặt trong hình ảnh 4d. Thời gian lặp lại là
cần thiết để chuyển đổi thời gian bắt đầu thành số lượng. Nếu tùy chọn '--times' là
không đặt giá trị này không có hiệu lực. Xin lưu ý rằng thời gian lặp lại và
các thiết bị khởi động được cung cấp phải ở cùng một đơn vị. Xin lưu ý rằng nếu - thời gian được đưa ra
tr phải được chỉ định trong cùng một đơn vị với thời gian bắt đầu đọc.

--bù lại=OFFSET
Hiệu số không đổi áp dụng cho thời gian khởi động khi chuyển đổi chúng thành số lượng.
Nếu không thiết lập '- times', tùy chọn này không có hiệu lực '.

-p, --percsigchg
Chuyển đổi thời gian tính toán thành phần trăm thay đổi tín hiệu so với thời gian đầu tiên
(khởi đầu) âm lượng. Điều này có thể không có ý nghĩa khi --hoạt động được đặt thành một cái gì đó
khác với 'mean'. Xin lưu ý rằng hình dạng của các thời gian tính toán
phụ thuộc nhiều vào khối lượng trung bình đầu tiên. Nó có thể có ý nghĩa hơn nếu sử dụng
điều kiện cơ sở thực như nguồn gốc. Tuy nhiên, điều này vẫn chưa được hỗ trợ. Vỡ nợ:
Sai

--printvoxel=INOXOXEL
In thời gian dự phòng của một voxel duy nhất cho tất cả các lần khởi động một cách riêng biệt. Cái này
sẽ in một ma trận (lần khởi động x thời gian), trong đó số cột giống với
giá trị của --nvols và số hàng tương ứng với số lượng được chỉ định
khởi đầu. (ví dụ: 'z, y, x')

--hoạt động=HOẠT ĐỘNG
Chọn phép toán được thực hiện để tính toán các khoảng thời gian tối ưu.
Theo mặc định, đây là giá trị trung bình trên tất cả các kích thích ('mean'). Các khả năng khác
là độ lệch chuẩn ('std') và sai số chuẩn ('sde').

Sử dụng pynifti_pst trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net