spin - Trực tuyến trên đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

spin - công cụ phân tích và chỉnh sửa DNA (một phần của gói staden)

SYNOPSIS

quay [tùy chọn]

MÔ TẢ

Spin là một chương trình tương tác và đồ họa để phân tích và so sánh các chuỗi. Nó
chứa các chức năng để tìm kiếm các vị trí hạn chế, trình tự / mô típ đồng thuận và protein
vùng mã hóa, có thể phân tích thành phần của trình tự và dịch DNA thành protein.
Nó cũng chứa các hàm để định vị các phân đoạn giống nhau trong và giữa các
trình tự và để tìm sự liên kết toàn cục và cục bộ giữa các cặp trình tự. Giúp đỡ
đánh giá ý nghĩa thống kê của các so sánh mà chương trình có thể tính toán các bảng của
tần số điểm dự kiến ​​và quan sát cho mỗi mức điểm. Hầu hết các chức năng phân tích
hoạt động trên các chuỗi đơn lẻ sẽ thêm các kết quả đồ họa của chúng vào "Lô trình tự SPIN"
được liên kết với trình tự đang được phân tích. (Một ngoại lệ là hạn chế
tìm kiếm enzyme tạo ra cửa sổ riêng biệt của riêng nó.) Hầu hết các chức năng so sánh các cặp
trình tự thêm kết quả của chúng vào "Lô so sánh trình tự SPIN". Trình tự SPIN
Mỗi lô và Ô so sánh trình tự SPIN đều có các cửa sổ hiển thị trình tự được liên kết:
Hiển thị Trình tự và Hiển thị So sánh Trình tự. Những điều này cho phép văn bản của
trình tự được xem và sử dụng con trỏ để hiển thị các vị trí tương ứng trong
màn hình đồ họa. Các ô đồ họa có thể được thu phóng và con trỏ hoặc dấu chéo có thể được
được sử dụng để xác định vị trí của các kết quả riêng lẻ. Các lô có thể được xếp chồng lên nhau.

LỰA CHỌN

-bản đồ định dạng: Bản đồ màu cho cửa sổ chính

-trưng bày:
Hiển thị để sử dụng

-hình học: Hình dạng ban đầu cho cửa sổ

-Tên:
Tên để sử dụng cho ứng dụng

-đồng bộ hóa: Sử dụng chế độ đồng bộ cho máy chủ hiển thị

-trực quan:
Trực quan cho cửa sổ chính

-sử dụng: Id của cửa sổ để nhúng ứng dụng

--: Chuyển tất cả các đối số còn lại đến script

Sử dụng spin trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net