Đây là lệnh song song có thể được chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
tandem - Phần mềm khối phổ X! Tandem để giải trình tự peptit
SYNOPSIS
song song
MÔ TẢ
Trang hướng dẫn sử dụng này tài liệu ngắn gọn về song song gói mang lại một khối lượng
phần mềm phần mềm đo phổ để xác định trình tự peptit và xác định protein.
Phần mềm này có giao diện lập trình ứng dụng (API) rất đơn giản, không phức tạp:
nó chỉ cần lấy một tệp XML hướng dẫn trên dòng lệnh của nó và xuất ra kết quả
vào tệp XML, tệp này đã được chỉ định trong tệp XML đầu vào. Định dạng tệp đầu ra
được mô tả tại `http://www.thegpm.org/docs/X_series_output_form.pdf'.
Không giống như một số công cụ tìm kiếm thế hệ trước, tất cả X! Công cụ tìm kiếm hàng loạt
tính toán độ tin cậy thống kê (giá trị kỳ vọng) cho tất cả các phổ riêng lẻ-
các bài tập theo trình tự. Họ cũng tập hợp lại tất cả các chỉ định peptit trong một tập dữ liệu
vào các trình tự protein đã biết và chỉ định độ tin cậy thống kê rằng tập hợp này
và sự liên kết là không ngẫu nhiên. Công thức cho nó có thể được tìm thấy ở đây. Do đó, tách
phần mềm phân tích thống kê và lắp ráp, ví dụ như PeptideProphet và ProteinProphet, không
cần được sử dụng.
THƯ MỤC THAM KHẢO ĐẾN BE TRÍCH DẪN
Robertson Craig và Ronald C. Beavis. (2004) TANDEM: kết hợp các protein với khối phổ.
Tin sinh học, 20, 1466-1467.
Xem thêm tài liệu tham khảo liên quan đến phần mềm này tại
`http://www.thegpm.org/GPM/references.html'.
Sử dụng song song trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
