Đây là lệnh TMscore có thể được chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
Điểm TM - một thuật toán để tính toán sự giống nhau về cấu trúc liên kết của hai protein
cấu trúc
PHIÊN BẢN
Tài liệu này đề cập đến phiên bản TM-score được phát hành vào ngày 2011/01/30
SYNOPSIS
1. Chạy TM-score để so sánh 'model' và 'native':
Mô hình TMscore gốc
2. Chạy điểm số TM với d0 được chỉ định, ví dụ như 5 Angstrom:
Mô hình TMscore gốc -d 5
3. Chạy điểm số TM với đầu ra chồng chất, ví dụ 'TM.sup' và xem trong Rasmol:
Mô hình TMscore gốc -o TM.sup
rasmol -script TM.sup
MÔ TẢ
Chương trình này là để so sánh hai cấu trúc protein và xác định vị trí chồng chất tốt nhất
có điểm TM cao nhất. Cấu trúc đầu vào phải ở định dạng PDB. Theo mặc định, điểm TM
được bình thường hóa bởi protein thứ hai. Người dùng có thể nhận được một hướng dẫn ngắn gọn bằng cách đơn giản
chạy chương trình mà không có đối số.
LỰA CHỌN
-o filename.sup Kết xuất chồng chất vào tệp được chỉ định,
thích hợp để sử dụng trong rasmol.
-d giá trị Đặt d0 thành số angstrom được chỉ định.
Sử dụng TMscore trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
