wb_command - Trực tuyến trên đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

wb_command - chương trình dòng lệnh để thực hiện nhiều tác vụ thuật toán khác nhau bằng cách sử dụng
khối lượng, bề mặt và dữ liệu màu xám

SYNOPSIS

MÔ TẢ

-add-to-spec-file THÊM MỘT TẬP TIN VÀO MỘT TẬP TIN ĐẶC ĐIỂM KỸ THUẬT

wb_command -add-to-spec-file

- tệp thông số kỹ thuật để thêm vào - cấu trúc của
tập tin dữ liệu - đường dẫn đến tệp

Tệp thông số kỹ thuật kết quả sẽ ghi đè tệp thông số kỹ thuật hiện có.
Nếu thông số kỹ thuật

tệp không tồn tại, nó được tạo bằng siêu dữ liệu mặc định.
Cấu trúc

đối số phải là một trong những điều sau:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID KHÁC OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-backend-trung-binh-duong-roi KẾT NỐI MỘT SỐ LỆNH DỰ PHÒNG CỦA DB CHO ROI CỦA CIFTI AVERAGE DENSE

wb_command -backend-trung-binh-duong-roi

- danh sách các chỉ số cifti được phân tách bằng dấu phẩy thành trung bình - tập tin
để viết hàng trung bình vào

Lệnh này có thể không phải là lệnh bạn đang tìm kiếm, hãy thử
-cifti-trung-binh-duong-roi. Danh sách các tệp cifti có giá trị trung bình từ
đầu vào tiêu chuẩn và ghi đầu ra của nó dưới dạng số cuối nhỏ, số nguyên 32-bit của kích thước hàng
tiếp theo là hàng khi 32-bit nổi.

-backend-trung bình-roi-tương quan KẾT NỐI MỘT SỐ LỆNH DỰ PHÒNG DB CHO ROI HÀNG KHÔNG CIFTI
THAM NHŨNG

wb_command -backend-trung bình-roi-tương quan

- danh sách các chỉ số cifti được phân tách bằng dấu phẩy thành trung bình và sau đó

tương quan

- tệp để ghi hàng trung bình vào

Lệnh này có thể không phải là lệnh bạn đang tìm kiếm, hãy thử
-cifti-trung bình-roi-tương quan. Danh sách các tệp cifti có giá trị trung bình từ
đầu vào tiêu chuẩn và ghi đầu ra của nó dưới dạng số cuối nhỏ, số nguyên 32-bit của kích thước hàng
tiếp theo là hàng khi 32-bit nổi.

-viền-xuất-bảng-màu VIẾT TÊN VÀ MÀU SẮC BIÊN GIỚI NHƯ VĂN BẢN

wb_command -viền-xuất-bảng-màu

- tệp đường viền đầu vào - đầu ra - tệp văn bản đầu ra

[-class-Colors] - sử dụng các màu của lớp thay vì các màu tên

Lấy tên và màu sắc của từng đường viền và viết nó ở định dạng giống như
-metric-nhãn-nhập mong đợi. Theo mặc định, các đường viền được tô màu theo tên đường viền,
chỉ định -class-màu sắc thay vào đó tô màu chúng theo lớp. Các giá trị chính bắt đầu từ 1
và tuân theo thứ tự của các đường viền trong tệp.

-viền-tệp-xuất-to-caret5 XUẤT FILE BIÊN GIỚI VÀO ĐỊNH DẠNG FILE CARET5

wb_command -viền-tệp-xuất-to-caret5

- tệp biên giới bàn làm việc - tiền tố cho tên của
dấu mũ đầu ra 5

tệp border / borderproj / bordercolor

[-surface] - có thể lặp lại - chỉ định một bề mặt đầu vào

- một tệp bề mặt để không chiếu các đường viền

Tệp đường viền Workbench có thể chứa đường viền cho nhiều cấu trúc và đường viền
cả dự án và không dự kiến. Nó cũng chứa một bảng màu cho
Biên giới.

Caret5 có cả tệp đường viền (chưa dự án) và hình chiếu đường viền (đã chiếu). Trong
ngoài ra, mỗi tệp hình chiếu đường viền hoặc đường viền Caret5 thường chứa dữ liệu cho
một cấu trúc duy nhất. Caret5 cũng sử dụng tệp màu đường viền liên kết các màu
với tên của các đường biên giới.

Lệnh này sẽ cố gắng xuất ra cả tệp hình chiếu đường viền và đường viền Caret5.
Mỗi tệp chiếu đường viền / đường viền đầu ra sẽ chứa dữ liệu cho một cấu trúc
có thể có nhiều tệp được tạo. Tên cấu trúc được bao gồm trong tên của
mỗi đường viền hoặc tệp chiếu đường viền được tạo.

Tệp màu đường viền One Caret5 cũng sẽ được tạo ra bằng lệnh này.

Việc cung cấp (các) bề mặt làm thông số đầu vào là tùy chọn, nhưng được khuyến nghị. Bề mặt
có thể cần thiết để tạo cả tọa độ được chiếu và / hoặc không được chiếu của đường viền.
Nếu không tạo được đường viền đầu ra hoặc phép chiếu đường viền do lỗi
bề mặt bị thiếu với cấu trúc phù hợp, một thông báo lỗi sẽ được hiển thị và
một số tệp đầu ra sẽ không được tạo.

Khi ghi tệp mới, lệnh này sẽ ghi đè lên tệp có cùng tên.

-kết hợp đường viền LỌC BIÊN GIỚI MERGE VÀO TẬP TIN MỚI

wb_command -kết hợp đường viền

- đầu ra - tệp đường viền đầu ra

[-border] - có thể lặp lại - chỉ định tệp đường viền đầu vào

- một tệp đường viền để sử dụng đường viền từ

[-select] - có thể lặp lại - chọn một đường viền duy nhất để sử dụng

- số hoặc tên biên giới

[-up-to] - sử dụng phạm vi đường viền bao gồm

- số hoặc tên của cột cuối cùng cần bao gồm

[-reverse] - sử dụng phạm vi theo thứ tự ngược lại

Lấy một hoặc nhiều tệp đường viền và tạo một tệp đường viền mới từ các đường viền trong
Chúng.

Ví dụ: wb_command -kết hợp đường viền ngoài.biên giới -biên giới đầu tiên.biên giới -lựa chọn 1 -biên giới
giây.biên giới

Ví dụ này sẽ lấy đường viền đầu tiên từ first.border, tiếp theo là tất cả các đường viền
từ second.border, và viết những thứ này vào out.border.

-biên giới-mẫu lại VÍ DỤ MỘT TẬP TIN BIÊN GIỚI CHO MỘT LƯỚI KHÁC

wb_command -biên giới-mẫu lại

- tệp biên giới để lấy mẫu lại - một mặt cầu với
lưới mà chỉ số đó là

hiện tại

- một mặt cầu đăng ký với

và có lưới đầu ra mong muốn

- đầu ra - tệp đường viền đầu ra

Ví dụ về tệp đường viền, cho trước hai bề mặt hình cầu có trong thanh ghi. Chỉ một
các đường viền có cùng cấu trúc với hình cầu hiện tại sẽ được lấy mẫu lại.

-biên giới đến rois KIẾM ROIS METRIC TỪ BIÊN GIỚI

wb_command -biên giới đến rois

- bề mặt mà các đường viền được vẽ trên - tệp biên giới
- đầu ra - tệp số liệu đầu ra

[-border] - chỉ tạo ROI cho một đường viền

- tên của biên giới

[-inverse] - sử dụng lựa chọn nghịch đảo (đường viền bên ngoài)

Theo mặc định, vẽ ROI bên trong tất cả các đường viền trong tệp đường viền, dưới dạng số liệu riêng biệt
cột.

-đường viền đến đỉnh VẼ BIÊN GIỚI LÀM CHỨNG NHẬN TRONG TẬP TIN METRIC

wb_command -đường viền đến đỉnh

- bề mặt mà các đường viền được vẽ trên - tệp biên giới
- đầu ra - tệp số liệu đầu ra

[-border] - chỉ tạo ROI cho một đường viền

- tên của biên giới

Kết quả một số liệu với 1 trên đỉnh theo đường viền và 0 ở những nơi khác. Qua
mặc định, một cột số liệu riêng biệt được tạo cho mỗi đường viền.

-cifti-all-label-to-rois Tạo ROIS TỪ TẤT CẢ CÁC NHÃN TRONG BẢN ĐỒ NHÃN CIFTI

wb_command -cifti-all-label-to-rois

- tệp nhãn cifti đầu vào - số hoặc tên của bản đồ nhãn
sử dụng - đầu ra - tệp cifti đầu ra

Tệp cifti đầu ra có một cột cho mỗi nhãn trong bản đồ đầu vào được chỉ định, khác
hơn cái ??? nhãn, mỗi nhãn trong số đó chứa ROI của tất cả các brainordinate
đặt thành nhãn tương ứng.

-cifti-trung bình TỆP CIFTI TRUNG BÌNH

wb_command -cifti-trung bình

- đầu ra - xuất tệp cifti

[-exclude-outceptions] - loại trừ các ngoại lệ theo độ lệch chuẩn của từng

phần tử trên các tệp - số độ lệch chuẩn dưới mức trung bình
đến

bao gồm

- số độ lệch chuẩn trên mức trung bình để

bao gồm

[-cifti] - có thể lặp lại - chỉ định tệp đầu vào

- tệp cifti đầu vào

[-weight] - đưa ra trọng lượng cho tệp này

- trọng lượng sử dụng

Tính trung bình các tệp cifti với nhau.
Các tệp không có -cân nặng được chỉ định được đưa ra

trọng lượng là 1.
If -exclude-outvers được chỉ định, tại mỗi phần tử,

dữ liệu trên tất cả các tệp được coi là một tập hợp, giá trị trung bình không trọng số và tiêu chuẩn mẫu của nó
độ lệch được tìm thấy và các giá trị nằm ngoài số độ lệch chuẩn được chỉ định
được loại trừ khỏi giá trị trung bình (có thể có trọng số) tại phần tử đó.

-cifti-trung-binh-duong-roi AVERAGE CIFTI ROWS ACROSS ĐỐI TƯỢNG THEO ROI

wb_command -cifti-trung-binh-duong-roi

- đầu ra - xuất tệp cifti dscalar

[-cifti-roi] - tệp cifti chứa các trọng số kết hợp

- tệp roi cifti

[-in-memory] - cache the roi trong bộ nhớ để nó không bị đọc lại cho

mỗi cifti đầu vào

[-left-roi] - trọng số để sử dụng cho khối cầu bên trái

- dấu roi bên trái dưới dạng tệp số liệu

[-right-roi] - trọng số để sử dụng cho hempsphere bên phải

- the right roi as a metric file

[-cerebellum-roi] - trọng lượng để sử dụng cho bề mặt tiểu não

- roi cerebellum dưới dạng tệp số liệu

[-vol-roi] - trọng số voxel để sử dụng

- tập tin số lượng roi

[-left-area-Browse] - chỉ định bề mặt bên trái để chỉnh sửa khu vực đỉnh

- tệp bề mặt bên trái

[-phải-vùng-lướt] - chỉ định bề mặt phù hợp để sửa vùng đỉnh

- tệp bề mặt bên phải

[-cerebellum-area-Browse] - chỉ định bề mặt tiểu não cho khu vực đỉnh

điều chỉnh - tệp bề mặt tiểu não

[-cifti] - có thể lặp lại - chỉ định tệp cifti đầu vào

- một tệp cifti để trung bình trên

Tính trung bình các hàng cho mỗi bản đồ của (các) ROI, trên tất cả các tệp.
Bản đồ ROI là

được coi là các hàm trọng số, bao gồm các giá trị âm.
Trong

hiệu quả, đảm bảo rằng mọi thứ không nhằm mục đích sử dụng đều bằng không trong
Bản đồ ROI. Nếu như -cifti-roi được quy định, -trái-roi, -phải-roi, -tiểu não-roivà
-vol-roi không được chỉ định. Nếu nhiều tệp ROI không phải cifti được chỉ định,
chúng phải có cùng số cột.

-cifti-trung bình-roi-tương quan TÍCH HỢP ROI TRUNG BÌNH VỚI TẤT CẢ CÁC ROW SAU ĐÓ TRÁNH TAI TRUNG THU
ĐỐI TƯỢNG

wb_command -cifti-trung bình-roi-tương quan

- đầu ra - xuất tệp cifti

[-cifti-roi] - tệp cifti chứa các trọng số kết hợp

- tệp roi cifti

[-in-memory] - cache the roi trong bộ nhớ để nó không bị đọc lại cho

mỗi cifti đầu vào

[-left-roi] - trọng số để sử dụng cho khối cầu bên trái

- dấu roi bên trái dưới dạng tệp số liệu

[-right-roi] - trọng số để sử dụng cho hempsphere bên phải

- the right roi as a metric file

[-cerebellum-roi] - trọng lượng để sử dụng cho bề mặt tiểu não

- roi cerebellum dưới dạng tệp số liệu

[-vol-roi] - trọng số voxel để sử dụng

- tập tin số lượng roi

[-left-area-Browse] - chỉ định bề mặt bên trái để chỉnh sửa khu vực đỉnh

- tệp bề mặt bên trái

[-phải-vùng-lướt] - chỉ định bề mặt phù hợp để sửa vùng đỉnh

- tệp bề mặt bên phải

[-cerebellum-area-Browse] - chỉ định bề mặt tiểu não cho khu vực đỉnh

điều chỉnh - tệp bề mặt tiểu não

[-cifti] - có thể lặp lại - chỉ định tệp cifti đầu vào

- một tệp cifti để trung bình trên

Tính trung bình các hàng cho mỗi bản đồ của (các) ROI, lấy mối tương quan của mỗi ROI trung bình
đến phần còn lại của các hàng trong cùng một tệp, sau đó tính trung bình kết quả trên tất cả
các tập tin. ROI luôn được coi là hàm trọng số, bao gồm các giá trị âm.
Để đạt hiệu quả, hãy đảm bảo rằng mọi thứ không được sử dụng đều bằng không
bản đồ ROI. Nếu như -cifti-roi được quy định, -trái-roi, -phải-roi, -tiểu não-roi,
và -vol-roi không được chỉ định. Nếu nhiều tệp ROI không phải cifti được chỉ định,
chúng phải có cùng số cột.

-cifti-thay-đổi-dấu thời gian THAY ĐỔI THỜI GIAN CỦA MỘT TẬP TIN CIFTI

wb_command -cifti-thay-đổi-dấu thời gian

- tệp cifti để sửa đổi

[-row-timestep] - đặt timetep dọc theo các hàng

- giây mỗi bước thời gian

[-column-timestep] - đặt timetep dọc theo các cột

- giây mỗi bước thời gian

Cảnh báo nếu thứ nguyên được chỉ định không phải là mốc thời gian, nếu không sẽ sửa đổi bước thời gian,
và cuối cùng ghi kết quả vào cùng một tên tệp nếu bất kỳ kích thước nào đã được sửa đổi.
LƯU Ý: bạn có thể muốn -row-dấu thời gian, vì điều đó khớp với .dtseries.nii
sự chỉ rõ. Tùy chọn khác có sẵn chỉ để hoàn thiện.

-cifti-chuyển đổi DUMP CIFTI MATRIX VÀO CÁC ĐỊNH DẠNG KHÁC

wb_command -cifti-chuyển đổi

[-to-gifti-ext] - chuyển đổi sang tệp nhị phân bên ngoài GIFTI

- tệp cifti đầu vào - đầu ra - tệp gifti đầu ra

[-from-gifti-ext] - chuyển đổi GIFTI được tạo bằng lệnh này trở lại thành

CIFTI - tệp gifti đầu vào - đầu ra - đầu ra cifti
hồ sơ

[-đặt lại-điểm thời gian] - đặt lại ánh xạ dọc theo các hàng thành điểm thời gian,

lấy độ dài từ tệp gifti - thời gian mong muốn giữa các khung hình
- khoảng thời gian mong muốn của khung hình ban đầu

[-unit] - sử dụng một đơn vị khác với thời gian

- mã định danh đơn vị (SECOND mặc định)

[-reset-scalars] - đặt lại ánh xạ dọc theo các hàng thành vô hướng, lấy độ dài

từ tệp gifti

[-replace-binary] - thay thế dữ liệu bằng một tệp nhị phân

- tệp nhị phân chứa dữ liệu thay thế

[-flip-endian] - hoán đổi byte tệp nhị phân

[-transpose] - chuyển đổi tệp nhị phân

[-to-nifti] - chuyển đổi sang NIFTI1

- tệp cifti đầu vào - đầu ra - tệp nifti đầu ra

[-from-nifti] - chuyển đổi tệp NIFTI (1 hoặc 2) được thực hiện bằng lệnh này trở lại

thành CIFTI - tệp nifti đầu vào - một tệp cifti với
(các) thứ nguyên và (các) ánh xạ

cái đó nên được sử dụng

- đầu ra - tệp cifti đầu ra

[-đặt lại-điểm thời gian] - đặt lại ánh xạ dọc theo các hàng thành điểm thời gian,

lấy độ dài từ tệp nifti - thời gian mong muốn giữa các khung hình
- khoảng thời gian mong muốn của khung hình ban đầu

[-unit] - sử dụng một đơn vị khác với thời gian

- mã định danh đơn vị (SECOND mặc định)

[-reset-scalars] - đặt lại ánh xạ dọc theo các hàng thành vô hướng, lấy độ dài

từ tệp nifti

[-to-text] - chuyển đổi thành tệp văn bản thuần túy

- tệp cifti đầu vào - đầu ra - tệp văn bản đầu ra

[-col-delim] - chọn chuỗi để đặt giữa các phần tử trong một hàng

- chuỗi để sử dụng (mặc định là một ký tự tab)

[-from-text] - chuyển đổi từ văn bản thuần túy sang cifti

- tệp văn bản đầu vào - một tệp cifti với
(các) thứ nguyên và (các) ánh xạ

cái đó nên được sử dụng

- đầu ra - tệp cifti đầu ra

[-col-delim] - chỉ định chuỗi nằm giữa các phần tử trong một hàng

- chuỗi để sử dụng (mặc định là bất kỳ khoảng trắng nào)

[-đặt lại-điểm thời gian] - đặt lại ánh xạ dọc theo các hàng thành điểm thời gian,

lấy độ dài từ tệp văn bản - thời gian mong muốn giữa các khung hình
- khoảng thời gian mong muốn của khung hình ban đầu

[-unit] - sử dụng một đơn vị khác với thời gian

- mã định danh đơn vị (SECOND mặc định)

[-reset-scalars] - đặt lại ánh xạ dọc theo các hàng thành vô hướng, lấy độ dài

từ tệp văn bản

Lệnh này được sử dụng để chuyển đổi ma trận CIFTI đầy đủ sang / từ các định dạng có thể
được sử dụng bởi các chương trình không hiểu CIFTI. Nếu bạn muốn viết một hiện tại
Tệp CIFTI với một phiên bản CIFTI khác, hãy xem -tệp-chuyển đổi, Và nó
-cifti-phiên bản-chuyển đổi Lựa chọn. Nếu bạn muốn một phần của tệp CIFTI làm số liệu,
nhãn hoặc tập tin khối lượng, xem -cifti-riêng biệt. Nếu bạn muốn tạo tệp CIFTI
từ các tệp số liệu và / hoặc khối lượng, hãy xem -cifti-tạo-* các lệnh. Bạn phải
chỉ định chính xác một trong số -to-quà tặng-ext, -từ-gifti-ext, -to-nifti, -từ-nifti,
-để kiểm tra, hoặc là -từ-văn bản. Các -mục đích tùy chọn để -từ-gifti-ext là cần thiết nếu
tệp nhị phân thay thế theo thứ tự cột-chính. Các -đơn vị các tùy chọn chấp nhận những
các giá trị:

THỨ HAI HERTZ METER RADIAN

-cifti-convert-to-vô hướng THAY ĐỔI KÍCH THƯỚC CIFTI SANG BẢN ĐỒ SCALAR ĐÃ ĐẶT Tên

wb_command -cifti-convert-to-vô hướng

- đầu vào tệp cifti - ánh xạ nào cần thay đổi thành bản đồ vô hướng,
ROW hoặc COLUMN - đầu ra - xuất tệp cifti

[-name-file] - chỉ định tên cho các bản đồ

- tệp văn bản chứa tên bản đồ, một tên trên mỗi dòng

Tạo một tệp cifti mới có cùng dữ liệu với dữ liệu đầu vào, nhưng với một trong các
thứ nguyên được đặt để chứa các chuỗi xác định từng bản đồ. Chỉ định ROW sẽ
chuyển đổi tệp dtseries thành tệp dscalar.

-cifti-sao chép-ánh xạ THAY THẾ BẢN ĐỒ TRÊN TẬP TIN CIFTI

wb_command -cifti-sao chép-ánh xạ

- tệp cifti để sử dụng dữ liệu từ - hướng nào
trên để thay thế ánh xạ - một tệp cifti chứa
ánh xạ mong muốn - hướng nào trên sử dụng
lập bản đồ

từ

- đầu ra - tệp cifti đầu ra

phải có cùng chiều dài dọc theo hướng thay thế như
có dọc theo hướng tiêu bản. Mỗi đối số hướng phải là
ROW hoặc COLUMN.

-cifti-tương quan TẠO TỔNG HỢP TỔNG HỢP ROWS TRONG TẬP TIN CIFTI

wb_command -cifti-tương quan

- đầu vào tệp cifti - đầu ra - xuất tệp cifti

[-roi-override] - thực hiện tương quan từ một tập hợp con các hàng đến tất cả các hàng

[-left-roi] - sử dụng roi cho hempsphere bên trái

- dấu roi bên trái dưới dạng tệp số liệu

[-right-roi] - sử dụng roi cho ngay hempsphere

- the right roi as a metric file

[-cerebellum-roi] - sử dụng roi cho tiểu não

- roi cerebellum dưới dạng tệp số liệu

[-vol-roi] - sử dụng dấu roi cho âm lượng

- tập tin roi volume

[-cifti-roi] - sử dụng tệp cifti cho rois kết hợp

- tệp cifti roi

[-weights] - chỉ định trọng số cột

- tệp văn bản chứa một trọng số cho mỗi cột

[-fisher-z] - áp dụng biến đổi fish z nhỏ (tức là artanh) cho tương quan

[-no-demean] - thay vì tương quan, hãy chấm tích số của các hàng, sau đó

chuẩn hóa theo đường chéo

[-covariance] - tính hiệp phương sai thay vì tương quan

[-mem-limit] - hạn chế sử dụng bộ nhớ

- giới hạn bộ nhớ tính bằng gigabyte

Đối với mỗi hàng (hoặc mỗi hàng bên trong một roi nếu -roi-ghi đè được chỉ định), tương quan
cho tất cả các hàng khác. Các -cifti-roi phụ đề cho -roi-ghi đè có thể không được chỉ định
với bất kỳ phụ đề con - * - roi nào khác, nhưng bạn có thể chỉ định các phụ đề con - * - roi khác
với nhau.

Khi sử dụng -ngư dân-z tùy chọn, đầu ra KHÔNG phải là điểm Z, nó là artanh (r), để
thực hiện thêm phép toán trên kết quả đầu ra này, hãy xem xét sử dụng -cifti-toán.

Việc hạn chế sử dụng bộ nhớ sẽ làm cho nó tính toán đầu ra theo khối, và nếu
kích thước tệp đầu vào lớn hơn 70% giới hạn bộ nhớ, nó cũng sẽ đọc qua
tệp đầu vào như các hàng được yêu cầu, dẫn đến một số lần chuyển qua đầu vào
tệp (một lần cho mỗi đoạn). Giới hạn bộ nhớ không cần phải là số nguyên, bạn cũng có thể
chỉ định 0 để tính toán một hàng đầu ra duy nhất tại một thời điểm (điều này có thể rất chậm).

-cifti-tương quan-gradient LẮP RÁP CIFTI ROWS VÀ TỐT NGHIỆP

wb_command -cifti-tương quan-gradient

- cifti đầu vào - đầu ra - đầu ra cifti

[-left-surface] - chỉ định bề mặt bên trái để sử dụng

- tệp bề mặt bên trái

[-left-Correct-area] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán

chúng từ bề mặt bên trái - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-right-surface] - chỉ định bề mặt phù hợp để sử dụng

- tệp bề mặt bên phải

[-phải-khu vực sửa chữa] - khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán

chúng từ bề mặt bên phải - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-cerebellum-surface] - chỉ định bề mặt tiểu não để sử dụng

- tệp bề mặt tiểu não

[-cerebellum-Corre-Points] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì

tính toán chúng từ bề mặt tiểu não - đỉnh đã sửa
khu vực, như một số liệu

[-surface-presmooth] - làm mịn bề mặt trước khi tính toán

dốc - sigma để làm mịn bề mặt gaussian

nhân, tính bằng mm

[-volume-presmooth] - làm mịn âm lượng trước khi tính toán độ dốc

- sigma cho hạt nhân làm mịn khối lượng gaussian,

tính bằng mm

[-undo-fish-z] - áp dụng biến đổi z nhỏ ngư dân nghịch đảo cho

đầu vào

[-fisher-z] - áp dụng biến đổi fish z nhỏ cho các mối tương quan

trước khi lấy gradient

[-surface -lude] - loại trừ các đỉnh gần mỗi đỉnh hạt giống khỏi

tính toán - khoảng cách trắc địa từ đỉnh hạt để loại trừ

khu vực, tính bằng mm

[-volume -lude] - loại trừ các voxel gần mỗi voxel hạt giống khỏi tính toán

- khoảng cách từ hạt giống voxel cho vùng loại trừ, tính bằng mm

[-covariance] - tính hiệp phương sai thay vì tương quan

[-mem-limit] - hạn chế sử dụng bộ nhớ

- giới hạn bộ nhớ tính bằng gigabyte

Đối với mỗi cấu trúc, hãy tính toán mối tương quan của các hàng trong cấu trúc và lấy
gradient của các hàng kết quả, sau đó tính trung bình của chúng. Giới hạn bộ nhớ không cần
là một số nguyên, bạn cũng có thể chỉ định 0 để sử dụng ít bộ nhớ nhất có thể (điều này
có thể rất chậm).

-cifti-tạo-dày đặc-từ-mẫu TẠO CIFTI VỚI BẢN ĐỒ DENSE TRẬN ĐẤU

wb_command -cifti-tạo-dày đặc-từ-mẫu

- tệp để khớp với brainordinates của - đầu ra - cái
xuất tệp cifti

[-series] - tạo tệp dtseries thay vì dscalar

- tăng giữa các điểm loạt - giá trị bắt đầu của chuỗi

[-unit] - chọn đơn vị cho chuỗi (mặc định SECOND)

- mã định danh đơn vị

[-volume-all] - chỉ định một tệp khối lượng đầu vào cho tất cả dữ liệu voxel

- tập tin khối lượng đầu vào

[-from-crop] - đầu vào được cắt theo kích thước của dữ liệu voxel

trong tệp mẫu

[-cifti] - có thể lặp lại - sử dụng dữ liệu đầu vào từ tệp cifti

- tệp cifti chứa dữ liệu đầu vào

[-metric] - có thể lặp lại - sử dụng dữ liệu đầu vào từ tệp số liệu

- cấu trúc nào để đặt tệp số liệu vào - đầu vào
tệp số liệu

[-label] - có thể lặp lại - sử dụng dữ liệu đầu vào từ các tệp nhãn bề mặt

- cấu trúc nào để đặt tệp nhãn vào - nhãn đầu vào
hồ sơ

[-volume] - có thể lặp lại - sử dụng một tệp âm lượng cho một tập duy nhất

dữ liệu của cấu trúc - cấu trúc nào để đặt tập tin khối lượng vào
- tập tin khối lượng đầu vào

[-from-crop] - đầu vào được cắt theo kích thước của ổ đĩa

cấu trúc

Lệnh này giúp bạn tạo một tệp dscalar, dtseries hoặc dlabel cifti mới
khớp với không gian brainordinate được sử dụng trong một tệp cifti khác. Tệp mẫu phải
có không gian brainordinate mong muốn trong ánh xạ dọc theo hướng cột (đối với
dtseries, dscalar, dlabel, và dconn đối xứng, điều này luôn luôn xảy ra). Tất cả đầu vào
các tệp cifti phải có ánh xạ mô hình não dọc theo cột và sử dụng cùng một khối lượng
không gian và / hoặc đỉnh bề mặt được tính là khuôn mẫu cho các cấu trúc mà chúng chứa.
Nếu bất kỳ tệp đầu vào nào chứa dữ liệu nhãn, thì các tệp đầu vào có dữ liệu không phải là nhãn
được phép, và -loạt tùy chọn có thể không được sử dụng.

Bất kỳ cấu trúc nào không được bao phủ bởi một đầu vào đều chứa các số không hoặc không được gắn nhãn
Chìa khóa.

Các đối số của -Hệ mét, -nhãn mác or -âm lượng phải là một trong những
Sau đây:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID KHÁC OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

Đối số để -đơn vị phải là một trong những điều sau:

THỨ HAI HERTZ METER RADIAN

-cifti-tạo-dày đặc-vô hướng TẠO FILE SCALAR CIFTI DENSE

wb_command -cifti-tạo-dày đặc-vô hướng

- đầu ra - tệp cifti đầu ra

[-volume] - thành phần âm lượng

- tập tin khối lượng chứa tất cả dữ liệu voxel cho tất cả khối lượng

cấu trúc

- tập tin khối lượng nhãn có chứa các nhãn cho cifti

cấu trúc

[-left-metric] - số liệu cho bề mặt bên trái

- tệp số liệu

[-roi-left] - số đỉnh để sử dụng từ bề mặt bên trái

- ROI dưới dạng tệp số liệu

[-right-metric] - metric cho bề mặt bên trái

- tệp số liệu

[-roi-right] - số đỉnh để sử dụng từ bề mặt bên phải

- ROI dưới dạng tệp số liệu

[-cerebellum-metric] - số liệu cho tiểu não

- tệp số liệu

[-roi-cerebellum] - số đỉnh để sử dụng từ bề mặt bên phải

- ROI dưới dạng tệp số liệu

Tất cả các tệp đầu vào phải có cùng số cột / số lượng con.
Chỉ có

các thành phần được chỉ định sẽ nằm trong cifti đầu ra.
Tên bản đồ sẽ là

được lấy từ một trong các tệp đầu vào.
Ít nhất một thành phần phải là

được chỉ định.
Khối lượng nhãn phải có một số tên nhãn từ

danh sách này, tất cả các tên nhãn khác sẽ bị bỏ qua:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID KHÁC OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-tạo-dày đặc-thời gian TẠO KỲ HẠN THỜI HẠN CỦA CIFTI

wb_command -cifti-tạo-dày đặc-thời gian

- đầu ra - tệp cifti đầu ra

[-volume] - thành phần âm lượng

- tập tin khối lượng chứa tất cả dữ liệu voxel cho tất cả khối lượng

cấu trúc

- tập tin khối lượng nhãn có chứa các nhãn cho cifti

cấu trúc

[-left-metric] - số liệu cho bề mặt bên trái

- tệp số liệu

[-roi-left] - số đỉnh để sử dụng từ bề mặt bên trái

- ROI dưới dạng tệp số liệu

[-right-metric] - metric cho bề mặt bên trái

- tệp số liệu

[-roi-right] - số đỉnh để sử dụng từ bề mặt bên phải

- ROI dưới dạng tệp số liệu

[-cerebellum-metric] - số liệu cho tiểu não

- tệp số liệu

[-roi-cerebellum] - số đỉnh để sử dụng từ bề mặt bên phải

- ROI dưới dạng tệp số liệu

[-timestep] - đặt thời gian

- bước thời gian, tính bằng giây (mặc định 1.0)

[-timestart] - đặt thời gian bắt đầu

- thời gian ở khung hình đầu tiên, tính bằng giây (mặc định là 0.0)

[-unit] - sử dụng một đơn vị khác với thời gian

- mã định danh đơn vị (SECOND mặc định)

Tất cả các tệp đầu vào phải có cùng số cột / số lượng con.
Chỉ có

các thành phần được chỉ định sẽ nằm trong cifti đầu ra.
Ít nhất một

thành phần phải được chỉ định.
Khối lượng nhãn phải có một số

tên nhãn từ danh sách này, tất cả các tên nhãn khác sẽ bị bỏ qua:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID KHÁC OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

Sản phẩm -đơn vị tùy chọn chấp nhận các giá trị này:

THỨ HAI HERTZ METER RADIAN

-cifti-tạo-nhãn TẠO TẬP TIN NHÃN CIFTI

wb_command -cifti-tạo-nhãn

- đầu ra - tệp cifti đầu ra

[-volume] - thành phần âm lượng

- tập tin khối lượng chứa dữ liệu nhãn - nhãn mác
tập tin khối lượng có tên cấu trúc cifti thành

xác định khối lượng bưu kiện

[-left-label] - tệp nhãn cho bề mặt bên trái

- tệp nhãn

[-roi-left] - số đỉnh để sử dụng từ bề mặt bên trái

- ROI dưới dạng tệp số liệu

[-right-label] - nhãn cho bề mặt bên trái

- tệp nhãn

[-roi-right] - số đỉnh để sử dụng từ bề mặt bên phải

- ROI dưới dạng tệp số liệu

[-cerebellum-label] - nhãn cho tiểu não

- tệp nhãn

[-roi-cerebellum] - số đỉnh để sử dụng từ bề mặt bên phải

- ROI dưới dạng tệp số liệu

Tất cả các tệp đầu vào phải có cùng số cột / số lượng con.
Chỉ có

các thành phần được chỉ định sẽ nằm trong cifti đầu ra.
Ít nhất một

thành phần phải được chỉ định.

Sản phẩm -âm lượng tùy chọn -cifti-tạo-nhãn yêu cầu hai đối số khối lượng,
đối số label-volume chứa tất cả các nhãn bạn muốn hiển thị (ví dụ: hạt nhân của
thalamus), trong khi đối số khối lượng bưu kiện bao gồm tất cả các cấu trúc CIFTI mà bạn
muốn bao gồm dữ liệu bên trong (ví dụ: THALAMUS_LEFT, THALAMUS_RIGHT). Nếu bạn chỉ muốn
các nhãn trong voxels là tên cấu trúc, bạn có thể sử dụng cùng một tệp cho cả hai
tranh luận. Khối lượng bưu kiện phải sử dụng một số tên nhãn từ danh sách này, tất cả
các tên nhãn khác trong khối-lượng bưu kiện sẽ bị bỏ qua:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID KHÁC OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-create-vô hướng-series NHẬP DỮ LIỆU SERIES VÀO CIFTI

wb_command -cifti-create-vô hướng-series

- tập tin đầu vào - đầu ra - xuất tệp cifti

[-transpose] - sử dụng nếu các hàng của tệp văn bản nằm dọc theo đại lượng vô hướng

kích thước

[-name-file] - sử dụng tệp văn bản để đặt tên trên thứ nguyên vô hướng

- tệp văn bản chứa tên, một tên trên mỗi dòng

[-series] - đặt đơn vị và giá trị của chuỗi

- đơn vị sử dụng - giá trị tại điểm chuỗi đầu tiên - NS
khoảng thời gian giữa các điểm chuỗi

Chuyển đổi tệp văn bản chứa chuỗi có độ dài bằng nhau thành tệp cifti. Văn bản
tệp phải có các dòng được tạo thành từ các số được phân tách bằng khoảng trắng, không có phần thừa
dòng mới giữa các dòng.

Các đối số phải là một trong những điều sau:

THỨ HAI HERTZ METER RADIAN

-cifti-tương quan chéo GỬI MỘT TẬP TIN CIFTI VỚI MỘT TẬP TIN CIFTI KHÁC

wb_command -cifti-tương quan chéo

- tệp cifti đầu vào đầu tiên - tệp cifti đầu vào thứ hai
- đầu ra - xuất tệp cifti

[-weights] - chỉ định trọng số cột

- tệp văn bản chứa một trọng số cho mỗi cột

[-fisher-z] - áp dụng biến đổi fish z nhỏ (tức là artanh) cho tương quan

[-mem-limit] - hạn chế sử dụng bộ nhớ

- giới hạn bộ nhớ tính bằng gigabyte

Tương quan mọi hàng với mọi hàng trong .
Sản phẩm

ánh xạ dọc theo các cột trong trở thành ánh xạ dọc theo các hàng trong đầu ra.

Khi sử dụng -ngư dân-z tùy chọn, đầu ra KHÔNG phải là điểm Z, nó là artanh (r), để
thực hiện thêm phép toán trên kết quả đầu ra này, hãy xem xét sử dụng -cifti-toán.

Việc hạn chế sử dụng bộ nhớ sẽ làm cho nó tính toán đầu ra theo khối, bằng cách
đọc qua nhiều lần.

-cifti-giãn ra DILATE MỘT TẬP TIN CIFTI

wb_command -cifti-giãn ra

- tệp cifti đầu vào - mở rộng theo chiều nào,
ROW hoặc COLUMN - khoảng cách giãn ra trên bề mặt, tính bằng mm
- khoảng cách giãn ra trong thể tích, tính bằng mm -
đầu ra - tệp cifti đầu ra

[-left-surface] - chỉ định bề mặt bên trái để sử dụng

- tệp bề mặt bên trái

[-left-Correct-area] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán

chúng từ bề mặt bên trái - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-right-surface] - chỉ định bề mặt phù hợp để sử dụng

- tệp bề mặt bên phải

[-phải-khu vực sửa chữa] - khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán

chúng từ bề mặt bên phải - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-cerebellum-surface] - chỉ định bề mặt tiểu não để sử dụng

- tệp bề mặt tiểu não

[-cerebellum-Corre-Points] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì

tính toán chúng từ bề mặt tiểu não - đỉnh đã sửa
khu vực, như một số liệu

[-bad-brainordinate-roi] - chỉ định một roi trong số brainordinate để ghi đè,

chứ không phải số không - tệp cifti dscalar hoặc dtseries, giá trị dương
chứng tỏ

brainordinates để thay thế giá trị của chúng

[-ne most] - sử dụng giá trị gần nhất khi giãn dữ liệu không phải nhãn

[-merged-volume] - coi các thành phần volume như thể chúng là một

thành phần

Đối với tất cả các giá trị dữ liệu được chỉ định là xấu, nếu chúng lân cận một giá trị tốt hoặc nằm trong
khoảng cách được chỉ định của một giá trị tốt trong cùng một loại mô hình, hãy thay thế giá trị
với trung bình có trọng số khoảng cách của các giá trị tốt lân cận, nếu không, hãy đặt giá trị thành
số không. Nếu như -gần nhất được chỉ định, nó sẽ sử dụng giá trị từ giá trị tốt gần nhất
trong phạm vi thay vì trung bình có trọng số.

Các tùy chọn - * - khu vực đã hiệu chỉnh nhằm mục đích làm giãn ra mức trung bình của nhóm
bề mặt, nhưng nó chỉ là một hiệu chỉnh gần đúng cho việc giảm cấu trúc
trong một bề mặt trung bình nhóm.

If -bad-brainord-roi được chỉ định, tất cả các giá trị, bao gồm cả những giá trị có giá trị
bằng không, là tốt, ngoại trừ các vị trí có giá trị dương trong ROI. Nếu nó là
không được chỉ định, chỉ các giá trị bằng XNUMX là xấu.

-cifti-ước tính-fwhm ƯỚC LƯỢNG MỊN MÀNG FWHM CỦA MỘT TẬP TIN CIFTI

wb_command -cifti-ước tính-fwhm

- tệp cifti đầu vào

[-merged-volume] - coi các thành phần volume như thể chúng là một

thành phần

[-column] - chỉ ước tính đầu ra cho một cột

- số cột

[-surface] - có thể lặp lại - chỉ định một bề mặt đầu vào

- cấu trúc nào để sử dụng bề mặt này cho - tệp bề mặt

Ước tính độ mịn của các thành phần của tệp cifti, in các ước tính
đến đầu ra tiêu chuẩn. Nếu như -merged-khối lượng được sử dụng, tất cả voxels được sử dụng như một
thành phần, thay vì được phân tách theo cấu trúc.

phải là một trong những điều sau:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID KHÁC OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-export-secure-mapping VIẾT CHỈ SỐ THÀNH BẢN ĐỒ YẾU TỐ dưới dạng văn bản

wb_command -cifti-export-secure-mapping

- tệp cifti - xuất bản đồ theo hướng nào,
ROW hoặc COLUMN

[-volume-all] - xuất ánh xạ của tất cả các voxels

- đầu ra - tệp văn bản đầu ra

[-no-cifti-index] - không ghi chỉ mục cifti trong tệp đầu ra

[-Structure] - viết cấu trúc mà mỗi voxel thuộc về trong đầu ra

hồ sơ

[-surface] - có thể lặp lại - xuất ánh xạ của một cấu trúc bề mặt

- cấu trúc đầu ra - đầu ra - tệp văn bản đầu ra

[-no-cifti-index] - không ghi chỉ mục cifti trong tệp đầu ra

[-volume] - có thể lặp lại - xuất ánh xạ của một cấu trúc tập

- cấu trúc đầu ra - đầu ra - tệp văn bản đầu ra

[-no-cifti-index] - không ghi chỉ mục cifti trong tệp đầu ra

Lệnh này tạo ra các tệp văn bản mô tả ánh xạ từ các chỉ số cifti đến
đỉnh bề mặt hoặc voxels. Tất cả các chỉ số đều dựa trên số không. Định dạng mặc định cho
-bề mặt là các dòng có dạng:



Định dạng mặc định cho -âm lượng và -khối lượng-tất cả là các dòng có dạng:



-cifti-Extrema TÌM HIỂU THÊM TRONG TẬP TIN CIFTI

wb_command -cifti-Extrema

- cifti đầu vào - khoảng cách tối thiểu giữa các điểm cực trị
của cùng một

loại, cho các thành phần bề mặt

- khoảng cách nhỏ nhất giữa các điểm cực trị của cùng một

loại, cho các thành phần khối lượng

- thứ nguyên nào để tìm cực trị dọc theo, ROW hoặc COLUMN -
đầu ra - đầu ra cifti

[-left-surface] - chỉ định bề mặt bên trái để sử dụng

- tệp bề mặt bên trái

[-right-surface] - chỉ định bề mặt phù hợp để sử dụng

- tệp bề mặt bên phải

[-cerebellum-surface] - chỉ định bề mặt tiểu não để sử dụng

- tệp bề mặt tiểu não

[-surface-presmooth] - làm mịn bề mặt trước khi tìm thấy cực điểm

- sigma để làm mịn bề mặt gaussian

nhân, tính bằng mm

[-volume-presmooth] - làm mịn các thành phần âm lượng trước khi tìm thấy cực trị

- sigma cho hạt nhân làm mịn khối lượng gaussian,

tính bằng mm

[-threshold] - bỏ qua điểm cực trị nhỏ

- giá trị lớn nhất được coi là giá trị nhỏ nhất - nhỏ nhất
giá trị để xem xét là giá trị tối đa

[-merged-volume] - coi các thành phần volume như thể chúng là một

thành phần

[-sum-maps] - xuất ra tổng của các bản đồ cực trị thay vì mỗi bản đồ

riêng

[-consolidate-mode] - sử dụng hợp nhất cực tiểu cục bộ thay vì một

khu phố lớn

[-only-maxima] - chỉ tìm thấy cực đại

[-only-minima] - chỉ tìm thấy minima

Tìm các vị trí không gian trong tệp cifti có nhiều giá trị cao hơn tất cả
các vị trí lân cận trong cùng một cấu kiện (cấu trúc bề mặt hoặc thể tích). Đầu vào
tệp cifti phải có ánh xạ mô hình não dọc theo hướng được chỉ định. CỘT
là hướng hoạt động trên dtseries và dscalar. Đối với dconn, nếu nó là đối xứng
sử dụng COLUMN, nếu không thì sử dụng ROW.

-cifti-false-tương quan SO SÁNH KHẮC PHỤC TẠI ĐỊA PHƯƠNG VÀ ACROSS / QUA SULCI / GYRI

wb_command -cifti-false-tương quan

- tệp cifti để sử dụng cho tương quan <3D-dist> - khoảng cách 3D tối đa
để kiểm tra xung quanh mỗi đỉnh - khoảng cách trắc địa tối đa để sử dụng cho
láng giềng

tương quan

- khoảng cách trắc địa tối thiểu để sử dụng cho các vùng lân cận

tương quan

- đầu ra - tệp cifti dscalar đầu ra

[-left-surface] - chỉ định bề mặt bên trái để sử dụng

- tệp bề mặt bên trái

[-dump-text] - kết xuất các biện pháp thô được sử dụng vào một tệp văn bản

- tệp văn bản đầu ra

[-right-surface] - chỉ định bề mặt phù hợp để sử dụng

- tệp bề mặt bên phải

[-dump-text] - kết xuất các biện pháp thô được sử dụng vào một tệp văn bản

- tệp văn bản đầu ra

[-cerebellum-surface] - chỉ định bề mặt tiểu não để sử dụng

- tệp bề mặt tiểu não

[-dump-text] - kết xuất các biện pháp thô được sử dụng vào một tệp văn bản

- tệp văn bản đầu ra

Đối với mỗi đỉnh, hãy tính toán mối tương quan trung bình trong một phạm vi của đường trắc địa
khoảng cách không vượt qua một sulcus / gyrus và mối tương quan với gần nhất
đỉnh đi qua một sulcus / gyrus. Một đỉnh được coi là đi qua một sulcus / gyrus nếu
khoảng cách 3D nhỏ hơn một phần ba khoảng cách trắc địa. Tệp đầu ra
chứa tỷ lệ giữa các mối tương quan này và một số bản đồ bổ sung để giúp
giải thích tỷ lệ.

-cifti-find-cluster BỘ ĐIỀU CHỈNH BỘ LỌC THEO KHU VỰC / KHỐI LƯỢNG

wb_command -cifti-find-cluster

- cifti đầu vào - ngưỡng cho dữ liệu bề mặt
giá trị - ngưỡng cho diện tích cụm bề mặt, tính bằng mm ^ 2
- ngưỡng cho các giá trị dữ liệu khối lượng -
ngưỡng cho kích thước cụm âm lượng, tính bằng mm ^ 3 - thứ nguyên nào được sử dụng cho
thông tin không gian, ROW hoặc

CỘT

- đầu ra - đầu ra cifti

[-less-than] - tìm các giá trị nhỏ hơn , còn hơn là

lớn hơn

[-left-surface] - chỉ định bề mặt bên trái để sử dụng

- tệp bề mặt bên trái

[-các khu vực điều chỉnh] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán chúng

từ bề mặt - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-right-surface] - chỉ định bề mặt phù hợp để sử dụng

- tệp bề mặt bên phải

[-các khu vực điều chỉnh] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán chúng

từ bề mặt - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-cerebellum-surface] - chỉ định bề mặt tiểu não để sử dụng

- tệp bề mặt tiểu não

[-các khu vực điều chỉnh] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán chúng

từ bề mặt - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-cifti-roi] - chỉ tìm kiếm trong các khu vực quan tâm

- các khu vực để tìm kiếm bên trong, dưới dạng tệp cifti

[-merged-volume] - coi các thành phần volume như thể chúng là một

thành phần

[-size-ratio] - bỏ qua các cụm nhỏ hơn một phần cụ thể của

cụm lớn nhất trong cấu trúc - phần nhỏ của cấu trúc
khu vực cụm lớn nhất - phần nhỏ của cụm lớn nhất của cấu trúc
khối lượng

[-distance] - bỏ qua các cụm xa hơn một khoảng cách nhất định từ

cụm lớn nhất trong cấu trúc - bao xa từ cái lớn nhất
cụm một cụm có thể

được, từ cạnh này sang cạnh khác, tính bằng mm

- cách cụm lớn nhất mà một cụm có thể ở bao xa,

từ cạnh này sang cạnh khác, tính bằng mm

[-start] - bắt đầu gắn nhãn các cụm từ giá trị khác 1

- giá trị cung cấp cho cụm đầu tiên được tìm thấy

Xuất ra tệp cifti với các số nguyên khác không cho tất cả các brainordinates trong một phạm vi lớn
đủ cụm và số không ở nơi khác. Các số nguyên biểu thị thành viên cụm (bởi
mặc định, cụm đầu tiên được tìm thấy sẽ sử dụng giá trị 1, cụm thứ hai 2, v.v.). Đầu vào
tệp cifti phải có ánh xạ mô hình não trên kích thước đã chọn, các cột cho
.dtseries và cả .dconn. ROI nên có một mô hình não lập bản đồ
, khớp chính xác với ánh xạ của hướng đã chọn trong tệp đầu vào.
Dữ liệu bên ngoài ROI bị bỏ qua.

-cifti-gradient TỐT NGHIỆP CỦA MỘT TẬP TIN CIFTI

wb_command -cifti-gradient

- cifti đầu vào - kích thước nào để lấy gradient theo,
ROW hoặc COLUMN - đầu ra - đầu ra cifti

[-left-surface] - chỉ định bề mặt bên trái để sử dụng

- tệp bề mặt bên trái

[-left-Correct-area] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán

chúng từ bề mặt bên trái - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-right-surface] - chỉ định bề mặt phù hợp để sử dụng

- tệp bề mặt bên phải

[-phải-khu vực sửa chữa] - khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán

chúng từ bề mặt bên phải - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-cerebellum-surface] - chỉ định bề mặt tiểu não để sử dụng

- tệp bề mặt tiểu não

[-cerebellum-Corre-Points] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì

tính toán chúng từ bề mặt tiểu não - đỉnh đã sửa
khu vực, như một số liệu

[-surface-presmooth] - làm mịn bề mặt trước khi tính toán

dốc - sigma để làm mịn bề mặt gaussian

nhân, tính bằng mm

[-volume-presmooth] - làm mịn bề mặt trước khi tính toán độ dốc

- sigma cho hạt nhân làm mịn khối lượng gaussian,

tính bằng mm

[-average-output] - xuất giá trị trung bình của các bản đồ độ lớn gradient

thay vì từng bản đồ gradient riêng biệt

[-vectors] - vectơ gradient đầu ra

- đầu ra - các vectơ, dưới dạng tệp dscalar

Thực hiện tính toán độ dốc trên từng thành phần của tệp cifti và tùy chọn
trung bình các gradient kết quả. Các -các diễn viên và -trung bình-đầu ra tùy chọn có thể không
được sử dụng cùng nhau. Bạn phải chỉ định một bề mặt cho mỗi cấu trúc bề mặt trong
tệp cifti. Hướng COLUMN sẽ nhanh hơn và là hướng hoạt động
trên dtseries. Đối với dconn, bạn có thể muốn ROW, trừ khi bạn đang sử dụng
-trung bình-đầu ra.

-cifti-nhãn-kề TẠO MATRIX ADJACENCY CỦA TỆP NHÃN CIFTI

wb_command -cifti-nhãn-kề

- tệp nhãn cifti đầu vào - đầu ra - đầu ra cifti
ma trận kề pconn

[-left-surface] - chỉ định bề mặt bên trái để sử dụng

- tệp bề mặt bên trái

[-right-surface] - chỉ định bề mặt phù hợp để sử dụng

- tệp bề mặt bên phải

[-cerebellum-surface] - chỉ định bề mặt tiểu não để sử dụng

- tệp bề mặt tiểu não

Tìm các voxels liền kề mặt và các đỉnh được kết nối có các giá trị nhãn khác nhau,
và đếm chúng cho từng cặp. Đặt số lượng kết quả vào một số bị hủy
tệp kết nối, với đường chéo bằng không. Điều này đưa ra một ước tính sơ bộ về
biên giới giữa hai nhãn là bao lâu hoặc mở rộng.

-cifti-nhãn-xuất-bảng XUẤT BẢNG NHÃN TỪ CIFTI AS TEXT

wb_command -cifti-nhãn-xuất-bảng

- tệp nhãn cifti đầu vào - số hoặc tên của bản đồ nhãn
sử dụng - đầu ra - tệp văn bản đầu ra

Lấy bảng nhãn từ bản đồ nhãn cifti và ghi nó vào định dạng văn bản
phù hợp với những gì được mong đợi bởi -cifti-nhãn-nhập khẩu.

-cifti-nhãn-nhập khẩu TẠO FILE NHÃN CIFTI TỪ FILE CIFTI

wb_command -cifti-nhãn-nhập khẩu

- tệp cifti đầu vào - tệp văn bản chứa các giá trị
và tên cho các nhãn - đầu ra - tệp nhãn cifti đầu ra

[-discard-others] - đặt bất kỳ giá trị nào không được đề cập trong danh sách nhãn thành

??? nhãn mác

[-unlabeled-value] - đặt giá trị sẽ được hiểu là không được gắn nhãn

- giá trị số cho không được gắn nhãn (mặc định là 0)

[-drop-used-label] - xóa mọi giá trị nhãn không sử dụng khỏi nhãn

bàn

Tạo tệp nhãn cifti từ tệp cifti có các giá trị giống nhãn.
Bạn

có thể chỉ định chuỗi trống ('' sẽ hoạt động trên linux / mac) cho ,
sẽ được xử lý như thể nó là một tệp trống. Tệp danh sách nhãn phải có
các dòng có định dạng sau:



Không chỉ định khóa "không được gắn nhãn" trong tệp, giả định rằng 0 có nghĩa là không
được dán nhãn trừ khi -giá trị không được gắn nhãn được quy định. Tên nhãn phải nằm riêng biệt
dòng, nhưng có thể chứa khoảng trắng hoặc các ký tự bất thường khác (nhưng không phải dòng mới).
Khoảng trắng được cắt bớt từ cả hai đầu của tên nhãn, nhưng được giữ lại nếu nó nằm trong
giữa nhãn. Các giá trị của màu đỏ, xanh lục, xanh lam và alpha phải là các số nguyên từ
0 đến 255 và sẽ chỉ định màu mà nhãn được vẽ (alpha của 255 có nghĩa là
mờ đục, đó có thể là những gì bạn muốn). Theo mặc định, nó sẽ đặt tên nhãn mới
với tên LABEL_ # cho bất kỳ giá trị nào gặp phải không được đề cập trong danh sách
tập tin, chỉ định -đĩa-những người khác thay vào đó, đặt chúng thành khóa "không được gắn nhãn".

-cifti-nhãn-to-roi ĐẶT NHÃN CIFTI THÀNH ROI

wb_command -cifti-nhãn-to-roi

- tệp nhãn cifti đầu vào - đầu ra - đầu ra cifti
tệp vô hướng

[-name] - chọn nhãn theo tên

- tên nhãn mà bạn muốn có

[-key] - chọn nhãn bằng phím

- khóa nhãn mà bạn muốn có

[-map] - chọn một bản đồ nhãn để sử dụng

- số bản đồ hoặc tên

Đối với mỗi bản đồ trong , một bản đồ được tạo ở nơi tất cả các địa điểm
gắn nhãn với hoặc với một chìa khóa của được cho một giá trị là 1 và
tất cả các vị trí khác được cho bằng 0. Chính xác là một trong số -Tên và -Chìa khóa phải được chỉ định.
Chỉ định -bản đồ chỉ sử dụng một bản đồ từ .

-cifti-toán ĐÁNH GIÁ THỂ HIỆN TRÊN CÁC LỌC CIFTI

wb_command -cifti-toán

- biểu thức để đánh giá, trong dấu ngoặc kép - đầu ra - cái
xuất tệp cifti

[-fixnan] - thay thế kết quả NaN bằng một giá trị

- giá trị để thay thế NaN bằng

[-override-mapping-check] - không kiểm tra tính tương thích của ánh xạ,

chỉ kiểm tra độ dài

[-var] - có thể lặp lại - tệp cifti để sử dụng làm biến

- tên của biến, như được sử dụng trong biểu thức - cifti
tệp để sử dụng làm biến này

[-select] - có thể lặp lại - chọn một chỉ mục từ một thứ nguyên

- thứ nguyên để chọn (dựa trên 1) - chỉ mục để sử dụng (dựa trên 1)

[-repeat] - lặp lại các giá trị đã chọn cho mỗi chỉ mục đầu ra trong

kích thước này

Lệnh này đánh giá tại mỗi phần tử ma trận một cách độc lập. Ở đó
phải có ít nhất một -var (để lấy bố cục đầu ra từ), ngay cả khi
được chỉ định trong nó không được sử dụng trong .

Để chọn một cột từ tệp 2D (hầu hết các tệp cifti là 2D), hãy sử dụng -lựa chọn 1
, ở đâu là dựa trên 1. Để chọn một hàng từ tệp 2D, hãy sử dụng
-lựa chọn 2 . Ở đâu -lựa chọn không được sử dụng, các tệp cifti phải tương thích
ánh xạ (ví dụ: ánh xạ mô hình não và bưu kiện phải khớp chính xác ngoại trừ
tên các thửa đất). Sử dụng -ghi đè-ánh xạ-kiểm tra để bỏ qua kiểm tra này.

Tên tệp không hợp lệ trong , sử dụng một tên biến và một -var tùy chọn với
phù hợp để chỉ định một tệp đầu vào. Định dạng của là như
sau:

Biểu thức bao gồm hằng số, biến, toán tử, dấu ngoặc đơn và hàm,
trong ký hiệu infix, chẳng hạn như 'exp (-x + 3) * thang đo '. Các biến là các chuỗi bất kỳ
chiều dài, sử dụng các ký tự az, AZ, 0-9 và _, nhưng không được lấy tên của
được đặt tên là hằng số. Hiện tại, chỉ có một hằng số được đặt tên là PI. Các nhà điều hành
là +, -, *, /, ^,>, <,> =, <=, ==,! =,!, &&, ||. Chúng hoạt động như trong C, ngoại trừ
^ đó là lũy thừa, tức là pow (x, y) và có mức độ ưu tiên cao hơn
toán tử nhị phân (cũng có, '-3 ^ -4 ^ -5' có nghĩa là '- (3 ^ (- (4 ^ -5)))'). Dấu <=,> =, ==, và! =
các nhà khai thác được cung cấp một lượng nhỏ không gian lung lay, bằng một phần triệu
nhỏ hơn giá trị tuyệt đối của các giá trị được so sánh.

Các toán tử so sánh và logic trả về 0 hoặc 1, bạn có thể thực hiện việc tạo mặt nạ với các biểu thức
như 'x * (mặt nạ> 0)'. Đối với tất cả các toán tử logic, một đầu vào được coi là true iff
nó lớn hơn 0. Biểu thức '0 <x <5' không sai về mặt cú pháp, nhưng
nó sẽ KHÔNG làm những gì mong muốn, bởi vì nó được đánh giá từ trái sang phải, tức là '((0
x) <5) ', sẽ luôn trả về 1, vì cả hai kết quả có thể có của phép so sánh là
nhỏ hơn 5. Một cảnh báo sẽ được tạo ra nếu một biểu hiện thuộc loại này được phát hiện.
Sử dụng một cái gì đó như 'x> 0 && x <5' để có được hành vi mong muốn.

Khoảng trắng giữa các phần tử bị bỏ qua, 'sin (2 * x)' tương đương với
'sin (2 * x)', nhưng 's trong (2 * x)' là một lỗi. Phép nhân ngụ ý không được phép,
biểu thức '2x' sẽ được phân tích cú pháp như một biến. Dấu ngoặc đơn là (), không sử dụng
[] hoặc {}. Các hàm yêu cầu dấu ngoặc đơn, biểu thức 'sin x' là một lỗi.

Các chức năng sau được hỗ trợ:

sin: 1 đối số, sin của đối số (đơn vị là radian) cos: 1 đối số,
cosine của đối số (đơn vị là radian) tan: 1 đối số, tiếp tuyến của
đối số (đơn vị là radian) asin: 1 đối số, nghịch đảo của sin của đối số,
tính bằng radian acos: 1 đối số, nghịch đảo của cosine của đối số, tính bằng radian
đối số atan: 1, nghịch đảo của tiếp tuyến của đối số, tính bằng radian atan2: 2
đối số, atan2 (y, x) trả về nghịch đảo của tiếp tuyến của

(y / x), tính bằng radian, xác định góc phần tư bằng dấu của cả hai đối số

sinh: 1 đối số, sin hyperbol của đối số cosh: 1 đối số,
cosin hyperbol của đối số tanh: 1 đối số, tiếp tuyến hyperboloc của đối số
đối số asinh: 1 đối số, sin hyperbol nghịch đảo của đối số acosh: 1
đối số, cosin hyperbol nghịch đảo của đối số atanh: 1 đối số,
tiếp tuyến hyperboloc nghịch đảo của đối số ln: 1, logarit tự nhiên của
đối số exp: 1 đối số, hằng số e nâng lên thành sức mạnh của đối số
log: 1 đối số, logarit cơ số 10 của đối số sqrt: 1 đối số, bình phương
gốc của đối số abs: 1 đối số, giá trị tuyệt đối của tầng đối số: 1
đối số, số nguyên lớn nhất không lớn hơn vòng đối số: 1 đối số,
số nguyên gần nhất, với các mối quan hệ được làm tròn đi từ

không

ceil: 1 đối số, số nguyên nhỏ nhất không nhỏ hơn đối số min: 2 đối số,
min (x, y) trả về y nếu (x> y), x nếu không thì max: 2 đối số, max (x, y) trả về y
if (x <y), x nếu không thì mod: 2 đối số, mod (x, y) = x - y * tầng (x / y) hoặc 0 nếu
y == 0 kẹp: 3 đối số, kẹp (x, thấp, cao) = tối thiểu (tối đa (x, thấp), cao)

-cifti-hợp nhất MERGE CIFTI TIMESERIES, SCALAR HOẶC CÁC LỌC NHÃN

wb_command -cifti-hợp nhất

- đầu ra - xuất tệp cifti

[-cifti] - có thể lặp lại - chỉ định tệp cifti đầu vào

- một tệp cifti để sử dụng các cột từ

[-column] - có thể lặp lại - chọn một cột duy nhất để sử dụng

- chỉ mục cột (bắt đầu từ 1)

[-up-to] - sử dụng một loạt các cột

- chỉ mục của cột cuối cùng cần bao gồm

[-reverse] - sử dụng phạm vi theo thứ tự ngược lại

Đưa ra các tệp CIFTI đầu vào có các ánh xạ phù hợp dọc theo các cột và
ánh xạ dọc theo các hàng là cùng một loại, tất cả đều là chuỗi, vô hướng hoặc nhãn, cái này
lệnh nối các cột được chỉ định theo chiều ngang (các hàng trở nên dài hơn).

Ví dụ: wb_command -cifti-hợp nhất ra.dtseries.nii -cifti đầu tiên.dtseries.nii -cột
1 -cifti thứ hai.dtseries.nii

Ví dụ này sẽ lấy cột đầu tiên từ first.dtseries.nii, tiếp theo là tất cả
các cột từ second.dtseries.nii và ghi các cột này vào out.dtseries.nii.

-cifti-hợp nhất-dày đặc HỢP NHẤT CÁC TỆP CIFTI CÙNG KÍCH THƯỚC DUY NHẤT

wb_command -cifti-hợp nhất-dày đặc

- thứ nguyên nào để hợp nhất, ROW hoặc COLUMN - đầu ra -
tệp cifti đầu ra

[-cifti] - có thể lặp lại - chỉ định tệp cifti đầu vào

- một tệp cifti để hợp nhất

Các tệp cifti đầu vào phải có các ánh xạ phù hợp theo hướng không
được chỉ định, và ánh xạ dọc theo hướng được chỉ định phải là mô hình não.

-cifti-pairwise-tương quan CÁC CON ĐƯỜNG CẶP GÓC GIỮA HAI LỌC CIFTI

wb_command -cifti-pairwise-tương quan

- tệp cifti đầu vào đầu tiên - tệp cifti đầu vào thứ hai
- đầu ra - xuất tệp cifti

[-fisher-z] - áp dụng biến đổi fish z nhỏ (tức là artanh) cho tương quan

Đối với mỗi hàng trong , tương quan nó với cùng một hàng trong , và đặt
dẫn đến cùng một hàng , chỉ có một cột.

-cifti-bảng màu ĐẶT PALETTE TRÊN TẬP TIN CIFTI

wb_command -cifti-bảng màu

- đầu vào cifti - chế độ lập bản đồ - đầu ra - cái
xuất tệp cifti

[-column] - chọn một cột duy nhất cho bản đồ vô hướng

- số cột hoặc tên

[-pos-phần trăm] - phần trăm tối thiểu / tối đa để tô màu dữ liệu dương

- phần trăm cho dữ liệu ít tích cực nhất - NS
phân vị cho dữ liệu tích cực nhất

[-neg-phần trăm] - phần trăm tối thiểu / tối đa cho màu dữ liệu âm

- phần trăm cho dữ liệu tiêu cực nhất - NS
phân vị cho dữ liệu tiêu cực nhất

[-pos-user] - giá trị tối thiểu / tối đa của người dùng để tô màu dữ liệu dương

- giá trị cho dữ liệu ít tích cực nhất - giá trị
cho dữ liệu tích cực nhất

[-neg-user] - giá trị tối thiểu / tối đa của người dùng để tô màu dữ liệu phủ định

- giá trị cho dữ liệu âm ít nhất - giá trị
cho dữ liệu tiêu cực nhất

[-interpolate] - nội suy màu

- boolean, có nội suy không

[-disp-pos] - hiển thị dữ liệu tích cực

- boolean, có hiển thị không

[-disp-neg] - hiển thị dữ liệu tích cực

- boolean, có hiển thị không

[-disp-zero] - hiển thị dữ liệu gần bằng XNUMX hơn ngưỡng giới hạn tối thiểu

- boolean, có hiển thị không

[-palette-name] - đặt bảng màu được sử dụng

- tên của bảng màu

[-thresholding] - đặt ngưỡng

- cài đặt ngưỡng - hiển thị các giá trị bên trong hoặc bên ngoài ngưỡng
- ngưỡng cửa thấp hơn - ngưỡng trên

LƯU Ý: Tệp đầu ra phải là tệp khác với tệp đầu vào.

Đối với bản đồ vô hướng, theo mặc định, bảng màu được thay đổi cho mọi bản đồ, hãy chỉ định -cột
để thay đổi chỉ một bản đồ. Cài đặt bảng màu không được chỉ định sẽ được lấy từ
cột đầu tiên cho các bản đồ vô hướng và từ bảng tệp hiện có cho các ánh xạ khác
các loại. Các đối số phải là một trong những điều sau:

MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE

Các tranh luận với -bảng-tên phải là một trong những điều sau:

PSYCH PSYCH-NO-NONE ROY-BIG ROY-BIG-BL Màu cam-vàng xám_Interp_Positive
Gray_Interp clear_brain videoen_style fidl raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG đỏ-vàng xanh lam-ánh sáng xanh FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_blue fsl_vàng JET256

Các tranh luận với -ngưỡng phải là một trong những điều sau:

THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL

Các tranh luận với -ngưỡng phải là một trong những điều sau:

THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE

-cifti-parcel-mapping-to-nhãn TẠO DLABEL TỪ TẬP TIN ĐƯỢC CỘNG HÒA

wb_command -cifti-parcel-mapping-to-nhãn

- tập tin bị hủy đầu vào - thứ nguyên nào để sử dụng
bản đồ bưu kiện từ, ROW hoặc COLUMN - một tệp cifti với mong muốn
lập bản đồ dày đặc

cột

- đầu ra - tệp nhãn dày đặc đầu ra

Lệnh này sẽ xuất ra một tệp dlabel, hữu ích để thực hiện cùng một lệnh hủy đối với
một tệp dày đặc khác.

Đối với ptseries, pscalar, plabel, pconn và pdconn, sử dụng ROW cho sẽ
làm việc.

-cifti-bưu kiện CHỈNH SỬA MỘT TẬP TIN CIFTI

wb_command -cifti-bưu kiện

- tệp cifti để hủy bỏ - một tệp nhãn cifti để sử dụng
cho việc hủy bỏ - ánh xạ nào để phân vùng, ROW hoặc COLUMN
- đầu ra - xuất tệp cifti

Mỗi nhãn trong tệp nhãn cifti sẽ được coi là một lô và tất cả các hàng hoặc
các cột trong lô được tính trung bình với nhau để tạo thành hàng hoặc cột đầu ra.
Nếu ROW được chỉ định, thì ánh xạ đầu vào dọc theo các hàng phải là brainordinates và
ánh xạ đầu ra dọc theo các hàng sẽ là các lô, nghĩa là các cột sẽ được tính trung bình
cùng nhau. Đối với dtseries hoặc dscalar, hãy sử dụng COLUMN.

-cifti-giảm HOẠT ĐỘNG GIẢM HIỆU SUẤT CŨNG CIFTI ROWS

wb_command -cifti-giảm

- tệp cifti để giảm - toán tử giảm để sử dụng
- đầu ra - tệp cifti đầu ra

[-exclude-outceptions] - loại trừ các ngoại lệ khỏi mỗi hàng theo tiêu chuẩn

lệch lạc - số độ lệch chuẩn dưới mức trung bình để

bao gồm

- số độ lệch chuẩn trên mức trung bình để

bao gồm

Đối với mỗi hàng cifti, lấy dữ liệu dọc theo hàng làm vectơ và thực hiện
giảm cụ thể trên nó, đưa kết quả vào cột đầu ra duy nhất trong đó
hàng ngang. Các toán tử giảm như sau:

MAX: giá trị lớn nhất MIN: giá trị nhỏ nhất INDEXMAX: chỉ số dựa trên 1 của
giá trị lớn nhất INDEXMIN: chỉ số dựa trên 1 của giá trị nhỏ nhất SUM: thêm tất cả các giá trị
PRODUCT: nhân tất cả các giá trị MEAN: giá trị trung bình của dữ liệu STDEV: tiêu chuẩn
độ lệch (mẫu số N) SAMPSTDEV: độ lệch chuẩn mẫu (N-1
mẫu số) VARIANCE: phương sai của dữ liệu MEDIAN: giá trị trung bình của dữ liệu
MODE: chế độ của dữ liệu COUNT_NONZERO: số phần tử khác không trong
dữ liệu

-cifti-sắp xếp lại REORDER CÁC THÔNG SỐ HOẶC BẢN ĐỒ SCALAR / NHÃN TRONG TỆP CIFTI

wb_command -cifti-sắp xếp lại

- đầu vào tệp cifti bị hủy bỏ - thứ nguyên nào để sắp xếp lại
cùng, ROW hoặc COLUMN - một tệp văn bản có chứa thứ tự mong muốn
sự biến đổi - đầu ra - tệp cifti được sắp xếp lại

Ánh xạ dọc theo hướng được chỉ định phải là bưu kiện, vô hướng hoặc nhãn. Vì
pscalar hoặc ptseries, sử dụng COLUMN để sắp xếp lại các bưu kiện. Đối với nhãn, hãy sử dụng ROW. Các
tệp phải chứa các chỉ số dựa trên 1 được phân tách bằng khoảng trắng (dấu cách,
dòng mới, tab, v.v.), với nhiều chỉ số như có dọc theo chỉ định
kích thước. Các chỉ số này chỉ định chỉ mục hiện tại nào sẽ kết thúc bằng
vị trí, ví dụ: nếu thứ tự hiện tại là 'ABC D' và thứ tự mong muốn là
'DAB C', tệp văn bản phải chứa '4 1 2 3'.

-cifti-thay-thế-cấu trúc THAY THẾ DỮ LIỆU TRONG CẤU TRÚC TRONG TẬP TIN CIFTI

wb_command -cifti-thay-thế-cấu trúc

- cifti để sửa đổi - thứ nguyên nào để giải thích như một
bản đồ đơn, ROW hoặc COLUMN

[-volume-all] - thay thế dữ liệu trong tất cả các thành phần volume

- âm lượng đầu vào

[-from-crop] - đầu vào được cắt theo kích thước của dữ liệu

[-discard-used-label] - khi thao tác trên tệp dlabel, hãy thả bất kỳ

các khóa nhãn không sử dụng từ bảng nhãn

[-label] - có thể lặp lại - thay thế dữ liệu trong thành phần nhãn bề mặt

- cấu trúc thay thế dữ liệu của - tệp nhãn đầu vào

[-metric] - có thể lặp lại - thay thế dữ liệu trong thành phần bề mặt

- cấu trúc để thay thế dữ liệu của - số liệu đầu vào

[-volume] - có thể lặp lại - thay thế dữ liệu trong một thành phần âm lượng

- cấu trúc để thay thế dữ liệu của - âm lượng đầu vào

[-from-crop] - đầu vào được cắt theo kích thước của thành phần

Bạn phải chỉ định ít nhất một trong số -Hệ mét, -nhãn mác, -âm lượng, hoặc là -khối lượng-tất cả cho điều này
lệnh để làm bất cứ điều gì. Khối lượng đầu vào phải phù hợp với đầu ra của
-cifti-riêng biệt. Đối với dtseries / dscalar, hãy sử dụng COLUMN và nếu ma trận của bạn sẽ
hoàn toàn đối xứng, COLUMN hiệu quả hơn. Đối số cấu trúc phải là một trong những
sau đây:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID KHÁC OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-mẫu lại ĐẶT LẠI MỘT TẬP TIN CIFTI ĐẾN MỘT KHÔNG GIAN CIFTI MỚI

wb_command -cifti-mẫu lại

- tệp cifti để lấy lại mẫu - hướng của đầu vào
cái đó nên được lấy mẫu lại - một tệp cifti chứa không gian cifti
để lấy lại mẫu cho - hướng của mẫu để sử dụng làm

lấy lại mẫu không gian

- chỉ định một phương pháp lấy mẫu lại bề mặt - chỉ định một
phương pháp nội suy khối lượng - đầu ra - tệp cifti đầu ra

[-surface-large] - sử dụng trọng số lớn nhất thay vì trọng số trung bình khi

làm lại bề mặt

[-volume-predilate] - giãn các thành phần âm lượng trước khi lấy mẫu lại

- khoảng cách, tính bằng mm, để giãn ra

[-surface-postdilate] - làm giãn các thành phần bề mặt sau khi lấy mẫu lại

- khoảng cách, tính bằng mm, để giãn ra

[-affine] - sử dụng phép biến đổi affine trên các thành phần khối lượng

- tệp affine để sử dụng

[-flirt] - PHẢI được sử dụng nếu affine là affine tán tỉnh

- âm lượng nguồn được sử dụng khi tạo liên kết
- khối lượng mục tiêu được sử dụng khi tạo liên kết

[-warpfield] - sử dụng warpfield trên các thành phần khối lượng

- chiến trường để sử dụng

[-fnirt] - PHẢI được sử dụng nếu sử dụng trường dọc fnirt

- âm lượng nguồn được sử dụng khi tạo

chiến trường

[-left -here] - chỉ định các hình cầu để lấy mẫu lại bề mặt bên trái

- một quả cầu có lưới giống như bên trái hiện tại

bề mặt

- một hình cầu với lưới bên trái mới đang được đăng ký

với hình cầu hiện tại

[-left-area-surfs] - chỉ định bề mặt bên trái để làm vùng đỉnh

sửa chữa dựa trên - bề mặt giải phẫu bên trái có liên quan với
hiện hành

mắt lưới

- bề mặt giải phẫu bên trái có liên quan với lưới mới

[-left-area-metrics] - chỉ định số liệu khu vực đỉnh bên trái để làm khu vực

sửa chữa dựa trên - một tệp số liệu với các vùng đỉnh cho
hiện hành

mắt lưới

- một tệp số liệu với các vùng đỉnh cho lưới mới

[-phải-hình cầu] - chỉ định hình cầu để lấy mẫu lại bề mặt bên phải

- một quả cầu có lưới giống như bên phải hiện tại

bề mặt

- một hình cầu với lưới bên phải mới đang được đăng ký

với hình cầu hiện tại

[-right-area-surfs] - chỉ định bề mặt bên phải để làm vùng đỉnh

sửa chữa dựa trên - bề mặt giải phẫu bên phải có liên quan với
hiện hành

mắt lưới

- bề mặt giải phẫu bên phải có liên quan với lưới mới

[-right-area-metrics] - chỉ định số liệu khu vực đỉnh bên phải để làm khu vực

sửa chữa dựa trên - một tệp số liệu với các vùng đỉnh cho
hiện hành

mắt lưới

- một tệp số liệu với các vùng đỉnh cho lưới mới

[-cerebellum -hereres] - chỉ định các hình cầu để lấy mẫu lại bề mặt tiểu não

- một quả cầu có cùng mắt lưới với dòng điện

bề mặt tiểu não

- một hình cầu với lưới tiểu não mới nằm trong

đăng ký với quả cầu hiện tại

[-cerebellum-area-surfs] - chỉ định bề mặt tiểu não để làm đỉnh

hiệu chỉnh khu vực dựa trên - bề mặt giải phẫu tiểu não liên quan
với

lưới hiện tại

- bề mặt giải phẫu tiểu não có liên quan với lưới mới

[-cerebellum-area-metrics] - chỉ định số liệu khu vực đỉnh tiểu não để

thực hiện hiệu chỉnh khu vực dựa trên - một tệp số liệu với các khu vực đỉnh cho
hiện nay

mắt lưới

- một tệp số liệu với các vùng đỉnh cho lưới mới

Lấy mẫu lại dữ liệu cifti sang một không gian brainordinate khác.
Sử dụng COLUMN cho

hướng để lấy lại mẫu dscalar, dlabel hoặc dtseries.
Lấy mẫu lại cả hai

kích thước của một dconn yêu cầu chạy lệnh này hai lần, một lần với COLUMN và
một lần với ROW. Nếu bạn đang lấy mẫu lại một dconn và máy của bạn có một lượng lớn
của bộ nhớ, bạn có thể cân nhắc sử dụng -cifti-resample-dconn-bộ nhớ tránh viết
và đọc lại một tệp trung gian. Nếu hình cầu không được chỉ định cho một bề mặt
cấu trúc tồn tại trong các tệp cifti, dữ liệu của nó được sao chép mà không cần lấy mẫu lại hoặc
sự giãn nở. Quá trình giãn nở được thực hiện bằng phương thức 'gần nhất' và được thực hiện trên
cho dữ liệu bề mặt. Các thành phần âm lượng được đệm trước khi giãn nở để giãn nở
không chạy vào cạnh của hộp giới hạn thành phần.

Các phương pháp lấy mẫu lại được đề xuất là ADAP_BARY_AREA và CUBIC (khối vuông),
ngoại trừ dữ liệu nhãn sẽ sử dụng ADAP_BARY_AREA và ENCLOSING_VOXEL.

Các đối số phải là một trong những điều sau:

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

Các đối số phải là một trong những điều sau:

ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC

-cifti-resample-dconn-bộ nhớ SỬ DỤNG RẤT NHIỀU BỘ NHỚ ĐỂ GIẢI CỨU DCONN

wb_command -cifti-resample-dconn-bộ nhớ

- tệp cifti để lấy lại mẫu - một tệp cifti chứa
không gian cifti để lấy lại mẫu - hướng của mẫu
để sử dụng như

lấy lại mẫu không gian

- chỉ định một phương pháp lấy mẫu lại bề mặt - chỉ định một
phương pháp nội suy khối lượng - đầu ra - tệp cifti đầu ra

[-surface-large] - sử dụng trọng số lớn nhất thay vì trọng số trung bình khi

làm lại bề mặt

[-volume-predilate] - giãn các thành phần âm lượng trước khi lấy mẫu lại

- khoảng cách, tính bằng mm, để giãn ra

[-surface-postdilate] - làm giãn các thành phần bề mặt sau khi lấy mẫu lại

- khoảng cách, tính bằng mm, để giãn ra

[-affine] - sử dụng phép biến đổi affine trên các thành phần khối lượng

- tệp affine để sử dụng

[-flirt] - PHẢI được sử dụng nếu affine là affine tán tỉnh

- âm lượng nguồn được sử dụng khi tạo liên kết
- khối lượng mục tiêu được sử dụng khi tạo liên kết

[-warpfield] - sử dụng warpfield trên các thành phần khối lượng

- chiến trường để sử dụng

[-fnirt] - PHẢI được sử dụng nếu sử dụng trường dọc fnirt

- âm lượng nguồn được sử dụng khi tạo

chiến trường

[-left -here] - chỉ định các hình cầu để lấy mẫu lại bề mặt bên trái

- một quả cầu có lưới giống như bên trái hiện tại

bề mặt

- một hình cầu với lưới bên trái mới đang được đăng ký

với hình cầu hiện tại

[-left-area-surfs] - chỉ định bề mặt bên trái để làm vùng đỉnh

sửa chữa dựa trên - bề mặt giải phẫu bên trái có liên quan với
hiện hành

mắt lưới

- bề mặt giải phẫu bên trái có liên quan với lưới mới

[-left-area-metrics] - chỉ định số liệu khu vực đỉnh bên trái để làm khu vực

sửa chữa dựa trên - một tệp số liệu với các vùng đỉnh cho
hiện hành

mắt lưới

- một tệp số liệu với các vùng đỉnh cho lưới mới

[-phải-hình cầu] - chỉ định hình cầu để lấy mẫu lại bề mặt bên phải

- một quả cầu có lưới giống như bên phải hiện tại

bề mặt

- một hình cầu với lưới bên phải mới đang được đăng ký

với hình cầu hiện tại

[-right-area-surfs] - chỉ định bề mặt bên phải để làm vùng đỉnh

sửa chữa dựa trên - bề mặt giải phẫu bên phải có liên quan với
hiện hành

mắt lưới

- bề mặt giải phẫu bên phải có liên quan với lưới mới

[-right-area-metrics] - chỉ định số liệu khu vực đỉnh bên phải để làm khu vực

sửa chữa dựa trên - một tệp số liệu với các vùng đỉnh cho
hiện hành

mắt lưới

- một tệp số liệu với các vùng đỉnh cho lưới mới

[-cerebellum -hereres] - chỉ định các hình cầu để lấy mẫu lại bề mặt tiểu não

- một quả cầu có cùng mắt lưới với dòng điện

bề mặt tiểu não

- một hình cầu với lưới tiểu não mới nằm trong

đăng ký với quả cầu hiện tại

[-cerebellum-area-surfs] - chỉ định bề mặt tiểu não để làm đỉnh

hiệu chỉnh khu vực dựa trên - bề mặt giải phẫu tiểu não liên quan
với

lưới hiện tại

- bề mặt giải phẫu tiểu não có liên quan với lưới mới

[-cerebellum-area-metrics] - chỉ định số liệu khu vực đỉnh tiểu não để

thực hiện hiệu chỉnh khu vực dựa trên - một tệp số liệu với các khu vực đỉnh cho
hiện nay

mắt lưới

- một tệp số liệu với các vùng đỉnh cho lưới mới

Lệnh này thực hiện tương tự như chạy -cifti-mẫu lại hai lần, nhưng sử dụng bộ nhớ
lên đến khoảng gấp đôi kích thước mà tệp trung gian sẽ có. Đây là
bởi vì dconn trung gian được giữ trong bộ nhớ, thay vì được ghi vào đĩa, và
các thành phần trước và sau khi lấy lại mẫu / giãn nở phải ở trong bộ nhớ tại
đồng thời trong quá trình tính toán có liên quan. Nếu hình cầu không được chỉ định cho một
cấu trúc bề mặt tồn tại trong các tệp cifti, dữ liệu của nó được sao chép mà không
lấy mẫu lại hoặc giãn nở. Quá trình giãn nở được thực hiện bằng phương thức 'gần nhất' và được thực hiện trên
cho dữ liệu bề mặt. Các thành phần âm lượng được đệm trước khi giãn nở vì vậy
sự giãn nở đó không chạy vào cạnh của hộp giới hạn thành phần.

Các đối số phải là một trong những điều sau:

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

Các đối số phải là một trong những điều sau:

ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC

-cifti-hạn chế-dày đặc-bản đồ LOẠI TRỪ CÁC NGUỒN GỐC RA KHỎI TẬP TIN CIFTI

wb_command -cifti-hạn chế-dày đặc-bản đồ

- cifti đầu vào - thứ nguyên nào để thay đổi ánh xạ
bật, ROW hoặc COLUMN - đầu ra - đầu ra cifti

[-cifti-roi] - tệp cifti chứa rois kết hợp

- rois dưới dạng tệp cifti

[-left-roi] - các đỉnh để sử dụng từ bán cầu trái

- dấu roi bên trái dưới dạng tệp số liệu

[-right-roi] - các đỉnh để sử dụng từ bán cầu phải

- the right roi as a metric file

[-cerebellum-roi] - đỉnh sử dụng từ tiểu não

- roi cerebellum dưới dạng tệp số liệu

[-vol-roi] - voxels để sử dụng

- tập tin số lượng roi

Viết một phiên bản sửa đổi của , nơi mà tất cả các brainordinates bên ngoài
(các) roi được chỉ định sẽ bị xóa khỏi tệp. Nếu như -cifti-roi được chỉ định, không có khác
- * - tùy chọn roi có thể được chỉ định. Nếu không sử dụng -cifti-roi, tùy chọn bất kỳ - * - roi không
Hiện tại sẽ loại bỏ cấu trúc có liên quan, nếu có trong tệp đầu vào.

-cifti-roi-trung bình CÁC TUYẾN HÀNG KHÔNG TRONG MỘT TẬP TIN CIFTI DUY NHẤT

wb_command -cifti-roi-trung bình

- tệp cifti đến các hàng trung bình từ - tệp văn bản đầu ra của
giá trị trung bình

[-cifti-roi] - tệp cifti chứa rois kết hợp

- rois dưới dạng tệp cifti

[-left-roi] - các đỉnh để sử dụng từ bán cầu trái

- dấu roi bên trái dưới dạng tệp số liệu

[-right-roi] - các đỉnh để sử dụng từ bán cầu phải

- the right roi as a metric file

[-cerebellum-roi] - đỉnh sử dụng từ tiểu não

- roi cerebellum dưới dạng tệp số liệu

[-vol-roi] - voxels để sử dụng

- tập tin số lượng roi

Tính trung bình các hàng nằm trong ROI được chỉ định và viết kết quả
hàng trung bình của một tệp văn bản, được phân tách bằng các dòng mới. Nếu như -cifti-roi được quy định,
-trái-roi, -phải-roi, -tiểu não-roivà -vol-roi không được chỉ định.

-cifti-rois-from-Extrema TẠO BẢN ĐỒ ROI CIFTI TỪ CÁC BẢN ĐỒ CỰC KỲ

wb_command -cifti-rois-from-Extrema

- cifti đầu vào - giới hạn khoảng cách trắc địa từ đỉnh, tính bằng mm
- giới hạn khoảng cách euclid từ tâm voxel, tính bằng mm - cái mà
kích thước một bản đồ cực trị nằm dọc, ROW hoặc COLUMN - đầu ra - đầu ra
thành phố

[-left-surface] - chỉ định bề mặt bên trái để sử dụng

- tệp bề mặt bên trái

[-right-surface] - chỉ định bề mặt phù hợp để sử dụng

- tệp bề mặt bên phải

[-cerebellum-surface] - chỉ định bề mặt tiểu não để sử dụng

- tệp bề mặt tiểu não

[-gaussian] - tạo hạt nhân gaussian thay vì ROI cố định

- sigma cho hạt nhân gaussian bề mặt, tính bằng mm - NS
sigma cho khối lượng hạt nhân gaussian, tính bằng mm

[-overlap-logic] - cách xử lý ROI trùng lặp, CHO PHÉP mặc định

- phương pháp giải quyết chồng chéo

[-merged-volume] - coi các thành phần volume như thể chúng là một

thành phần

Đối với mỗi giá trị khác không trong mỗi bản đồ, hãy tạo bản đồ với ROI xung quanh vị trí đó.
Nếu -ga nga tùy chọn được chỉ định, sau đó các hạt nhân gaussian chuẩn hóa được xuất ra
thay vì ROI. Các tranh luận với -chồng chéo-logic phải là một trong những CHO PHÉP,
CLOSEST hoặc EXCLUDE. ALLOW là mặc định và có nghĩa là ROI được xử lý
độc lập và có thể chồng chéo lên nhau. CLOSEST có nghĩa là ROI không được trùng lặp và điều đó
không có ROI nào chứa các đỉnh gần với một đỉnh mầm khác. EXCLUDE có nghĩa là
ROI không được trùng lặp và bất kỳ đỉnh nào trong phạm vi của nhiều hơn một ROI
không thuộc bất kỳ ROI nào.

-cifti-riêng biệt VIẾT CẤU TRÚC CIFTI NHƯ METRIC, NHÃN HOẶC KHỐI LƯỢNG

wb_command -cifti-riêng biệt

- cifti để tách một thành phần của - hướng nào đến
tách thành các thành phần, ROW hoặc COLUMN

[-volume-all] - tách tất cả các cấu trúc ổ đĩa thành một tệp ổ đĩa

- đầu ra - âm lượng đầu ra

[-roi] - cũng xuất ra roi trong đó voxels có dữ liệu

- đầu ra - âm lượng đầu ra roi

[-label] - xuất ra một tệp nhãn khối lượng cho biết vị trí của

cấu trúc - đầu ra - khối lượng đầu ra nhãn

[-crop] - cắt khối lượng theo kích thước của dữ liệu thay vì sử dụng

kích thước khối lượng ban đầu

[-label] - có thể lặp lại - tách một mô hình bề mặt thành một nhãn bề mặt

tập tin - cấu trúc đầu ra - đầu ra - nhãn đầu ra
hồ sơ

[-roi] - cũng xuất ra roi mà các đỉnh có dữ liệu

- output - chỉ số đầu ra roi

[-metric] - có thể lặp lại - tách một mô hình bề mặt thành một tệp số liệu

- cấu trúc đầu ra - đầu ra - số liệu đầu ra

[-roi] - cũng xuất ra roi mà các đỉnh có dữ liệu

- output - chỉ số đầu ra roi

[-volume] - có thể lặp lại - tách cấu trúc tập thành một tập tin

- cấu trúc đầu ra - đầu ra - âm lượng đầu ra

[-roi] - cũng xuất ra roi trong đó voxels có dữ liệu

- đầu ra - âm lượng đầu ra roi

[-crop] - cắt khối lượng theo kích thước của thành phần thay vì sử dụng

kích thước khối lượng ban đầu

Đối với dtseries, dscalar và dlabel, hãy sử dụng COLUMN cho , và nếu bạn có
dconn đối xứng, COLUMN hiệu quả hơn.

Bạn phải chỉ định ít nhất một trong số -Hệ mét, -khối lượng-tất cả, -âm lượng, hoặc là -nhãn mác cho điều này
lệnh để làm bất cứ điều gì. Khối lượng đầu ra sẽ xếp hàng theo không gian với bản gốc của chúng
vị trí, cho dù chúng có bị cắt xén hay không.

Cho mỗi , sử dụng một trong các chuỗi sau:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID KHÁC OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-làm mịn MỊN MỘT TẬP TIN CIFTI

wb_command -cifti-làm mịn

- cifti đầu vào - sigma cho bề mặt gaussian
làm mịn hạt nhân,

tính bằng mm

- sigma cho hạt nhân làm mịn khối lượng gaussian, trong

mm

- thứ nguyên nào để làm mượt, ROW hoặc COLUMN - đầu ra -
đầu ra cifti

[-left-surface] - chỉ định bề mặt bên trái để sử dụng

- tệp bề mặt bên trái

[-left-Correct-area] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán

chúng từ bề mặt bên trái - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-right-surface] - chỉ định bề mặt phù hợp để sử dụng

- tệp bề mặt bên phải

[-phải-khu vực sửa chữa] - khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán

chúng từ bề mặt bên phải - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-cerebellum-surface] - chỉ định bề mặt tiểu não để sử dụng

- tệp bề mặt tiểu não

[-cerebellum-Corre-Points] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì

tính toán chúng từ bề mặt tiểu não - đỉnh đã sửa
khu vực, như một số liệu

[-cifti-roi] - chỉ mượt mà trong các khu vực quan tâm

- các vùng cần làm mịn bên trong, dưới dạng tệp cifti

[-fix-zeros-volume] - coi các giá trị bằng XNUMX trong volume là dữ liệu bị thiếu

[-fix-zeros-surface] - coi các giá trị của XNUMX trên bề mặt là bị thiếu

dữ liệu

[-merged-volume] - xuyên suốt ranh giới cấu trúc dưới vỏ

Tệp cifti đầu vào phải có ánh xạ mô hình não trên kích thước đã chọn,
cột cho .dtseries và cho .dconn. Theo mặc định, dữ liệu khác
cấu trúc được làm mịn một cách độc lập (tức là, làm mịn "hạn chế thửa đất"), vì vậy
cấu trúc âm lượng chạm vào không mượt mà qua ranh giới này. Chỉ định
-merged-khối lượng để bỏ qua những ranh giới này. Làm mịn bề mặt sử dụng
Phương pháp làm mịn GEO_GAUSS_AREA.

Các tùy chọn - * - vùng đã sửa được dành cho khi không thể tránh khỏi việc làm trơn
nhóm bề mặt trung bình, nó chỉ là một hiệu chỉnh gần đúng để giảm
cấu trúc trong một nhóm bề mặt trung bình. Tốt hơn là làm mịn dữ liệu trên
cá nhân trước khi tính trung bình, khi khả thi.

Sản phẩm -fix-số không-* các tùy chọn sẽ coi các giá trị bằng XNUMX là thiếu dữ liệu và không sử dụng
giá trị đó khi tạo các giá trị được làm mịn, nhưng sẽ điền vào các số không bằng
giá trị ngoại suy. ROI phải có mô hình não ánh xạ dọc theo các cột,
khớp chính xác ánh xạ của hướng đã chọn trong tệp đầu vào. Dữ liệu
bên ngoài ROI bị bỏ qua.

-cifti-thống kê THỐNG KÊ CỘT CIFTI ALONG

wb_command -cifti-thống kê

- cifti đầu vào

[-reduce] - sử dụng phép toán giảm

- hoạt động giảm

[-percentile] - cung cấp giá trị ở một phân vị

- phân vị cần tìm

[-column] - chỉ hiển thị đầu ra cho một cột

- chỉ mục cột (bắt đầu từ 1)

[-roi] - chỉ xem xét dữ liệu bên trong một roi

- roi, dưới dạng tệp cifti

[-match-maps] - mỗi cột đầu vào sử dụng cột tương ứng

từ tệp roi

[-show-map-name] - in chỉ mục và tên cột trước mỗi đầu ra

Đối với mỗi cột của đầu vào, một số duy nhất được in, kết quả là
hoạt động giảm hoặc phân vị được chỉ định. Sử dụng -cột để chỉ cung cấp đầu ra cho một
cột đơn. Sử dụng -roi để chỉ xem xét dữ liệu trong một khu vực. Chính xác là một trong số
-giảm or -phần trăm phải được chỉ định.

Đối số với -giảm tùy chọn phải là một trong những tùy chọn sau:

MAX: giá trị lớn nhất MIN: giá trị nhỏ nhất INDEXMAX: chỉ số dựa trên 1 của
giá trị lớn nhất INDEXMIN: chỉ số dựa trên 1 của giá trị nhỏ nhất SUM: thêm tất cả các giá trị
PRODUCT: nhân tất cả các giá trị MEAN: giá trị trung bình của dữ liệu STDEV: tiêu chuẩn
độ lệch (mẫu số N) SAMPSTDEV: độ lệch chuẩn mẫu (N-1
mẫu số) VARIANCE: phương sai của dữ liệu MEDIAN: giá trị trung bình của dữ liệu
MODE: chế độ của dữ liệu COUNT_NONZERO: số phần tử khác không trong
dữ liệu

-cifti-chuyển vị VẬN CHUYỂN TẬP TIN CIFTI

wb_command -cifti-chuyển vị

- tệp cifti đầu vào - đầu ra - tệp cifti đầu ra

[-mem-limit] - hạn chế sử dụng bộ nhớ

- giới hạn bộ nhớ tính bằng gigabyte

Đầu vào phải là tệp cifti 2 chiều.
Đầu ra là một tệp cifti

trong đó mọi hàng trong đầu vào là một cột trong đầu ra.

-cifti-vector-hoạt động THỰC HIỆN VẬN HÀNH VECTOR TRÊN TỆP CIFTI

wb_command -cifti-vector-hoạt động

- tệp đầu vào vectơ đầu tiên - tệp đầu vào vectơ thứ hai
- thao tác vectơ để làm gì - đầu ra - tệp đầu ra

[-normalize-a] - chuẩn hóa vectơ của đầu vào đầu tiên

[-normalize-b] - chuẩn hóa vectơ của đầu vào thứ hai

[-normalize-output] - chuẩn hóa vectơ đầu ra (không hợp lệ cho dấu chấm

sản phẩm)

[-độ lớn] - xuất ra độ lớn của kết quả (không hợp lệ cho dấu chấm

sản phẩm)

Có hoạt động vectơ trên hai tệp cifti (tệp đó phải có bội số của 3
cột). Một trong các đầu vào có thể có nhiều vectơ (hơn 3 cột),
nhưng không phải cả hai (ít nhất một phải có chính xác 3 cột). Các -kích cỡ và
-chuẩn hóa-đầu ra các tùy chọn có thể không được chỉ định cùng nhau hoặc với một hoạt động
trả về một vô hướng (tích chấm). Các tham số phải là một trong những
Sau đây:

KHOẢN TRÍCH THÊM THÊM CHÉO CHÉO

-cifti-trọng-số liệu thống kê THỐNG KÊ TRỌNG LƯỢNG CŨNG CIFTI

wb_command -cifti-trọng-số liệu thống kê

- cifti đầu vào

[-spatial-weights] - sử dụng diện tích đỉnh và thể tích voxel làm trọng số

[-left-area-Surf] - sử dụng một bề mặt cho các khu vực đỉnh bên trái

- bề mặt bên trái để sử dụng

[-phải-vùng-lướt] - sử dụng bề mặt cho các vùng đỉnh bên phải

- bề mặt phù hợp để sử dụng

[-cerebellum-area-Browse] - sử dụng một bề mặt cho các khu vực đỉnh tiểu não

- bề mặt tiểu não để sử dụng

[-left-area-metric] - sử dụng tệp số liệu cho các khu vực đỉnh bên trái

- tệp số liệu có chứa các vùng đỉnh bên trái

[-right-area-metric] - sử dụng tệp số liệu cho các khu vực đỉnh bên phải

- tệp số liệu có chứa các vùng đỉnh bên phải

[-cerebellum-area-metric] - sử dụng tệp số liệu cho đỉnh tiểu não

khu vực - tệp số liệu chứa đỉnh tiểu não

khu vực

[-cifti-weights] - sử dụng tệp cifti chứa các trọng số

- trọng số để sử dụng, dưới dạng tệp cifti

[-column] - chỉ hiển thị đầu ra cho một cột

- cột để sử dụng (dựa trên 1)

[-roi] - chỉ xem xét dữ liệu bên trong một roi

- roi, dưới dạng tệp cifti

[-match-maps] - mỗi cột đầu vào sử dụng cột tương ứng

từ tệp roi

[-mean] - tính trung bình có trọng số

[-stdev] - tính toán độ lệch chuẩn có trọng số

[-sample] - ước tính stdev dân số từ mẫu

[-percentile] - tính toán phần trăm có trọng số

- phân vị cần tìm

[-sum] - tính tổng có trọng số

[-show-map-name] - in chỉ mục bản đồ và tên trước mỗi đầu ra

Nếu ánh xạ dọc theo cột là mô hình não, thì đối với mỗi cột của đầu vào,
hoạt động cụ thể được thực hiện trên mỗi bề mặt và trên tất cả các voxels, và kết quả
được in riêng. Đối với các loại ánh xạ khác, hoạt động được thực hiện trên mỗi
và một số trên mỗi bản đồ được in. Chính xác là một trong số -không gian-trọng số or
-cifti-trọng lượng phải được chỉ định. Sử dụng -cột chỉ cung cấp đầu ra cho một
cột. Sử dụng -roi để chỉ xem xét dữ liệu trong một khu vực. Chính xác là một trong số -nghĩa là,
-stdev, -phần trăm or -Tổng phải được chỉ định.

Sử dụng -Tổng với -không gian-trọng số (Hoặc với -cifti-trọng lượng và một cifti chứa
trọng số có ý nghĩa tương tự) tương đương với tích phân đối với diện tích và
âm lượng.

-lớp-thêm-thành viên

Thêm thành viên vào tệp tiêu đề lớp (.h) và tệp thực thi (.cxx).

[-add-to-files] [-m ] ...

Nếu -add-to-files không được chỉ định, mã cho tiêu đề và triển khai
các tệp được in ra thiết bị đầu cuối.

Nếu -add-to-files được chỉ định, các tệp lớp dự kiến ​​sẽ nằm trong
thư mục hiện tại và được đặt tên .tay .cxx. Tệp tiêu đề
phải chứa văn bản này trong phần riêng tư của nó:

// THÊM_NEW_MEMBERS_HERE

Tệp triển khai phải chứa văn bản này trong phần công khai của nó:

// THÊM_NEW_METHODS_HERE

Nếu thiếu một trong hai chuỗi văn bản này, mã sẽ được thêm vào
(các) tệp được in ra thiết bị đầu cuối.

Đối với mỗi thành viên, ba chuỗi văn bản được phân tách bằng dấu cách phải được cung cấp và chúng
là tên của thành viên kiểu dữ liệu của nó và mô tả về thành viên đó. Nếu
mô tả chứa khoảng trắng mô tả phải được đặt trong dấu ngoặc kép ("").

Nếu kiểu dữ liệu bắt đầu bằng một chữ cái viết hoa, nó được giả định là tên của một
lớp. Trong trường hợp này, cả bộ lấy const và không phải const được tạo nhưng không phải setter
được tạo ra. Nếu không, kiểu dữ liệu được mong đợi là kiểu nguyên thủy và cả hai
getter và setter được tạo ra. Lưu ý rằng AString và QString được coi là
các loại nguyên thủy.

-class-tạo

Tạo tệp tiêu đề lớp (.h) và tệp thực thi (.cxx).

Sử dụng:

[-copy] [-event-class ] [-event-listening] [-no-parent] [-parent
]

LỰA CHỌN

-bộ soi

Thêm hàm tạo bản sao và toán tử gán

-lớp bảy

Khi tạo lớp con Sự kiện, việc sử dụng tùy chọn này sẽ tự động đặt
lớp cha cho Sự kiện và đặt giá trị kiểu liệt kê sự kiện đã cho vào
tham số cho phương thức khởi tạo lớp Sự kiện.

Cho không cần phải thêm trước nó với "EventTypeEnum ::".

-event-người nghe

Triển khai EventListenerInterface để lớp có thể lắng nghe các sự kiện.

-không có cha mẹ

Lớp được tạo không có nguồn gốc từ bất kỳ lớp nào khác. Theo mặc định, lớp cha là
CaretObject.

-cha mẹ

Chỉ định lớp cha (dẫn xuất từ). Theo mặc định, lớp cha là
CaretObject.

-bối cảnh

Triển khai SceneableInterface để các thể hiện của lớp có thể được khôi phục
từ và lưu vào cảnh.

-cảnh-phân lớp

Thêm các phương thức có thể được gọi bởi lớp cha để lớp con này có thể lưu
và khôi phục dữ liệu đến và từ các cảnh.

Tùy chọn này chỉ nên được sử dụng khi tạo một lớp có siêu lớp triển khai
SceneableInterface

-lớp-tạo-thuật toán

Tạo tệp tiêu đề Lớp thuật toán (.h) và tệp thực thi (.cxx).

Sử dụng:



thuật toán-lớp-tên

Tên bắt buộc của lớp thuật toán PHẢI bắt đầu bằng "Thuật toán"

chuyển đổi dòng lệnh

Chuyển đổi dòng lệnh cần thiết cho thuật toán.

Mô tả ngắn

Mô tả ngắn bắt buộc trong dấu ngoặc kép.

-class-tạo-enum

Tạo tệp tiêu đề kiểu liệt kê (.h) và tệp thực thi (.cxx).

Sử dụng:



tên lớp enum

Tên của kiểu liệt kê.
Phải kết thúc bằng "Enum"

số giá trị

Số lượng giá trị trong kiểu liệt kê.

số tự động

Các mã số nguyên được tạo tự động tương ứng với các giá trị được liệt kê.
Giá trị cho tham số này là "true" và "false".

[enum-name-1] [enum-name-2] ... [enum-name-N]

Tên tùy chọn cho các giá trị được liệt kê.

Nếu số lượng tên được liệt kê nhiều hơn tham số "number-of-value", thì
"number-of-value" sẽ trở thành số lượng tên. Nếu số lượng tên là
ít hơn "number-of-value", các mục nhập trống sẽ được tạo.

-lớp-tạo-hoạt động

Tạo tệp tiêu đề Lớp hoạt động (.h) và tệp thực thi (.cxx).

Sử dụng:

[-không có tham số]

tên-lớp-hoạt động

Tên bắt buộc của lớp hoạt động PHẢI bắt đầu bằng "Hoạt động"

chuyển đổi dòng lệnh

Chuyển đổi dòng lệnh cần thiết để hoạt động.

Mô tả ngắn

Mô tả ngắn bắt buộc trong dấu ngoặc kép.

-không có tham số

Tham số tùy chọn nếu hoạt động không sử dụng tham số.

-chuyển đổi-affine CHUYỂN ĐỔI MỘT TẬP TIN LIÊN QUAN GIỮA CÁC CHUYỂN ĐỔI

wb_command -chuyển đổi-affine

[-from-world] - đầu vào là liên kết NIFTI 'thế giới'

- affine đầu vào

[-from-flirt] - đầu vào là ma trận tán tỉnh

- affine đầu vào - âm lượng nguồn được sử dụng khi tạo
đầu vào

tinh

- khối lượng mục tiêu được sử dụng khi tạo đầu vào

tinh

[-to-world] - ghi đầu ra dưới dạng liên kết NIFTI 'thế giới'

- đầu ra - kết quả đầu ra

[-to-flirt] - có thể lặp lại - ghi đầu ra dưới dạng ma trận tán tỉnh

- đầu ra - kết quả đầu ra - âm lượng bạn muốn
áp dụng biến đổi cho - không gian mục tiêu bạn muốn biến đổi
âm lượng để

phù hợp với

Ma trận thế giới NIFTI có thể được sử dụng trực tiếp trên tọa độ mm thông qua ma trận
phép nhân, họ sử dụng hệ tọa độ NIFTI, nghĩa là, X dương là đúng,
dương Y là trước, và Z dương là cao hơn.

Bạn phải chỉ định chính xác một -từ tùy chọn, nhưng bạn có thể chỉ định nhiều -đến
tùy chọn và bất kỳ -đến tùy chọn lấy số lượng có thể được chỉ định nhiều lần.

-convert-sợi-định hướng CHUYỂN ĐỔI KHỐI LƯỢNG THÔNG SỐ BINGHAM THÀNH FILE ĐỊNH HƯỚNG

wb_command -convert-sợi-định hướng

- khối lượng nhãn cấu trúc cifti - đầu ra - đầu ra
tập tin định hướng sợi

[-fiber] - có thể lặp lại - chỉ định khối lượng tham số cho một sợi

- độ bền sợi trung bình - độ lệch tiêu chuẩn của độ bền sợi
- góc theta - góc phi - góc psi - ka bingham
tham số - tham số kb bingham

Lấy các tham số bingham được tính toán trước từ các tệp khối lượng và chuyển đổi chúng thành
định dạng bàn làm việc sử dụng để hiển thị. Các đối số phải là một nhãn
khối lượng, trong đó các nhãn sử dụng các chuỗi này:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID KHÁC OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-chuyển đổi-ma trận4-sang-ma trận2 TẠO MỘT CIFTI MATRIX2 TỪ MATRIX4 WBSPARSE

wb_command -chuyển đổi-ma trận4-sang-ma trận2

- một tệp wbsparse matrix4 - sản lượng - tổng
số lượng sợi, dưới dạng tệp cifti

[-distances] - khoảng cách quỹ đạo trung bình đầu ra

- đầu ra - khoảng cách, dưới dạng tệp cifti

Lệnh này tạo tệp cifti từ số lượng sợi trong tệp wbsparse ma trận4,
và tùy chọn tệp cifti thứ hai từ các khoảng cách.

-convert-matrix4-to-workbench-thưa thớt CHUYỂN ĐỔI MATRIX3 4-FILE THÀNH FILE SPARSE CÔNG VIỆC

wb_command -convert-matrix4-to-workbench-thưa thớt

- tệp ma trận4 đầu tiên - tệp ma trận1 thứ hai
- tệp ma trận4 thứ ba - tệp .fiberTEMP.nii
tập tin quỹ đạo này được áp dụng

đến

- danh sách các bộ ba chỉ số voxel chất trắng được sử dụng trong

ma trận quỹ đạo

- đầu ra - tệp thưa thớt đầu ra của bàn làm việc

[-surface-seed] - chỉ định không gian hạt bề mặt

- tệp metric roi của tất cả các nút được sử dụng trong không gian hạt giống

[-volume-seed] - chỉ định khối lượng seed space

- tệp cifti để sử dụng ánh xạ khối lượng từ -
thứ nguyên dọc theo tệp cifti để lấy ánh xạ từ,

ROW hoặc COLUMN

Chuyển đổi đầu ra ma trận 4 của probtrackx thành định dạng tệp thưa thớt trên bàn làm việc.
Chính xác là một trong số -surface-seed và -volume-hạt phải được chỉ định.

-convert-warpfield CHUYỂN ĐỔI MỘT CHIẾN TRANH GIỮA CÁC CÔNG ĐOẠN

wb_command -convert-warpfield

[-from-world] - đầu vào là chiến trường NIFTI 'thế giới'

- trường dọc đầu vào

[-from-fnirt] - đầu vào là trường dọc fnirt

- trường dọc đầu vào - âm lượng nguồn được sử dụng khi
tạo đầu vào

chiến trường

[-to-world] - ghi đầu ra dưới dạng trường chiến tranh NIFTI 'thế giới'

- đầu ra - trường dọc đầu ra

[-to-fnirt] - có thể lặp lại - ghi đầu ra dưới dạng trường dọc tán tỉnh

- đầu ra - trường dọc đầu ra - âm lượng bạn muốn
áp dụng warpfield vào

Chiến trường thế giới NIFTI có thể được sử dụng trực tiếp trên tọa độ mm thông qua lấy mẫu
ba nguồn con tại tọa độ và thêm các giá trị được lấy mẫu vào tọa độ
vectơ, chúng sử dụng hệ tọa độ NIFTI, tức là X từ trái sang phải, Y là
sau so với trước, và Z kém hơn so với cấp trên.

LƯU Ý: lệnh này không đảo ngược trường dọc và để làm cong một bề mặt, bạn phải
sử dụng nghịch đảo của trường dọc làm cong khối lượng tương ứng.

Bạn phải chỉ định chính xác một -từ tùy chọn, nhưng bạn có thể chỉ định nhiều -đến
tùy chọn và bất kỳ -đến tùy chọn lấy số lượng có thể được chỉ định nhiều lần.

-create-sign-distance-volume TẠO KHỐI LƯỢNG KHOẢNG CÁCH ĐÃ KÝ TỪ BỀ MẶT

wb_command -create-sign-distance-volume

- bề mặt đầu vào - một âm lượng trong không gian đầu ra mong muốn
(độ mờ, khoảng cách, điểm gốc) - đầu ra - âm lượng đầu ra

[-roi-out] - xuất ra một khối lượng roi trong đó đầu ra có tính toán

giá trị - output - khối lượng roi đầu ra

[-fill-value] - chỉ định một giá trị để đưa vào tất cả các voxels không nhận được

chỉ định một khoảng cách - giá trị cần điền (mặc định là 0)

[-exact-limit] - chỉ định khoảng cách cho đầu ra chính xác

- khoảng cách tính bằng mm (mặc định 5)

[-approx-limit] - chỉ định khoảng cách cho đầu ra gần đúng

- khoảng cách tính bằng mm (mặc định 20)

[-approx-Neighbor] - vùng lân cận voxel để tính toán gần đúng

- kích thước của khối lân cận được đo từ tâm đến mặt, tính bằng

voxels (mặc định 2 = 5x5x5)

[-winding] - phương pháp quấn dây cho thử nghiệm điểm bên trong bề mặt

- tên của phương thức (mặc định EVEN_ODD)

Tính toán hàm khoảng cách đã ký của bề mặt.
Khoảng cách chính xác là

được tính bằng cách tìm điểm gần nhất trên bất kỳ tam giác bề mặt nào với tâm của
voxel. Khoảng cách gần đúng được tính bắt đầu với những khoảng cách này, sử dụng
phương pháp dijkstra với một vùng lân cận của voxels. Chỉ định chính xác quá nhỏ
khoảng cách có thể tạo ra kết quả không mong muốn. Thông số kỹ thuật hợp lệ cho các phương pháp cuộn dây là
như sau:

EVEN_ODD (mặc định) TIÊU CỰC NONZERO BÌNH THƯỜNG

Phương pháp NORMALS sử dụng chuẩn của tam giác và cạnh hoặc tam giác gần nhất
đánh bởi một tia từ điểm. Phương pháp này có thể nhanh hơn một chút, nhưng chỉ
đáng tin cậy đối với một bề mặt đóng kín không xuyên qua chính nó. Tất cả những thứ khác
phương pháp đếm các giao cắt đi vào (dương) và đi ra (tiêu cực) của một tia thẳng đứng từ
điểm, sau đó được tính là bên trong nếu tổng số là số lẻ, âm hoặc khác,
tương ứng.

-estimate-chất xơ-binghams DỰ TOÁN ĐỊNH HƯỚNG PHÂN BỐ ĐỊNH HƯỚNG SỢI TỪ CÁC MẪU BEDPOSTX

wb_command -estimate-chất xơ-binghams

- mẫu độ bền sợi 1 - sợi 1 theta
mẫu - sợi 1 mẫu phi - sợi 1
mẫu sức mạnh - 2 mẫu theta sợi -
sợi 2 mẫu phi - mẫu độ bền sợi 3
- 3 mẫu theta sợi - sợi 3 phi
mẫu - khối lượng nhãn cấu trúc cifti - đầu ra -
xuất ra tệp phân phối sợi cifti

Lệnh này thực hiện ước tính phân phối bingham cho mỗi sợi
định hướng trong mỗi voxel được gắn nhãn định danh cấu trúc. Các nhãn này
đến từ đối số này phải có nhãn phù hợp với
chuỗi sau:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID KHÁC OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-sợi-chấm-sản phẩm CÁC SẢN PHẨM SỢI CẠNH TRANH ĐỊNH HƯỚNG VỚI BỀ MẶT THƯỜNG

wb_command -sợi-chấm-sản phẩm

- bề mặt ranh giới trắng / xám - hướng sợi
tập tin - khoảng cách tối đa từ bất kỳ nút bề mặt nào mà một sợi quang

dân số có thể là, tính bằng mm

- thử nghiệm trên bề mặt để xem liệu quần thể sợi có nên

được dùng

- sản lượng - số liệu của các sản phẩm chấm - đầu ra - một số liệu
của các giá trị f của sự phân bố sợi quang

Đối với mỗi đỉnh, lệnh này tìm tập hợp sợi gần nhất đáp ứng
kiểm tra và tính toán giá trị tuyệt đối của tích số chấm của bề mặt
bình thường và hướng trung bình chuẩn hóa của mỗi sợi. Các kiểm tra phải
là một trong BÊN TRONG, BÊN NGOÀI hoặc BẤT KỲ, điều này khiến lệnh chỉ sử dụng sợi quang
quần thể bên trong bề mặt, bên ngoài bề mặt, hoặc không quan tâm đến
hướng nó là từ bề mặt. Mỗi quần thể sợi được đầu ra trong một
cột số liệu.

-tệp-chuyển đổi THAY ĐỔI PHIÊN BẢN CỦA ĐỊNH DẠNG TẬP TIN

wb_command -tệp-chuyển đổi

[-border-version-convert] - ghi tệp đường viền với một phiên bản khác

- tệp đường viền đầu vào - phiên bản định dạng để viết dưới dạng,
1 hoặc 3 (2 không

hiện hữu)

- đầu ra - tệp đường viền đầu ra

[-surface] - phải được chỉ định nếu đầu vào là phiên bản 1

- sử dụng tệp bề mặt này để biết cấu trúc và số lượng

đỉnh, bỏ qua đường viền trên các cấu trúc khác

[-nifti-version-convert] - ghi tệp nifti với phiên bản khác

- tệp nifti đầu vào - phiên bản nifti để viết là -
đầu ra - tệp nifti đầu ra

[-cifti-version-convert] - ghi tệp cifti với phiên bản khác

- tệp cifti đầu vào - phiên bản cifti để viết là
- đầu ra - tệp cifti đầu ra

Bạn chỉ có thể chỉ định một tùy chọn cấp cao nhất.

-tệp-thông tin DANH SÁCH THÔNG TIN VỀ NỘI DUNG CỦA TẬP TIN

wb_command -tệp-thông tin

- tập tin dữ liệu

[-no-map-info] - không hiển thị thông tin bản đồ cho các tệp hỗ trợ bản đồ

[-chỉ-bước-khoảng thời gian] - tắt đầu ra bình thường, in khoảng thời gian

giữa các bản đồ

[-only-number-of-maps] - chặn đầu ra bình thường, in số lượng bản đồ

[-only-map-names] - chặn đầu ra bình thường, in tên của tất cả các bản đồ

Liệt kê thông tin về nội dung của tệp dữ liệu.
Chỉ có một -chỉ có tùy chọn

có thể được chỉ định.
Thông tin được liệt kê khi không -chỉ có tùy chọn hiện tại

phụ thuộc vào loại tệp dữ liệu.

-foci-get-projector-vertex NHẬN VERTEX DỰ ÁN CHO FOCI

wb_command -foci-get-projector-vertex

- tập tin foci - bề mặt liên quan đến tệp foci
- đầu ra - tệp số liệu đầu ra

[-name] - chọn tiêu điểm theo tên

- tên của tiêu điểm

Đối với mỗi tiêu điểm, một cột được tạo trong và đỉnh có nhiều
ảnh hưởng đến phép chiếu của nó được gán giá trị 1 trong cột đó, với tất cả các giá trị khác
đỉnh 0. Nếu -Tên được sử dụng, chỉ một tiêu điểm sẽ được sử dụng.

-foci-list-coords PHỐI HỢP FOCI ĐẦU RA TRONG TỆP VĂN BẢN

wb_command -foci-list-coords

- tập tin foci đầu vào - đầu ra - tọa độ đầu ra
tập tin văn bản

[-names-out] - xuất tên foci

- đầu ra - tệp văn bản để đặt tên foci vào

Xuất ra tọa độ cho mọi tiêu điểm trong tệp foci và tùy chọn tiêu điểm
tên trong tệp văn bản thứ hai.

-foci-mẫu lại FOCI DỰ ÁN ĐẾN MỘT MẶT BẰNG KHÁC NHAU

wb_command -foci-mẫu lại

- tệp foci đầu vào - đầu ra - tệp foci đầu ra

[-left-surface] - các bề mặt bên trái để lấy mẫu lại

- bề mặt mà các tiêu điểm hiện đang được chiếu lên - NS
bề mặt để chiếu các tiêu điểm lên

[-right-surface] - bề mặt phù hợp để lấy mẫu lại

- bề mặt mà các tiêu điểm hiện đang được chiếu lên - NS
bề mặt để chiếu các tiêu điểm lên

[-cerebellum-surface] - bề mặt tiểu não để lấy mẫu lại

- bề mặt mà các tiêu điểm hiện đang được chiếu lên - NS
bề mặt để chiếu các tiêu điểm lên

[-discard-distance-from-surface] - bỏ qua khoảng cách mà các tiêu điểm ở trên

hoặc dưới bề mặt hiện tại

[-restore-xyz] - đặt tọa độ xyz ban đầu vào foci, thay vì

so với tọa độ thu được từ phép chiếu

Bỏ dự án foci từ cho cấu trúc, sau đó chiếu chúng lên
. Nếu các tiêu điểm có khoảng cách có ý nghĩa trên hoặc dưới bề mặt, hãy sử dụng
các bề mặt giải phẫu. Nếu các tiêu điểm nằm trên bề mặt, hãy sử dụng các hình cầu đã đăng ký
và các tùy chọn -dĩa-khoảng cách-từ-bề mặt và -khôi phục-xyz.

-gifti-all-label-to-rois KIẾM ROIS TỪ TẤT CẢ CÁC NHÃN TRONG MỘT CỘT GIFTI

wb_command -gifti-all-label-to-rois

- tệp nhãn gifti đầu vào - số hoặc tên của bản đồ nhãn
sử dụng - đầu ra - tệp số liệu đầu ra

Tệp số liệu đầu ra có một cột cho mỗi nhãn trong bản đồ đầu vào được chỉ định,
khác hơn ??? nhãn, mỗi nhãn chứa ROI của tất cả các đỉnh là
đặt thành nhãn tương ứng.

-gifti-chuyển đổi Chuyển đổi tệp GIFTI sang mã hóa khác nhau

Sử dụng:



mã hóa gifti

Mã hóa GIFTI bắt buộc.

đầu vào-tập tin quà tặng

Tên tệp GIFTI đầu vào bắt buộc.

ra-gift-file

Tên tệp GIFTI đầu ra bắt buộc.

Mã hóa GIFTI hợp lệ:

ASCII BASE64_BINARY GZIP_BASE64_BINARY EXTERNAL_FILE_BINARY

-gifti-nhãn-thêm-tiền tố THÊM PHỤ LỤC CHO TẤT CẢ CÁC TÊN NHÃN TRONG TỆP NHÃN GIFTI

wb_command -gifti-nhãn-thêm-tiền tố

- tệp nhãn đầu vào - chuỗi tiền tố để thêm -
đầu ra - tệp nhãn đầu ra

Đối với mỗi nhãn không phải là '???', hãy thêm vào trước đến tên nhãn.

-gifti-nhãn-sang-roi ĐẶT NHÃN QUÀ TẶNG VÀO MỘT CHỈ SỐ ROI

wb_command -gifti-nhãn-sang-roi

- tệp nhãn gifti đầu vào - đầu ra - số liệu đầu ra
hồ sơ

[-name] - chọn nhãn theo tên

- tên nhãn mà bạn muốn có

[-key] - chọn nhãn bằng phím

- khóa nhãn mà bạn muốn có

[-map] - chọn một bản đồ nhãn để sử dụng

- số bản đồ hoặc tên

Đối với mỗi bản đồ trong , một bản đồ được tạo ở nơi tất cả các địa điểm
gắn nhãn với hoặc với một chìa khóa của được cho một giá trị là 1 và
tất cả các vị trí khác được cho bằng 0. Chính xác là một trong số -Tên và -Chìa khóa phải được chỉ định.
Chỉ định -bản đồ chỉ sử dụng một bản đồ từ .

-nhãn-giãn ra DILATE MỘT TẬP TIN NHÃN

wb_command -nhãn-giãn ra

- nhãn đầu vào - bề mặt giãn ra -
khoảng cách tính bằng mm để làm giãn nhãn - đầu ra - tệp nhãn đầu ra

[-bad-vertex-roi] - chỉ định một roi của các đỉnh để ghi đè, thay vì

đỉnh có khóa không được gắn nhãn - tệp số liệu, các giá trị dương biểu thị
đỉnh để có

giá trị của họ đã thay thế

[-column] - chọn một cột để giãn ra

- số cột hoặc tên

[-các khu vực điều chỉnh] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán chúng từ

bề mặt - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

Điền thông tin nhãn cho tất cả các đỉnh được chỉ định là xấu, cho đến khi được chỉ định
khoảng cách với các nhãn khác. Nếu như -xấu-đỉnh-roi được chỉ định, tất cả các đỉnh,
kể cả những đỉnh có khóa không được gắn nhãn đều tốt, ngoại trừ những đỉnh có
giá trị dương trong ROI. Nếu nó không được chỉ định, chỉ các đỉnh có
khóa không được gắn nhãn là xấu.

-nhãn-xuất-bảng BẢNG NHÃN XUẤT KHẨU TỪ GIFTI NHƯ VĂN BẢN

wb_command -nhãn-xuất-bảng

- tệp nhãn đầu vào - đầu ra - tệp văn bản đầu ra

Lấy bảng nhãn từ tệp nhãn gifti và ghi nó vào định dạng văn bản
phù hợp với những gì được mong đợi bởi -metric-nhãn-nhập.

-nhãn-mặt nạ MẶT NẠ MỘT TẬP TIN NHÃN

wb_command -nhãn-mặt nạ

- tệp nhãn để che - số liệu mặt nạ - đầu ra -
tệp nhãn đầu ra

[-column] - chọn một cột

- số cột hoặc tên

Theo mặc định, nhãn đầu ra là bản sao của nhãn đầu vào, nhưng với nhãn 'không sử dụng'
gắn nhãn ở bất kỳ nơi nào chỉ số mặt nạ không tích cực. nếu như -cột được chỉ định,
đầu ra chỉ chứa một cột, phiên bản bị che của cột đầu vào được chỉ định.

-nhãn hợp nhất LỌC NHÃN MERGE VÀO TẬP TIN MỚI

wb_command -nhãn hợp nhất

- đầu ra - nhãn đầu ra

[-label] - có thể lặp lại - chỉ định nhãn đầu vào

- một tệp nhãn để sử dụng các cột từ

[-column] - có thể lặp lại - chọn một cột duy nhất để sử dụng

- số cột hoặc tên

[-up-to] - sử dụng một loạt các cột

- số hoặc tên của cột cuối cùng cần bao gồm

[-reverse] - sử dụng phạm vi theo thứ tự ngược lại

Lấy một hoặc nhiều tệp nhãn và tạo tệp nhãn mới bằng cách nối
cột từ chúng. Các tệp đầu vào phải có cùng số đỉnh và
cấu trúc giống nhau.

Ví dụ: wb_command -nhãn hợp nhất out.label.gii -nhãn mác đầu tiên.label.gii -cột 1
-nhãn mác thứ hai.label.gii

Ví dụ này sẽ lấy cột đầu tiên từ first.label.gii và tất cả các cột con
từ second.label.gii và viết những thứ này vào out.label.gii.

-label-repair-key THAY ĐỔI CÁC GIÁ TRỊ CHÍNH TRONG FILE NHÃN

wb_command -label-repair-key

- tệp nhãn đầu vào - tệp văn bản với khóa cũ và mới
giá trị - đầu ra - tệp nhãn đầu ra

[-column] - chọn một cột để sử dụng

- số cột hoặc tên

nên có các dòng có dạng 'oldkey newkey', như sau:

3 5 5 8 8 2

Điều này sẽ thay đổi nhãn hiện tại bằng phím '3' để sử dụng phím '5' thay thế, 5
sẽ sử dụng 8 và 8 sẽ sử dụng 2. Bất kỳ xung đột nào trong các giá trị khóa đều dẫn đến nhãn
mà không được chỉ định trong tệp bản đồ lại được ánh xạ lại thành một
Chìa khóa. Ghép lại nhiều hơn một khóa vào cùng một khóa mới hoặc cùng một khóa cho nhiều hơn
một khóa mới, dẫn đến lỗi. Điều này sẽ không thay đổi giao diện của tệp
khi hiển thị, nó sẽ thay đổi các phím trong dữ liệu cùng một lúc.

-nhãn-mẫu lại VÍ DỤ LẠI MỘT TẬP TIN NHÃN CHO MỘT LỆNH KHÁC

wb_command -nhãn-mẫu lại

- tệp nhãn để lấy mẫu lại - một mặt cầu với
lưới mà tệp nhãn là

hiện tại

- một mặt cầu đăng ký với

và có lưới đầu ra mong muốn

- tên phương thức - đầu ra - tệp nhãn đầu ra

[-area-surfs] - chỉ định bề mặt để thực hiện hiệu chỉnh vùng đỉnh dựa trên

- bề mặt giải phẫu liên quan với

mắt lưới

- bề mặt giải phẫu liên quan với lưới thép

[-area-metrics] - chỉ định số liệu khu vực đỉnh để thực hiện hiệu chỉnh khu vực dựa trên

trên - một tệp số liệu với các khu vực đỉnh cho

mắt lưới

- một tệp số liệu với các khu vực đỉnh cho lưới thép

[-current-roi] - sử dụng một roi đầu vào trên lưới hiện tại để loại trừ dữ liệu không phải

đỉnh - the roi, dưới dạng tệp số liệu

[-valid-roi-out] - xuất ROI của các đỉnh nhận dữ liệu từ hợp lệ

đỉnh nguồn - output - đầu ra roi dưới dạng số liệu

[-largest] - chỉ sử dụng nhãn của đỉnh có trọng số lớn nhất

Ví dụ về một tệp nhãn, cho trước hai bề mặt hình cầu có trong thanh ghi. Nếu
phương pháp thực hiện hiệu chỉnh khu vực, chính xác là một trong số -khu vực-lướt sóng or -area-số liệu phải
được chỉ định.

Sản phẩm -lớn nhất tùy chọn dẫn đến hành vi đỉnh gần nhất khi được sử dụng với BARYCENTRIC,
nó sử dụng giá trị của đỉnh nguồn có trọng số lớn nhất. Khi nào -lớn nhất
không được chỉ định, trọng số đỉnh được tính tổng theo nhãn nào chúng
tương ứng với, và nhãn có tổng lớn nhất được sử dụng.

Các đối số phải là một trong những điều sau:

ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC

Phương pháp ADAP_BARY_AREA được khuyến nghị cho dữ liệu nhãn, vì nó phải
tốt hơn trong việc phân giải các đỉnh gần nhiều nhãn hoặc trong trường hợp
hạ mẫu.

-nhãn-đến-đường viền VẼ NHÃN BIÊN GIỚI

wb_command -nhãn-đến-đường viền

- bề mặt để sử dụng cho thông tin hàng xóm - đầu vào
tệp nhãn - đầu ra - tệp đường viền đầu ra

[-placement] - đặt khoảng cách dọc theo các điểm đường viền cạnh được vẽ

- phần dọc theo cạnh từ đỉnh bên trong (mặc định 0.33)

[-column] - chọn một cột

- số cột hoặc tên

Đối với mỗi nhãn, hãy tìm tất cả các cạnh trên lưới vượt qua ranh giới của nhãn,
và vẽ đường viền qua chúng. Theo mặc định, điều này được thực hiện trên tất cả các cột trong
tệp đầu vào, sử dụng tên bản đồ làm tên lớp cho đường viền.

-metadata-remove-Provenance XÓA THÔNG TIN CUNG CẤP TỪ FILE METADATA

wb_command -metadata-remove-Provenance

- tệp để xóa thông tin xuất xứ khỏi -
đầu ra - tên để lưu tệp đã sửa đổi dưới dạng

Loại bỏ các trường siêu dữ liệu xuất xứ được thêm bởi bàn làm việc trong quá trình xử lý.

-metadata-string-Replace THAY THẾ MỘT DÒNG TRONG TẤT CẢ CÁC SỐ LIỆU CỦA MỘT TẬP TIN

wb_command -metadata-string-Replace

- tệp thay thế siêu dữ liệu trong - chuỗi cần tìm
- chuỗi để thay thế với - đầu ra
- tên để lưu tệp đã sửa đổi thành

[-case-insensitive] - đối sánh với cả biến thể chữ hoa và chữ thường

Thay thế tất cả các lần xuất hiện của trong siêu dữ liệu và tên bản đồ của
với .

-metric-chuyển đổi CHUYỂN ĐỔI TẬP TIN KIM LOẠI THÀNH GIẢ NIFTI

wb_command -metric-chuyển đổi

[-to-nifti] - chuyển đổi số liệu thành nifti

- số liệu để chuyển đổi - đầu ra - tệp nifti đầu ra

[-from-nifti] - chuyển nifti sang hệ mét

- tệp nifti để chuyển đổi - tệp bề mặt để sử dụng số lượng
các nút và cấu trúc từ - đầu ra - tệp số liệu đầu ra

Mục đích của lệnh này là chuyển đổi giữa các tệp số liệu và nifti1 để
Các chương trình không biết gifti có thể hoạt động trên dữ liệu. Bạn phải chỉ định chính xác một trong số
các tùy chọn.

-metric-giãn nở DILATE MỘT TẬP TIN METRIC

wb_command -metric-giãn nở

- số liệu giãn ra - bề mặt để tính toán -
khoảng cách tính bằng mm để giãn ra - đầu ra - số liệu đầu ra

[-bad-vertex-roi] - chỉ định một roi của các đỉnh để ghi đè, thay vì

đỉnh có giá trị bằng không - tệp số liệu, các giá trị dương biểu thị
đỉnh để có

giá trị của họ đã thay thế

[-data-roi] - chỉ định một roi về nơi có dữ liệu

- tệp số liệu, các giá trị dương biểu thị các đỉnh có

dữ liệu

[-column] - chọn một cột để giãn ra

- số cột hoặc tên

[-ne most] - sử dụng giá trị tốt gần nhất thay vì giá trị trung bình có trọng số

[-linear] - điền vào các giá trị bằng phép nội suy tuyến tính dọc mạnh nhất

Gradient

[-exponent] - sử dụng một số mũ khác trong hàm trọng số

- số mũ 'n' để sử dụng trong (khu vực / (khoảng cách ^ n)) làm

chức năng trọng số (mặc định 2)

[-các khu vực điều chỉnh] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán chúng từ

bề mặt - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

Đối với tất cả các đỉnh của chỉ số được chỉ định là xấu, nếu chúng lân cận với một không xấu
đỉnh có dữ liệu hoặc nằm trong khoảng cách xác định của đỉnh như vậy, hãy thay thế
giá trị với giá trị trung bình có trọng số khoảng cách của các đỉnh không xấu lân cận có dữ liệu,
nếu không, hãy đặt giá trị bằng XNUMX. Không có vấn đề nhỏ như thế nào là, sự giãn nở sẽ
luôn sử dụng ít nhất các đỉnh lân cận ngay lập tức. Nếu như -gần nhất được chỉ định, nó
thay vào đó sẽ sử dụng giá trị từ đỉnh không xấu gần nhất với dữ liệu trong phạm vi
của một trung bình có trọng số.

If -xấu-đỉnh-roi được chỉ định, chỉ các đỉnh có giá trị dương trong ROI mới là
tồi tệ. Nếu nó không được chỉ định, chỉ những đỉnh có dữ liệu, với giá trị bằng XNUMX,
là xấu. Nếu như -data-roi không được chỉ định, tất cả các đỉnh được giả định là có dữ liệu.

Lưu ý rằng -các khu vực điều chỉnh tùy chọn sử dụng hiệu chỉnh gần đúng cho thay đổi
trong khoảng cách dọc theo một bề mặt trung bình của nhóm.

-metric-ước tính-fwhm ƯỚC LƯỢNG MỀM MỊN CỦA MỘT TẬP TIN KIM LOẠI

wb_command -metric-ước tính-fwhm

- bề mặt để sử dụng cho thông tin khoảng cách và hàng xóm -
số liệu đầu vào

[-roi] - chỉ sử dụng dữ liệu trong ROI

- tệp số liệu để sử dụng làm ROI

[-column] - chọn một cột duy nhất để ước tính độ mượt mà của

- số cột hoặc tên

Ước tính độ mượt mà của các cột số liệu, in các ước tính theo tiêu chuẩn
đầu ra. Những ước tính này bỏ qua sự thay đổi trong khoảng cách đỉnh.

-metric-Extreme TÌM HIỂU THÊM TRONG TẬP TIN METRIC

wb_command -metric-Extreme

- bề mặt để sử dụng cho thông tin khoảng cách - số liệu để
tìm cực điểm của - khoảng cách tối thiểu giữa các điểm cực trị được xác định của
giống nhau

kiểu

- đầu ra - chỉ số cực trị đầu ra

[-presmooth] - làm mịn số liệu trước khi tìm thấy điểm cực trị

- sigma cho hạt nhân làm mịn gaussian, tính bằng mm

[-roi] - bỏ qua các giá trị bên ngoài vùng đã chọn

- khu vực để tìm điểm cực trị, dưới dạng một số liệu

[-threshold] - bỏ qua điểm cực trị nhỏ

- giá trị lớn nhất được coi là giá trị nhỏ nhất - nhỏ nhất
giá trị để xem xét là giá trị tối đa

[-sum-column] - xuất ra tổng của các cột cực trị thay vì mỗi cột

cột riêng

[-consolidate-mode] - sử dụng hợp nhất cực tiểu cục bộ thay vì một

khu phố lớn

[-only-maxima] - chỉ tìm thấy cực đại

[-only-minima] - chỉ tìm thấy minima

[-column] - chọn một cột để tìm điểm cực trị trong

- số cột hoặc tên

Tìm điểm cực trị trong tệp chỉ số, sao cho không có hai điểm cực trị cùng loại
ở trong của nhau. Các cực trị được dán nhãn là -1 cho cực tiểu, 1 cho
cực đại, 0 nếu không. Nếu như -chỉ-tối đa or -chỉ-cực tiểu được chỉ định, sau đó nó sẽ
bỏ qua cực trị không thuộc loại được chỉ định. Các tùy chọn này loại trừ lẫn nhau.

If -roi được chỉ định, không chỉ dữ liệu bên ngoài roi không được sử dụng, mà bất kỳ đỉnh nào trên
cạnh của ROI sẽ không bao giờ được tính là một cực trị, trong trường hợp ROI cắt giảm
qua một gradient, nếu không sẽ tạo ra cực trị ở nơi cần có
không ai.

If -sum-cột được chỉ định, các cột cực trị này được tính tổng và kết quả đầu ra có
một cột duy nhất với kết quả này.

Theo mặc định, điểm dữ liệu chỉ là điểm cực trị nếu nó là điểm cực trị hơn mọi điểm khác
datapoint nằm trong từ nó. Nếu như -các chế độ cố định được sử dụng, nó
thay vào đó, bắt đầu bằng cách tìm tất cả các điểm dữ liệu cao hơn
hàng xóm, thì mặc dù có bất kỳ thái cực nào bên trong của nhau, lấy
hai điểm cực trị gần nhau nhất và hợp nhất chúng thành một điểm trung bình có trọng số
dựa trên số lượng cực trị ban đầu đã được hợp nhất vào mỗi.

Theo mặc định, tất cả các cột đầu vào được sử dụng mà không làm mịn, sử dụng -cột để chỉ định một
một cột để sử dụng, và -mạch để làm trơn đầu vào trước khi tìm thấy
cực.

-metric-false-tương quan SO SÁNH KHẮC PHỤC TẠI ĐỊA PHƯƠNG VÀ ACROSS / QUA SULCI / GYRI

wb_command -metric-false-tương quan

- bề mặt để tính toán khoảng cách trắc địa và 3D với - NS
chỉ số để tương quan <3D-dist> - khoảng cách 3D tối đa để kiểm tra xung quanh mỗi đỉnh
- khoảng cách trắc địa tối đa để sử dụng cho các vùng lân cận

tương quan

- khoảng cách trắc địa tối thiểu để sử dụng cho các vùng lân cận

tương quan

- đầu ra - số liệu đầu ra

[-roi] - chọn khu vực quan tâm có dữ liệu

- khu vực, dưới dạng tệp số liệu

[-dump-text] - kết xuất các biện pháp thô được sử dụng vào một tệp văn bản

- tệp văn bản đầu ra

Đối với mỗi đỉnh, hãy tính toán mối tương quan trung bình trong một phạm vi của đường trắc địa
khoảng cách không vượt qua một sulcus / gyrus và mối tương quan với gần nhất
đỉnh đi qua một sulcus / gyrus. Một đỉnh được coi là đi qua một sulcus / gyrus nếu
khoảng cách 3D nhỏ hơn một phần ba khoảng cách trắc địa. Tệp đầu ra
chứa tỷ lệ giữa các mối tương quan này và một số bản đồ bổ sung để giúp
giải thích tỷ lệ.

-metric-điền-lỗ ĐIỀN LỖI TRONG MỘT SỐ ROI

wb_command -metric-điền-lỗ

- bề mặt để sử dụng cho thông tin hàng xóm - ROI đầu vào
Hệ mét - đầu ra - chỉ số ROI đầu ra

[-các khu vực điều chỉnh] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán chúng từ

bề mặt - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

Tìm tất cả các khu vực được kết nối không có trong ROI và ghi các khu vực đó vào
tất cả trừ cái lớn nhất, xét về diện tích bề mặt.

-metric-find-cluster BỘ LỌC LỌC THEO KHU VỰC BỀ MẶT

wb_command -metric-find-cluster

- bề mặt để tính toán - số liệu đầu vào
- ngưỡng cho các giá trị dữ liệu - ngưỡng cho
diện tích cụm, tính bằng mm ^ 2 - đầu ra - số liệu đầu ra

[-less-than] - tìm các giá trị nhỏ hơn , còn hơn là

lớn hơn

[-roi] - chọn khu vực quan tâm

- roi, như một thước đo

[-các khu vực điều chỉnh] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán chúng từ

bề mặt - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-column] - chọn một cột

- số cột hoặc tên

[-size-ratio] - bỏ qua các cụm nhỏ hơn một phần cụ thể của

cụm lớn nhất trong bản đồ - phần diện tích của cụm lớn nhất

[-distance] - bỏ qua các cụm xa hơn một khoảng cách nhất định từ

cụm lớn nhất - cách cụm lớn nhất mà một cụm có thể ở bao xa,
cạnh

để cạnh, tính bằng mm

[-start] - bắt đầu gắn nhãn các cụm từ giá trị khác 1

- giá trị cung cấp cho cụm đầu tiên được tìm thấy

Xuất ra một số liệu với các số nguyên khác không cho tất cả các đỉnh trong phạm vi đủ lớn
cụm và các số không ở những nơi khác. Các số nguyên biểu thị thành viên cụm (theo mặc định,
cụm đầu tiên được tìm thấy sẽ sử dụng giá trị 1, cụm thứ hai 2, v.v.). Theo mặc định, các giá trị
lớn hơn được coi là ở trong một cụm, sử dụng -ít hơn đến
kiểm tra các giá trị nhỏ hơn ngưỡng. Để áp dụng điều này làm mặt nạ cho dữ liệu, hoặc
để thực hiện việc tạo ngưỡng phức tạp hơn, hãy xem -đo-toán.

-metric-gradient TỐT NGHIỆP BỀ MẶT CỦA MỘT TẬP TIN KIM LOẠI

wb_command -metric-gradient

- bề mặt để tính toán độ dốc trên - số liệu để
tính toán độ dốc của - đầu ra - độ lớn của gradient

[-presmooth] - làm mượt số liệu trước khi tính toán gradient

- sigma cho hạt nhân làm mịn gaussian, tính bằng mm

[-roi] - chọn một khu vực quan tâm để lấy gradient

- khu vực lấy gradient bên trong, làm thước đo

[-match-cột] - đối với mỗi cột đầu vào, hãy sử dụng cột tương ứng

từ roi

[-vectors] - vectơ gradient đầu ra

- đầu ra - các vectơ dưới dạng tệp số liệu

[-column] - chọn một cột duy nhất để tính độ dốc của

- số cột hoặc tên

[-các khu vực điều chỉnh] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán chúng từ

bề mặt - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-average-normals] - tính trung bình các điểm chuẩn của mỗi đỉnh với

hàng xóm trước khi sử dụng chúng để tính toán gradient

Tại mỗi đỉnh, các lân cận trực tiếp được mở ra trên một mặt phẳng tiếp tuyến với
bề mặt tại đỉnh (cụ thể, vuông góc với pháp tuyến). Gradient là
được tính toán bằng cách sử dụng một hồi quy giữa các vị trí mở ra của các đỉnh và
giá trị của chúng. Sau đó, gradient được cung cấp bởi độ dốc của hồi quy, và
được dựng lại dưới dạng vector gradient 3D. Theo mặc định, lấy gradient của tất cả
các cột, không có giá trị định sẵn, trên toàn bộ bề mặt, mà không tính trung bình
chuẩn mực của bề mặt giữa các nước láng giềng.

Khi đang sử dụng -các khu vực điều chỉnh, lưu ý rằng đó là một hiệu chỉnh gần đúng. Đang làm
Làm mịn trên các bề mặt riêng lẻ trước khi lấy trung bình / độ dốc được ưu tiên, khi
có thể, để tận dụng cấu trúc bề mặt ban đầu.

Việc chỉ định ROI sẽ hạn chế gradient chỉ sử dụng dữ liệu từ ROI
số liệu là số dương và số không đầu ra ở bất kỳ vị trí nào mà chỉ số ROI không dương.

Theo mặc định, cột đầu tiên của chỉ số roi được sử dụng cho tất cả các cột đầu vào. Khi nào
-match-cột được chỉ định cho -roi tùy chọn, các chỉ số đầu vào và roi phải có
cùng một số cột và đối với chỉ mục của mỗi cột đầu vào, cùng một cột
chỉ mục được sử dụng trong số liệu roi. Nếu -match-cột tùy chọn để -roi được sử dụng
trong khi -cột tùy chọn cũng được sử dụng, số lượng cột của chỉ số roi phải
khớp với số liệu đầu vào và nó sẽ sử dụng cột roi với chỉ số của
cột đầu vào đã chọn.

Số liệu đầu ra vectơ được tổ chức sao cho các thành phần X, Y và Z từ một
cột đầu vào đơn là các cột liên tiếp.

-metric-nhãn-nhập NHẬP FILE NHÃN HÀNG GIFTI TỪ FILE METRIC

wb_command -metric-nhãn-nhập

- tệp số liệu đầu vào - tệp văn bản chứa các giá trị
và tên cho các nhãn - đầu ra - tệp nhãn gifti đầu ra

[-discard-others] - đặt bất kỳ giá trị nào không được đề cập trong danh sách nhãn thành

??? nhãn mác

[-unlabeled-value] - đặt giá trị sẽ được hiểu là không được gắn nhãn

- giá trị số cho không được gắn nhãn (mặc định là 0)

[-column] - chọn một cột để nhập

- số cột hoặc tên

[-drop-used-label] - xóa mọi giá trị nhãn không sử dụng khỏi nhãn

bàn

Tạo tệp nhãn gifti mới từ tệp số liệu có các giá trị giống nhãn. Bạn có thể
chỉ định chuỗi trống ('' sẽ hoạt động trên linux / mac) cho , cái mà
sẽ được xử lý như thể nó là một tệp trống. Tệp danh sách nhãn phải có các dòng
định dạng sau:



Không chỉ định khóa "không được gắn nhãn" trong tệp, giả định rằng 0 có nghĩa là không
được dán nhãn trừ khi -giá trị không được gắn nhãn được quy định. Tên nhãn phải nằm riêng biệt
dòng, nhưng có thể chứa khoảng trắng hoặc các ký tự bất thường khác (nhưng không phải dòng mới).
Khoảng trắng được cắt bớt từ cả hai đầu của tên nhãn, nhưng được giữ lại nếu nó nằm trong
giữa nhãn. Các giá trị của màu đỏ, xanh lục, xanh lam và alpha phải là các số nguyên từ
0 đến 255 và sẽ chỉ định màu mà nhãn được vẽ (alpha của 255 có nghĩa là
mờ đục, đó có thể là những gì bạn muốn). Theo mặc định, nó sẽ đặt tên nhãn mới
với tên LABEL_ # cho bất kỳ giá trị nào gặp phải không được đề cập trong danh sách
tập tin, chỉ định -đĩa-những người khác thay vào đó, đặt các voxels này thành khóa "unlabeled".

-metric-mặt nạ MẶT NẠ MỘT TẬP TIN KIM LOẠI

wb_command -metric-mặt nạ

- số liệu đầu vào - số liệu mặt nạ - đầu ra - cái
số liệu đầu ra

[-column] - chọn một cột

- số cột hoặc tên

Theo mặc định, số liệu đầu ra là bản sao của số liệu đầu vào, nhưng với số không
bất cứ nơi nào số liệu mặt nạ không tích cực. nếu như -cột được chỉ định, đầu ra
chỉ chứa một cột, phiên bản bị che của cột đầu vào được chỉ định.

-đo-toán ĐÁNH GIÁ THỂ HIỆN TRÊN LỌC KIM LOẠI

wb_command -đo-toán

- biểu thức để đánh giá, trong dấu ngoặc kép - đầu ra - cái
số liệu đầu ra

[-fixnan] - thay thế kết quả NaN bằng một giá trị

- giá trị để thay thế NaN bằng

[-var] - có thể lặp lại - số liệu để sử dụng làm biến

- tên của biến, như được sử dụng trong biểu thức - số liệu
tệp để sử dụng làm biến này

[-column] - chọn một cột

- số cột hoặc tên

[-repeat] - sử dụng lại một cột duy nhất cho mỗi cột tính toán

Lệnh này đánh giá tại mỗi đỉnh bề mặt một cách độc lập. Ở đó
phải có ít nhất một -var tùy chọn (để lấy cấu trúc, số lượng đỉnh và
số cột từ), ngay cả khi được chỉ định trong nó không được sử dụng trong
. Tất cả các chỉ số phải có cùng số đỉnh. Tên tệp là
không hợp lệ trong , sử dụng một tên biến và một -var tùy chọn với sự phù hợp
để chỉ định một tệp đầu vào. Nếu -cột tùy chọn được cung cấp cho bất kỳ -var
tùy chọn, chỉ một cột được sử dụng từ tệp đó. Nếu như -lặp lại được chỉ định, tệp
phải chỉ có một cột hoặc có -cột tùy chọn được chỉ định. Tất cả các tệp
cái đó không sử dụng -lặp lại phải có cùng số cột được yêu cầu để được sử dụng.
Định dạng của là như sau:

Biểu thức bao gồm hằng số, biến, toán tử, dấu ngoặc đơn và hàm,
trong ký hiệu infix, chẳng hạn như 'exp (-x + 3) * thang đo '. Các biến là các chuỗi bất kỳ
chiều dài, sử dụng các ký tự az, AZ, 0-9 và _, nhưng không được lấy tên của
được đặt tên là hằng số. Hiện tại, chỉ có một hằng số được đặt tên là PI. Các nhà điều hành
là +, -, *, /, ^,>, <,> =, <=, ==,! =,!, &&, ||. Chúng hoạt động như trong C, ngoại trừ
^ đó là lũy thừa, tức là pow (x, y) và có mức độ ưu tiên cao hơn
toán tử nhị phân (cũng có, '-3 ^ -4 ^ -5' có nghĩa là '- (3 ^ (- (4 ^ -5)))'). Dấu <=,> =, ==, và! =
các nhà khai thác được cung cấp một lượng nhỏ không gian lung lay, bằng một phần triệu
nhỏ hơn giá trị tuyệt đối của các giá trị được so sánh.

Các toán tử so sánh và logic trả về 0 hoặc 1, bạn có thể thực hiện việc tạo mặt nạ với các biểu thức
như 'x * (mặt nạ> 0)'. Đối với tất cả các toán tử logic, một đầu vào được coi là true iff
nó lớn hơn 0. Biểu thức '0 <x <5' không sai về mặt cú pháp, nhưng
nó sẽ KHÔNG làm những gì mong muốn, bởi vì nó được đánh giá từ trái sang phải, tức là '((0
x) <5) ', sẽ luôn trả về 1, vì cả hai kết quả có thể có của phép so sánh là
nhỏ hơn 5. Một cảnh báo sẽ được tạo ra nếu một biểu hiện thuộc loại này được phát hiện.
Sử dụng một cái gì đó như 'x> 0 && x <5' để có được hành vi mong muốn.

Khoảng trắng giữa các phần tử bị bỏ qua, 'sin (2 * x)' tương đương với
'sin (2 * x)', nhưng 's trong (2 * x)' là một lỗi. Phép nhân ngụ ý không được phép,
biểu thức '2x' sẽ được phân tích cú pháp như một biến. Dấu ngoặc đơn là (), không sử dụng
[] hoặc {}. Các hàm yêu cầu dấu ngoặc đơn, biểu thức 'sin x' là một lỗi.

Các chức năng sau được hỗ trợ:

sin: 1 đối số, sin của đối số (đơn vị là radian) cos: 1 đối số,
cosine của đối số (đơn vị là radian) tan: 1 đối số, tiếp tuyến của
đối số (đơn vị là radian) asin: 1 đối số, nghịch đảo của sin của đối số,
tính bằng radian acos: 1 đối số, nghịch đảo của cosine của đối số, tính bằng radian
đối số atan: 1, nghịch đảo của tiếp tuyến của đối số, tính bằng radian atan2: 2
đối số, atan2 (y, x) trả về nghịch đảo của tiếp tuyến của

(y / x), tính bằng radian, xác định góc phần tư bằng dấu của cả hai đối số

sinh: 1 đối số, sin hyperbol của đối số cosh: 1 đối số,
cosin hyperbol của đối số tanh: 1 đối số, tiếp tuyến hyperboloc của đối số
đối số asinh: 1 đối số, sin hyperbol nghịch đảo của đối số acosh: 1
đối số, cosin hyperbol nghịch đảo của đối số atanh: 1 đối số,
tiếp tuyến hyperboloc nghịch đảo của đối số ln: 1, logarit tự nhiên của
đối số exp: 1 đối số, hằng số e nâng lên thành sức mạnh của đối số
log: 1 đối số, logarit cơ số 10 của đối số sqrt: 1 đối số, bình phương
gốc của đối số abs: 1 đối số, giá trị tuyệt đối của tầng đối số: 1
đối số, số nguyên lớn nhất không lớn hơn vòng đối số: 1 đối số,
số nguyên gần nhất, với các mối quan hệ được làm tròn đi từ

không

ceil: 1 đối số, số nguyên nhỏ nhất không nhỏ hơn đối số min: 2 đối số,
min (x, y) trả về y nếu (x> y), x nếu không thì max: 2 đối số, max (x, y) trả về y
if (x <y), x nếu không thì mod: 2 đối số, mod (x, y) = x - y * tầng (x / y) hoặc 0 nếu
y == 0 kẹp: 3 đối số, kẹp (x, thấp, cao) = tối thiểu (tối đa (x, thấp), cao)

-metric-hợp nhất MERGE METRIC LỌC VÀO TẬP TIN MỚI

wb_command -metric-hợp nhất

- đầu ra - số liệu đầu ra

[-metric] - có thể lặp lại - chỉ định một số liệu đầu vào

- một tệp số liệu để sử dụng các cột từ

[-column] - có thể lặp lại - chọn một cột duy nhất để sử dụng

- số cột hoặc tên

[-up-to] - sử dụng một loạt các cột

- số hoặc tên của cột cuối cùng cần bao gồm

[-reverse] - sử dụng phạm vi theo thứ tự ngược lại

Lấy một hoặc nhiều tệp chỉ số và tạo một tệp chỉ số mới bằng cách nối
cột từ chúng. Các tệp chỉ số đầu vào phải có cùng số đỉnh
và cấu trúc giống nhau.

Ví dụ: wb_command -metric-hợp nhất out.func.gii -Hệ mét đầu tiên.func.gii -cột 1
-Hệ mét thứ hai.func.gii

Ví dụ này sẽ lấy cột đầu tiên từ first.func.gii, theo sau là tất cả
các cột từ second.func.gii và viết các cột này thành out.func.gii.

-metric-bảng màu THIẾT LẬP PALETTE CỦA MỘT TẬP TIN KIM LOẠI

wb_command -metric-bảng màu

- số liệu để sửa đổi - chế độ lập bản đồ

[-column] - chọn một cột

- số cột hoặc tên

[-pos-phần trăm] - phần trăm tối thiểu / tối đa để tô màu dữ liệu dương

- phần trăm cho dữ liệu ít tích cực nhất - NS
phân vị cho dữ liệu tích cực nhất

[-neg-phần trăm] - phần trăm tối thiểu / tối đa cho màu dữ liệu âm

- phần trăm cho dữ liệu tiêu cực nhất - NS
phân vị cho dữ liệu tiêu cực nhất

[-pos-user] - giá trị tối thiểu / tối đa của người dùng để tô màu dữ liệu dương

- giá trị cho dữ liệu ít tích cực nhất - giá trị
cho dữ liệu tích cực nhất

[-neg-user] - giá trị tối thiểu / tối đa của người dùng để tô màu dữ liệu phủ định

- giá trị cho dữ liệu âm ít nhất - giá trị
cho dữ liệu tiêu cực nhất

[-interpolate] - nội suy màu

- boolean, có nội suy không

[-disp-pos] - hiển thị dữ liệu tích cực

- boolean, có hiển thị không

[-disp-neg] - hiển thị dữ liệu tích cực

- boolean, có hiển thị không

[-disp-zero] - hiển thị dữ liệu gần bằng XNUMX hơn ngưỡng giới hạn tối thiểu

- boolean, có hiển thị không

[-palette-name] - đặt bảng màu được sử dụng

- tên của bảng màu

[-thresholding] - đặt ngưỡng

- cài đặt ngưỡng - hiển thị các giá trị bên trong hoặc bên ngoài ngưỡng
- ngưỡng cửa thấp hơn - ngưỡng trên

Tệp số liệu ban đầu được ghi đè bằng phiên bản đã sửa đổi.
By

mặc định, tất cả các cột của tệp số liệu được điều chỉnh theo cài đặt mới, hãy sử dụng
-cột tùy chọn để thay đổi chỉ một cột. Cài đặt ánh xạ không được chỉ định trong
các tùy chọn sẽ được lấy từ cột đầu tiên. Các đối số phải là một trong những
sau đây:

MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE

Các tranh luận với -bảng-tên phải là một trong những điều sau:

PSYCH PSYCH-NO-NONE ROY-BIG ROY-BIG-BL Màu cam-vàng xám_Interp_Positive
Gray_Interp clear_brain videoen_style fidl raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG đỏ-vàng xanh lam-ánh sáng xanh FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_blue fsl_vàng JET256

Các tranh luận với -ngưỡng phải là một trong những điều sau:

THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL

Các tranh luận với -ngưỡng phải là một trong những điều sau:

THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE

-metric-giảm GIẢM HIỆU SUẤT VẬN HÀNH ACROSS METRIC COLUMNS

wb_command -metric-giảm

- số liệu cần giảm - toán tử giảm để sử dụng
- đầu ra - số liệu đầu ra

[-exclude-outceptions] - loại trừ các ngoại lệ khỏi mỗi vectơ theo tiêu chuẩn

lệch lạc - số độ lệch chuẩn dưới mức trung bình để

bao gồm

- số độ lệch chuẩn trên mức trung bình để

bao gồm

Đối với mỗi đỉnh bề mặt, lấy dữ liệu trên các cột dưới dạng vectơ và thực hiện
mức giảm được chỉ định trên nó, đưa kết quả vào cột đầu ra duy nhất tại
đỉnh đó. Các toán tử giảm như sau:

MAX: giá trị lớn nhất MIN: giá trị nhỏ nhất INDEXMAX: chỉ số dựa trên 1 của
giá trị lớn nhất INDEXMIN: chỉ số dựa trên 1 của giá trị nhỏ nhất SUM: thêm tất cả các giá trị
PRODUCT: nhân tất cả các giá trị MEAN: giá trị trung bình của dữ liệu STDEV: tiêu chuẩn
độ lệch (mẫu số N) SAMPSTDEV: độ lệch chuẩn mẫu (N-1
mẫu số) VARIANCE: phương sai của dữ liệu MEDIAN: giá trị trung bình của dữ liệu
MODE: chế độ của dữ liệu COUNT_NONZERO: số phần tử khác không trong
dữ liệu

-metric-hồi quy CÁC CHỈ SỐ ĐỊA LÝ NGOÀI TỆP KIM LOẠI

wb_command -metric-hồi quy

- số liệu để hồi quy - đầu ra - số liệu đầu ra

[-roi] - chỉ hồi quy bên trong một roi

- khu vực sử dụng để hồi quy, làm thước đo

[-column] - chọn một cột duy nhất để hồi quy

- số cột hoặc tên

[-remove] - có thể lặp lại - chỉ định một số liệu để hồi quy

- tệp số liệu để sử dụng

[-remove-column] - chọn một cột để sử dụng, thay vì tất cả

- số cột hoặc tên

[-keep] - có thể lặp lại - chỉ định một số liệu để đưa vào hồi quy, nhưng không

tẩy - tệp số liệu để sử dụng

[-keep-column] - chọn một cột để sử dụng, thay vì tất cả

- số cột hoặc tên

Đối với mỗi bộ hồi quy, giá trị trung bình trên bề mặt của nó được trừ khỏi dữ liệu của nó. Mỗi
bản đồ đầu vào sau đó được hồi quy đối với những điều này và một số hạng không đổi. Kết quả
độ dốc hồi quy của tất cả các bộ hồi quy được chỉ định với -tẩy được nhân lên với
các bản đồ hồi quy tương ứng, và chúng được trừ khỏi bản đồ đầu vào.

-metric-remove-island XÓA ĐẢO khỏi AN ROI METRIC

wb_command -metric-remove-island

- bề mặt để sử dụng cho thông tin hàng xóm - ROI đầu vào
Hệ mét - đầu ra - chỉ số ROI đầu ra

[-các khu vực điều chỉnh] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán chúng từ

bề mặt - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

Tìm tất cả các khu vực được kết nối trong ROI và số không tất cả trừ khu vực lớn nhất, trong
điều kiện về diện tích bề mặt.

-mẫu lại số liệu VÍ DỤ MỘT TẬP TIN KIM LOẠI CHO MỘT MẶT LƯỚI KHÁC NHAU

wb_command -mẫu lại số liệu

- tệp số liệu để lấy lại mẫu - một mặt cầu với
lưới mà chỉ số đó là

hiện tại

- một mặt cầu đăng ký với

và có lưới đầu ra mong muốn

- tên phương thức - đầu ra - số liệu đầu ra

[-area-surfs] - chỉ định bề mặt để thực hiện hiệu chỉnh vùng đỉnh dựa trên

- bề mặt giải phẫu liên quan với

mắt lưới

- bề mặt giải phẫu liên quan với lưới thép

[-area-metrics] - chỉ định số liệu khu vực đỉnh để thực hiện hiệu chỉnh khu vực dựa trên

trên - một tệp số liệu với các khu vực đỉnh cho

mắt lưới

- một tệp số liệu với các khu vực đỉnh cho lưới thép

[-current-roi] - sử dụng một roi đầu vào trên lưới hiện tại để loại trừ dữ liệu không phải

đỉnh - the roi, dưới dạng tệp số liệu

[-valid-roi-out] - xuất ROI của các đỉnh nhận dữ liệu từ hợp lệ

đỉnh nguồn - output - đầu ra roi dưới dạng số liệu

[-largest] - chỉ sử dụng giá trị của đỉnh có trọng số lớn nhất

Ví dụ về một tệp số liệu, cho trước hai bề mặt hình cầu được đăng ký. Nếu
phương pháp thực hiện hiệu chỉnh khu vực, chính xác là một trong số -khu vực-lướt sóng or -area-số liệu phải
được chỉ định.

Sản phẩm -hiện-roi tùy chọn chỉ che đầu vào, đầu ra có thể bị giãn ra một chút trong
so sánh, cân nhắc sử dụng -metric-mặt nạ trên đầu ra khi sử dụng -hiện-roi.

Sản phẩm -lớn nhất tùy chọn dẫn đến hành vi đỉnh gần nhất khi được sử dụng với BARYCENTRIC,
thay vì thực hiện giá trị trung bình có trọng số, nó sử dụng giá trị của đỉnh nguồn mà
có trọng số lớn nhất cho mỗi đỉnh mục tiêu. Điều này chủ yếu dành cho
lấy mẫu lại các chỉ số ROI.

Các đối số phải là một trong những điều sau:

ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC

Phương pháp ADAP_BARY_AREA được khuyến nghị cho dữ liệu chỉ số thông thường, vì nó
nên sử dụng tất cả dữ liệu trong khi lấy mẫu xuống, không giống như BARYCENTRIC.

-metric-rois-from-Extrema TẠO BẢN ĐỒ ROI METRIC TỪ CÁC BẢN ĐỒ CỰC KỲ

wb_command -metric-rois-from-Extrema

- bề mặt sử dụng cho khoảng cách trắc địa - số liệu đầu vào
tập tin - giới hạn khoảng cách trắc địa từ đỉnh, tính bằng mm - đầu ra -
tệp số liệu đầu ra

[-gaussian] - tạo hạt nhân gaussian thay vì ROI phẳng

- sigma cho hạt nhân gaussian, tính bằng mm

[-roi] - chọn khu vực quan tâm để sử dụng

- khu vực sử dụng, làm thước đo

[-overlap-logic] - cách xử lý ROI trùng lặp, CHO PHÉP mặc định

- phương pháp giải quyết chồng chéo

[-column] - chọn một cột đầu vào duy nhất để sử dụng

- số cột hoặc tên

Đối với mỗi giá trị khác không trong mỗi bản đồ, hãy tạo bản đồ với ROI xung quanh vị trí đó.
Nếu -ga nga tùy chọn được chỉ định, sau đó các hạt nhân gaussian chuẩn hóa được xuất ra
thay vì ROI. Các tranh luận với -chồng chéo-logic phải là một trong những CHO PHÉP,
CLOSEST hoặc EXCLUDE. ALLOW là mặc định và có nghĩa là ROI được xử lý
độc lập và có thể chồng chéo lên nhau. CLOSEST có nghĩa là ROI không được trùng lặp và điều đó
không có ROI nào chứa các đỉnh gần với một đỉnh mầm khác. EXCLUDE có nghĩa là
ROI không được trùng lặp và bất kỳ đỉnh nào trong phạm vi của nhiều hơn một ROI
không thuộc bất kỳ ROI nào.

-metric-rois-to-biên giới VẼ BIÊN GIỚI AROUND METRIC ROIS

wb_command -metric-rois-to-biên giới

- bề mặt để sử dụng cho thông tin hàng xóm - số liệu đầu vào
chứa ROI - tên để sử dụng cho lớp của các đường viền đầu ra
- đầu ra - tệp đường viền đầu ra

[-placement] - đặt khoảng cách dọc theo các điểm đường viền cạnh được vẽ

- phần dọc theo cạnh từ đỉnh bên trong (mặc định 0.33)

[-column] - chọn một cột

- số cột hoặc tên

Đối với mỗi cột ROI, hãy tìm tất cả các cạnh trên lưới vượt qua ranh giới của
ROI và vẽ đường viền qua chúng. Theo mặc định, điều này được thực hiện trên tất cả các cột trong
tệp đầu vào, sử dụng tên bản đồ làm tên cho đường viền.

-metric-làm mịn HÚT MỌI TẬP TIN KIM LOẠI

wb_command -metric-làm mịn

- bề mặt nhẵn - số liệu để làm trơn
- sigma cho hàm nhân gaussian, tính bằng mm
- đầu ra - số liệu đầu ra

[-roi] - chọn một khu vực quan tâm để làm mượt

- roi để làm trơn bên trong, như một thước đo

[-match-cột] - đối với mỗi cột đầu vào, hãy sử dụng cột tương ứng

từ roi

[-fix-zeros] - coi các giá trị XNUMX không phải là dữ liệu

[-column] - chọn một cột để làm mịn

- số cột hoặc tên

[-các khu vực điều chỉnh] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán chúng từ

bề mặt - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

[-method] - chọn phương pháp làm mịn, mặc định GEO_GAUSS_AREA

- tên của phương pháp làm mịn

Làm mịn tệp số liệu trên bề mặt.
Theo mặc định, làm trơn tất cả các cột đầu vào

trên toàn bộ bề mặt, chỉ định -cột chỉ sử dụng một cột đầu vào và -roi đến
mượt mà chỉ khi số liệu roi lớn hơn 0, xuất ra các số không ở nơi khác.

Khi đang sử dụng -roi, dữ liệu đầu vào bên ngoài ROI không được sử dụng để tính toán
các giá trị. Theo mặc định, cột đầu tiên của chỉ số roi được sử dụng cho tất cả đầu vào
cột. Khi nào -match-cột được chỉ định cho -roi tùy chọn, đầu vào và roi
các chỉ số phải có cùng số cột và đối với chỉ số của mỗi cột đầu vào,
cùng một chỉ mục cột được sử dụng trong chỉ số roi. Nếu -match-cột tùy chọn để
-roi được sử dụng trong khi -cột tùy chọn cũng được sử dụng, số lượng cột phải
khớp giữa chỉ số roi và đầu vào, và nó sẽ sử dụng cột roi với
chỉ mục của cột đầu vào đã chọn.

Sản phẩm -fix-số không tùy chọn khiến quá trình làm mịn không sử dụng giá trị đầu vào nếu nó bằng XNUMX,
nhưng vẫn ghi một giá trị được làm mịn vào đỉnh. Điều này hữu ích cho các số không
chỉ ra sự thiếu thông tin, ngăn họ làm giảm cường độ của
các đỉnh lân cận, trong khi cung cấp giá trị ngoại suy cho giá trị XNUMX.

Sản phẩm -các khu vực điều chỉnh tùy chọn được dành cho khi không thể tránh khỏi việc làm trơn
bề mặt trung bình của nhóm, nó chỉ là một hiệu chỉnh gần đúng để giảm
cấu trúc trong một nhóm bề mặt trung bình. Tốt hơn là làm mịn dữ liệu trên
cá nhân trước khi tính trung bình, khi khả thi.

Giá trị hợp lệ cho là:

GEO_GAUSS_AREA - sử dụng nhân gaussian trắc địa và chuẩn hóa dựa trên đỉnh
khu vực để làm việc đáng tin cậy hơn trên các bề mặt không đều

GEO_GAUSS_EQUAL - sử dụng hạt nhân gaussian trắc địa và chuẩn hóa giả sử mỗi
đỉnh có tầm quan trọng ngang nhau

GEO_GAUSS - phù hợp với làm mịn gaussian trắc địa từ caret5, nhưng không kiểm tra
hạt nhân vì có tầm quan trọng không bằng nhau

Phương thức GEO_GAUSS_AREA là mặc định vì nó thường là lựa chọn chính xác.
GEO_GAUSS_EQUAL có thể là lựa chọn chính xác khi tổng các giá trị đỉnh nhiều hơn
có ý nghĩa thì tích phân bề mặt (tổng các giá trị. * diện tích), ví dụ khi
làm mịn các vùng đỉnh (tổng là tổng diện tích bề mặt, trong khi bề mặt
tích phân là tổng bình phương của các diện tích đỉnh). Phương pháp GEO_GAUSS không
được khuyến nghị, nó tồn tại chủ yếu để sao chép các phương pháp nghiên cứu được thực hiện với caret5's
làm trơn trắc địa.

-số liệu thống kê THỐNG KÊ THỂ TÍCH TRÊN TẬP TIN KIM LOẠI

wb_command -số liệu thống kê

- số liệu đầu vào

[-reduce] - sử dụng phép toán giảm

- hoạt động giảm

[-percentile] - cung cấp giá trị ở một phân vị

- phân vị cần tìm

[-column] - chỉ hiển thị đầu ra cho một cột

- số cột hoặc tên

[-roi] - chỉ xem xét dữ liệu bên trong một roi

- the roi, dưới dạng tệp số liệu

[-match-maps] - mỗi cột đầu vào sử dụng cột tương ứng

từ tệp roi

[-show-map-name] - in chỉ mục bản đồ và tên trước mỗi đầu ra

Đối với mỗi cột của đầu vào, một số duy nhất được in, kết quả là
hoạt động giảm hoặc phân vị được chỉ định. Sử dụng -cột để chỉ cung cấp đầu ra cho một
cột đơn. Sử dụng -roi để chỉ xem xét dữ liệu trong một khu vực. Chính xác là một trong số
-giảm or -phần trăm phải được chỉ định.

Đối số với -giảm tùy chọn phải là một trong những tùy chọn sau:

MAX: giá trị lớn nhất MIN: giá trị nhỏ nhất INDEXMAX: chỉ số dựa trên 1 của
giá trị lớn nhất INDEXMIN: chỉ số dựa trên 1 của giá trị nhỏ nhất SUM: thêm tất cả các giá trị
PRODUCT: nhân tất cả các giá trị MEAN: giá trị trung bình của dữ liệu STDEV: tiêu chuẩn
độ lệch (mẫu số N) SAMPSTDEV: độ lệch chuẩn mẫu (N-1
mẫu số) VARIANCE: phương sai của dữ liệu MEDIAN: giá trị trung bình của dữ liệu
MODE: chế độ của dữ liệu COUNT_NONZERO: số phần tử khác không trong
dữ liệu

-metric-tfce LÀM TFCE TRÊN MỘT TẬP TIN KIM LOẠI

wb_command -metric-tfce

- bề mặt để tính toán - số liệu để chạy TFCE trên
- đầu ra - số liệu đầu ra

[-presmooth] - làm mượt số liệu trước khi chạy TFCE

- sigma cho hạt nhân làm mịn gaussian, tính bằng mm

[-roi] - chọn một khu vực quan tâm để chạy TFCE trên

- khu vực để chạy TFCE, như một số liệu

[-parameters] - đặt tham số cho tích phân TFCE

- số mũ cho khu vực cụm (mặc định 1.0) - số mũ cho giá trị ngưỡng
(mặc định 2.0)

[-column] - chọn một cột

- số cột hoặc tên

[-các khu vực điều chỉnh] - các khu vực đỉnh để sử dụng thay vì tính toán chúng từ

bề mặt - các khu vực đỉnh đã sửa, dưới dạng một số liệu

Nâng cao cụm không có ngưỡng là một phương pháp để tăng giá trị tương đối của
các vùng sẽ tạo thành các cụm trong một bài kiểm tra ngưỡng tiêu chuẩn. Đây là
được thực hiện bằng cách đánh giá tích phân của:

e (h, p) ^ E * h ^ H * dh

tại mỗi đỉnh p, trong đó h nằm trong khoảng từ 0 đến giá trị lớn nhất trong dữ liệu và e (h,
p) là phạm vi của cụm chứa đỉnh p ở ngưỡng h. Phủ định
các giá trị được nâng cao tương tự bằng cách phủ định dữ liệu, chạy cùng một quy trình và
phủ định kết quả.

Khi đang sử dụng -mạch với -các khu vực điều chỉnh, lưu ý rằng nó là một giá trị gần đúng
hiệu chỉnh trong thuật toán làm mịn (hiệu chỉnh TFCE là chính xác). Đang làm
làm mịn trên các bề mặt riêng lẻ trước khi lấy trung bình / TFCE được ưu tiên, khi có thể,
để liên kết tốt hơn kích thước hạt nhân làm mịn với kích thước tính năng ban đầu.

Phương pháp TFCE được giải thích trong: Smith SM, Nichols TE., "Cụm không có ngưỡng
nâng cao: giải quyết các vấn đề về làm mịn, sự phụ thuộc vào ngưỡng và
bản địa hóa trong suy luận cụm. "Neuroimage. 2009 Jan 1;44(1): 83-98. PMID:
18501637

-ánh xạ từ số liệu sang âm lượng MAP FILE METRIC FILE TO VOLUME

wb_command -ánh xạ từ số liệu sang âm lượng

- tệp số liệu đầu vào - bề mặt sử dụng tọa độ từ
- một tập tin âm lượng trong không gian âm lượng đầu ra mong muốn -
đầu ra - tập tin âm lượng đầu ra

[-ne most-vertex] - sử dụng giá trị từ đỉnh gần nhất với voxel

Trung tâm - bao xa từ bề mặt đến các giá trị ánh xạ thành voxels, tính bằng mm

[-ribbon-constraintined] - sử dụng thuật toán ánh xạ ràng buộc ribbon

- bề mặt bên trong của dải băng - bề mặt bên ngoài của
Băng rôn

[-voxel-subiv] - phân chia voxel trong khi ước tính trọng số voxel

- số lượng phân khu, mặc định là 3

Ánh xạ các giá trị từ tệp số liệu thành tệp khối lượng.
Bạn phải chỉ định

chính xác một tùy chọn phương pháp ánh xạ.
Sản phẩm -một đỉnh phương pháp sử dụng

giá trị từ đỉnh gần tâm voxel nhất (hữu ích cho các giá trị nguyên). Các
-ribbon-ràng buộc phương pháp sử dụng phương pháp tương tự như trong ánh xạ -volume-to-surface-map,
sau đó sử dụng các trọng số ngược lại.

-đo-vectơ-hoạt động THỰC HIỆN HOẠT ĐỘNG CỦA VECTOR TRÊN CÁC LỌC KIM LOẠI

wb_command -đo-vectơ-hoạt động

- tệp đầu vào vectơ đầu tiên - tệp đầu vào vectơ thứ hai
- thao tác vectơ để làm gì - đầu ra - tệp đầu ra

[-normalize-a] - chuẩn hóa vectơ của đầu vào đầu tiên

[-normalize-b] - chuẩn hóa vectơ của đầu vào thứ hai

[-normalize-output] - chuẩn hóa vectơ đầu ra (không hợp lệ cho dấu chấm

sản phẩm)

[-độ lớn] - xuất ra độ lớn của kết quả (không hợp lệ cho dấu chấm

sản phẩm)

Có hoạt động vectơ trên hai tệp số liệu (tệp đó phải có bội số của 3
cột). Một trong các đầu vào có thể có nhiều vectơ (hơn 3 cột),
nhưng không phải cả hai (ít nhất một phải có chính xác 3 cột). Các -kích cỡ và
-chuẩn hóa-đầu ra các tùy chọn có thể không được chỉ định cùng nhau hoặc với một hoạt động
trả về một vô hướng (tích chấm). Các tham số phải là một trong những
Sau đây:

KHOẢN TRÍCH THÊM THÊM CHÉO CHÉO

-metric-vector-direction-roi TÌM NẾU Vectơ ĐIỂM ĐẾN MỘT ROI

wb_command -metric-vector-direction-roi

- bề mặt để tính toán - roi để tìm ngắn nhất
con đường dẫn đến - đầu ra - số liệu đầu ra

[-roi] - không tính các đỉnh bên ngoài một roi

- khu vực để tính toán bên trong, như một số liệu

Tại mỗi đỉnh, tính vectơ dọc theo điểm bắt đầu của đường đi ngắn nhất đến ROI.

-số liệu thống kê trọng số THỐNG KÊ THỂ TÍCH TRỌNG LƯỢNG TRÊN MỘT TẬP TIN KIM LOẠI

wb_command -số liệu thống kê trọng số

- số liệu đầu vào

[-area-surface] - sử dụng các vùng đỉnh làm trọng số

- bề mặt để sử dụng cho các vùng đỉnh

[-weight-metric] - sử dụng trọng số từ tệp số liệu

- tệp số liệu có chứa trọng số

[-column] - chỉ hiển thị đầu ra cho một cột

- số cột hoặc tên

[-roi] - chỉ xem xét dữ liệu bên trong một roi

- the roi, dưới dạng tệp số liệu

[-match-maps] - mỗi cột đầu vào sử dụng cột tương ứng

từ tệp roi

[-mean] - tính trung bình có trọng số

[-stdev] - tính toán độ lệch chuẩn có trọng số

[-sample] - ước tính stdev dân số từ mẫu

[-percentile] - tính toán phần trăm có trọng số

- phân vị cần tìm

[-sum] - tính tổng có trọng số

[-show-map-name] - in chỉ mục bản đồ và tên trước mỗi đầu ra

Đối với mỗi cột của đầu vào, một số duy nhất được in, kết quả là
hoạt động chỉ định. Sử dụng -cột để chỉ cung cấp đầu ra cho một cột duy nhất. Sử dụng
-roi để chỉ xem xét dữ liệu trong một khu vực. Chính xác là một trong số -giảm or
-phần trăm phải được chỉ định, và chính xác một trong số -nghĩa là, -stdev, -phần trăm or
-Tổng phải được chỉ định.

Sử dụng -Tổng với -diện tích-bề mặt (Hoặc -trọng số-số liệu với một số liệu có chứa
dữ liệu) tương đương với tích phân đối với diện tích bề mặt. Ví dụ, nếu
bạn muốn tìm diện tích bề mặt trong một roi, hãy làm như sau:

$ wb_command -metric-weighted-stats roi.func.gii -sum -area-surface

độ dày trung bình.surf.gii

-nifti-thông tin HIỂN THỊ THÔNG TIN VỀ TẬP TIN NIFTI / CIFTI

wb_command -nifti-thông tin

- tệp nifti / cifti để kiểm tra

[-print-header] - hiển thị nội dung tiêu đề

[-print-matrix] - xuất các giá trị trong ma trận (chỉ cifti)

[-print-xml] - in cifti XML (chỉ cifti)

[-version] - chuyển đổi XML sang một phiên bản CIFTI cụ thể (mặc định là

phiên bản cifti của tệp) - phiên bản CIFTI để sử dụng

Bạn phải chỉ định ít nhất một -in-* Lựa chọn.

-probtrackx-dot-chuyển đổi CHUYỂN ĐỔI MỘT TẬP TIN .DOT TỪ PROBTRACKX THÀNH CIFTI

wb_command -probtrackx-dot-chuyển đổi

- đầu vào tệp .dot - đầu ra - xuất tệp cifti

[-row-voxels] - ánh xạ đầu ra dọc theo một hàng sẽ là voxels

- một tệp văn bản chứa các chỉ số IJK cho các voxels

đã sử dụng

- một tập nhãn với các kích thước và hình dạng được sử dụng, với

nhãn cấu trúc

[-row-surface] - ánh xạ đầu ra dọc theo một hàng sẽ là các đỉnh bề mặt

- một tệp số liệu có giá trị dương trên tất cả các nút được sử dụng

[-row-cifti] - lập bản đồ dọc theo một hàng từ tệp cifti

- tệp cifti để lấy bản đồ từ - kích thước nào để
thực hiện việc lập bản đồ, ROW hoặc COLUMN

[-col-voxels] - ánh xạ đầu ra dọc theo một cột sẽ là voxels

- một tệp văn bản chứa các chỉ số IJK cho các voxels

đã sử dụng

- một tập nhãn với các kích thước và hình dạng được sử dụng, với

nhãn cấu trúc

[-col-surface] - ánh xạ đầu ra dọc theo một cột sẽ là bề mặt

đỉnh - một tệp số liệu có giá trị dương trên tất cả các nút được sử dụng

[-col-cifti] - lấy ánh xạ dọc theo một cột từ tệp cifti

- tệp cifti để lấy bản đồ từ - kích thước nào để
thực hiện việc lập bản đồ, ROW hoặc COLUMN

[-transpose] - chuyển đổi ma trận đầu vào

[-make-đối xứng] - chuyển đổi đầu vào nửa bình phương thành đầu ra ma trận đầy đủ

LƯU Ý: chính xác một -hàng tùy chọn và một -col tùy chọn phải được sử dụng.

Nếu tệp đầu vào không có các chỉ mục của nó được sắp xếp theo đúng thứ tự, điều này
lệnh có thể mất nhiều thời gian hơn dự kiến. Xác định -mục đích sẽ chuyển
ma trận đầu vào trước khi cố gắng đưa các giá trị của nó vào tệp cifti, đó là
hiện cần cho ít nhất ma trận2 để hiển thị nó như dự định. Như thế nào
tệp cifti được hiển thị dựa trên đó -hàng tùy chọn được chỉ định: nếu -row-voxels
được chỉ định, sau đó nó sẽ hiển thị dữ liệu trên các lát khối lượng. Các tên nhãn trong
(các) tập nhãn phải có các tên sau, các tên khác bị bỏ qua:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID KHÁC OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-bộ-đồ-tên ĐẶT TÊN CỦA MỘT HOẶC NHIỀU BẢN ĐỒ TRONG MỘT TẬP TIN

wb_command -bộ-đồ-tên

- tệp để đặt tên bản đồ của

[-name-file] - sử dụng một tệp văn bản để thay thế tất cả các tên bản đồ

- tệp văn bản chứa tên bản đồ, một tên trên mỗi dòng

[-map] - có thể lặp lại - chỉ định một bản đồ để đặt tên của

- chỉ mục bản đồ để thay đổi tên của - tên để đặt cho
bản đồ

Đặt tên của một hoặc nhiều bản đồ cho số liệu, hình dạng, nhãn, thể tích, vô hướng cifti hoặc
các tệp nhãn cifti. Nếu -tên-tệp tùy chọn không được chỉ định, -bản đồ tùy chọn phải
được chỉ định ít nhất một lần. Các -bản đồ không thể sử dụng tùy chọn khi -tên-tệp is
được chỉ định.

-bộ-cấu trúc THIẾT LẬP CẤU TRÚC CỦA MỘT TẬP TIN DỮ LIỆU

wb_command -bộ-cấu trúc

- tệp để thiết lập cấu trúc của - cấu trúc để thiết lập
tập tin cho

[-surface-type] - đặt loại bề mặt (chỉ được sử dụng nếu tệp là

tệp bề mặt) - tên loại bề mặt

[-surface-Secondary-type] - đặt loại thứ cấp của một bề mặt (chỉ

được sử dụng nếu tệp là tệp bề mặt) - tên của loại bề mặt thứ cấp

Tệp hiện có được sửa đổi và viết lại thành cùng một tên tệp.
Hợp lệ

giá trị cho tên cấu trúc là:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID KHÁC OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

Tên hợp lệ cho loại bề mặt là:

CHƯA BIẾT XÂY DỰNG GIẢI PHẪU GIẢI PHẪU ĐÃ CÓ VERY_INFLATED SPHERICAL SEMI_SPHERICAL
VỎ PHẲNG ELLIPSOID

Tên hợp lệ cho loại bề mặt thứ cấp là:

BẢNG MẶT TRUNG BÌNH XÁM_TRẮNG KHÔNG HỢP LỆ

-show-cảnh TẮT HIỂN THỊ MÀN HÌNH ĐẾN MỘT TẬP TIN HÌNH ẢNH

wb_command -show-cảnh

- tệp cảnh - tên hoặc số (bắt đầu từ một)
của cảnh trong

tập tin cảnh

- tên tệp hình ảnh đầu ra - chiều rộng của (các) hình ảnh đầu ra
- chiều cao của (các) hình ảnh đầu ra

Kết xuất nội dung của các cửa sổ trình duyệt được hiển thị trong một cảnh thành (các) tệp hình ảnh. Các
tên tệp hình ảnh phải tương tự như "capture.png". Nếu chỉ có một hình ảnh để
kết xuất, tên hình ảnh sẽ không thay đổi. Nếu có nhiều hơn một hình ảnh để hiển thị,
một chỉ mục sẽ được chèn vào tên hình ảnh: "capture_01.png", "capture_02.png"
và vv

Định dạng hình ảnh được xác định bởi phần mở rộng tệp hình ảnh. Định dạng hình ảnh
có sẵn trên hệ thống này là:

bmp ico jpeg jpg png ppm tif tiff xbm xpm

Lưu ý: Các định dạng hình ảnh có sẵn có thể khác nhau tùy theo hệ điều hành.

-sign-distance-to-surface TÍNH KHOẢNG CÁCH ĐÃ KÝ KẾT TỪ MỘT BỀ MẶT ĐẾN BỀ MẶT KHÁC

wb_command -sign-distance-to-surface

- bề mặt so sánh để đo khoảng cách đã ký trên
- bề mặt tham chiếu xác định khoảng cách đã ký

chức năng

- đầu ra - số liệu đầu ra

[-winding] - phương pháp quấn dây cho thử nghiệm điểm bên trong bề mặt

- tên của phương thức (mặc định EVEN_ODD)

Tính toán hàm khoảng cách đã ký của bề mặt tham chiếu tại mọi đỉnh trên
bề mặt so sánh. LƯU Ý: quan hệ này KHÔNG đối xứng, dòng từ a
đỉnh đến điểm gần nhất trên bề mặt 'ref' (một trong những xác định dấu
chức năng khoảng cách) sẽ chỉ phù hợp với bình thường của bề mặt 'ref'. Có giá trị
thông số kỹ thuật cho các phương pháp cuộn dây như sau:

EVEN_ODD (mặc định) TIÊU CỰC NONZERO BÌNH THƯỜNG

Phương pháp NORMALS sử dụng chuẩn của tam giác và cạnh hoặc tam giác gần nhất
đánh bởi một tia từ điểm. Phương pháp này có thể nhanh hơn một chút, nhưng chỉ
đáng tin cậy đối với một bề mặt đóng kín không xuyên qua chính nó. Tất cả những thứ khác
phương pháp đếm các giao cắt đi vào (dương) và đi ra (tiêu cực) của một tia thẳng đứng từ
điểm, sau đó được tính là bên trong nếu tổng số là số lẻ, âm hoặc khác,
tương ứng.

-spec-tệp-hợp nhất MERGE HAI LỌC CỤ THỂ THÀNH MỘT

wb_command -spec-tệp-hợp nhất

- tệp thông số kỹ thuật đầu tiên để hợp nhất - tệp thông số kỹ thuật thứ hai để hợp nhất
- đầu ra - tập tin đặc tả đầu ra

Tệp thông số kỹ thuật đầu ra chứa mọi tệp nằm trong một trong các tệp thông số kỹ thuật đầu vào.

-surface-affine-hồi quy KHẮC PHỤC SỰ CHUYỂN HÓA ẢNH HƯỞNG GIỮA CÁC MẶT TRÊN CÙNG LƯỚI

wb_command -surface-affine-hồi quy

- bề mặt cong vênh - bề mặt phù hợp với tọa độ của
- đầu ra - tệp liên kết đầu ra

Sử dụng hồi quy tuyến tính để tính toán một affine tối thiểu hóa tổng bình phương của
chênh lệch tọa độ giữa bề mặt mục tiêu và bề mặt nguồn bị cong vênh.
Lưu ý rằng điều này có tác dụng làm co bề mặt bị cong vênh. Đầu ra
được viết dưới dạng ma trận NIFTI 'thế giới', xem -chuyển đổi-affine để chuyển đổi nó để sử dụng trong
phần mềm khác.

-bề mặt-áp dụng-affine ÁP DỤNG CHUYỂN HÓA ẢNH HƯỞNG ĐẾN TẬP TIN BỀ MẶT

wb_command -bề mặt-áp dụng-affine

- bề mặt để biến đổi - tệp liên kết - đầu ra
- bề mặt chuyển đổi đầu ra

[-flirt] - PHẢI được sử dụng nếu affine là affine tán tỉnh

- âm lượng nguồn được sử dụng khi tạo liên kết
- khối lượng mục tiêu được sử dụng khi tạo liên kết

Đối với ma trận tán tỉnh, bạn phải sử dụng -thả thính tùy chọn, bởi vì ma trận tán tỉnh không
mô tả đầy đủ về phép biến đổi tọa độ mà chúng đại diện. Nếu -thả thính
tùy chọn không hiện tại, liên kết phải là liên kết 'thế giới' nifti, có thể là
thu được với -chuyển đổi-affine lệnh hoặc aff_conv từ bộ 4dfp.

-bề mặt-áp dụng-warpfield ÁP DỤNG WARPFIELD CHO TẬP TIN BỀ MẶT

wb_command -bề mặt-áp dụng-warpfield

- bề mặt để biến đổi - chiến trường INVERSE
- đầu ra - bề mặt chuyển đổi đầu ra

[-fnirt] - PHẢI được sử dụng nếu sử dụng trường dọc fnirt

- chiến trường phía trước

LƯU Ý: làm cong một bề mặt yêu cầu INVERSE của trường dọc được sử dụng để làm cong
khối lượng mà nó phù hợp với. Tiêu đề của sợi dọc phía trước là cần thiết bởi -fnirt
để diễn giải chính xác các chuyển vị trong trường dọc fnirt.

Nếu -fnirt tùy chọn không hiện tại, warpfield phải là một 'thế giới' nifti
Warpfield, có thể lấy được bằng -convert-warpfield chỉ huy.

-surface-trung bình CÁC LỌC BỀ MẶT AVERAGE CÙNG NHAU

wb_command -surface-trung bình

- đầu ra - bề mặt trung bình đầu ra

[-stddev] - tính toán độ lệch chuẩn của mẫu 3D

- đầu ra - chỉ số đầu ra cho mẫu 3D

độ lệch chuẩn

[-uncerturance] - tính toán 'độ không chắc chắn' của dấu mũ 5

- đầu ra - số liệu đầu ra cho sự không chắc chắn

[-surf] - có thể lặp lại - chỉ định một bề mặt để đưa vào giá trị trung bình

- một tệp bề mặt đến mức trung bình

Độ lệch chuẩn của mẫu 3D được tính là 'sqrt (sum (bình phương' '(xyz -
có nghĩa là (xyz))) / (n - 1)) '.

Độ không chắc chắn là một thước đo kế thừa được sử dụng trong dấu mũ 5 và được tính là 'tổng (chiều dài (xyz
- mean (xyz))) / n '.

-surface-gần nhất-vertex TÌM VERTEX BỀ MẶT CLOSEST ĐỂ PHỐI HỢP

wb_command -surface-gần nhất-vertex

- bề mặt sử dụng - tệp văn bản với tọa độ
- đầu ra - tệp văn bản đầu ra với số đỉnh

Đối với mỗi bộ ba tọa độ XYZ, hãy tìm đỉnh gần nhất trên bề mặt và xuất ra
số đỉnh của nó vào một tệp văn bản.

-surface-toạ độ-to-metric TẠO FILE METRIC PHỐI HỢP BỀ MẶT

wb_command -surface-toạ độ-to-metric

- bề mặt sử dụng tọa độ của - đầu ra - cái
số liệu đầu ra

Đặt tọa độ của bề mặt vào tệp số liệu 3 bản đồ, dưới dạng x, y, z.

-lớp bề mặt-vỏ não TẠO BỀ MẶT PHỤ THUỘC BỀ MẶT

wb_command -lớp bề mặt-vỏ não

- bề mặt chất trắng - bề mặt pial
- phần thể tích để đặt lớp ở - đầu ra -
bề mặt đầu ra

[-placement-out] - xuất vị trí dưới dạng một phần nhỏ khoảng cách từ pial

sang màu trắng - đầu ra - số liệu đầu ra

[-untwist] - tùy chọn tạm thời để so sánh các phương pháp, chỉ định sử dụng cũ

phương pháp

Các bề mặt đầu vào phải có sự tương ứng đỉnh.
Bề mặt đầu ra

được tạo ra bằng cách đặt các đỉnh giữa hai bề mặt sao cho
thể tích bên trong bất kỳ mảng nhỏ nào của bề mặt mới và trắng là phần đã cho
thể tích của cùng một miếng dán giữa các mặt tròn và bề mặt trắng (tức là,
chỉ định 0 sẽ cho bề mặt trắng, 1 sẽ cho bề mặt pial).

-surface-tạo-hình cầu TẠO MỘT SPHERE VỚI CÁC KHU VERTEX ĐỒNG Ý

wb_command -surface-tạo-hình cầu

- số đỉnh mong muốn - đầu ra - đầu ra
hình cầu

Tạo một hình cầu bằng cách chia đều các hình tam giác của một khối lập phương, để đến
càng gần với số đỉnh mong muốn càng tốt và sửa đổi nó để có
các khu vực đỉnh rất giống nhau cho tất cả các đỉnh. Để tạo một cặp đỉnh phù hợp
hình cầu trái và phải, sử dụng lệnh này, sau đó -bề mặt-lật-lr để tạo ra
hình cầu khác, sau đó -bộ-cấu trúc trên mỗi. Ví dụ:

$ wb_command -surface-create -here 6000 Sphere.6k.R.surf.gii
$ wb_command -surface-flip-lr Sphere.6k.R.surf.gii Sphere.6k.L.surf.gii
$ wb_command -set-Structure Sphere.6k.R.surf.gii CORTEX_RIGHT
$ wb_command -set-structure Sphere.6k.L.surf.gii CORTEX_LEFT

-bề mặt-cắt-mẫu lại VÍ DỤ MỘT BỀ MẶT CẮT

wb_command -bề mặt-cắt-mẫu lại

- tệp bề mặt để lấy lại mẫu - một mặt cầu
với lưới mà bề mặt đầu vào

là hiện nay trên

- một mặt cầu đăng ký với

và có lưới đầu ra mong muốn

- đầu ra - tệp bề mặt đầu ra

Ví dụ về một tệp bề mặt, cho trước hai bề mặt hình cầu có trong thanh ghi.
Lấy mẫu lại trung tâm được sử dụng, vì nó thường tốt hơn cho việc lấy mẫu lại
bề mặt, và vì dù sao nó cũng cần thiết để tìm ra cấu trúc liên kết mới.

-surface-méo ĐO KHOẢNG CÁCH GIỮA CÁC MẶT BẰNG

wb_command -surface-méo

- bề mặt tham chiếu - méo mó
mặt - đầu ra - chỉ số độ méo đầu ra

[-smooth] - làm mịn dữ liệu khu vực

- hạt nhân làm mịn sigma tính bằng mm

[-caret5-method] - sử dụng phương pháp làm biến dạng bề mặt từ dấu mũ5

[-edge-method] - tính toán độ biến dạng của độ dài cạnh thay vì diện tích

Lệnh này, khi không sử dụng -caret5-phương thức or -edge-phương pháp, tương đương với việc sử dụng
-surface-vertex-area trên mỗi bề mặt, làm mịn cả hai chỉ số đầu ra với
Phương pháp GEO_GAUSS_EQUAL trên bề mặt mà chúng đến từ nếu -trơn tru được chỉ định, và
sau đó sử dụng công thức 'ln (méo / tham chiếu) /ln(2) 'trên các kết quả được làm mịn.

Khi đang sử dụng -caret5-phương thức, nó sử dụng phương pháp làm biến dạng bề mặt từ dấu mũ 5,
lấy log cơ số 2 của tỷ lệ diện tích ô, sau đó tính trung bình các kết quả đó ở
mỗi đỉnh, và sau đó làm mịn kết quả trên bề mặt tham chiếu.

Khi đang sử dụng -edge-phương pháp, Các -trơn tru tùy chọn bị bỏ qua và đầu ra ở mỗi
đỉnh là giá trị trung bình của 'abs (ln (refEdge / distortEdge) /ln(2)) 'trên tất cả các cạnh
nối với đỉnh.

-bề mặt-lật-lr GƯƠNG MỘT BỀ MẶT QUA KẾ HOẠCH YZ

wb_command -bề mặt-lật-lr

- bề mặt lật - đầu ra - bề mặt lật đầu ra

Lệnh này phủ định tọa độ x của mỗi đỉnh và lật bề mặt
chuẩn, để bạn có bề mặt thuận tay trái ngược với các tính năng giống nhau
và tương ứng nút, với các chuẩn nhất quán với bề mặt ban đầu. Điều đó
là, nếu bề mặt đầu vào có các đường chuẩn hướng ra ngoài, thì bề mặt đầu ra cũng sẽ
có các tiêu chuẩn hướng ra bên ngoài.

-surface-flip-chuẩn BAY TẤT CẢ CÁC GẠCH TRÊN MỘT BỀ MẶT

wb_command -surface-flip-chuẩn

- bề mặt để lật các tiêu chuẩn của - đầu ra - đầu ra
bề mặt

Lật tất cả các hình tam giác trên một bề mặt, dẫn đến các đường chuẩn bề mặt bị lật
hướng khác (hướng nội so với hướng ngoại). Nếu bạn biến đổi một bề mặt với một liên kết
có yếu tố quyết định tiêu cực hoặc một trường dọc tương tự lật bề mặt, bạn
có thể kết thúc với một bề mặt có các đường chuẩn hướng vào trong, có thể có màn hình
các vấn đề. Sử dụng lệnh này sẽ giải quyết vấn đề đó.

-surface-tạo-tăng cao BỀ MẶT TẠO LƯNG

wb_command -surface-tạo-tăng cao

- bề mặt giải phẫu - đầu ra -
bề mặt thổi phồng đầu ra - đầu ra - đầu ra rất
bề mặt phồng lên

[-iterations-scale] - tỷ lệ số lần lặp tùy chọn

- giá trị quy mô số lần lặp lại

Tạo bề mặt phồng và rất căng. Các bề mặt đầu ra được 'khớp'
(có cùng phạm vi XYZ) đối với bề mặt giải phẫu. Trong hầu hết các trường hợp, quy mô số lần lặp lại
của 1.0 (mặc định) là đủ. Tuy nhiên, nếu bề mặt chứa một số lượng lớn
nút (150,000), hãy thử quy mô lặp lại là 2.5.

-bề mặt-trắc địa-khoảng cách TÍNH TOÁN KHOẢNG CÁCH HÌNH HỌC TỪ MỘT VERTEX ĐẾN TOÀN BỘ BỀ MẶT

wb_command -bề mặt-trắc địa-khoảng cách

- bề mặt để tính toán - đỉnh để tính toán trắc địa
khoảng cách từ - đầu ra - số liệu đầu ra

[-naive] - chỉ sử dụng hàng xóm, không thu thập thông tin hình tam giác (không khuyến khích)

[-limit] - dừng lại ở một khoảng cách nhất định

- khoảng cách tính bằng mm để dừng lại ở

Trừ khi -giới hạn được chỉ định, tính toán khoảng cách trắc địa từ chỉ định
đỉnh cho tất cả những người khác. Kết quả được xuất dưới dạng tệp chỉ số cột đơn, với
giá trị của -1 cho các đỉnh mà khoảng cách không được tính toán. Nếu như -ngây thơ không phải là
được chỉ định, nó không chỉ sử dụng những người hàng xóm ngay lập tức mà còn sử dụng những người hàng xóm có nguồn gốc từ
bò qua các cặp tam giác có chung một cạnh.

-bề mặt-trắc địa-rois VẼ ROIS GIỚI HẠN HÌNH HỌC TẠI VERTICES

wb_command -bề mặt-trắc địa-rois

- bề mặt để vẽ - giới hạn khoảng cách trắc địa từ đỉnh,
tính bằng mm - một tệp văn bản chứa các đỉnh để vẽ ROI

xung quanh

- đầu ra - số liệu đầu ra

[-gaussian] - tạo hạt nhân gaussian thay vì ROI phẳng

- sigma cho hạt nhân gaussian, tính bằng mm

[-overlap-logic] - cách xử lý ROI trùng lặp, CHO PHÉP mặc định

- phương pháp giải quyết chồng chéo

[-names] - đặt tên cho các cột từ tệp văn bản

- một tệp văn bản chứa các tên cột, mỗi tên một dòng

Đối với mỗi đỉnh trong tệp danh sách, một cột trong chỉ số đầu ra được tạo và
ROI xung quanh đỉnh đó được vẽ trong cột đó. Mỗi cột chỉ số sẽ có số không
ngoài khoảng cách trắc địa cách nhau bằng và theo mặc định sẽ có
giá trị của 1.0 bên trong nó. Nếu -ga nga tùy chọn được chỉ định, các giá trị bên trong
ROI thay vào đó sẽ tạo thành một gaussian với giá trị được chỉ định là sigma, được chuẩn hóa
để tổng các giá trị khác không trong cột số liệu là 1.0. Các
tranh luận với -chồng chéo-logic phải là một trong số CHO PHÉP, ĐÓNG CỬA hoặc LOẠI TRỪ. CHO PHÉP là
mặc định và có nghĩa là ROI được xử lý độc lập và có thể trùng lặp. GẦN NHẤT
có nghĩa là ROI không được trùng lặp và không có ROI nào chứa các đỉnh gần hơn
đến một đỉnh hạt khác. EXCLUDE có nghĩa là ROI không được trùng lặp và bất kỳ
đỉnh trong phạm vi của nhiều hơn một ROI không thuộc về bất kỳ ROI nào.

-lạm phát bề mặt LẠM PHÁT BỀ MẶT

wb_command -lạm phát bề mặt

- bề mặt giải phẫu - tệp bề mặt để
thổi phồng lên - số chu kỳ làm mịn
- cường độ làm mịn (phạm vi [0.0 - 1.0])
- làm mịn các lần lặp lại - yếu tố lạm phát
- đầu ra - tệp bề mặt đầu ra

Làm phồng bề mặt bằng cách thực hiện các chu kỳ bao gồm làm mịn sau đó là
lạm phát (để điều chỉnh sự co rút do làm mịn).

-bề mặt-thông tin HIỂN THỊ THÔNG TIN VỀ MỘT BỀ MẶT

wb_command -bề mặt-thông tin

- Bề mặt mà thông tin được hiển thị

Thông tin về bề mặt được hiển thị bao gồm các đỉnh, hình tam giác, hộp giới hạn,
và khoảng cách.

-bề mặt phù hợp TRẬN ĐẤU BỀ MẶT

wb_command -bề mặt phù hợp

- Bề mặt phù hợp (Tham khảo) - Tập tin
chứa bề mặt sẽ được biến đổi - Tệp bề mặt
sau khi biến đổi

Tệp bề mặt đầu vào sẽ được chuyển đổi để các phạm vi tọa độ của nó (giới hạn
hộp) khớp với tệp của Match Surface File

-bề mặt-sửa đổi-hình cầu THAY ĐỔI RADIUS VÀ TÙY CHỌN NGƯỜI GẦN ĐÂY

wb_command -bề mặt-sửa đổi-hình cầu

- hình cầu để sửa đổi - bán kính của hình cầu đầu ra nên
có - đầu ra - hình cầu đầu ra

[-recenter] - gần hơn hình cầu bằng hộp giới hạn

Lệnh này có thể hữu ích nếu bạn đã sử dụng -bề mặt-mẫu lại để lấy lại mẫu một hình cầu,
có thể gặp phải các vấn đề thường không xuất hiện trong
-surface-bridge-project-unproject. Nếu hình cầu đã được căn giữa
nguồn gốc, sử dụng -trung tâm vẫn có thể thay đổi nó một chút trước khi thay đổi bán kính,
mà có thể là không thể sử dụng được.

Nếu như không gần với hình cầu, hoặc không tập trung xung quanh điểm gốc và
-trung tâm không được sử dụng, một cảnh báo được in.

-surface-normalals ĐẦU RA VERTEX BÌNH THƯỜNG NHƯ TẬP TIN KIM LOẠI

wb_command -surface-normalals

- bề mặt để xuất ra các tiêu chuẩn của - đầu ra - bình thường
vectơ

Tính toán các vectơ thông thường của tệp bề mặt và xuất chúng dưới dạng 3 cột
tệp số liệu.

-bề mặt-mẫu lại VÍ DỤ MẶT BẰNG LƯỚI KHÁC NHAU

wb_command -bề mặt-mẫu lại

- tệp bề mặt để lấy lại mẫu - một mặt cầu
với lưới mà bề mặt đầu vào

là hiện nay trên

- một mặt cầu đăng ký với

và có lưới đầu ra mong muốn

- tên phương thức - đầu ra - tệp bề mặt đầu ra

[-area-surfs] - chỉ định bề mặt để thực hiện hiệu chỉnh vùng đỉnh dựa trên

- bề mặt có liên quan với lưới thép - Một
bề mặt liên quan với lưới thép

[-area-metrics] - chỉ định số liệu khu vực đỉnh để thực hiện hiệu chỉnh khu vực dựa trên

trên - một tệp số liệu với các khu vực đỉnh cho

mắt lưới

- một tệp số liệu với các khu vực đỉnh cho lưới thép

Ví dụ về một tệp bề mặt, cho trước hai bề mặt hình cầu có trong thanh ghi. Nếu như
phương pháp này thực hiện hiệu chỉnh khu vực, chính xác là một trong số -khu vực-lướt sóng or -area-số liệu phải
được chỉ định. Tùy chọn này không được sử dụng trong các trường hợp bình thường, nhưng được cung cấp cho
sự đầy đủ.

Các đối số phải là một trong những điều sau:

ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC

Phương pháp BARYCENTRIC được khuyến nghị cho các bề mặt giải phẫu, trừ khi chúng
khá thô, để giảm thiểu làm mịn.

Đối với các bề mặt cắt (bao gồm cả bản đồ phẳng), hãy sử dụng -bề mặt-cắt-mẫu lại.

Thay vì lấy mẫu lại bề mặt hình cầu, -surface-bridge-project-unproject
lệnh được khuyến khích.

-làm mịn bề mặt LÀM MỊN BỀ MẶT

wb_command -làm mịn bề mặt

- bề mặt dũa nhẵn - sức mạnh làm mịn
(phạm vi [0.0 - 1.0]) - làm mịn các lần lặp lại -
đầu ra - tệp bề mặt đầu ra

Làm mịn bề mặt bằng cách lấy trung bình các nút với các nút lân cận của chúng.

-surface-bridge-project-unproject DEFORM A SPHERE THEO ĐĂNG KÝ

wb_command -surface-bridge-project-unproject

- hình cầu với lưới đầu ra mong muốn - Một
hình cầu thẳng hàng với hình cầu trong - hình cầu-dự-tới
biến dạng đối với không gian đầu ra - đầu ra - hình cầu đầu ra

Mỗi đỉnh của dự kiến để có được
trọng số barycentric, sau đó được sử dụng để loại bỏ .
Điều này dẫn đến một hình cầu có cấu trúc liên kết là , nhưng tọa độ đã thay đổi
bởi sự biến dạng giữa và .
và phải có cùng một cấu trúc liên kết với mỗi
khác, nhưng có thể có cấu trúc liên kết khác nhau.

-surface-to-surface-3d-khoảng cách KHOẢNG CÁCH CẠNH TRANH GIỮA CÁC GIẤY CHỨNG NHẬN KHẮC PHỤC

wb_command -surface-to-surface-3d-khoảng cách

- bề mặt để so sánh với tài liệu tham khảo - NS
bề mặt để sử dụng làm tài liệu tham khảo - đầu ra - khoảng cách đầu ra

[-vectors] - xuất ra các vectơ dịch chuyển

- đầu ra - các vectơ đầu ra

Tính toán sự khác biệt vectơ giữa các đỉnh của mỗi bề mặt có cùng
index, as (comp - ref), và xuất ra các cường độ, và tùy chọn độ dịch chuyển
vectơ.

-surface-vertex-area ĐO KHU VỰC BỀ MẶT MỖI VERTEX CHỊU TRÁCH NHIỆM VỀ

wb_command -surface-vertex-area

- bề mặt để đo - đầu ra - số liệu đầu ra

Mỗi đỉnh có một phần ba diện tích của mỗi tam giác mà nó là một phần của nó.

-bề mặt-nêm-khối lượng ĐO KHỐI LƯỢNG PER-VERTEX GIỮA CÁC MẶT BẰNG

wb_command -bề mặt-nêm-khối lượng

- bề mặt bên trong - bề mặt bên ngoài -
đầu ra - chỉ số đầu ra

Tính thể tích của mỗi đỉnh từ bề mặt này sang bề mặt khác. Các bề mặt
phải có sự tương ứng của nút.

-đơn vị kiểm tra

-volume-affine-lấy lại mẫu VÍ DỤ KHỐI LƯỢNG SỬ DỤNG CHUYỂN ĐỔI NGUỒN

wb_command -volume-affine-lấy lại mẫu

- âm lượng để lấy lại mẫu - tệp liên kết để áp dụng
- một tệp âm lượng trong không gian âm lượng bạn muốn cho

đầu ra

- phương pháp lấy mẫu lại - đầu ra - âm lượng đầu ra

[-flirt] - PHẢI được sử dụng nếu affine là affine tán tỉnh

- âm lượng nguồn được sử dụng khi tạo liên kết
- khối lượng mục tiêu được sử dụng khi tạo liên kết

Lấy mẫu lại một tệp âm lượng với một phép chuyển đổi liên kết.
Khuyến nghị

các phương thức là CUBIC (đường trục khối) cho hầu hết dữ liệu và ENCLOSING_VOXEL cho dữ liệu nhãn.
Thông số phải là một trong số:

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

-volume-all-label-to-rois TẠO ROIS TỪ TẤT CẢ CÁC NHÃN TRONG KHUNG THỂ TÍCH

wb_command -volume-all-label-to-rois

- tệp nhãn khối lượng đầu vào - số hoặc tên của nhãn
bản đồ để sử dụng - đầu ra - tệp âm lượng đầu ra

Khối lượng đầu ra có một khung cho mỗi nhãn trong khung đầu vào được chỉ định, khác
hơn cái ??? nhãn, mỗi nhãn chứa ROI của tất cả các voxels được đặt thành
nhãn tương ứng.

-volume-chụp-mặt phẳng HÌNH ẢNH TƯƠNG THÍCH TỪ KẾ HOẠCH QUA KHỐI LƯỢNG

wb_command -volume-chụp-mặt phẳng

- tập tin khối lượng để nội suy từ - tên hoặc số của
subvolume để sử dụng - kiểu nội suy - chiều rộng của hình ảnh đầu ra,
tính bằng pixel - chiều cao của hình ảnh đầu ra, tính bằng pixel - giá trị để kết xuất
như màu đen - giá trị hiển thị thành màu trắng - tọa độ x của
phía dưới bên trái của hình ảnh đầu ra - tọa độ y của đáy
bên trái của hình ảnh đầu ra - tọa độ z của phía dưới bên trái của
hình ảnh đầu ra - tọa độ x của phía dưới bên phải của đầu ra
hình ảnh - tọa độ y của góc dưới bên phải của hình ảnh đầu ra
- tọa độ z của góc dưới bên phải của hình ảnh đầu ra
- tọa độ x của phía trên bên trái của hình ảnh đầu ra -
tọa độ y của phía trên bên trái của hình ảnh đầu ra - tọa độ z của
trên cùng bên trái của hình ảnh đầu ra - đầu ra - hình ảnh đầu ra

LƯU Ý: Nếu bạn muốn tạo một hình ảnh với tất cả các khả năng của GUI
kết xuất, xem -show-cảnh.

Hiển thị hình ảnh của một mặt phẳng tùy ý thông qua tệp âm lượng, với một
bảng màu xám tuyến tính. Thông số phải là một trong số:

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

-volume-copy-extension SAO CHÉP DỮ LIỆU ĐÃ MỞ RỘNG VÀO TẬP TIN KHỐI LƯỢNG KHÁC

wb_command -volume-copy-extension

- tập tin khối lượng chứa dữ liệu voxel để sử dụng
- tập tin khối lượng có chứa các phần mở rộng để sử dụng - đầu ra - cái
khối lượng đầu ra

[-drop-chưa biết] - không sao chép các tiện ích mở rộng mà bàn làm việc không hiểu

Lệnh này sao chép thông tin trong một tệp khối lượng không phải là một phần quan trọng của
tiêu đề tiêu chuẩn hoặc ma trận dữ liệu, ví dụ như tên bản đồ, cài đặt bảng màu, bảng nhãn.
If -drop-không xác định không được chỉ định, nó cũng sao chép các loại thông tin tương tự
bằng phần mềm khác.

-volume-tạo TẠO TẬP TIN KHỐI LƯỢNG KHỐI

wb_command -volume-tạo

- chiều dài của kích thước thứ nhất - chiều dài của chiều thứ hai -
chiều dài của chiều thứ ba - đầu ra - âm lượng đầu ra

[-plumb] - đặt thông qua thứ tự trục và khoảng cách / độ lệch

- một chuỗi như 'XYZ' chỉ định chỉ mục nào nằm dọc

chiều không gian nào

- thay đổi tọa độ x từ việc tăng giá trị có liên quan

chỉ số

- thay đổi tọa độ y từ việc tăng giá trị có liên quan

chỉ số

- thay đổi tọa độ z từ việc tăng giá trị có liên quan

chỉ số

- tọa độ x của voxel đầu tiên - tọa độ y của
voxel đầu tiên - tọa độ z của voxel đầu tiên

[-sform] - đặt qua một nifti sform

- tăng tọa độ x từ việc tăng chỉ số i
- tăng tọa độ x từ việc tăng chỉ số j - tăng trong
tọa độ x từ việc tăng chỉ số k - tọa độ x của voxel đầu tiên
- tăng tọa độ y từ việc tăng chỉ số i
- tăng tọa độ y từ việc tăng chỉ số j - tăng trong
tọa độ y từ việc tăng chỉ số k - tọa độ y của voxel đầu tiên
- tăng tọa độ z từ việc tăng chỉ số i
- tăng tọa độ z từ việc tăng chỉ số j - tăng trong
tọa độ z từ việc tăng chỉ số k - tọa độ z của voxel đầu tiên

Tạo một tập tin chứa đầy các số không.
Chính xác là một trong số -dây dọi or -hình dạng

phải được chỉ định.

-volume-giãn nở DILATE MỘT TẬP TIN KHỐI LƯỢNG

wb_command -volume-giãn nở

- khối lượng giãn ra - khoảng cách tính bằng mm để giãn ra -
phương pháp giãn nở để sử dụng - đầu ra - âm lượng đầu ra

[-bad-voxel-roi] - chỉ định một roi voxel để ghi đè, thay vì

voxels có giá trị bằng XNUMX - tập tin khối lượng, các giá trị dương biểu thị voxels thành
có

giá trị của họ đã thay thế

[-data-roi] - chỉ định một roi về nơi có dữ liệu

- tập tin khối lượng, các giá trị dương biểu thị các voxels có

dữ liệu

[-subvolume] - chọn một subvolume để giãn ra

- số hoặc tên subvolume

Đối với tất cả các voxel được chỉ định là xấu, nếu chúng là hàng xóm của một voxel không tồi với
dữ liệu hoặc nằm trong khoảng cách được chỉ định của một voxel như vậy, hãy thay thế giá trị trong
voxel xấu với một giá trị được tính toán từ voxel không xấu lân cận có dữ liệu,
nếu không, hãy đặt giá trị bằng XNUMX. Không có vấn đề nhỏ như thế nào là, sự giãn nở sẽ
luôn sử dụng ít nhất voxels hàng xóm khuôn mặt.

Theo mặc định, voxels có dữ liệu với giá trị 0 là không hợp lệ, hãy chỉ định -xấu-voxel-roi
để chỉ đếm voxels là xấu nếu chúng được chọn bởi roi. Nếu như -data-roi không phải là
được chỉ định, tất cả các voxels được giả định là có dữ liệu.

Giá trị hợp lệ cho là:

GẦN NHẤT - sử dụng giá trị từ trọng lượng voxel tốt gần nhất - sử dụng trọng số
trung bình dựa trên khoảng cách

-volume-ước tính-fwhm ƯỚC LƯỢNG KHÓI FWHM CỦA MỘT KHỐI LƯỢNG

wb_command -volume-ước tính-fwhm

- âm lượng đầu vào

[-roi] - chỉ sử dụng dữ liệu trong ROI

- khối lượng sử dụng làm ROI

[-subvolume] - chọn một subvolume để ước tính độ mượt mà của

- số hoặc tên subvolume

Ước tính độ mượt mà của âm lượng đầu vào theo các hướng X, Y và Z một cách riêng biệt,
in các ước tính thành đầu ra tiêu chuẩn. Nếu như -bộ phận không được chỉ định, mỗi
subvolume được ước tính và hiển thị riêng biệt.

-volume-cực đoan TÌM HIỂU THÊM TRONG TẬP TIN KHỐI LƯỢNG

wb_command -volume-cực đoan

- tập tin khối lượng để tìm điểm cực trị của - khoảng cách tối thiểu
giữa các cực trị được xác định của cùng một

kiểu

- đầu ra - âm lượng cực đại đầu ra

[-presmooth] - làm mịn âm lượng trước khi tìm thấy điểm cực trị

- sigma cho hạt nhân làm mịn gaussian, tính bằng mm

[-roi] - bỏ qua các giá trị bên ngoài vùng đã chọn

- khu vực tìm thấy điểm cực trị trong

[-threshold] - bỏ qua điểm cực trị nhỏ

- giá trị lớn nhất được coi là giá trị nhỏ nhất - nhỏ nhất
giá trị để xem xét là giá trị tối đa

[-sum-subvols] - xuất ra tổng của các phụ cực trị thay vì từng

subvolume riêng biệt

[-consolidate-mode] - sử dụng hợp nhất cực tiểu cục bộ thay vì một

khu phố lớn

[-only-maxima] - chỉ tìm thấy cực đại

[-only-minima] - chỉ tìm thấy minima

[-subvolume] - chọn một subvolume duy nhất để tìm cực trị trong

- số hoặc tên subvolume

Tìm điểm cực trị trong một tập tin khối lượng, sao cho không có hai điểm cực trị cùng loại
ở trong của nhau. Các cực trị được dán nhãn là -1 cho cực tiểu, 1 cho
cực đại, 0 nếu không. Nếu như -chỉ-tối đa or -chỉ-cực tiểu được chỉ định, sau đó nó sẽ
bỏ qua cực trị không thuộc loại được chỉ định. Các tùy chọn này loại trừ lẫn nhau.

If -sum-subvols được chỉ định, các nguồn phụ cực đoan này được tổng hợp và đầu ra
có một subvolume duy nhất với kết quả này.

Theo mặc định, điểm dữ liệu chỉ là điểm cực trị nếu nó là điểm cực trị hơn mọi điểm khác
datapoint nằm trong từ nó. Nếu như -các chế độ cố định được sử dụng, nó
thay vào đó, bắt đầu bằng cách tìm tất cả các điểm dữ liệu cao hơn
hàng xóm, thì mặc dù có bất kỳ thái cực nào bên trong của nhau, lấy
hai điểm cực trị gần nhau nhất và hợp nhất chúng thành một điểm trung bình có trọng số
dựa trên số lượng cực trị ban đầu đã được hợp nhất vào mỗi.

Theo mặc định, tất cả các nguồn phụ đầu vào được sử dụng mà không làm mịn, sử dụng -bộ phận đến
chỉ định một subvolume duy nhất để sử dụng, và -mạch để làm trơn đầu vào trước
tìm điểm cực trị.

-volume-điền-lỗ ĐIỀN SỐ LẦN TRONG MỘT KHỐI LƯỢNG ROI

wb_command -volume-điền-lỗ

- khối lượng ROI đầu vào - đầu ra - khối lượng ROI đầu ra

Tìm tất cả các bộ phận được kết nối với khuôn mặt không được bao gồm trong ROI và điền vào tất cả ngoại trừ
cái lớn nhất với những cái.

-volume-find-cluster BỘ ĐIỀU CHỈNH BỘ LỌC THEO KHỐI LƯỢNG

wb_command -volume-find-cluster

- âm lượng đầu vào - ngưỡng cho các giá trị dữ liệu
- ngưỡng cho âm lượng cụm, tính bằng mm ^ 3 - đầu ra -
khối lượng đầu ra

[-less-than] - tìm các giá trị nhỏ hơn , còn hơn là

lớn hơn

[-roi] - chọn khu vực quan tâm

- the roi, dưới dạng một tập tin khối lượng

[-subvolume] - chọn một subvolume duy nhất

- số hoặc tên subvolume

[-size-ratio] - bỏ qua các cụm nhỏ hơn một phần cụ thể của

cụm lớn nhất trong bản đồ - phần nhỏ của khối lượng lớn nhất của cụm

[-distance] - bỏ qua các cụm xa hơn một khoảng cách nhất định từ

cụm lớn nhất - cách cụm lớn nhất mà một cụm có thể ở bao xa,
cạnh

để cạnh, tính bằng mm

[-start] - bắt đầu gắn nhãn các cụm từ giá trị khác 1

- giá trị cung cấp cho cụm đầu tiên được tìm thấy

Đầu ra một khối lượng với các số nguyên khác không cho tất cả các voxel trong một phạm vi đủ lớn
cụm và các số không ở những nơi khác. Các số nguyên biểu thị thành viên cụm (theo mặc định,
cụm đầu tiên được tìm thấy sẽ sử dụng giá trị 1, cụm thứ hai 2, v.v.). Theo mặc định, các giá trị
lớn hơn được coi là ở trong một cụm, sử dụng -ít hơn đến
kiểm tra các giá trị nhỏ hơn ngưỡng. Để áp dụng điều này làm mặt nạ cho dữ liệu, hoặc
để thực hiện việc tạo ngưỡng phức tạp hơn, hãy xem -tố-toán.

-volume-gradient TỐT NGHIỆP CỦA MỘT TẬP TIN KHỐI LƯỢNG

wb_command -volume-gradient

- âm lượng đầu vào - đầu ra - gradient đầu ra
độ lớn âm lượng

[-presmooth] - làm mịn âm lượng trước khi tính toán gradient

- sigma cho hàm trọng số gaussian, tính bằng mm

[-roi] - chọn một khu vực quan tâm để lấy gradient

- khu vực lấy gradient trong

[-vectors] - vectơ đầu ra

- đầu ra - các vectơ dưới dạng tệp khối lượng

[-subvolume] - chọn một subvolume duy nhất để lấy gradient của

- số hoặc tên subvolume

Tính toán độ dốc của khối lượng bằng cách thực hiện hồi quy tuyến tính cho mỗi voxel,
chỉ xem xét những người hàng xóm có khuôn mặt của nó trừ khi tồn tại quá ít những người hàng xóm có khuôn mặt. Các
vectơ gradient được xây dựng từ các đạo hàm riêng của tuyến tính kết quả
và độ lớn của vectơ này là đầu ra. Nếu được chỉ định, khối lượng
đầu ra vectơ được sắp xếp với các thành phần x, y và z từ một khối phụ như
các mạch con liên tiếp.

-volume-nhãn-xuất-bảng XUẤT BẢNG NHÃN TỪ KHỐI LƯỢNG NHƯ VĂN BẢN

wb_command -volume-nhãn-xuất-bảng

- tệp nhãn khối lượng đầu vào - số hoặc tên của nhãn
bản đồ để sử dụng - đầu ra - tệp văn bản đầu ra

Lấy bảng nhãn từ bản đồ nhãn tập và ghi nó vào định dạng văn bản
phù hợp với những gì được mong đợi bởi -volume-nhãn-nhập khẩu.

-volume-nhãn-nhập khẩu NHẬP KHỐI LƯỢNG NHÃN ĐỂ ĐỊNH DẠNG THẢM

wb_command -volume-nhãn-nhập khẩu

- khối lượng nhãn cần nhập - tệp văn bản chứa
giá trị và tên cho nhãn - đầu ra - khối lượng nhãn bàn làm việc đầu ra

[-discard-others] - đặt bất kỳ voxels nào có giá trị không được đề cập trong nhãn

danh sách đến ??? nhãn mác

[-unlabeled-value] - đặt giá trị sẽ được hiểu là không được gắn nhãn

- giá trị số cho không được gắn nhãn (mặc định là 0)

[-subvolume] - chọn một subvolume để nhập

- số hoặc tên subvolume

[-drop-used-label] - xóa mọi giá trị nhãn không sử dụng khỏi nhãn

bàn

Tạo một tập mới với thông tin nhãn trong tiêu đề trong dấu mũ nifti
định dạng phần mở rộng. Bạn có thể chỉ định chuỗi trống ('' sẽ hoạt động trên linux / mac) cho
, sẽ được coi như là một tệp trống. Danh sách nhãn
tệp phải có các dòng có định dạng sau:



Không chỉ định khóa "không được gắn nhãn" trong tệp, giả định rằng 0 có nghĩa là không
được dán nhãn trừ khi -giá trị không được gắn nhãn được quy định. Tên nhãn phải nằm riêng biệt
dòng, nhưng có thể chứa khoảng trắng hoặc các ký tự bất thường khác (nhưng không phải dòng mới).
Khoảng trắng được cắt bớt từ cả hai đầu của tên nhãn, nhưng được giữ lại nếu nó nằm trong
giữa nhãn. Các giá trị của màu đỏ, xanh lục, xanh lam và alpha phải là các số nguyên từ
0 đến 255 và sẽ chỉ định màu mà nhãn được vẽ (alpha của 255 có nghĩa là
mờ đục, đó có thể là những gì bạn muốn). Theo mặc định, nó sẽ đặt tên nhãn mới
với tên LABEL_ # cho bất kỳ giá trị nào gặp phải không được đề cập trong danh sách
tập tin, chỉ định -đĩa-những người khác thay vào đó, đặt các voxels này thành khóa "unlabeled".

-volume-nhãn-to-roi ĐẶT NHÃN KHỐI LƯỢNG THÀNH KHỐI LƯỢNG ROI

wb_command -volume-nhãn-to-roi

- tệp nhãn khối lượng đầu vào - đầu ra - âm lượng đầu ra
hồ sơ

[-name] - chọn nhãn theo tên

- tên nhãn mà bạn muốn có

[-key] - chọn nhãn bằng phím

- khóa nhãn mà bạn muốn có

[-map] - chọn một bản đồ nhãn để sử dụng

- số bản đồ hoặc tên

Đối với mỗi bản đồ trong , một bản đồ được tạo ở nơi tất cả các địa điểm
gắn nhãn với hoặc với một chìa khóa của được cho một giá trị là 1 và
tất cả các vị trí khác được cho bằng 0. Chính xác là một trong số -Tên và -Chìa khóa phải được chỉ định.
Chỉ định -bản đồ chỉ sử dụng một bản đồ từ .

-khối-nhãn-to-ánh xạ bề mặt BẢN ĐỒ KHỐI LƯỢNG NHÃN VÀO TỆP NHÃN BỀ MẶT

wb_command -khối-nhãn-to-ánh xạ bề mặt

- khối lượng để ánh xạ dữ liệu từ - bề mặt để ánh xạ dữ liệu lên
- đầu ra - tệp nhãn gifti đầu ra

[-subvol-select] - chọn một subvolume để lập bản đồ

- số hoặc tên subvolume

Sử dụng phương pháp ánh xạ voxel kèm theo để ánh xạ dữ liệu nhãn sang tệp nhãn gifti.

-tố-toán ĐÁNH GIÁ BIỂU HIỆN VỀ BỘ LỌC KHỐI LƯỢNG

wb_command -tố-toán

- biểu thức để đánh giá, trong dấu ngoặc kép - đầu ra - cái
khối lượng đầu ra

[-fixnan] - thay thế kết quả NaN bằng một giá trị

- giá trị để thay thế NaN bằng

[-var] - có thể lặp lại - tệp khối lượng để sử dụng làm biến

- tên của biến, như được sử dụng trong biểu thức - âm lượng
tệp để sử dụng làm biến này

[-subvolume] - chọn một subvolume duy nhất

- số hoặc tên subvolume

[-repeat] - sử dụng lại một subvolume duy nhất cho mỗi subvolume của phép tính

Lệnh này đánh giá ở mỗi voxel một cách độc lập.
Chỗ đó

phải có ít nhất một -var tùy chọn (để lấy không gian âm lượng từ), ngay cả khi
được chỉ định trong nó không được sử dụng trong . Tất cả các tập phải có cùng một tập
không gian. Tên tệp không hợp lệ trong , sử dụng một tên biến và một -var
tùy chọn với sự phù hợp để chỉ định một tệp đầu vào. Nếu -bộ phận Tùy chọn là
đưa cho bất kỳ -var tùy chọn, chỉ có một dữ liệu con được sử dụng từ tệp đó. Nếu như -lặp lại is
được chỉ định, tệp phải chỉ có một subvolume hoặc có -bộ phận
tùy chọn được chỉ định. Tất cả các tệp không sử dụng -lặp lại phải có cùng một số
yêu cầu sử dụng subvolumes. Định dạng của là như sau:

Biểu thức bao gồm hằng số, biến, toán tử, dấu ngoặc đơn và hàm,
trong ký hiệu infix, chẳng hạn như 'exp (-x + 3) * thang đo '. Các biến là các chuỗi bất kỳ
chiều dài, sử dụng các ký tự az, AZ, 0-9 và _, nhưng không được lấy tên của
được đặt tên là hằng số. Hiện tại, chỉ có một hằng số được đặt tên là PI. Các nhà điều hành
là +, -, *, /, ^,>, <,> =, <=, ==,! =,!, &&, ||. Chúng hoạt động như trong C, ngoại trừ
^ đó là lũy thừa, tức là pow (x, y) và có mức độ ưu tiên cao hơn
toán tử nhị phân (cũng có, '-3 ^ -4 ^ -5' có nghĩa là '- (3 ^ (- (4 ^ -5)))'). Dấu <=,> =, ==, và! =
các nhà khai thác được cung cấp một lượng nhỏ không gian lung lay, bằng một phần triệu
nhỏ hơn giá trị tuyệt đối của các giá trị được so sánh.

Các toán tử so sánh và logic trả về 0 hoặc 1, bạn có thể thực hiện việc tạo mặt nạ với các biểu thức
như 'x * (mặt nạ> 0)'. Đối với tất cả các toán tử logic, một đầu vào được coi là true iff
nó lớn hơn 0. Biểu thức '0 <x <5' không sai về mặt cú pháp, nhưng
nó sẽ KHÔNG làm những gì mong muốn, bởi vì nó được đánh giá từ trái sang phải, tức là '((0
x) <5) ', sẽ luôn trả về 1, vì cả hai kết quả có thể có của phép so sánh là
nhỏ hơn 5. Một cảnh báo sẽ được tạo ra nếu một biểu hiện thuộc loại này được phát hiện.
Sử dụng một cái gì đó như 'x> 0 && x <5' để có được hành vi mong muốn.

Khoảng trắng giữa các phần tử bị bỏ qua, 'sin (2 * x)' tương đương với
'sin (2 * x)', nhưng 's trong (2 * x)' là một lỗi. Phép nhân ngụ ý không được phép,
biểu thức '2x' sẽ được phân tích cú pháp như một biến. Dấu ngoặc đơn là (), không sử dụng
[] hoặc {}. Các hàm yêu cầu dấu ngoặc đơn, biểu thức 'sin x' là một lỗi.

Các chức năng sau được hỗ trợ:

sin: 1 đối số, sin của đối số (đơn vị là radian) cos: 1 đối số,
cosine của đối số (đơn vị là radian) tan: 1 đối số, tiếp tuyến của
đối số (đơn vị là radian) asin: 1 đối số, nghịch đảo của sin của đối số,
tính bằng radian acos: 1 đối số, nghịch đảo của cosine của đối số, tính bằng radian
đối số atan: 1, nghịch đảo của tiếp tuyến của đối số, tính bằng radian atan2: 2
đối số, atan2 (y, x) trả về nghịch đảo của tiếp tuyến của

(y / x), tính bằng radian, xác định góc phần tư bằng dấu của cả hai đối số

sinh: 1 đối số, sin hyperbol của đối số cosh: 1 đối số,
cosin hyperbol của đối số tanh: 1 đối số, tiếp tuyến hyperboloc của đối số
đối số asinh: 1 đối số, sin hyperbol nghịch đảo của đối số acosh: 1
đối số, cosin hyperbol nghịch đảo của đối số atanh: 1 đối số,
tiếp tuyến hyperboloc nghịch đảo của đối số ln: 1, logarit tự nhiên của
đối số exp: 1 đối số, hằng số e nâng lên thành sức mạnh của đối số
log: 1 đối số, logarit cơ số 10 của đối số sqrt: 1 đối số, bình phương
gốc của đối số abs: 1 đối số, giá trị tuyệt đối của tầng đối số: 1
đối số, số nguyên lớn nhất không lớn hơn vòng đối số: 1 đối số,
số nguyên gần nhất, với các mối quan hệ được làm tròn đi từ

không

ceil: 1 đối số, số nguyên nhỏ nhất không nhỏ hơn đối số min: 2 đối số,
min (x, y) trả về y nếu (x> y), x nếu không thì max: 2 đối số, max (x, y) trả về y
if (x <y), x nếu không thì mod: 2 đối số, mod (x, y) = x - y * tầng (x / y) hoặc 0 nếu
y == 0 kẹp: 3 đối số, kẹp (x, thấp, cao) = tối thiểu (tối đa (x, thấp), cao)

-hợp nhất âm lượng KHỐI LƯỢNG MERGE LỌC VÀO TẬP TIN MỚI

wb_command -hợp nhất âm lượng

- đầu ra - tệp âm lượng đầu ra

[-volume] - có thể lặp lại - chỉ định một tệp âm lượng đầu vào

- một tập tin khối lượng để sử dụng subvolumes từ

[-subvolume] - có thể lặp lại - chọn một subvolume duy nhất để sử dụng

- số hoặc tên subvolume

[-up-to] - sử dụng một loạt các nguồn phụ

- số lượng hoặc tên của subvolume cuối cùng đến

bao gồm

[-reverse] - sử dụng phạm vi theo thứ tự ngược lại

Lấy một hoặc nhiều tập tin khối lượng và tạo một tập tin khối lượng mới bằng cách nối
subvolumes từ chúng. Các tệp âm lượng đầu vào phải có cùng một không gian âm lượng.

Ví dụ: wb_command -hợp nhất âm lượng ra.nii -âm lượng đầu tiên.nii -bộ phận 1 -âm lượng
thứ hai.nii

Ví dụ này sẽ lấy subvolume đầu tiên từ first.nii, sau đó là tất cả
subvolumes từ second.nii và viết những thứ này cho out.nii.

-bảng màu THIẾT LẬP PALETTE CỦA MỘT TẬP TIN KHỐI LƯỢNG

wb_command -bảng màu

- tập tin khối lượng để sửa đổi - chế độ lập bản đồ

[-subvolume] - chọn một subvolume duy nhất

- số hoặc tên subvolume

[-pos-phần trăm] - phần trăm tối thiểu / tối đa để tô màu dữ liệu dương

- phần trăm cho dữ liệu ít tích cực nhất - NS
phân vị cho dữ liệu tích cực nhất

[-neg-phần trăm] - phần trăm tối thiểu / tối đa cho màu dữ liệu âm

- phần trăm cho dữ liệu tiêu cực nhất - NS
phân vị cho dữ liệu tiêu cực nhất

[-pos-user] - giá trị tối thiểu / tối đa của người dùng để tô màu dữ liệu dương

- giá trị cho dữ liệu ít tích cực nhất - giá trị
cho dữ liệu tích cực nhất

[-neg-user] - giá trị tối thiểu / tối đa của người dùng để tô màu dữ liệu phủ định

- giá trị cho dữ liệu âm ít nhất - giá trị
cho dữ liệu tiêu cực nhất

[-interpolate] - nội suy màu

- boolean, có nội suy không

[-disp-pos] - hiển thị dữ liệu tích cực

- boolean, có hiển thị không

[-disp-neg] - hiển thị dữ liệu tích cực

- boolean, có hiển thị không

[-disp-zero] - hiển thị dữ liệu gần bằng XNUMX hơn ngưỡng giới hạn tối thiểu

- boolean, có hiển thị không

[-palette-name] - đặt bảng màu được sử dụng

- tên của bảng màu

[-thresholding] - đặt ngưỡng

- cài đặt ngưỡng - hiển thị các giá trị bên trong hoặc bên ngoài ngưỡng
- ngưỡng cửa thấp hơn - ngưỡng trên

Tập tin khối lượng gốc được ghi đè bằng phiên bản đã sửa đổi.
By

mặc định, tất cả các cột của tệp âm lượng được điều chỉnh theo cài đặt mới, hãy sử dụng
-bộ phận tùy chọn để thay đổi chỉ một âm lượng phụ. Cài đặt ánh xạ không được chỉ định trong
các tùy chọn sẽ được lấy từ subvolume đầu tiên. Các đối số phải là một trong những
sau đây:

MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE

Các tranh luận với -bảng-tên phải là một trong những điều sau:

PSYCH PSYCH-NO-NONE ROY-BIG ROY-BIG-BL Màu cam-vàng xám_Interp_Positive
Gray_Interp clear_brain videoen_style fidl raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG đỏ-vàng xanh lam-ánh sáng xanh FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_blue fsl_vàng JET256

Các tranh luận với -ngưỡng phải là một trong những điều sau:

THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL

Các tranh luận với -ngưỡng phải là một trong những điều sau:

THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE

-volume-bưu kiện-lấy lại mẫu THÔNG SỐ KHỐI LƯỢNG MỊN VÀ TÁI TẠO

wb_command -volume-bưu kiện-lấy lại mẫu

- khối lượng dữ liệu đầu vào - khối lượng nhãn của nơi
bưu kiện hiện đang - khối lượng nhãn của nơi các bưu kiện nên ở
- Kernel gaussian sigma để làm mịn trong quá trình lấy mẫu lại -
đầu ra - khối lượng đầu ra

[-fix-zeros] - coi các giá trị XNUMX không phải là dữ liệu

[-subvolume] - chọn một subvolume duy nhất làm đầu vào

- số hoặc tên subvolume

Làm mịn và lấy lại mẫu cho vùng bên trong mỗi nhãn trong các gói nhỏ đến vùng của
cùng tên nhãn trong bưu kiện mới. Bất kỳ voxels nào trong vùng nhãn đầu ra nhưng
bên ngoài vùng nhãn đầu vào sẽ được ngoại suy từ dữ liệu lân cận. Các
-fix-số không tùy chọn khiến quá trình làm mịn không sử dụng giá trị đầu vào nếu nó bằng XNUMX, nhưng
vẫn ghi một giá trị làm mịn vào voxel và sau khi làm mịn hoàn tất, nó sẽ
kiểm tra mọi giá trị còn lại bằng XNUMX và điền chúng bằng các giá trị ngoại suy.

Lưu ý: tất cả các tập phải có cùng kích thước và khoảng cách.
Để sử dụng một

không gian đầu ra khác nhau, hãy xem -khối lượng-bưu kiện-lấy mẫu lại-chung.

-khối lượng-bưu kiện-lấy mẫu lại-chung CÁC THÔNG SỐ KHỐI LƯỢNG MỊN VÀ TÁI TẠO TỪ CÁC KHỐI LƯỢNG KHÁC NHAU
SPACE

wb_command -khối lượng-bưu kiện-lấy mẫu lại-chung

- khối lượng dữ liệu đầu vào - khối lượng nhãn của nơi
bưu kiện hiện đang - khối lượng nhãn của nơi các bưu kiện nên ở
- Kernel gaussian sigma để làm mịn trong quá trình lấy mẫu lại -
đầu ra - khối lượng đầu ra

[-fix-zeros] - coi các giá trị XNUMX không phải là dữ liệu

[-subvolume] - chọn một subvolume duy nhất làm đầu vào

- số hoặc tên subvolume

Làm mịn và lấy lại mẫu cho vùng bên trong mỗi nhãn trong các gói nhỏ đến vùng của
cùng tên nhãn trong bưu kiện mới. Bất kỳ voxels nào trong vùng nhãn đầu ra nhưng
bên ngoài vùng nhãn đầu vào sẽ được ngoại suy từ dữ liệu lân cận. Các
-fix-số không tùy chọn khiến quá trình làm mịn không sử dụng giá trị đầu vào nếu nó bằng XNUMX, nhưng
vẫn ghi một giá trị làm mịn vào voxel và sau khi làm mịn hoàn tất, nó sẽ
kiểm tra mọi giá trị còn lại bằng XNUMX và điền chúng bằng các giá trị ngoại suy.
Khối lượng đầu ra sẽ sử dụng không gian khối lượng của các bưu kiện mới, không cần
ở trong cùng một không gian âm lượng với đầu vào.

-volume-bưu kiện-làm mịn CÁC BỘ PHẬN MỊN TRONG MỘT KHỐI LƯỢNG RIÊNG

wb_command -volume-bưu kiện-làm mịn

- âm lượng để làm mịn - một tập nhãn có chứa
bưu kiện để làm mịn - hạt nhân làm mịn gaussian sigma, tính bằng mm
- đầu ra - âm lượng đầu ra

[-fix-zeros] - coi các giá trị XNUMX không phải là dữ liệu

[-subvolume] - chọn một subvolume duy nhất để làm mịn

- số hoặc tên subvolume

Ổ đĩa được làm mịn trong mỗi nhãn trong ổ đĩa nhãn chỉ sử dụng dữ liệu từ
trong nhãn. Tương đương với việc chạy trơn tru âm lượng với ROI phù hợp với từng
gắn nhãn riêng biệt, sau đó thêm các khối lượng kết quả, nhưng nhanh hơn.

-sản lượng-giảm GIẢM HIỆU SUẤT VẬN HÀNH CÁC LOẠI ACROSS

wb_command -sản lượng-giảm

- tập tin âm lượng để giảm - toán tử giảm để sử dụng
- đầu ra - âm lượng đầu ra

[-exclude-outceptions] - loại trừ các ngoại lệ khỏi mỗi thời gian theo tiêu chuẩn

lệch lạc - số độ lệch chuẩn dưới mức trung bình để

bao gồm

- số độ lệch chuẩn trên mức trung bình để

bao gồm

Đối với mỗi voxel, lấy dữ liệu trên các vòng con dưới dạng vectơ và thực hiện
giảm cụ thể trên nó, đưa kết quả vào khối lượng đầu ra duy nhất tại đó
voxel. Các toán tử giảm như sau:

MAX: giá trị lớn nhất MIN: giá trị nhỏ nhất INDEXMAX: chỉ số dựa trên 1 của
giá trị lớn nhất INDEXMIN: chỉ số dựa trên 1 của giá trị nhỏ nhất SUM: thêm tất cả các giá trị
PRODUCT: nhân tất cả các giá trị MEAN: giá trị trung bình của dữ liệu STDEV: tiêu chuẩn
độ lệch (mẫu số N) SAMPSTDEV: độ lệch chuẩn mẫu (N-1
mẫu số) VARIANCE: phương sai của dữ liệu MEDIAN: giá trị trung bình của dữ liệu
MODE: chế độ của dữ liệu COUNT_NONZERO: số phần tử khác không trong
dữ liệu

-volume-remove-island LOẠI BỎ ĐẢO KHỐI LƯỢNG ROI

wb_command -volume-remove-island

- khối lượng ROI đầu vào - đầu ra - khối lượng ROI đầu ra

Tìm tất cả các phần được kết nối với nhau của ROI và bỏ qua tất cả trừ phần lớn nhất.

-volume-định hướng lại THAY ĐỔI THỨ TỰ VOXEL CỦA TẬP TIN KHỐI LƯỢNG

wb_command -volume-định hướng lại

- âm lượng để định hướng lại - định hướng mong muốn
- out - âm lượng được định hướng lại

Thay đổi thứ tự voxel và khoảng cách tiêu đề / thông tin gốc sao cho
giá trị của bất kỳ điểm không gian nào là không thay đổi. Chuỗi định hướng trông giống như 'LPI',
có nghĩa là chỉ mục đầu tiên từ trái sang phải, chỉ mục thứ hai nằm sau phía trước và
thứ ba là thua kém cấp trên. Các ký tự hợp lệ là:

L từ trái sang phải

R từ phải sang trái

P sau đến trước

Một trước đến sau

Tôi thua kém cấp trên

S cao hơn kém

-volume-rois-from-Extrema TẠO BẢN ĐỒ ROI KHỐI LƯỢNG TỪ CÁC BẢN ĐỒ CỰC KỲ

wb_command -volume-rois-from-Extrema

- âm lượng đầu vào - giới hạn khoảng cách từ tâm voxel, tính bằng mm
- đầu ra - âm lượng đầu ra

[-gaussian] - tạo hạt nhân gaussian thay vì ROI phẳng

- sigma cho hạt nhân gaussian, tính bằng mm

[-roi] - chọn khu vực quan tâm để sử dụng

- khu vực sử dụng

[-overlap-logic] - cách xử lý ROI trùng lặp, CHO PHÉP mặc định

- phương pháp giải quyết chồng chéo

[-subvolume] - chọn một subvolume duy nhất để lấy gradient của

- số hoặc tên subvolume

Đối với mỗi giá trị khác không trong mỗi bản đồ, hãy tạo bản đồ với ROI xung quanh vị trí đó.
Nếu -ga nga tùy chọn được chỉ định, sau đó các hạt nhân gaussian chuẩn hóa được xuất ra
thay vì ROI. Các tranh luận với -chồng chéo-logic phải là một trong những CHO PHÉP,
CLOSEST hoặc EXCLUDE. ALLOW là mặc định và có nghĩa là ROI được xử lý
độc lập và có thể chồng chéo lên nhau. CLOSEST có nghĩa là ROI không được trùng lặp và điều đó
không có ROI nào chứa các đỉnh gần với một đỉnh mầm khác. EXCLUDE có nghĩa là
ROI không được trùng lặp và bất kỳ đỉnh nào trong phạm vi của nhiều hơn một ROI
không thuộc bất kỳ ROI nào.

-volume-set-space THAY ĐỔI THÔNG TIN KHÔNG GIAN KHỐI LƯỢNG

wb_command -volume-set-space

- âm lượng đầu vào - đầu ra - âm lượng đầu ra

[-plumb] - đặt thông qua thứ tự trục và khoảng cách / độ lệch

- một chuỗi như 'XYZ' chỉ định chỉ mục nào nằm dọc

chiều không gian nào

- thay đổi tọa độ x từ việc tăng giá trị có liên quan

chỉ số

- thay đổi tọa độ y từ việc tăng giá trị có liên quan

chỉ số

- thay đổi tọa độ z từ việc tăng giá trị có liên quan

chỉ số

- tọa độ x của voxel đầu tiên - tọa độ y của
voxel đầu tiên - tọa độ z của voxel đầu tiên

[-sform] - đặt qua một nifti sform

- tăng tọa độ x từ việc tăng chỉ số i
- tăng tọa độ x từ việc tăng chỉ số j - tăng trong
tọa độ x từ việc tăng chỉ số k - tọa độ x của voxel đầu tiên
- tăng tọa độ y từ việc tăng chỉ số i
- tăng tọa độ y từ việc tăng chỉ số j - tăng trong
tọa độ y từ việc tăng chỉ số k - tọa độ y của voxel đầu tiên
- tăng tọa độ z từ việc tăng chỉ số i
- tăng tọa độ z từ việc tăng chỉ số j - tăng trong
tọa độ z từ việc tăng chỉ số k - tọa độ z của voxel đầu tiên

Viết một bản sao của tệp khối lượng, với thông tin khoảng cách được thay đổi như
được chỉ định. Không có sắp xếp lại dữ liệu voxel xảy ra. Chính xác là một trong số -dây dọi or
-hình dạng phải được chỉ định.

-làm mịn LÀM MỊN MỘT TẬP TIN KHỐI LƯỢNG

wb_command -làm mịn

- âm lượng để làm mịn - hạt nhân làm mịn gaussian sigma,
tính bằng mm - đầu ra - âm lượng đầu ra

[-roi] - mượt mà chỉ từ dữ liệu trong ROI

- khối lượng sử dụng làm ROI

[-fix-zeros] - coi các giá trị XNUMX không phải là dữ liệu

[-subvolume] - chọn một subvolume duy nhất để làm mịn

- số hoặc tên subvolume

Làm mịn Gaussian cho khối lượng.
Theo mặc định, làm mượt tất cả các ổ điện phụ với

không có ROI, nếu ROI được cho, chỉ voxels dương trong khối lượng ROI mới có giá trị của chúng
được sử dụng và tất cả các voxels khác được đặt thành XNUMX. Làm mịn một âm lượng không trực giao sẽ
chậm hơn đáng kể, vì không thể tách hoạt động thành
Làm mịn 1 chiều mà không làm biến dạng hình dạng hạt nhân.

Sản phẩm -fix-số không tùy chọn khiến quá trình làm mịn không sử dụng giá trị đầu vào nếu nó bằng XNUMX,
nhưng vẫn ghi một giá trị được làm mịn vào voxel. Điều này hữu ích cho các số không
chỉ ra sự thiếu thông tin, ngăn họ làm giảm cường độ của
voxels gần đó, trong khi cung cấp giá trị ngoại suy cho giá trị XNUMX.

-số liệu thống kê THỐNG KÊ THỂ TÍCH TRÊN TẬP TIN KHỐI LƯỢNG

wb_command -số liệu thống kê

- âm lượng đầu vào

[-reduce] - sử dụng phép toán giảm

- hoạt động giảm

[-percentile] - cung cấp giá trị ở một phân vị

- phân vị cần tìm

[-subvolume] - chỉ hiển thị đầu ra cho một subvolume

- số hoặc tên subvolume

[-roi] - chỉ xem xét dữ liệu bên trong một roi

- the roi, dưới dạng một tập tin khối lượng

[-match-maps] - mỗi khối lượng con của đầu vào sử dụng

subvolume từ tệp roi

[-show-map-name] - in chỉ mục bản đồ và tên trước mỗi đầu ra

Đối với mỗi khối lượng phụ của đầu vào, một số duy nhất được in, kết quả là
hoạt động giảm hoặc phân vị được chỉ định. Sử dụng -bộ phận chỉ đưa ra đầu ra
cho một subvolume duy nhất. Sử dụng -roi để chỉ xem xét dữ liệu trong một khu vực.
Chính xác là một trong số -giảm or -phần trăm phải được chỉ định.

Đối số với -giảm tùy chọn phải là một trong những tùy chọn sau:

MAX: giá trị lớn nhất MIN: giá trị nhỏ nhất INDEXMAX: chỉ số dựa trên 1 của
giá trị lớn nhất INDEXMIN: chỉ số dựa trên 1 của giá trị nhỏ nhất SUM: thêm tất cả các giá trị
PRODUCT: nhân tất cả các giá trị MEAN: giá trị trung bình của dữ liệu STDEV: tiêu chuẩn
độ lệch (mẫu số N) SAMPSTDEV: độ lệch chuẩn mẫu (N-1
mẫu số) VARIANCE: phương sai của dữ liệu MEDIAN: giá trị trung bình của dữ liệu
MODE: chế độ của dữ liệu COUNT_NONZERO: số phần tử khác không trong
dữ liệu

-volume-tfce LÀM TFCE TRÊN TẬP TIN KHỐI LƯỢNG

wb_command -volume-tfce

- âm lượng để chạy TFCE trên - đầu ra - âm lượng đầu ra

[-presmooth] - giảm âm lượng trước khi chạy TFCE

- sigma cho hạt nhân làm mịn gaussian, tính bằng mm

[-roi] - chọn một khu vực quan tâm để chạy TFCE trên

- khu vực để chạy TFCE, dưới dạng âm lượng

[-parameters] - đặt tham số cho tích phân TFCE

- số mũ cho khối lượng cụm (mặc định 0.5) - số mũ cho giá trị ngưỡng
(mặc định 2.0)

[-subvolume] - chọn một subvolume duy nhất

- số hoặc tên subvolume

Nâng cao cụm không có ngưỡng là một phương pháp để tăng giá trị tương đối của
các vùng sẽ tạo thành các cụm trong một bài kiểm tra ngưỡng tiêu chuẩn. Đây là
được thực hiện bằng cách đánh giá tích phân của:

e (h, p) ^ E * h ^ H * dh

tại mỗi đỉnh p, trong đó h nằm trong khoảng từ 0 đến giá trị lớn nhất trong dữ liệu và e (h,
p) là phạm vi của cụm chứa đỉnh p ở ngưỡng h. Phủ định
các giá trị được nâng cao tương tự bằng cách phủ định dữ liệu, chạy cùng một quy trình và
phủ định kết quả.

Phương pháp này được giải thích trong: Smith SM, Nichols TE., "Cụm không có ngưỡng
nâng cao: giải quyết các vấn đề về làm mịn, sự phụ thuộc vào ngưỡng và
bản địa hóa trong suy luận cụm. "Neuroimage. 2009 Jan 1;44(1): 83-98. PMID:
18501637

ánh xạ -volume-to-surface-map KHỐI LƯỢNG BẢN ĐỒ ĐẾN BỀ MẶT

wb_command ánh xạ -volume-to-surface-map

- khối lượng để ánh xạ dữ liệu từ - bề mặt để ánh xạ dữ liệu lên
- đầu ra - tệp số liệu đầu ra

[-trilinear] - sử dụng phép nội suy thể tích ba tuyến

[-enclosing] - giá trị sử dụng của voxel đi kèm

[-cubic] - sử dụng splines khối

[-ribbon-constraintined] - sử dụng thuật toán ánh xạ ràng buộc ribbon

- bề mặt bên trong của dải băng - bề mặt bên ngoài của
Băng rôn

[-volume-roi] - sử dụng số lượng roi

- tập tin

[-voxel-subiv] - phân chia voxel trong khi ước tính trọng số voxel

- số lượng phân khu, mặc định là 3

[-output-weights] - ghi trọng số voxel cho một đỉnh thành một thể tích

tập tin - số đỉnh để lấy trọng số voxel, dựa trên 0
- đầu ra - khối lượng để ghi trọng số vào

[-myelin-style] - sử dụng phương pháp từ ánh xạ myelin

- một lượng nhỏ của dải ruy băng vỏ não cho cái này

bán cầu

- một tệp số liệu về độ dày vỏ não - nhân guassian tính bằng mm
cho trọng số voxels trong phạm vi

[-subvol-select] - chọn một subvolume để lập bản đồ

- số hoặc tên subvolume

Bạn phải chỉ định chính xác một phương pháp ánh xạ.
Bao quanh voxel sử dụng

giá trị từ voxel đỉnh nằm bên trong, trong khi trilinear thực hiện một tuyến tính 3D
nội suy dựa trên các voxels ngay lập tức trên mỗi cạnh của đỉnh
Chức vụ.

Phương pháp ánh xạ ruy-băng xây dựng một đa diện từ các cạnh của đỉnh trên
mỗi bề mặt và ước tính lượng thể tích của khối đa diện này rơi vào
bên trong bất kỳ voxels nào gần đó, để sử dụng làm trọng lượng để lấy mẫu. ROI khối lượng là
hữu ích để loại trừ các hiệu ứng âm lượng từng phần của voxels mà bề mặt đi qua, và
sẽ khiến ánh xạ bỏ qua các voxels không có giá trị dương trong
mặt nạ. Số chia nhỏ chỉ định cách nó ước tính số lượng của
thể tích khối đa diện giao nhau, bằng cách tách mỗi voxel thành các phần NxNxN, và
kiểm tra xem tâm của mỗi mảnh có nằm bên trong khối đa diện hay không. Nếu bạn có
voxels rất lớn, hãy cân nhắc tăng điều này nếu bạn nhận được số không trong đầu ra của mình.

Phương thức kiểu myelin sử dụng một phần của lệnh ánh xạ myelin caret5 để thực hiện
ánh xạ: đối với mỗi đỉnh bề mặt, lấy tất cả các voxel gần hơn độ dày tại
đỉnh nằm trong ROI ruy-băng và cách đó chưa đến một nửa giá trị độ dày
từ đỉnh dọc theo hướng của bề mặt pháp tuyến và áp dụng một gaussian
kernel với sigma được chỉ định cho chúng để có được trọng số để sử dụng.

-volume-vector-hoạt động THỰC HIỆN VẬN HÀNH VECTOR TRÊN CÁC LỌC THỂ TÍCH

wb_command -volume-vector-hoạt động

- tệp đầu vào vectơ đầu tiên - tệp đầu vào vectơ thứ hai
- thao tác vectơ để làm gì - đầu ra - tệp đầu ra

[-normalize-a] - chuẩn hóa vectơ của đầu vào đầu tiên

[-normalize-b] - chuẩn hóa vectơ của đầu vào thứ hai

[-normalize-output] - chuẩn hóa vectơ đầu ra (không hợp lệ cho dấu chấm

sản phẩm)

[-độ lớn] - xuất ra độ lớn của kết quả (không hợp lệ cho dấu chấm

sản phẩm)

Thực hiện thao tác vectơ trên hai tệp khối lượng (tệp đó phải có bội số của 3
phụ). Một trong các đầu vào có thể có nhiều vectơ (hơn 3
subvolumes), nhưng không phải cả hai (ít nhất một phải có chính xác 3 subvolumes). Các
-kích cỡ và -chuẩn hóa-đầu ra các tùy chọn có thể không được chỉ định cùng nhau hoặc với
Hoạt động DOT. Các tham số phải là một trong những thông số sau:

KHOẢN TRÍCH THÊM THÊM CHÉO CHÉO

-volume-warpfield-mẫu lại VÍ DỤ KHỐI LƯỢNG SỬ DỤNG WARPFIELD

wb_command -volume-warpfield-mẫu lại

- âm lượng để lấy lại mẫu - trường dọc để áp dụng
- một tệp âm lượng trong không gian âm lượng bạn muốn cho

đầu ra

- phương pháp lấy mẫu lại - đầu ra - âm lượng đầu ra

[-fnirt] - PHẢI được sử dụng nếu sử dụng trường dọc fnirt

- khối lượng nguồn được sử dụng khi tạo trường dọc

Lấy mẫu lại một tập tin khối lượng với một trường dọc.
Các phương pháp được đề xuất là

CUBIC (đường nét khối) cho hầu hết dữ liệu và ENCLOSING_VOXEL cho dữ liệu nhãn. Các
tham số phải là một trong số:

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

-số liệu thống kê trọng số THỐNG KÊ THỂ TÍCH TRỌNG LƯỢNG TRÊN TẬP TIN KHỐI LƯỢNG

wb_command -số liệu thống kê trọng số

- âm lượng đầu vào

[-weight-volume] - sử dụng trọng lượng từ một tệp khối lượng

- tập tin khối lượng có chứa các trọng lượng

[-subvolume] - chỉ hiển thị đầu ra cho một subvolume

- số hoặc tên subvolume

[-roi] - chỉ xem xét dữ liệu bên trong một roi

- the roi, dưới dạng một tập tin khối lượng

[-match-maps] - mỗi khối lượng con của đầu vào sử dụng

subvolume từ tệp roi

[-mean] - tính trung bình có trọng số

[-stdev] - tính toán độ lệch chuẩn có trọng số

[-sample] - ước tính stdev dân số từ mẫu

[-percentile] - tính toán phần trăm có trọng số

- phân vị cần tìm

[-sum] - tính tổng có trọng số

[-show-map-name] - in chỉ mục bản đồ và tên trước mỗi đầu ra

Đối với mỗi khối lượng phụ của đầu vào, một số duy nhất được in, kết quả là
hoạt động chỉ định. Nếu như -trọng lượng-khối lượng không được chỉ định, khối lượng của mỗi voxel là
đã sử dụng. Sử dụng -bộ phận để chỉ cung cấp đầu ra cho một âm lượng phụ duy nhất. Sử dụng -roi đến
chỉ xem xét dữ liệu trong một khu vực. Chính xác là một trong số -nghĩa là, -stdev, -phần trăm
or -Tổng phải được chỉ định.

Sử dụng -Tổng không có -trọng lượng-khối lượng tương đương với tích hợp đối với
âm lượng.

-wbsparse-hợp nhất-dày đặc HỢP NHẤT CÁC TỆP WBSPARSE CÙNG KÍCH THƯỚC RÕ RÀNG

wb_command -wbsparse-hợp nhất-dày đặc

- thứ nguyên nào để hợp nhất, ROW hoặc COLUMN - đầu ra
- tệp wbsparse đầu ra

[-wbsparse] - có thể lặp lại - chỉ định một tệp wbsparse đầu vào

- một tệp wbsparse để hợp nhất

Các tệp wbsparse đầu vào phải có các ánh xạ phù hợp theo hướng không
được chỉ định, và ánh xạ dọc theo hướng được chỉ định phải là mô hình não.

-zip-cảnh-tệp ZIP MỘT TẬP TIN KỊCH BẢN VÀ CÁC LỌC DỮ LIỆU CỦA NÓ

wb_command -zip-cảnh-tệp

- tệp cảnh để tạo tệp zip từ - tên
của thư mục được tạo khi tệp nén

giải nén

- out - tệp zip sẽ được tạo

[-base-dir] - chỉ định một thư mục chứa tất cả các tệp dữ liệu ở đâu đó

bên trong, điều này sẽ trở thành thư mục gốc của cấu trúc thư mục zipfile
- cac thu mục

Nếu tệp zip đã tồn tại, nó sẽ bị ghi đè.
If -base-dir không phải là

được chỉ định, thư mục chứa tệp cảnh được sử dụng cho thư mục cơ sở.
Tệp cảnh chỉ được chứa các đường dẫn tương đối và không được có tệp dữ liệu nào ở bên ngoài
thư mục cơ sở.

-zip-spec-tệp ZIP MỘT TẬP TIN CỤ THỂ VÀ CÁC TỆP DỮ LIỆU CỦA NÓ

wb_command -zip-spec-tệp

- tệp đặc tả để thêm vào tệp zip - tên
của thư mục được tạo khi tệp nén

giải nén

- out - tệp zip sẽ được tạo

[-base-dir] - chỉ định một thư mục chứa tất cả các tệp dữ liệu ở đâu đó

bên trong, điều này sẽ trở thành thư mục gốc của cấu trúc thư mục zipfile
- cac thu mục

Nếu tệp zip đã tồn tại, nó sẽ bị ghi đè.
If -base-dir không phải là

được chỉ định, thư mục chứa tệp đặc tả được sử dụng cho thư mục cơ sở.
Tệp đặc tả chỉ được chứa các đường dẫn tương đối và không có tệp dữ liệu nào được ở bên ngoài
thư mục cơ sở. Các tệp cảnh bên trong tệp thông số kỹ thuật không được kiểm tra cho tệp nào
chúng tham chiếu, đảm bảo rằng tất cả các tệp dữ liệu được tham chiếu bởi các tệp cảnh cũng
được tham chiếu bởi tệp đặc tả.

Sử dụng wb_command trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net