xbs - Trực tuyến trên đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

xbs - mô hình phân tử quả bóng và cây gậy

SYNOPSIS

xbs [-id] [-h] [-geo gg] [-sc x] [-màu sắc]
[-NS tiêu đề] [-bw] [-st] [-rv] [-autocolor]
[-hh]

MÔ TẢ

xbs sử dụng đồ họa cửa sổ X để tạo ra các đồ thị bóng và gậy. Nó đọc tọa độ và
dữ liệu khác từ một tập tin đầu vào id.bs (ví dụ ch4.bs) và có thể có các "khung" khác nhau với
đã dịch chuyển tọa độ từ một tập tin di chuyển phụ trợ tôi.mv (ví dụ ch4.mv). Các tập tin mặc định
là in.bs và in.mv Trong bản phân phối Debian, hãy xem các tệp đầu vào và tập lệnh mẫu trong
/usr/share/doc/xbs/examples.

LỰA CHỌN

-geo gg
thiết lập hình học cửa sổ

-sc x
thiết lập hệ số tỷ lệ

-t tiêu đề
đặt tiêu đề cửa sổ

-màu
sử dụng màu sắc

-ww đen trắng với màu xám mịn

-NS đen trắng có chấm màu xám

-rv đảo ngược màu sắc

-tự động tô màu
đã chọn màu sắc riêng

-ừ trợ giúp lâu dài

-geo gg
thiết lập hình học cửa sổ

ĐẦU VÀO FORMAT

Trong trường hợp đơn giản, tệp ch4.bs có thể trông như thế này:

nguyên tử C 0.000 0.000 0.000
nguyên tử H 1.155 1.155 1.155
nguyên tử H -1.155 -1.155 1.155
nguyên tử H 1.155 -1.155 -1.155
nguyên tử H -1.155 1.155 -1.155

thông số C 1.000 0.7
thông số H 0.700 1.00

trái phiếu CC 0.000 4.000 0.109 1.00
trái phiếu CH 0.000 3.400 0.109 1.00
trái phiếu hộ gia đình 0.000 2.800 0.109 1.00

Điều này đặt tọa độ theo định dạng
loại nguyên tử xyz

và cách vẽ từng loài nguyên tử, theo định dạng
tên thông số bán kính màu

và cách vẽ liên kết, ở định dạng liên kết name1 name2 min-length max-length bán kính color

Tệp di chuyển chứa các khung bổ sung như thế này:

khung Đây là khung số hai
0.000 0.000 0.000 1.155 1.155 1.155 -1.155 -1.155 1.155
1.155 -1.155 -1.155 -1.155 1.155 -1.155

Sau từ khóa 'khung' là một chuỗi xác định, sau đó đến tọa độ cho tất cả
các nguyên tử. Ngắt dòng có thể xuất hiện ở bất cứ đâu giữa các tọa độ.

Cũng có thể có các dòng đầu vào khác, cụ thể là các dòng đặt tham số (xem bên dưới).
Ví dụ: 'inc 5' đặt mức tăng cho góc xoay thành 5 độ.

Trong cả hai tệp, các dòng bắt đầu bằng * và các dòng trống là các nhận xét.

SỬ DỤNG

Sau khi bắt đầu chương trình với 'xbs ch4', cốt truyện có thể được điều khiển trực tiếp bằng cách chọn
phím. Ví dụ: để xoay phân tử, hãy sử dụng các phím con trỏ và phím "," và "." Các
hai cái cuối cùng được chọn vì chúng ở dưới "<" và ">" trông giống như mũi tên. Để bước
qua các khung để hiển thị một "bộ phim", sử dụng các phím '[' và ']'. Một số phím khác được
được xác định để hoạt động trực tiếp. Các chức năng phức tạp hơn được thực hiện bằng cách nhấn 'i' để nhận
một dòng đầu vào và sau đó gõ một lệnh. Sử dụng 'xbs -hh' để lấy thông tin về các phím và
lệnh.

Định cỡ: Phím '+' và '-' làm cho ô lớn hơn hoặc nhỏ hơn.

Phối cảnh: Phím p chuyển đổi phối cảnh. Mặc định là tắt. Đối với giả quan,
kích thước hình cầu phụ thuộc vào khoảng cách tới người xem nhưng vị trí trên trang thì
không thay đổi. Đối với phối cảnh thực, kích thước và vị trí đều thay đổi. Sức mạnh
của hiệu ứng phối cảnh phụ thuộc vào khoảng cách tới người xem, điều này được thể hiện trong
dòng trạng thái. Nó được thay đổi bằng phím 'd' và 'D' hoặc có thể đặt trực tiếp bằng lệnh
'quận'. (Lưu ý: nếu bạn đến quá gần và đặt điểm nhìn vào bên trong một nguyên tử, chương trình sẽ
sẽ cố gắng tô màu toàn bộ vũ trụ, việc này mất rất nhiều thời gian).

Ánh sáng: lệnh 'gramp dốc giữa' làm mờ các nguyên tử ở phía sau theo cấp số nhân
con dốc. Lệnh 'light xyz' tạo bóng cho các nguyên tử giống như ánh sáng chiếu dọc theo vectơ
(XYZ). Các lệnh này chỉ hoạt động ở chế độ đen/trắng. Để chuyển về màu bình thường,
nhập 'gramp' hoặc 'light' mà không cần đối số.

Định vị: Các phím bàn phím 8,6,4,2 di chuyển sơ đồ theo một dpos tăng dần (có thể
được thiết lập bằng lệnh 'dpos'). Phím bàn phím '*' lưu vị trí hiện tại là 'home' (hoặc sử dụng
lệnh 'pos' để đặt trực tiếp vị trí ban đầu). Phím bàn phím số 7 di chuyển cốt truyện về nhà.
Các vị trí có liên quan đến tâm của cửa sổ.

Đang lưu: lệnh 'save' ghi dữ liệu vào một tệp (Save.bs mặc định). Nếu có nhiều
Frames, một tập tin di chuyển cũng được ghi. Lệnh 'lưu' có một số tùy chọn, xem bên dưới.

In: lệnh 'print' ghi đầu ra vào tệp postscript, theo mặc định là tệp
'Bs.ps'. Một tập tin in vẫn mở cho đến khi nó được đóng lại một cách rõ ràng. Bằng cách này, một số lô
có thể được xếp chồng lên cùng một trang, sử dụng các phím con trỏ trên bàn phím để dịch chuyển các ô phụ
trên trang. Lệnh 'in' có một số tùy chọn, xem bên dưới.

ONLINE CỨU GIÚP

Nhập 'xbs -h' và 'xbs -hh' sẽ mang lại trợ giúp ngắn tương ứng dài.

Sau khi khởi động xbs, phím 'h' chuyển đổi chế độ xem tổng quan. Đây là thông tin tương tự như
thu được bằng 'xbs -hh'.

Trên dòng đầu vào, sử dụng 'help print' hoặc 'print ?' hoặc thậm chí 'print -h' để nhận trợ giúp về
lệnh cụ thể chẳng hạn như (trong trường hợp này) in. Trợ giúp này cũng hiển thị mọi tùy chọn có thể
cho lệnh.

Thanh dấu cách bật tắt thông tin bổ sung về cốt truyện được ghi vào cửa sổ.

HÀNG

1. Màu:

- Một màu được chỉ định dưới dạng số từ 0 đến 1 (giá trị màu xám), ba số
trong khoảng từ 0 đến 1 (giá trị đỏ, lục, lam hoặc RGB) hoặc dưới dạng tên màu từ tệp
/usr/lib/X11/rgb.txt (hoặc tương tự).

- Trong tệp đầu vào, màu sắc của từng loài hoặc liên kết được đặt theo ba cách sau.

- Các tùy chọn xbs sau có liên quan đến màu sắc: -color kích hoạt màu sắc (mặc định) bw
chỉ sử dụng màu xám -st chỉ sử dụng màu xám, được quy định từ một vài giá trị -rv đảo ngược tất cả
màu sắc -tự động chọn màu sắc riêng. Bạn có thể thay đổi những điều này một cách tương tác bằng bản cập nhật
yêu cầu. Để nhất quán, màu đen bây giờ là 0 và màu trắng là 1. Tùy chọn -rv sẽ chuyển đổi điều này.
Lý do duy nhất để sử dụng -bw hoặc -st là lệnh 'light' và 'gramp' không hoạt động
với màu sắc.

- Tùy chọn '-auto' được sử dụng để tô màu các nguyên tử theo một cách tiêu chuẩn nào đó. Những màu sắc này là
được đặt trong quy trình 'set_auto_colors' trong tệp subs.h. Bắt đầu từ nhãn loài (ví dụ: Pd3
hoặc Mg-a) phần alpha đứng đầu được trích xuất và viết hoa (tức là PD hoặc MG) và phần này
chuỗi được sử dụng để chọn một màu. Ý tưởng là đặt màu sắc yêu thích của một người vào
thường trình và sau đó biên dịch lại xbs.

- Lệnh 'color' thay đổi màu sắc của các nguyên tử một cách tương tác, tức là. 'màu C* xanh'
thay đổi màu sắc của tất cả các loài phù hợp. Để hiển thị màu sắc của một loài, hãy sử dụng
mà không chỉ định màu (ví dụ: 'color C1' hoặc 'color C-a').

- Khi dữ liệu được lưu bằng lệnh 'save', các màu hiện tại (như được đặt với 'color')
được lưu dưới dạng chuỗi. Với 'save -rgb', giá trị RGB được ghi thay vì màu
những cái tên. Nếu tùy chọn -rv được sử dụng, các màu đảo ngược sẽ được lưu dưới dạng giá trị RGB.

2. Một số lệnh có tùy chọn, vd. in, lưu, cập nhật. Ví dụ:

print -T in và thêm một số thông tin làm tiêu đề

print -t 'text .... ' in và đặt văn bản làm tiêu đề

cập nhật -rv cập nhật nhưng bật đảo ngược

cập nhật +rv cập nhật nhưng tắt đảo ngược

update -bw update nhưng chuyển sang màu đen/trắng

save -rgb lưu với màu sắc làm giá trị rgb

save -step n chỉ lưu với mọi khung hình thứ n
(tốt để nén một tệp .mv lớn).

Sử dụng 'cập nhật trợ giúp', v.v. trên dòng đầu vào để xem các tùy chọn.

3. So khớp mẫu cho nhãn nguyên tử: * khớp với bất kỳ chuỗi nào, + bất kỳ ký tự nào.
Điều này có thể được sử dụng trong lệnh 'color' và trong dòng 'bonds' trong tệp đầu vào
(xác định trái phiếu nào được rút ra). Ví dụ: 'trái phiếu C* H* ...' chọn tất cả
trái phiếu giữa
các nguyên tử như C1 và H34, v.v. và 'liên kết * * ...' chọn tất cả các cặp.

4. Những thay đổi linh tinh khác:

- Phím 'a' hiển thị hướng trục.

- Phím 'n' hiển thị tên hoặc số nguyên tử. Phím 'c' hiển thị tọa độ.

- Để đóng file in postscript dùng lệnh “close”.

- Lệnh 'dup xyz' nhân đôi tất cả các nguyên tử được dịch chuyển bởi (x,y,z).

- Lệnh 'cut xyzab' cắt các nguyên tử nằm giữa a và b
dọc theo vectơ (x,y,z).

- Dòng đầu vào có danh sách lịch sử để lấy lại các lệnh cũ.
Sử dụng mũi tên lên và xuống khi dòng đầu vào đang hoạt động.

- Trên một số hệ thống, phím xóa lùi không có tác dụng chỉnh sửa
dòng đầu vào. Do đó phím mũi tên trái được xác định là có
chức năng backspace cũng có.

Sử dụng xbs trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net