Đây là ứng dụng Linux có tên Tái tạo dòng tế bào tự động có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng testData.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng này có tên Tái tạo dòng tế bào tự động với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
Tái tạo dòng tế bào tự động
MÔ TẢ
Từ Amat và cộng sự, Phương pháp Tự nhiên, 2014 *:
"Việc tái tạo toàn diện các dòng tế bào ở các sinh vật đa bào phức tạp là mục tiêu trọng tâm của sinh học phát triển. Chúng tôi trình bày một khung tính toán mã nguồn mở để phân đoạn và theo dõi nhân tế bào với độ chính xác và tốc độ cao. Chúng tôi chứng minh (1) tính tổng quát của nó, bằng cách tái tạo các dòng tế bào trong dữ liệu hình ảnh bốn chiều, kích thước terabyte của phôi ruồi giấm, cá ngựa vằn và chuột, thu được bằng ba loại kính hiển vi huỳnh quang khác nhau, (2) khả năng mở rộng, bằng cách phân tích các giai đoạn phát triển nâng cao với tối đa 20,000 tế bào mỗi thời điểm , ở 26,000 ô tối thiểu 1 trên một máy trạm và (3) dễ sử dụng, bằng cách chỉ điều chỉnh hai tham số trên tất cả các tập dữ liệu và cung cấp các công cụ trực quan và chỉnh sửa để quản lý dữ liệu hiệu quả. Phương pháp của chúng tôi đạt được độ chính xác liên kết trung bình 97.0% trên tất cả các loài và phương thức hình ảnh. "
* Vui lòng trích dẫn bài báo này nếu bạn sử dụng mã này cho nghiên cứu của mình
Khán giả
Khoa học / Nghiên cứu, Người dùng cuối / Máy tính để bàn
Giao diện người dùng
Bảng điều khiển / Thiết bị đầu cuối
Ngôn ngữ lập trình
C ++, C
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/tgmm/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
