Đây là ứng dụng Linux có tên BiomeNet để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng BiomeNet.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên BiomeNet này để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
BiomeNet để chạy trong Linux trực tuyến
Ad
MÔ TẢ
Metagenomics tạo ra một số lượng lớn các trình tự vi sinh vật có thể được chỉ định một chức năng trao đổi chất. Việc sử dụng dữ liệu như vậy để suy ra sự khác biệt về trao đổi chất ở cấp độ cộng đồng bị cản trở do thiếu khung thống kê phù hợp. Ở đây, chúng tôi mô tả một mô hình Bayes phân cấp mới, được gọi là BiomeNet (Suy luận Bayes về mạng lưới trao đổi chất), để suy ra tỷ lệ phổ biến khác nhau của mạng lưới trao đổi chất giữa các cộng đồng vi sinh vật. Để suy ra cấu trúc của các tương tác trao đổi chất ở cấp độ cộng đồng, BiomeNet áp dụng khung mô hình thành viên hỗn hợp cho thông tin phong phú về enzym. Ý tưởng cơ bản là các thành phần hỗn hợp của mô hình (phản ứng trao đổi chất, mạng con và mạng lưới) được chia sẻ trên tất cả các nhóm (mẫu vi sinh vật), nhưng tỷ lệ hỗn hợp khác nhau giữa các nhóm. Thông qua khuôn khổ này, mô hình có thể nắm bắt các cấu trúc lồng nhau trong dữ liệu. BiomeNet là duy nhất trong việc mô hình hóa mỗi mẫu metagenome như một hỗn hợp của các hệ thống trao đổi chất phức tạp (metabosystems).Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Ngôn ngữ lập trình
C ++, S / R
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/biomenet/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
