Đây là ứng dụng Linux có tên là Calis-p để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng calis-p-0.1.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên Calis-p này để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
Calis-p để chạy trong Linux trực tuyến
MÔ TẢ
Calis-p (Phương pháp tiếp cận CALgary đối với đồng vị IS trong proteomics) là một gói phần mềm để trích xuất trực tiếp dấu vân tay đồng vị cacbon ổn định (SIF) của các loài riêng lẻ trong cộng đồng vi sinh vật từ tập dữ liệu siêu nguyên tử. Nó lấy các bảng đối sánh phổ peptit (PSM) đã cho điểm cho các mẫu và vật liệu hiệu chuẩn, và dữ liệu MS thô ở định dạng mzML làm đầu vào. Trong bước đầu tiên, phần mềm tìm các đỉnh đồng vị cho mỗi PSM và tính tổng cường độ của chúng trong một khoảng thời gian lưu được chỉ định. Các dạng đồng vị đã xác định (các cặp giá trị m / z + tổng cường độ) cùng với công thức tổng của các peptit đã xác định được báo cáo và sử dụng làm đầu vào cho bước thứ hai của Calis-p để tính toán các giá trị delta13C cho tất cả các peptit vượt qua một tập hợp của bộ lọc, cũng như giá trị delta13C trung bình và sai số tiêu chuẩn cho từng loài. Các giá trị delta13C của loài cần được hiệu chỉnh cho sự phân đoạn đồng vị của thiết bị bằng cách áp dụng độ lệch được xác định bằng cách sử dụng vật liệu chuẩn.Tính năng
- Dữ liệu SIF được trích xuất trực tiếp từ tập dữ liệu siêu tiêu chuẩn
- Thu được các giá trị SIF một cách chính thức và đáng tin cậy cho một số lượng lớn các loài trong một mẫu quần xã vi sinh vật với hiệu suất cao.
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/calis-p/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
