Đây là ứng dụng Linux có tên COGsoft để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống là COGsoft.04.19.2012.tgz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên COGsoft này để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
COGsoft để chạy trên Linux trực tuyến
Ad
MÔ TẢ
Phần mềm để tạo Cụm các Nhóm Chính thống (có thuật toán EdgeSearch mới). Tham khảo mới nhất: Kristensen DM, Kannan L, Coleman MK, Wolf YI, Sorokin A, Koonin EV, Mushegian A. Bioinformatics 2010.Tính năng
- Mô tả điểm mạnh / điểm yếu của các phương pháp khác nhau: Kristensen DM, Wolf YI, Mushegian AR, Koonin EV. Các phương pháp tính toán để suy luận Gene Orthology. Thông tin sinh học ngắn gọn. 2011 Tháng 12; 5 (379): 91-2011. Epub 19 ngày XNUMX tháng XNUMX. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21690100
- Tham chiếu thuật toán: Kristensen DM, Kannan L, Coleman MK, Wolf YI, Sorokin A, Koonin EV, Mushegian A. Một thuật toán đa thức thấp để tập hợp các cụm các nhóm trực giao từ các đối xứng liên hệ đối xứng tốt nhất. Tin sinh học. 2010 Tháng sáu 15; 26 (12): 1481-7. Epub 2010 ngày 2 tháng XNUMX. http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/btq229?ijkey=zD7TIWnncGvDGYE&keytype=ref
- Đánh giá tốt / kỹ lưỡng về các ortholog / COG: Koonin EV. Ortholog, paralogs và hệ gen tiến hóa. Annu Rev Genet. 2005; 39: 309-38. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16285863
- Giấy COG gốc: Tatusov RL, Koonin EV, Lipman DJ. Một quan điểm bộ gen về họ protein. Khoa học. 1997 Ngày 24 tháng 278; 5338 (631): 7-XNUMX. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9381173
- Cơ sở dữ liệu COG: Tatusov RL, Galperin MY, Natale DA, Koonin EV. Cơ sở dữ liệu COG: một công cụ để phân tích quy mô bộ gen về các chức năng và sự tiến hóa của protein. Axit nucleic Res. 2000 ngày 1 tháng 28; 1 (33): 6-XNUMX. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10592175
- Trang web phòng thí nghiệm Koonin: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/groups/koonin/
- Trang web FTP chính thức: ftp.ncbi.nih.gov/pub/wolf/COGs/COGsoft/ (mặc dù hiện tại, readme chỉ trỏ đến trang sourceforge)
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Giao diện người dùng
Dòng lệnh
Ngôn ngữ lập trình
C + +
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/cogtriaries/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
