Đây là ứng dụng Linux có tên COPEread có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng cop-v1.2.5.tgz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên COPEread với OnWorks này miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
COPEđọc
SỰ MIÊU TẢ:
COPE (Kết nối các lần đọc đầu cặp chồng chéo) là một phương pháp để căn chỉnh và kết nối các lần đọc đầu cặp được sắp xếp theo trình tự được chiếu sáng trong đó kích thước chèn nhỏ hơn tổng chiều dài của hai lần đọc. và nghiên cứu bảng điểm.
Trích dẫn đầy đủ:
COPE: Một công cụ đọc kết nối đầu cặp dựa trên k-mer chính xác để tạo điều kiện thuận lợi cho việc lắp ráp bộ gen
Binghang Liu; Kiến Anh Viên; Siu-Ming Yiu; Trấn Vũ Lý; Yinlong Xie; Diên Tường Trần; Yujian Shi; Hào Trương; Lý Anh Thụy; Tak-Wah Lam; Lạc Băng Băng
Tin sinh học (2012) 28 (22): 2870-2874; doi: 10.1093 / bioinformatics / bts563
Tính năng
- kết nối đọc đầu cặp chồng chéo
Ngôn ngữ lập trình
C + +
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/coperead/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.