Đây là ứng dụng Linux có tên GenNon-h để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng GenNonH_share.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên GenNon-h này để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
GenNon-h để chạy trong Linux trực tuyến
MÔ TẢ
Một số gói phần mềm có sẵn chotạo ra DNA MSA được phát triển theo
các quá trình Markov thời gian liên tục trên cây phát sinh loài. Mặt khác,
phương pháp mô phỏng DNA MSA trực tiếp từ các ma trận chuyển tiếp
không tồn tại. Hơn nữa, phần mềm hiện có hạn chế đối với
các mô hình có thể đảo ngược thời gian và nó không được tối ưu hóa để
tạo dữ liệu không đồng nhất (tức là đặt tỷ lệ thay thế khác nhau ở các dòng khác nhau).
GenNon-H là gói đầu tiên được thiết kế để tạo nhiều liên kết trình tự trong
quá trình Markov thời gian rời rạc trên cây phát sinh loài, lấy mẫu trực tiếp từ ma trận chuyển tiếp.
Dựa trên mô hình đầu vào và
cây phát sinh loài ở định dạng Newick (với chiều dài cành được đo
là số lượng thay thế dự kiến trên mỗi trang web),
thuật toán tạo ra các liên kết DNA có độ dài mong muốn.
GenNon-H là một dự án hợp tác được mô tả tại http://genome.crg.es/cgi-bin/phylo_mod_sel/AlgGenNonH.pl.
Ngôn ngữ lập trình
C + +
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/gennonh/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.