Đây là ứng dụng Linux có tên Hierachical_DNAcoder có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng Sourcecode.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên Hierachical_DNAcoder này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
Bộ mã hóa phân cấp_DNA
MÔ TẢ
Việc lưu trữ và truyền dữ liệu dữ liệu bộ gen lớn đang trở thành mối quan tâm quan trọng đối với các nhà nghiên cứu y sinh. Chúng tôi trình bày một phương pháp nén bộ gen dựa trên đa tham chiếu mới với cấu trúc thần bí. Cách tiếp cận của chúng tôi phù hợp với định dạng căn chỉnh tiêu chuẩn trên thực tế (tức là, BAM) đang là nhu cầu cấp thiết hiện nay. Chúng tôi sắp xếp các trình tự mới với trình tự tham chiếu bằng cách sử dụng SOAP3, một phần mềm căn chỉnh dựa trên GPU và tóm tắt các thuộc tính và thông tin ánh xạ để có các lần đọc được ánh xạ chính xác. Để tăng tỷ lệ căn chỉnh chính xác, chúng tôi cũng sắp xếp lại các lần đọc được ánh xạ và chưa được ánh xạ gần đúng bằng cách thay đổi trình tự tham chiếu hoặc rút ngắn độ dài đọc. Trong khi đó, chúng tôi tiếp tục nghiên cứu bằng cách sử dụng các giá trị chất lượng “mất mát” thông qua sơ đồ phân cụm k-mean và tìm ra tác động nhỏ của nó đối với các ứng dụng hạ nguồn. Phương pháp được đề xuất đã đạt được tỷ lệ nén từ 0.5 đến 0.65, tương ứng với tiết kiệm không gian 35% -50%, trên bộ dữ liệu thử nghiệm.
Tính năng
- Có hiệu quả
- NHANH CHÓNG
- Hứa hẹn
Khán giả
Công nghệ thông tin, Khoa học / Nghiên cứu, Kỹ thuật
Ngôn ngữ lập trình
C + +
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/hierachicaldnac/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
