Đây là ứng dụng Linux có tên iMSAT để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng SSRs.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên iMSAT này để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
iMSAT để chạy trong Linux trực tuyến
MÔ TẢ
iMSAT đại diện cho một bản cập nhật đầy đủ của chương trình vcf2MSAT. Chương trình python dòng lệnh này cho phép người dùng sử dụng dữ liệu đa hình được tạo bằng công cụ SAM- và BAM cũng như tệp căn chỉnh .fasta để tìm kiếm các điểm đánh dấu vi vệ tinh đa hình (MSAT hoặc STR). Bằng cách xác định các nhà tạo đa hình, thay vì các vùng lặp lại đơn giản như các chương trình trước đây đã làm, iMSAT tăng đáng kể tốc độ mà các MSAT đa hình có thể được xác định - tiết kiệm thời gian và tiền bạc quý báu của các nhà nghiên cứu. Chuyến thăm http://www.biomedcentral.com/1471-2164/15/858/abstract đối với bài báo pdf mô tả tiện ích của iMSAT và nếu bạn sử dụng chương trình, vui lòng trích dẫn bài viết này là: Andersen và Mills: iMSAT: một cách tiếp cận mới để phát triển các locus microsatellite bằng cách sử dụng các thư viện Illumina được mã vạch. BMC Genomics 2014 15: 858.Tính năng
- Nhận dạng tế bào vi mô đa hình
- Illumina trình tự
- Phân tích bộ gen
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Giao diện người dùng
Dòng lệnh
Ngôn ngữ lập trình
Python
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/imsat/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
