Đây là ứng dụng Linux có tên MANTI có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng MANTI-v5.4.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng này có tên MANTI với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
QUÁ KHỨ
MÔ TẢ
MANTI là giải pháp đánh giá và chú thích N-termini một cửa. MANTI trước đây (không có) được gọi là muda.pl trước v3.7, dự án đã được đổi tên thành MANTI.pl với v3.7 vào ngày 2019 tháng 06 năm 24.
Nó tập hợp thông tin từ các tệp đầu ra MaxQuant hoặc DiaNN/MSFragger khác nhau thành một tệp chính phù hợp rõ ràng cho các phân tích neo-termini protein. Điểm neo trung tâm cho tập hợp dữ liệu là tệp modeditSpecificPeptides.txt hoặc diann-output.pr_matrix.tsv - dữ liệu bổ sung được suy ra từ các tệp nguồn khác nhau từ thư mục tương ứng. Cũng có thể hữu ích cho các mục đích proteomics thông thường nhưng tập lệnh này được tối ưu hóa rất nhiều để xác định và xác nhận protein neo-termini. Giao diện đồ họa có sẵn dưới dạng Yoğurtlu_MANTI (tập lệnh Perl/Tk) + thực thi. các phiên bản ứng dụng dành cho Win1x mà không cần cài đặt Perl cục bộ.
Để được giải thích rất chi tiết về các tham số tập lệnh và chiến lược đánh giá, vui lòng tham khảo PDF thủ công mở rộng
Tính năng
- Nắm vững diễn giải N-Termini nâng cao
- Đánh giá MaxQuant N-termini
- Phân tích và xác thực dữ liệu DiaNN/MSFragger DIA N-termini
- Đánh giá và xác nhận Protein-Termini
- (UniProt) chú thích và lắp ráp dữ liệu
- Tích hợp Limma, LOCALIZER, TargetP2.0 & TopFINDer
- Ánh xạ lại các Termini đã xác định để sửa các Isoforms
- Nhiều tùy chọn hình ảnh hóa với các tập lệnh R được cung cấp
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Giao diện người dùng
Dòng lệnh
Ngôn ngữ lập trình
Perl
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/manti/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
