Đây là ứng dụng Linux có tên Molecular Dynamics Studio có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng WindowsRelease.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng này có tên Molecular Dynamics Studio với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
Phân tử Dynamics Studio
MÔ TẢ
Đây là một tập hợp các sửa đổi phần mềm được tạo ra để tích hợp NanoEngineer-1, PACKMOL và MSI2LMP nhằm mục đích dễ dàng tạo ra các tế bào động lực học phân tử. NanoEngineer-1 là một phần mềm CAD phân tử được viết bởi Nanorex và cung cấp cho người dùng một cách dễ dàng để tạo ra các phân tử, trong khi các sửa đổi phần mềm cho phép người dùng nhập các nguyên tử bằng cách sử dụng nhiều trường lực. PACKMOL có thể tạo ra một tập hợp các phân tử ngẫu nhiên bằng cách sử dụng các mẫu phân tử từ NanoEngineer-1, do đó cung cấp ô MD ban đầu. Các sửa đổi đối với PACKMOL cho phép dữ liệu kiểu nguyên tử được truyền qua phần mềm MSI2LMP. MSI2LMP tạo tệp đầu vào LAMMPS dựa trên các trường lực lớp I hoặc lớp II. MSI2LMP đã được sửa đổi để sử dụng dữ liệu trường lực được mã hóa bằng số được tạo bởi NanoEngineer-1. Định dạng tệp MMP đã được mở rộng và tích hợp vào cả ba ứng dụng phần mềm.
http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
Tính năng
- Khả năng CAD phân tử thông qua NanoEngineer-1
- Nhập nguyên tử theo cách thủ công dựa trên trường Lực nguyên tử CFF91
- Tạo các mẫu phân tử bằng NanoEngineer-1
- Tạo ô MD bằng PACKMOL và nhiều mẫu phân tử
- Tạo Tệp đầu vào Hình học LAMMPS bằng MSI2LMP
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Giao diện người dùng
OpenGL, Qt
Ngôn ngữ lập trình
Fortran, Python, C ++, C
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
