Đây là ứng dụng Linux có tên MoPAC có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống là MoPAC_0.3.1.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên MoPAC này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
MoPAC
MÔ TẢ
Để tạo thuận lợi cho việc so sánh các yếu tố cần thiết của gen trong hai hoặc nhiều mẫu tế bào, chúng tôi đề xuất MoPAC (Mô-đun Pipeline để phân tích màn hình CRISPR), một công cụ tương tác điều khiển Shiny để phân tích mức độ cần thiết khác nhau trong màn hình CRISPR / Cas9.
Để biết hướng dẫn cài đặt và sử dụng, vui lòng tham khảo trang wiki.
Tính năng
- Đo lường không thiên vị về tính cần thiết của gen khác biệt trong màn hình CRISPR.
- Dễ sử dụng thông qua một người dùng đồ họa tương tác giữa các giai đoạn.
- Các số liệu sẵn sàng xuất bản được tạo ở mỗi bước phân tích.
- Cả tệp FASTQ và bảng đếm số lần đọc (trước hoặc sau khi chuẩn hóa) đều được phép làm đầu vào.
- Kiểm soát chất lượng dựa trên danh mục gen để phát hiện và lọc các yếu tố ngoại lai.
- Phân tích bản thể học được tích hợp sẵn thông qua gói STRINGdb R.
- Xử lý nhanh thông qua biên dịch C ++ các bước tính toán chuyên sâu.
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Giao diện người dùng
Dựa trên web
Ngôn ngữ lập trình
C ++, S / R
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/mopac/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
