Musket - tải xuống trình sửa lỗi đọc ngắn cho Linux

Đây là ứng dụng Linux có tên Musket - trình sửa lỗi đọc ngắn có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng musket-1.1.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.

Musket - trình sửa lỗi đọc ngắn

MÔ TẢ

Musket là một bộ hiệu chỉnh dựa trên k-mer nhiều tầng hiệu quả cho dữ liệu đọc ngắn của Illumina. Bộ sửa lỗi này sử dụng phương pháp tiếp cận phổ k-mer và giới thiệu ba kỹ thuật hiệu chỉnh trong quy trình làm việc nhiều tầng. Kết quả đánh giá hiệu suất của chúng tôi, về chất lượng chỉnh sửa và các biện pháp lắp ráp bộ gen de novo, cho thấy Musket luôn là một trong những trình sửa lỗi dựa trên thay thế hoạt động tốt nhất. Ngoài ra, Musket đa luồng sử dụng mô hình chủ-tớ và thể hiện khả năng mở rộng song song vượt trội so với tất cả các trình sửa lỗi được đánh giá khác cũng như thời gian thực hiện tổng thể có tính cạnh tranh cao.

Khán giả

Ngành chăm sóc sức khỏe, Khoa học / Nghiên cứu

Giao diện người dùng

Bảng điều khiển / Thiết bị đầu cuối, Dòng lệnh

Ngôn ngữ lập trình

C + +

Danh Mục

Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/musket/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ ​​một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.