Đây là ứng dụng Linux có tên RGAAT có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới tên RGAAT.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên RGAAT này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
RGAAT
MÔ TẢ
Chương trình này có thể lắp ráp và / hoặc chú thích bộ gen cho bộ gen mới và nâng cấp bộ gen đã biết bằng cách sử dụng tệp căn chỉnh trình tự (định dạng SAM hoặc BAM), tệp biến thể trình tự (định dạng VCF hoặc bảng năm màu (phân cách bằng tab, bao gồm nhiễm sắc thể, vị trí, id, tham chiếu alen và alen thay thế)) hoặc tệp trình tự bộ gen mới (định dạng FASTA) dựa trên tệp trình tự bộ gen tham chiếu (định dạng FASTA) và tệp chú thích (định dạng TBL, GTF, GFF, GFF3 hoặc BED).
Tính năng
- nhận dạng biến thể trình tự
- xây dựng trình tự đồng thuận bộ gen
- sửa đổi bộ gen
- so sánh bộ gen
- chú thích bộ gen
- xây dựng chuyển đổi tọa độ bộ gen giữa các phiên bản lắp ráp bộ gen khác nhau
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Ngôn ngữ lập trình
Perl
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/rgaat/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
