Đây là ứng dụng Linux có tên SeqSelector có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới tên SeqSelector1.1b.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên SeqSelector với OnWorks này miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
SeqSelector
Ad
MÔ TẢ
Bộ công cụ SeqSelector là một bộ các tập lệnh python độc lập với nền tảng, thân thiện với người dùng để tạo điều kiện thuận lợi cho việc lựa chọn các trình tự để làm giàu có mục tiêu cho các thư viện thế hệ tiếp theo thông qua thu thập trình tự dựa trên kết hợp. Các tập lệnh không yêu cầu kiến thức về lập trình và có thể được áp dụng cho trình tự bộ gen của các loài mô hình hoặc không mô hình. Chúng tôi đề xuất một quy trình làm việc trong đó các gen quan tâm được xác định đầu tiên từ các nghiên cứu trước đây và các bộ dữ liệu có sẵn công khai về chú thích gen chức năng. Khi danh sách các gen ứng viên đã được xác định, trình tự của chúng sẽ được chọn từ bộ gen tham chiếu. Các trình tự này được sử dụng như một truy vấn trong quá trình tìm kiếm BLAST về bộ gen không có chú thích của một loài không thuộc mô hình, và sau đó các trình tự tương ứng được trả về, có thể được sử dụng để thiết kế mồi cho bắt trình tự dựa trên lai ghép.
Ngôn ngữ lập trình
Python
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/seqselector/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
