Đây là ứng dụng Linux có tên SUPERmerge để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng SUPERmerge.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên SUPERmerge này để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
SUPERmerge để chạy trong Linux trực tuyến
MÔ TẢ
SUPERmerge là một thuật toán phân tích chồng chất đọc ChIP-seq và chú thích để điều tra các tệp liên kết (BAM) của bộ dữ liệu ChIP-seq sửa đổi histone khuếch tán với các miền nhiễm sắc rộng ở một mức độ phân giải cặp cơ sở. SUPERmerge cho phép điều chỉnh linh hoạt nhiều thông số tích lũy được đọc, do đó tiết lộ cách các đảo đọc tổng hợp lại thành các vùng bao phủ trên toàn bộ bộ gen và các đặc điểm chú thích mà chúng ánh xạ trong các bản sao sinh học riêng lẻ. SUPERmerge đặc biệt hữu ích để điều tra các thí nghiệm ChIP-seq cỡ mẫu thấp trong đó các sửa đổi histone biểu sinh (ví dụ: H3K9me1, H3K27me3) dẫn đến các đỉnh rộng vốn có với phạm vi làm giàu tín hiệu lan tỏa bao gồm nhiều locus gen liên tiếp và các đặc điểm được chú thích.Tính năng
- ChIP-seq
- biểu sinh
- tin sinh học
- sinh hoc tinh toan
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Ngôn ngữ lập trình
C
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/supermerge/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.