Đây là ứng dụng Linux có tên Tax4Fun2 có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống là Tax4Fun2_1.1.3.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên Tax4Fun2 này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
Thuế4Fun2
Ad
MÔ TẢ
Tax4Fun2 không ngừng được phát triển và sẽ thay thế Tax4Fun cũ (http://tax4fun.gobics.de/).Phiên bản mới được xây dựng dựa trên 275 bộ gen vi khuẩn cổ và 12102 (Trạng thái hoàn chỉnh hoặc nhiễm sắc thể trong RefSeq). Tôi không bao gồm MAG hoặc các bộ gen chưa hoàn chỉnh nhưng một trong những tính năng quan trọng của Tax4Fun2 là khả năng kết hợp dữ liệu người dùng (Hỗ trợ Sinh vật nhân sơ và Sinh vật nhân chuẩn). Ngoài ra, chúng tôi đã thêm một tính năng để tính toán các chỉ số dự phòng chức năng (đa). Tôi đã thêm một ví dụ, cách dự đoán cấu hình chức năng và dự phòng chức năng. Để biết thêm chi tiết: https://www.biorxiv.org/content/early/2018/12/09/490037 (Lưu ý rằng đây là bản in trước và chưa có đánh giá đồng cấp).
Bạn sẽ cần phải cài đặt NCBI BLAST + trên hệ thống của mình trước khi có thể sử dụng. Đối với một số chức năng, bạn cần cài đặt gói R ape và seqinr.
Tôi bạn có bất kỳ vấn đề hoặc câu hỏi, xin vui lòng liên hệ với tôi ([email được bảo vệ]).
Tính năng
- Dự đoán chức năng từ dữ liệu rRNA 16S
- Dự phòng chức năng
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/tax4fun2/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
