Đây là ứng dụng Linux có tên Virmid có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống là Virmid-1.2.0.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng này có tên Virmid với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
rắn chắc
MÔ TẢ
TIN TỨC:
11-07-2013 Một phiên bản mới Virmid 1.1.0 đã được tải lên.
Ngày 08 tháng 29 năm 2013 Bài báo Virmid hiện đã được xuất bản trên tạp chí Genome Biology.
Kim S và cộng sự, "Virmid: phát hiện chính xác các đột biến soma với suy luận tạp chất trong mẫu", Genome Biology 2013, 14: R90
http://genomebiology.com/2013/14/8/R90/abstract
Virmid (Virtual Microdissection để gọi SNP) là một trình gọi biến thể dựa trên Java được thiết kế cho các mẫu đối sánh kiểm soát bệnh. Virmid cũng chuyên dụng để xác định khả năng nhiễm bẩn của từng cá thể mà mẫu bệnh không thể được làm sạch đủ. Trong khi tỷ lệ gọi SNP bị ảnh hưởng nghiêm trọng do sự không đồng nhất này, Virmid có thể phát hiện ra các SNP có tần số alen thấp bằng cách xem xét mức độ ô nhiễm (alpha). Các tính năng quan trọng của Virmid là:
• Ước tính sự kết hợp chính xác của mẫu đối chứng trong một mẫu bệnh (hỗn hợp)
• Cải thiện SNP và đột biến soma liên quan đến tỷ lệ ước tính
Tính năng
- Phát hiện đột biến xôma
- Suy luận tạp chất mẫu
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Ngôn ngữ lập trình
Java
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/virmid/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
