Đây là ứng dụng Windows có tên LoopMatcher có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng loopmatcher1.3.3.rar. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng này có tên LoopMatcher với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động bất kỳ trình giả lập trực tuyến OS OnWorks nào từ trang web này, nhưng trình giả lập trực tuyến Windows tốt hơn.
- 5. Từ Hệ điều hành Windows OnWorks bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng và cài đặt nó.
- 7. Tải xuống Wine từ kho phần mềm phân phối Linux của bạn. Sau khi cài đặt, bạn có thể nhấp đúp vào ứng dụng để chạy chúng với Wine. Bạn cũng có thể thử PlayOnLinux, một giao diện đẹp mắt trên Wine sẽ giúp bạn cài đặt các chương trình và trò chơi phổ biến của Windows.
Wine là một cách để chạy phần mềm Windows trên Linux, nhưng không cần Windows. Wine là một lớp tương thích Windows mã nguồn mở có thể chạy các chương trình Windows trực tiếp trên bất kỳ máy tính để bàn Linux nào. Về cơ bản, Wine đang cố gắng triển khai lại đủ Windows từ đầu để nó có thể chạy tất cả các ứng dụng Windows đó mà không thực sự cần đến Windows.
MÀN HÌNH
Ad
Vòng lặp
MÔ TẢ
LoopMatcher là một công cụ tin sinh học tìm kiếm cấu trúc kẹp tóc theo trình tự cDNA / mRNA (ở định dạng FASTA, GenBank hoặc Vienna) với các trình tự đồng thuận cụ thể trong vòng lặp. Nó sử dụng RNAfold để dự đoán cấu trúc trình tự và UShuffle để tạo ra các trình tự ngẫu nhiên với tần số k nucleotide xác định. Ngoài ra, các chuỗi ở định dạng GenBank có thể được tải xuống trực tiếp từ NCBI bằng cách sử dụng ID truy cập NCBI.
Yêu cầu
JAVA Runtime 8. Bạn nên có một bộ xử lý đa lõi để xử lý các chuỗi lớn.
* Hiện tại, phiên bản này chỉ chạy trong Windows x64.
Tính năng
- Hỗ trợ các tệp định dạng GenBank, FASTA và Vienna
- Xử lý một hoặc nhiều tệp
- Nhận và xử lý các chuỗi từ NCBI
- Tìm kiếm nhiều mẫu bằng cách sử dụng mã FASTA IUPAC cho nucleotide
- Tạo các phiên bản xáo trộn bằng tham số k-let (thuật toán Ushuffle)
- Kết quả trong bảng định dạng CSV
- Hai chế độ gấp, bản địa hóa hoặc toàn cầu (toàn bộ chuỗi)
- Gấp với RNAFold (cấu trúc năng lượng tự do tối thiểu)
Khán giả
Khoa học / Nghiên cứu, Giáo dục
Giao diện người dùng
Đu quay Java
Ngôn ngữ lập trình
Java
Môi trường cơ sở dữ liệu
Tập tin phẳng
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/find-a-loop/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
