Đây là ứng dụng Windows có tên PBSuite để chạy trong Windows trực tuyến trên Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống là PBSuite_15.8.24.tgz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên PBSuite này để chạy trong Windows trực tuyến trên Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động bất kỳ trình giả lập trực tuyến OS OnWorks nào từ trang web này, nhưng trình giả lập trực tuyến Windows tốt hơn.
- 5. Từ Hệ điều hành Windows OnWorks bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng và cài đặt nó.
- 7. Tải xuống Wine từ kho phần mềm phân phối Linux của bạn. Sau khi cài đặt, bạn có thể nhấp đúp vào ứng dụng để chạy chúng với Wine. Bạn cũng có thể thử PlayOnLinux, một giao diện đẹp mắt trên Wine sẽ giúp bạn cài đặt các chương trình và trò chơi phổ biến của Windows.
Wine là một cách để chạy phần mềm Windows trên Linux, nhưng không cần Windows. Wine là một lớp tương thích Windows mã nguồn mở có thể chạy các chương trình Windows trực tiếp trên bất kỳ máy tính để bàn Linux nào. Về cơ bản, Wine đang cố gắng triển khai lại đủ Windows từ đầu để nó có thể chạy tất cả các ứng dụng Windows đó mà không thực sự cần đến Windows.
MÀN HÌNH:
PBSuite để chạy trong Windows trực tuyến trên Linux trực tuyến
SỰ MIÊU TẢ:
Đây là nơi tổ chức hai dự án do Adam English tạo ra và duy trì.PBJelly - công cụ nâng cấp bộ gen.
PBHoney - công cụ phát hiện biến thể cấu trúc
Cả hai đều được chứa trong mã PBSuite được tìm thấy trong các bản tải xuống.
----- PBJelly -----
Đọc tờ giấy
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0047768
PBJelly là một đường ống tự động hóa cao giúp điều chỉnh các lần đọc trình tự dài (chẳng hạn như lần đọc PacBio RS hoặc lần đọc dài 454 ở định dạng fasta) với các tập hợp bản nháp có độ tin cậy cao. PBJelly lấp đầy hoặc giảm bớt nhiều khoảng trống đã chiếm được để tạo ra các bộ gen dự thảo được nâng cấp.
----- PBMật ong -----
Đọc tờ giấy
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/180/abstract
PBHoney là một triển khai của hai phương pháp nhận dạng biến thể được thiết kế để khai thác khả năng ánh xạ cao của các lần đọc dài (tức là lớn hơn 10,000 bp). PBHoney xem xét cả sự bất hòa trong lượt đọc và phần đuôi được cắt bớt mềm của các lượt đọc dài để xác định các biến thể cấu trúc.
Tính năng
- Lắp ráp bộ gen
- Nâng cấp bộ gen
- Biến thể cấu trúc
- Đánh giá lắp ráp
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Ngôn ngữ lập trình
Python
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/pb-jelly/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.