这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令blastclust，例如Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或MAC OS 在线模拟器
程序：
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blastclust - 基于 BLAST 分数的单连锁聚类
概要
爆炸团 [-[-C[-L X[-S X[-W N[-a N[-b F[-c 文件名[-d 文件名[-e F]
[-i 文件名[-l 文件名[-o 文件名[-p F[-r 文件名[-s 文件名]
[-v [文件名]]
商品描述
爆炸团 自动和系统地聚类蛋白质或 DNA 序列基于
在蛋白质或 Mega BLAST 的情况下使用 BLAST 算法找到的成对匹配
DNA 算法。 在后一种情况下，对所有数据执行单个 Mega BLAST 搜索
序列与从相同序列创建的数据库相结合。 爆炸团 发现
具有统计显着性匹配的序列对，并使用
单链接聚类。
配置
下面是选项的摘要。
- 打印使用信息
-C 完成未完成的聚类
-L X 长度覆盖阈值（默认值 = 0.9）
-S X 分数覆盖阈值（位分数/长度如果 < 3.0，身份百分比
除此以外; 默认值 = 1.75)
-W N 使用大小词 N （最佳完美匹配的长度；零调用默认行为：3
蛋白质，32 核苷酸）
-a N 要使用的 CPU 数量（默认值 = 1）
-b F 不需要覆盖两个邻居
-c 文件名
从配置文件中读取高级选项 文件名
-d 文件名
作为数据库输入
-e F 禁用数据库格式中的 id 解析
-i 文件名
FASTA 输入文件（程序最终会格式化数据库并删除文件；
默认 = 标准输入）
-l 文件名
将重新聚类限制为 id 列表 文件名
-o 文件名
集群列表的输出文件（默认 = stdout）
-p F 输入是核苷酸，而不是蛋白质。
-r 文件名
恢复邻居以便从 文件名
-s 文件名
保存所有邻居到 文件名
-v [文件名]
打印详细的进度消息（以 文件名)
使用 onworks.net 服务在线使用blastclust
