这是命令 fastq_quality_trimmer 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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fastq_quality_trimmer - 根据质量过滤序列
商品描述
用法:fastq_quality_trimmer [-h] [-v] [-t N] [-l N] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] 部分
A. Gordon 的 FASTX 工具包 0.0.13.1 (戈登@cshl.edu)
[-h] = 这个有用的帮助屏幕。
[-t N] = 质量阈值 - 较低的核苷酸
质量将被修剪(从序列的末尾)。
[-l N] = 最小长度 - 比这更短的序列(修剪后)
将被丢弃。 默认值 = 0 = 没有最小长度。
[-z] = 使用 GZIP 压缩输出。
[-i 文件]
= FASTQ 输入文件。 默认为标准输入。
[-o OUTFILE] = FASTQ 输出文件。 默认为标准输出。 [-v] = 详细 -
报告序列数。
如果指定了 [-o],
报告将打印到 STDOUT。
如果未指定 [-o](并且输出到 STDOUT),则报告将打印到
斯特德尔。
使用 onworks.net 服务在线使用 fastq_quality_trimmer