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fastx_trimmer - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 fastx_trimmer

这是命令 fastx_trimmer 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

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fastx_trimmer - FASTA/Q 修剪器

商品描述


用法:fastx_trimmer [-h] [-f N] [-l N] [-t N] [-m MINLEN] [-z] [-v] [-i INFILE] [-o
OUTFILE] A. Gordon 的 FASTX Toolkit 0.0.14 的一部分([电子邮件保护])

[-h] = 这个有用的帮助屏幕。

[-f N] = 要保留的第一个碱基。 默认值为 1(= 一垒)。

[-l N] = 要保留的最后一个基地。 默认为完整读取。

[-t N] = 从读取的末尾修剪 N 个核苷酸。

“-t”不能与“-l”和“-f”一起使用。

[-m 敏伦]
= 使用 [-t],丢弃比 MINLEN 短的读取。

[-z] = 使用 GZIP 压缩输出。

[-i 文件]
= FASTA/Q 输入文件。 默认为标准输入。

[-o OUTFILE] = FASTA/Q 输出文件。 默认为标准输出。

使用 onworks.net 服务在线使用 fastx_trimmer


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