这是命令 propka,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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propka - 基于 pKa 质子化 PDB 文件
概要
普罗卡 PROPKATM1
商品描述
普罗卡 自动质子化(氢离子的定位)到 PDB 中的结构
任何给定 pKa 值的格式。 要使用的文件必须在
运行 propka 的目录。
普罗卡 将生成两个名为 PROPKATMP2 和 PROPKATMP3 的输出文件。 PROPKATMP2
包含 PDB 格式的结果结构。 PROPKATMP3 包含对
普罗卡 运行。
引用 普卡
请确认您使用 普罗卡 通过引用:
Hui Li、Andrew D. Robertson 和 Jan H. Jensen:非常快速的经验预测和
蛋白质 pKa 值的解释,蛋白质,2005, 61, 704-721。
WEB 服务
PropKa 可以通过 Web 界面使用 http://propka.ki.ku.dk/.
使用 onworks.net 服务在线使用 propka