wb_command - 云端在线

程序：

您的姓名

wb_command - 用于执行各种算法任务的命令行程序
体积、表面和灰度数据

概要

商品描述

-添加到规范文件 将文件添加到规范文件

wb_命令 -添加到规范文件

- 要添加到的规范文件- 的结构
数据文件- 文件的路径

生成的规范文件会覆盖现有的规范文件。
如果规范

文件不存在，它是用默认元数据创建的。
结构

参数必须是以下之一：

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT 小脑 ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDLA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT 皮质
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT 海马_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT 无效 其他 OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-后端平均密集投资回报率 CIFTI 平均密集投资回报率的连接数据库后端命令

wb_命令 -后端平均密集投资回报率

- 逗号分隔的 cifti 指数列表以求平均值- 文件
将平均行写入

此命令可能不是您要查找的命令，请尝试
-cifti-平均密集-roi. 它需要从 cifti 文件列表中取平均值
标准输入，并将其输出写为行大小的小端、32 位整数
后跟作为 32 位浮点数的行。

-后端平均投资回报率相关性 CIFTI 平均投资回报率的连接数据库后端命令
相关性

wb_命令 -后端平均投资回报率相关性

- 逗号分隔的 cifti 索引列表，然后进行平均

关联

- 将平均行写入的文件

此命令可能不是您要查找的命令，请尝试
-cifti 平均 roi 相关性. 它需要从 cifti 文件列表中取平均值
标准输入，并将其输出写为行大小的小端、32 位整数
后跟作为 32 位浮点数的行。

-边框导出颜色表 将边框名称和颜色写为文本

wb_命令 -边框导出颜色表

- 输入边框文件- output - 输出文本文件

[-class-colors] - 使用类颜色而不是名称颜色

获取每个边框的名称和颜色，并将其写入与
-公制标签导入 期待。 默认情况下，边框按边框名称着色，
指定 -类颜色 改为按类为它们着色。 键值从 1 开始
并遵循文件中边框的顺序。

-border-file-export-to-caret5 将边界文件导出为 CARET5 文件格式

wb_命令 -border-file-export-to-caret5

- 工作台边框文件- 名称的前缀
输出插入符5

边框/borderproj/bordercolor 文件

[-surface] - 可重复 - 指定输入表面

- 用于取消边界投影的表面文件

工作台边框文件可能包含多个结构和边框的边框
投影和未投影。 它还包含一个颜色表，用于
国界。

Caret5 有边框（未投影）和边框投影（投影）文件。 在
此外，每个 Caret5 边框或边框投影文件通常包含以下数据：
单一结构。 Caret5 还使用了关联颜色的边框颜色文件
与边界的名称。

此命令将尝试输出 Caret5 边框和边框投影文件。
每个输出边界/边界投影文件将包含一个结构的数据，因此
可能创建了许多文件。 结构名称包含在名称中
创建的每个边框或边框投影文件。

此命令还将生成一个 Caret5 边框颜色文件。

提供表面作为输入参数是可选的，但建议使用。 表面
可能需要创建边界的投影和/或未投影坐标。
如果由于某个原因导致无法生成输出边界或边界投影
缺少具有匹配结构的表面，将显示错误消息并
将不会创建某些输出文件。

写入新文件时，此命令将覆盖同名文件。

-边界合并 将边界文件合并到一个新文件中

wb_命令 -边界合并

- output - 输出边界文件

[-border] - 可重复 - 指定输入边框文件

- 使用边框的边框文件

[-select] - 可重复 - 选择要使用的单个边框

- 边境号码或名称

[-up-to] - 使用包含的边界范围

- 要包含的最后一列的编号或名称

[-reverse] - 以相反的顺序使用范围

取一个或多个边框文件，并从中的边框制作一个新的边框文件
他们。

示例：wb_command -边界合并 出境 -边境 第一边界 -选择 1 -边境
第二个边界

此示例将从 first.border 中获取第一个边框，然后是所有边框
从second.border，并将这些写入out.border。

-边界重采样 将边界文件重新采样到不同的网格

wb_命令 -边界重采样

- 要重新采样的边界文件- 球面
度量是的网格

目前在

- 一个球面，与

并具有所需的输出网格

- output - 输出边界文件

给定两个对齐的球面，重新采样边界文件。 仅有的
与 current-sphere 具有相同结构的边界将被重新采样。

-边界到罗伊斯 从边界获得度量 ROI

wb_命令 -边界到罗伊斯

- 绘制边界的表面- 边界文件
- 输出 - 输出度量文件

[-border] - 只为一个边框创建 ROI

- 边界名称

[-inverse] - 使用反向选择（边框外）

默认情况下，在边框文件的所有边框内绘制 ROI，作为单独的度量
列。

-边界到顶点 在度量文件中将边界绘制为顶点

wb_命令 -边界到顶点

- 绘制边界的表面- 边界文件
- 输出 - 输出度量文件

[-border] - 只为一个边框创建 ROI

- 边界名称

输出一个度量，在边界后面的顶点上为 1，其他地方为 0。 经过
默认情况下，为每个边框创建一个单独的度量列。

-cifti-所有标签到 rois 从 CIFTI 标签地图中的所有标签中获取投资回报率

wb_命令 -cifti-所有标签到 rois

- 输入 cifti 标签文件- 标签图的编号或名称
使用- output - 输出 cifti 文件

输出 cifti 文件对指定输入映射中的每个标签都有一列，其他
比 ？？？ 标签，每个标签都包含所有脑坐标的 ROI
设置为相应的标签。

-cifti-平均值 平均 CIFTI 文件

wb_命令 -cifti-平均值

- 输出 - 输出 cifti 文件

[-exclude-outliers] - 通过每个的标准偏差排除异常值

跨文件元素- 低于平均值的标准差数量
至

包括

- 高于平均值的标准差数量

包括

[-cifti] - 可重复 - 指定输入文件

- 输入 cifti 文件

[-weight] - 给这个文件一个权重

- 使用的重量

将 cifti 文件平均在一起。
没有文件 -重量 给出了指定的

权重为 1。
If -排除异常值 被指定，在每个元素，

所有文件中的数据作为一个集合，其未加权的平均值和样本标准
发现偏差，并且值超出指定数量的标准偏差
被排除在该元素的（潜在加权）平均值之外。

-cifti-平均密集-roi 按投资回报率划分的跨学科的平均 CIFTI 行

wb_命令 -cifti-平均密集-roi

- 输出 - 输出 cifti dscalar 文件

[-cifti-roi] - 包含组合权重的 cifti 文件

- 投资回报率 cifti 文件

[-in-memory] ​​- 将 roi 缓存在内存中，以便它不会被重新读取

每个输入 cifti

[-left-roi] - 用于左半球的权重

- 左侧 roi 作为度量文件

[-right-roi] - 用于右半球的权重

- 正确的投资回报率作为度量文件

[-cerebellum-roi] - 用于小脑表面的权重

- 小脑 roi 作为度量文件

[-vol-roi] - 要使用的体素权重

- roi 卷文件

[-left-area-surf] - 指定顶点区域校正的左表面

- 左表面文件

[-right-area-surf] - 指定用于顶点区域校正的右表面

- 正确的表面文件

[-cerebellum-area-surf] - 指定顶点区域的小脑表面

更正- 小脑表面文件

[-cifti] - 可重复 - 指定输入 cifti 文件

- 一个用于平均的 cifti 文件

平均每个 ROI(s) 地图的行，跨所有文件。
投资回报率图是

视为加权函数，包括负值。
对于

效率，确保所有不打算使用的东西在
投资回报率图。 如果 -cifti-roi 被指定， -左投资回报率, -正确的投资回报率, -小脑-roi及
-vol-roi 不得指定。 如果指定了多个非 cifti ROI 文件，
它们必须具有相同的列数。

-cifti 平均 roi 相关性 将 ROI 平均值与所有行相关联，然后求平均值
必修科

wb_命令 -cifti 平均 roi 相关性

- 输出 - 输出 cifti 文件

[-cifti-roi] - 包含组合权重的 cifti 文件

- 投资回报率 cifti 文件

[-in-memory] ​​- 将 roi 缓存在内存中，以便它不会被重新读取

每个输入 cifti

[-left-roi] - 用于左半球的权重

- 左侧 roi 作为度量文件

[-right-roi] - 用于右半球的权重

- 正确的投资回报率作为度量文件

[-cerebellum-roi] - 用于小脑表面的权重

- 小脑 roi 作为度量文件

[-vol-roi] - 要使用的体素权重

- roi 卷文件

[-left-area-surf] - 指定顶点区域校正的左表面

- 左表面文件

[-right-area-surf] - 指定用于顶点区域校正的右表面

- 正确的表面文件

[-cerebellum-area-surf] - 指定顶点区域的小脑表面

更正- 小脑表面文件

[-cifti] - 可重复 - 指定输入 cifti 文件

- 一个用于平均的 cifti 文件

平均每个 ROI 地图的行，获取每个 ROI 平均值的相关性
到同一文件中的其余行，然后对所有结果求平均值
文件。 ROI 始终被视为加权函数，包括负值。
为了效率，确保所有不打算使用的东西在
投资回报率图。 如果 -cifti-roi 被指定， -左投资回报率, -正确的投资回报率, -小脑-roi,
和 -vol-roi 不得指定。 如果指定了多个非 cifti ROI 文件，
它们必须具有相同的列数。

-cifti-更改时间步长 更改 CIFTI 文件的时间步骤

wb_命令 -cifti-更改时间步长

- 要修改的 cifti 文件

[-row-timestep] - 沿行设置时间步长

- 每个时间步长的秒数

[-column-timestep] - 沿列设置时间步长

- 每个时间步长的秒数

如果指定的维度不是时间点，则发出警告，否则修改时间步长，
如果修改了任何维度，最后将结果写入相同的文件名。
注意：你可能想要 -行时间步长，因为它匹配 .dtseries.nii
规格。 另一个选项仅用于完整性。

-cifti-转换 将 CIFTI 矩阵转储为其他格式

wb_命令 -cifti-转换

[-to-gifti-ext] - 转换为 GIFTI 外部二进制文件

- 输入 cifti 文件- output - 输出gifti文件

[-from-gifti-ext] - 将使用此命令制作的 GIFTI 转换回

国际贸易投资委员会- 输入gifti文件- 输出 - 输出 cifti
文件

[-reset-timepoints] - 将沿行的映射重置为时间点，

从gifti文件中获取长度- 所需的帧之间的时间
- 初始帧所需的时间偏移

[-unit] - 使用时间以外的单位

- 单位标识符（默认第二个）

[-reset-scalars] - 将沿行的映射重置为标量，取长度

来自gifti文件

[-replace-binary] - 用二进制文件替换数据

- 包含替换数据的二进制文件

[-flip-endian] - 字节交换二进制文件

[-transpose] - 转置二进制文件

[-to-nifti] - 转换为 NIFTI1

- 输入 cifti 文件- 输出 - 输出 nifti 文件

[-from-nifti] - 将使用此命令制作的 NIFTI（1 或 2）文件转换回

走进投洽会- 输入 nifti 文件- 一个 cifti 文件
维度和映射

应该使用的

- output - 输出 cifti 文件

[-reset-timepoints] - 将沿行的映射重置为时间点，

从 nifti 文件中获取长度- 所需的帧之间的时间
- 初始帧所需的时间偏移

[-unit] - 使用时间以外的单位

- 单位标识符（默认第二个）

[-reset-scalars] - 将沿行的映射重置为标量，取长度

来自 nifti 文件

[-to-text] - 转换为纯文本文件

- 输入 cifti 文件- output - 输出文本文件

[-col-delim] - 选择要放在连续元素之间的字符串

- 要使用的字符串（默认为制表符）

[-from-text] - 从纯文本转换为 cifti

- 输入文本文件- 一个 cifti 文件
维度和映射

应该使用的

- output - 输出 cifti 文件

[-col-delim] - 指定行中元素之间的字符串

- 要使用的字符串（默认为任何空格）

[-reset-timepoints] - 将沿行的映射重置为时间点，

从文本文件中获取长度- 所需的帧之间的时间
- 初始帧所需的时间偏移

[-unit] - 使用时间以外的单位

- 单位标识符（默认第二个）

[-reset-scalars] - 将沿行的映射重置为标量，取长度

从文本文件

此命令用于将完整的 CIFTI 矩阵转换为/从可转换的格式
由不了解 CIFTI 的程序使用。 如果你想写一个现有的
具有不同 CIFTI 版本的 CIFTI 文件，请参阅 -文件转换，而其
-cifti 版本转换 选项。 如果您想将 CIFTI 文件的一部分作为指标，
标签或卷文件，请参阅 -cifti-分离. 如果要创建 CIFTI 文件
从度量和/或卷文件，请参阅 -cifti-创建-* 命令。 你必须
准确指定其中之一 -to-gifti-分机, -来自-gifti-ext, - 到 nifti, -来自-nifti,
-到文本或 -来自文本。 该 -转置 选项 -来自-gifti-ext 如果需要
替换二进制文件按列优先顺序排列。 这 -单元 选项接受这些
值：

第二赫兹米弧度

-cifti 转换为标量 将 CIFTI 维度更改为命名标量映射

wb_命令 -cifti 转换为标量

- 输入 cifti 文件- 将哪个映射更改为标量映射，
行或列- 输出 - 输出 cifti 文件

[-name-file] - 指定地图的名称

- 包含地图名称的文本文件，每行一个

使用与输入相同的数据创建一个新的 cifti 文件，但使用其中之一
维度设置为包含标识每个地图的字符串。 指定 ROW 将
将 dtseries 文件转换为 dscalar 文件。

-cifti 复制映射 替换 CIFTI 文件上的映射

wb_命令 -cifti 复制映射

- 使用数据的 cifti 文件- 哪个方向
在替换映射- 包含的 cifti 文件
所需的映射- 哪个方向使用
制图

在

- output - 输出 cifti 文件

沿替换方向的长度必须与
具有沿模板方向。 每个方向参数必须是
行或列。

-cifti-相关 在 CIFTI 文件中生成行的相关性

wb_命令 -cifti-相关

- 输入 cifti 文件- 输出 - 输出 cifti 文件

[-roi-override] - 执行从行子集到所有行的关联

[-left-roi] - 使用左半球的 roi

- 左侧 roi 作为度量文件

[-right-roi] - 使用右侧麻球的 roi

- 正确的投资回报率作为度量文件

[-cerebellum-roi] - 对小脑使用 roi

- 小脑 roi 作为度量文件

[-vol-roi] - 使用 roi 作为音量

- 卷 roi 文件

[-cifti-roi] - 使用 cifti 文件进行组合 rois

- cifti roi 文件

[-weights] - 指定列权重

- 每列包含一个权重的文本文件

[-fisher-z] - 将fisher small z 变换（即artanh）应用于相关性

[-no-demean] - 而不是相关，做行的点积，然后

按对角线归一化

[-covariance] - 计算协方差而不是相关

[-mem-limit] - 限制内存使用

- 以千兆字节为单位的内存限制

对于每一行（或 roi 内的每一行，如果 -roi-覆盖 被指定），关联
到所有其他行。 这 -cifti-roi 子选项 -roi-覆盖 可能未指定
与任何其他 -*-roi 子选项，但您可以指定其他 -*-roi 子选项
在一起。

使用时 -费舍尔-z 选项，输出不是 Z 分数，它是 artanh(r)，以
对这个输出做进一步的数学计算，考虑使用 -cifti-数学.

限制内存使用将使其以块为单位计算输出，如果
输入文件大小超过内存限制的 70%，它也会通读
输入文件作为行是必需的，导致多次通过输入
文件（每个块一次）。 内存限制不需要是整数，你也可以
指定 0 以一次计算单个输出行（这可能很慢）。

-cifti-相关-梯度 关联 CIFTI 行并取梯度

wb_命令 -cifti-相关-梯度

- 输入 cifti - 输出 - 输出 cifti

[-left-surface] - 指定要使用的左表面

- 左表面文件

[-left-corrected-areas] - 要使用而不是计算的顶点区域

它们从左表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-right-surface] - 指定要使用的正确表面

- 正确的表面文件

[-right-corrected-areas] - 要使用而不是计算的顶点区域

他们从正确的表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-cerebellum-surface] - 指定要使用的小脑表面

- 小脑表面文件

[-cerebellum-corrected-areas] - 要使用的顶点区域而不是

从小脑表面计算它们- 修正后的顶点
区域，作为度量

[-surface-presmooth] - 在计算之前在表面上平滑

坡度- 高斯表面平滑的 sigma

内核，毫米

[-volume-presmooth] - 在计算梯度之前平滑体积

- 高斯体积平滑核的 sigma，

单位为毫米

[-undo-fisher-z] - 将逆fisher small z 变换应用于

输入

[-fisher-z] - 将fisher small z 变换应用于相关性

在采取梯度之前

[-surface-exclude] - 从每个种子顶点附近排除顶点

计算- 用于排除的种子顶点的测地线距离

区域，毫米

[-volume-exclude] - 从计算中排除每个种子体素附近的体素

- 与禁区种子体素的距离，以毫米为单位

[-covariance] - 计算协方差而不是相关

[-mem-limit] - 限制内存使用

- 以千兆字节为单位的内存限制

对于每个结构，计算结构中行的相关性，并取
结果行的梯度，然后平均它们。 内存限制不需要
要成为整数，您还可以指定 0 以使用尽可能少的内存（这
可能会很慢）。

-cifti-从模板创建密集 使用匹配的密集地图创建 CIFTI

wb_命令 -cifti-从模板创建密集

- 匹配脑坐标的文件- 输出 -
输出 cifti 文件

[-series] - 制作 dtseries 文件而不是 dscalar

- 系列点之间的增量- 系列的起始值

[-unit] - 为系列选择单位（默认为 SECOND）

- 单位标识符

[-volume-all] - 为所有体素数据指定一个输入体积文件

- 输入卷文件

[-from-cropped] - 输入被裁剪到体素数据的大小

在模板文件中

[-cifti] - 可重复 - 使用来自 cifti 文件的输入数据

- 包含输入数据的 cifti 文件

[-metric] - 可重复 - 使用来自度量文件的输入数据

- 将度量文件放入哪个结构中- 输入
公制文件

[-label] - 可重复 - 使用来自表面标签文件的输入数据

- 将标签文件放入哪个结构中- 输入标签
文件

[-volume] - 可重复 - 对单个卷使用卷文件

结构数据- 将卷文件放入哪个结构中
- 输入卷文件

[-from-cropped] - 输入被裁剪到体积的大小

结构体

此命令可帮助您创建新的 dscalar、dtseries 或 dlabel cifti 文件
匹配另一个 cifti 文件中使用的脑坐标空间。 模板文件必须
在沿列方向的映射中具有所需的脑坐标空间（对于
dtseries、dscalar、dlabel 和对称 dconn 总是如此）。 所有输入
cifti 文件必须具有沿列映射的大脑模型并使用相同的体积
空间和/或表面顶点算作它们包含的结构的模板。
如果任何输入文件包含标签数据，则不包含非标签数据的输入文件
允许，并且 -系列 选项可能无法使用。

输入未覆盖的任何结构都填充零或未标记的
键。

这的论证 -公制, -标签 or -体积 必须是其中之一
在以下：

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT 小脑 ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDLA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT 皮质
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT 海马_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT 无效 其他 OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

的论点 -单元 必须是以下之一：

第二赫兹米弧度

-cifti-创建密集标量 创建 CIFTI 密集标量文件

wb_命令 -cifti-创建密集标量

- output - 输出 cifti 文件

[-volume] - 体积分量

- 包含所有体积的所有体素数据的体积文件

结构

- 包含 cifti 标签的标签卷文件

结构

[-left-metric] - 左表面的度量

- 度量文件

[-roi-left] - 从左表面使用的顶点的 roi

- 作为度量文件的 ROI

[-right-metric] - 左表面的度量

- 度量文件

[-roi-right] - 从右表面使用的顶点的 roi

- 作为度量文件的 ROI

[-cerebellum-metric] - 小脑的度量

- 度量文件

[-roi-cerebellum] - 从右表面使用的顶点的 roi

- 作为度量文件的 ROI

所有输入文件必须具有相同数量的列/子卷。
只有

指定的组件将在输出 cifti 中。
地图名称将是

取自输入文件之一。
必须至少有一个组件

指定的。
标签卷应该有一些标签名称来自

此列表中，所有其他标签名称将被忽略：

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT 小脑 ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDLA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT 皮质
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT 海马_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT 无效 其他 OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-创建密集时间序列 创建 CIFTI 密集时间序列

wb_命令 -cifti-创建密集时间序列

- output - 输出 cifti 文件

[-volume] - 体积分量

- 包含所有体积的所有体素数据的体积文件

结构

- 包含 cifti 标签的标签卷文件

结构

[-left-metric] - 左表面的度量

- 度量文件

[-roi-left] - 从左表面使用的顶点的 roi

- 作为度量文件的 ROI

[-right-metric] - 左表面的度量

- 度量文件

[-roi-right] - 从右表面使用的顶点的 roi

- 作为度量文件的 ROI

[-cerebellum-metric] - 小脑的度量

- 度量文件

[-roi-cerebellum] - 从右表面使用的顶点的 roi

- 作为度量文件的 ROI

[-timestep] - 设置时间步长

- 时间步长，以秒为单位（默认 1.0）

[-timestart] - 设置开始时间

- 第一帧的时间，以秒为单位（默认 0.0）

[-unit] - 使用时间以外的单位

- 单位标识符（默认第二个）

所有输入文件必须具有相同数量的列/子卷。
只有

指定的组件将在输出 cifti 中。
最后一个

必须指定组件。
标签卷应该有一些

此列表中的标签名称，所有其他标签名称将被忽略：

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT 小脑 ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDLA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT 皮质
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT 海马_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT 无效 其他 OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

这款 -单元 选项接受这些值：

第二赫兹米弧度

-cifti-创建-标签 创建 CIFTI 标签文件

wb_命令 -cifti-创建-标签

- output - 输出 cifti 文件

[-volume] - 体积分量

- 包含标签数据的卷文件- 标签
带有 cifti 结构名称的卷文件

定义体积包裹

[-left-label] - 左表面的标签文件

- 标签文件

[-roi-left] - 从左表面使用的顶点的 roi

- 作为度量文件的 ROI

[-right-label] - 左表面的标签

- 标签文件

[-roi-right] - 从右表面使用的顶点的 roi

- 作为度量文件的 ROI

[-cerebellum-label] - 小脑的标签

- 标签文件

[-roi-cerebellum] - 从右表面使用的顶点的 roi

- 作为度量文件的 ROI

所有输入文件必须具有相同数量的列/子卷。
只有

指定的组件将在输出 cifti 中。
最后一个

必须指定组件。

这款 -体积 选项 -cifti-创建-标签 需要两个体积参数，
label-volume 参数包含您要显示的所有标签（例如
thalamus），而parcel-volume 参数包括所有CIFTI 结构，您
想要在其中包含数据（例如 THALAMUS_LEFT、THALAMUS_RIGHT）。 如果你只是想要
体素中的标签是结构名称，您可以为两者使用相同的文件
论据。 包裹体积必须使用此列表中的一些标签名称，所有
包裹体积中的其他标签名称将被忽略：

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT 小脑 ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDLA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT 皮质
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT 海马_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT 无效 其他 OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-create-scalar-系列 将系列数据导入 CIFTI

wb_命令 -cifti-create-scalar-系列

- 输入文件- 输出 - 输出 cifti 文件

[-transpose] - 如果文本文件的行沿着标量使用

尺寸

[-name-file] - 使用文本文件在标量维度上设置名称

- 包含名称的文本文件，每行一个

[-series] - 设置系列的单位和值

- 要使用的单位- 第一个系列点的值- 这
系列点之间的间隔

将包含等长系列的文本文件转换为 cifti 文件。 文本
文件应该有由空格分隔的数字组成的行，没有额外的
行间换行。

这参数必须是以下之一：

第二赫兹米弧度

-cifti-互相关 将一个 CIFTI 文件与另一个 CIFTI 文件相关联

wb_命令 -cifti-互相关

- 首先输入 cifti 文件- 第二个输入 cifti 文件
- 输出 - 输出 cifti 文件

[-weights] - 指定列权重

- 每列包含一个权重的文本文件

[-fisher-z] - 将fisher small z 变换（即artanh）应用于相关性

[-mem-limit] - 限制内存使用

- 以千兆字节为单位的内存限制

关联每一行每一行.
这款

沿列映射成为沿输出行的映射。

使用时 -费舍尔-z 选项，输出不是 Z 分数，它是 artanh(r)，以
对这个输出做进一步的数学计算，考虑使用 -cifti-数学.

限制内存使用将使其以块为单位计算输出，通过
通读多次。

-cifti-扩张 扩大 CIFTI 文件

wb_命令 -cifti-扩张

- 输入 cifti 文件- 沿着哪个维度扩张，
行或列- 在表面上膨胀的距离，以毫米为单位
- 在体积中膨胀的距离，以毫米为单位——
output - 输出 cifti 文件

[-left-surface] - 指定要使用的左表面

- 左表面文件

[-left-corrected-areas] - 要使用而不是计算的顶点区域

它们从左表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-right-surface] - 指定要使用的正确表面

- 正确的表面文件

[-right-corrected-areas] - 要使用而不是计算的顶点区域

他们从正确的表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-cerebellum-surface] - 指定要使用的小脑表面

- 小脑表面文件

[-cerebellum-corrected-areas] - 要使用的顶点区域而不是

从小脑表面计算它们- 修正后的顶点
区域，作为度量

[-bad-brainordinate-roi] - 指定要覆盖的脑坐标的 roi，

而不是零- cifti dscalar 或 dtseries 文件，正值
表示

大脑坐标替换它们的值

[-nearest] - 在扩展非标签数据时使用最接近的值

[-merged-volume] - 将体积组件视为单个

元件

对于所有指定为坏的数据值，如果它们与好的值相邻或在
同类模型中一个好的值的指定距离，替换该值
使用附近良好值的距离加权平均值，否则将值设置为
零。 如果 -最近 指定，它将使用最接近的好值中的值
在范围内而不是加权平均值。

.-*-corrected-areas 选项用于按组平均扩展
表面，但它只是对结构减少的近似修正
在一个组平均表面。

If -坏脑协调-roi 指定，所有值，包括那些值
零，是好的，除了在 ROI 中具有正值的位置。 如果是
未指定，只有等于零的值是错误的。

-cifti-估计-fwhm 估计 CIFTI 文件的 FWHM 平滑度

wb_命令 -cifti-估计-fwhm

- 输入 cifti 文件

[-merged-volume] - 将体积组件视为单个

元件

[-column] - 仅对一列进行输出估计

- 列号

[-surface] - 可重复 - 指定输入表面

- 使用这个表面的结构- 表面文件

估计 cifti 文件组件的平滑度，打印估计值
到标准输出。 如果 -合并卷 使用时，所有体素都用作单个
组件，而不是由结构分隔。

必须是以下之一：

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT 小脑 ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDLA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT 皮质
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT 海马_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT 无效 其他 OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-导出密集映射 将索引写入元素映射作为文本

wb_命令 -cifti-导出密集映射

- cifti 文件- 从哪个方向导出映射，
行或列

[-volume-all] - 导出所有体素的映射

- output - 输出文本文件

[-no-cifti-index] - 不要在输出文件中写入 cifti 索引

[-structure] - 在输出中写入每个体素所属的结构

文件

[-surface] - 可重复 - 导出一个表面结构的映射

- 输出结构- output - 输出文本文件

[-no-cifti-index] - 不要在输出文件中写入 cifti 索引

[-volume] - 可重复 - 导出一个卷结构的映射

- 输出结构- output - 输出文本文件

[-no-cifti-index] - 不要在输出文件中写入 cifti 索引

此命令生成描述从 cifti 索引到
表面顶点或体素。 所有索引都是从零开始的。 默认格式为
-表面 是以下形式的行：



默认格式为 -体积 和 -音量-全部 是以下形式的行：



-cifti-极值 在 CIFTI 文件中查找极值

wb_命令 -cifti-极值

- 输入 cifti - 极值之间的最小距离
一样的

类型，用于表面组件

- 相同极值之间的最小距离

类型，用于体积分量

- 沿哪个维度查找极值，ROW 或 COLUMN ——
output - 输出 cifti

[-left-surface] - 指定要使用的左表面

- 左表面文件

[-right-surface] - 指定要使用的正确表面

- 正确的表面文件

[-cerebellum-surface] - 指定要使用的小脑表面

- 小脑表面文件

[-surface-presmooth] - 在找到极值之前在表面上平滑

- 高斯表面平滑的 sigma

内核，毫米

[-volume-presmooth] - 在找到极值之前平滑体积分量

- 高斯体积平滑核的 sigma，

单位为毫米

[-threshold] - 忽略小极值

- 考虑作为最小值的最大值- 最小的
考虑为最大值的值

[-merged-volume] - 将体积组件视为单个

元件

[-sum-maps] - 输出极值图的总和而不是每个图

另

[-consolidate-mode] - 使用局部最小值的合并而不是

大街区

[-only-maxima] - 只找到最大值

[-only-minima] - 只找到最小值

在 cifti 文件中查找具有比所有更极端值的空间位置
同一组件（表面或体积结构）中的附近位置。 输入
cifti 文件必须有一个沿着指定方向映射的大脑模型。 柱子
是适用于 dtseries 和 dscalar 的方向。 对于 dconn，如果它是对称的
使用 COLUMN，否则使用 ROW。

-cifti-假相关 比较本地和跨/通过 SULCI/GYRI 的相关性

wb_命令 -cifti-假相关

- 用于关联的 cifti 文件 <3D-dist> - 最大 3D 距离
检查每个顶点- 用于的最大测地距离
邻接

相关

- 用于相邻的最小测地距离

相关

- output - 输出 cifti dscalar 文件

[-left-surface] - 指定要使用的左表面

- 左表面文件

[-dump-text] - 转储用于文本文件的原始度量

- 输出文本文件

[-right-surface] - 指定要使用的正确表面

- 正确的表面文件

[-dump-text] - 转储用于文本文件的原始度量

- 输出文本文件

[-cerebellum-surface] - 指定要使用的小脑表面

- 小脑表面文件

[-dump-text] - 转储用于文本文件的原始度量

- 输出文本文件

对于每个顶点，计算测地线范围内的平均相关性
不跨越沟/回的距离，以及与最近的相关性
顶点穿过沟/回。 一个顶点被认为是穿过沟/回，如果
3D 距离小于测地线距离的三分之一。 输出文件
包含这些相关性之间的比率，以及一些额外的地图来帮助
解释一下比例。

-cifti-查找集群 按面积/体积过滤集群

wb_命令 -cifti-查找集群

- 输入 cifti - 表面数据的阈值
价值观- 表面簇区域的阈值，以 mm^2 为单位
- 体积数据值的阈值——
体积簇大小的阈值，以 mm^3 为单位- 用于哪个维度
空间信息，ROW 或

COLUMN

- 输出 - 输出 cifti

[-less-than] - 查找小于的值， 而不是

更大的

[-left-surface] - 指定要使用的左表面

- 左表面文件

[-corrected-areas] - 使用顶点区域而不是计算它们

从表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-right-surface] - 指定要使用的正确表面

- 正确的表面文件

[-corrected-areas] - 使用顶点区域而不是计算它们

从表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-cerebellum-surface] - 指定要使用的小脑表面

- 小脑表面文件

[-corrected-areas] - 使用顶点区域而不是计算它们

从表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-cifti-roi] - 仅在感兴趣的区域内搜索

- 要在其中搜索的区域，作为 cifti 文件

[-merged-volume] - 将体积组件视为单个

元件

[-size-ratio] - 忽略小于给定分数的簇

结构中最大的簇- 结构的一部分
最大的集群区域- 结构最大集群的一部分
体积

[-distance] - 忽略距离超过给定距离的集群

结构中最大的簇- 离最大的有多远
集群一个集群可以

是，边到边，毫米

- 集群离最大集群有多远，

边到边，mm

[-start] - 从 1 以外的值开始标记集群

- 给出找到的第一个簇的值

输出一个 cifti 文件，其中包含一个大范围内所有脑坐标的非零整数
足够的集群，其他地方为零。 整数表示集群成员资格（通过
默认情况下，找到的第一个集群将使用值 1，第二个集群 2 等）。 输入
cifti 文件必须有一个大脑模型映射到所选维度上，列
.dtseries 或 .dconn。 投资回报率应该有一个脑模型映射
列，与输入文件中所选方向的映射完全匹配。
ROI 之外的数据将被忽略。

-cifti-梯度 取 CIFTI 文件的梯度

wb_命令 -cifti-梯度

- 输入 cifti - 渐变的维度，
行或列- 输出 - 输出 cifti

[-left-surface] - 指定要使用的左表面

- 左表面文件

[-left-corrected-areas] - 要使用而不是计算的顶点区域

它们从左表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-right-surface] - 指定要使用的正确表面

- 正确的表面文件

[-right-corrected-areas] - 要使用而不是计算的顶点区域

他们从正确的表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-cerebellum-surface] - 指定要使用的小脑表面

- 小脑表面文件

[-cerebellum-corrected-areas] - 要使用的顶点区域而不是

从小脑表面计算它们- 修正后的顶点
区域，作为度量

[-surface-presmooth] - 在计算之前在表面上平滑

坡度- 高斯表面平滑的 sigma

内核，毫米

[-volume-presmooth] - 在计算梯度之前在表面上平滑

- 高斯体积平滑核的 sigma，

单位为毫米

[-average-output] - 输出梯度幅值图的平均值

而不是单独的每个渐变图

[-vectors] - 输出梯度向量

- 输出 - 向量，作为 dscalar 文件

对 cifti 文件的每个组件执行梯度计算，并可选
平均得到的梯度。 这 -向量 和 -平均输出 选项可能不会
一起使用。 您必须为每个表面结构指定一个表面
cifti 文件。 COLUMN 方向应该更快，并且是有效的方向
在 dt 系列上。 对于 dconn，您可能需要 ROW，除非您正在使用
-平均输出.

-cifti-label-邻接 制作 CIFTI 标签文件的邻接矩阵

wb_命令 -cifti-label-邻接

- 输入 cifti 标签文件- 输出 - 输出 cifti
pconn邻接矩阵

[-left-surface] - 指定要使用的左表面

- 左表面文件

[-right-surface] - 指定要使用的正确表面

- 正确的表面文件

[-cerebellum-surface] - 指定要使用的小脑表面

- 小脑表面文件

找到具有不同标签值的面相邻体素和连接顶点，
并为每对计算它们。 将结果计数放入一个parcellated
连接文件，对角线为零。 这给出了一个粗略的估计
两个标签之间的边界有多长或多宽。

-cifti-标签导出表 从 CIFTI 导出标签表为文本

wb_命令 -cifti-标签导出表

- 输入 cifti 标签文件- 标签图的编号或名称
使用- output - 输出文本文件

从 cifti 标签图中获取标签表，并将其写入文本格式
符合预期 -cifti 标签导入.

-cifti 标签导入 从 CIFTI 文件制作 CIFTI 标签文件

wb_命令 -cifti 标签导入

- 输入 cifti 文件- 包含值的文本文件
和标签名称- output - 输出 cifti 标签文件

[-discard-others] - 将标签列表中未提及的任何值设置为

？？？ 标签

[-unlabeled-value] - 设置将被解释为未标记的值

- 未标记的数值（默认为 0）

[-drop-unused-labels] - 从标签中删除任何未使用的标签值

表

从具有类似标签的值的 cifti 文件创建 cifti 标签文件。
您

可以指定空字符串（'' 将适用于 linux/mac） ,
这将被视为一个空文件。 标签列表文件必须有
以下格式的行：



不要在文件中指定“unlabeled”键，假设0表示没有
标记除非 -未标记值 被指定。 标签名称必须在单独的
行，但可能包含空格或其他不寻常的字符（但不是换行符）。
空格从标签名称的两端修剪，但如果它在
标签的中间。 red、green、blue 和 alpha 的值必须是整数
0 到 255，并将指定标签绘制的颜色（alpha 为 255 表示
不透明，这可能是您想要的）。 默认情况下，它将设置新的标签名称
对于列表中未提及的任何遇到的值，名称为 LABEL_#
文件，指定 -丢弃其他人 改为将这些设置为“未标记”键。

-cifti-标签到 roi 将 CIFTI 标签转化为投资回报率

wb_命令 -cifti-标签到 roi

- 输入 cifti 标签文件- 输出 - 输出 cifti
标量文件

[-name] - 按名称选择标签

- 您想要投资回报率的标签名称

[-key] - 按键选择标签

- 您想要投资回报率的标签键

[-map] - 选择要使用的单个标签地图

- 地图编号或名称

对于每个地图, 地图创建于所有地点在哪里
标有或用钥匙给定值为 1，并且
所有其他位置都为 0。正好是其中之一 -芋头 和 -键 必须指定。
指定 地图 只使用一张地图.

-cifti-数学 评估 CIFTI 文件上的表达式

wb_命令 -cifti-数学

- 要评估的表达式，在引号中- 输出 -
输出 cifti 文件

[-fixnan] - 用一个值替换 NaN 结果

- 用 NaN 替换的值

[-override-mapping-check] - 不检查映射的兼容性，

只检查长度

[-var] - 可重复 - 用作变量的 cifti 文件

- 表达式中使用的变量名称- cifti
用作此变量的文件

[-select] - 可重复 - 从维度中选择单个索引

- 要选择的维度（基于 1） - 要使用的索引（基于 1）

[-repeat] - 为每个输出索引重复选定的值

这个维度

此命令评估在每个矩阵元素上独立。 那里
必须至少是一个 -变量 选项（从中获取输出布局），即使
中指定的不用于.

要从 2D 文件（大多数 cifti 文件是 2D）中选择单列，请使用 -选择 1
， 在哪里是基于 1 的。 要从 2D 文件中选择一行，请使用
-选择 2 . 在哪里 -选择 未使用，cifti 文件必须具有兼容
映射（例如，大脑模型和包裹映射必须完全匹配，除了
包裹名称）。 用 -覆盖映射检查 跳过此检查。

文件名无效, 使用一个变量名和一个 -变量 选项与
匹配指定一个输入文件。 的格式就像
如下：

表达式由常量、变量、运算符、括号和函数组成，
中缀表示法，例如 'exp(-x + 3) * 规模'。 变量是任何字符串
长度，使用字符 az、AZ、0-9 和 _，但不能采用 a 的名称
名为常数。 目前，只有一个命名常量 PI。 运营商
是 +、-、*、/、^、>、<、>=、<=、==、!=、!、&&、||。 这些行为与 C 中的一样，除了
^ 是求幂，即 pow(x, y)，并且比其他优先级更高
二元运算符（同样，'-3^-4^-5' 表示'-(3^(-(4^-5)))'）。 <=、>=、== 和 !=
运营商有少量回旋余地，相当于百万分之一
被比较值的绝对值中较小的一个。

比较和逻辑运算符返回 0 或 1，您可以使用表达式进行屏蔽
像'x *（掩码> 0）'。 对于所有逻辑运算符，输入被认为是真实的
它大于 0。表达式 '0 < x < 5' 在语法上没有错误，但是
它不会做我们想要的，因为它是从左到右计算的，即 '((0
x) < 5)'，它将始终返回 1，因为比较的两种可能结果都是
小于 5。如果检测到此类型的表达式，则会生成警告。
使用诸如 'x > 0 && x < 5' 之类的东西来获得所需的行为。

元素之间的空白被忽略，' sin ( 2 * x ) ' 等价于
'sin(2*x)'，但 'sin(2*x)' 是一个错误。 不允许隐式乘法，
表达式 '2x' 将被解析为变量。 括号是()，不要用
[] 或者 {}。 函数需要括号，表达式“sin x”是错误的。

支持以下功能：

sin：1个参数，参数的正弦（单位是弧度）cos：1个参数，
参数的余弦（单位是弧度） tan：1 个参数，正切
参数（单位是弧度） asin：1 个参数，参数的正弦的倒数，
弧度 acos：1 个参数，参数余弦的倒数，以弧度为单位
atan: 1 个参数，参数正切的倒数，以弧度为单位 atan2: 2
参数，atan2(y, x) 返回正切的倒数

(y/x)，以弧度为单位，通过两个参数的符号确定象限

sinh: 1 个参数，参数的双曲正弦 cosh: 1 个参数，
参数 tanh 的双曲余弦：1 个参数，是
参数 asinh: 1 参数，参数 acosh: 1 的反双曲正弦
参数，参数 atanh 的反双曲余弦：1 个参数，
参数 ln 的反双曲线正切：1 个参数，自然对数
参数 exp：1 个参数，常数 e 的参数的幂
log：1 个参数，以 10 为底的对数 sqrt：1 个参数，平方
参数根 abs：1 个参数，参数 floor 的绝对值：1
参数，不大于参数round的最大整数：1个参数，
最接近的整数，关系四舍五入

零

ceil：1个参数，不小于参数的最小整数 min：2个参数，
min(x, y) 如果 (x > y) 返回 y，否则 x 最大：2 个参数，max(x, y) 返回 y
if (x < y), x 否则 mod: 2 个参数, mod(x, y) = x - y * floor(x / y), or 0 if
y == 0 钳位：3 个参数，钳位（x，低，高）= min（最大（x，低），高）

-cifti 合并 合并 CIFTI 时间序列、标量或标签文件

wb_命令 -cifti 合并

- 输出 - 输出 cifti 文件

[-cifti] - 可重复 - 指定输入 cifti 文件

- 使用列的 cifti 文件

[-column] - 可重复 - 选择要使用的单列

- 列索引（从 1 开始）

[-up-to] - 使用包含范围的列

- 要包含的最后一列的索引

[-reverse] - 以相反的顺序使用范围

给定输入 CIFTI 文件，这些文件具有沿列的匹配映射，并且
沿行的映射是相同的类型，都是系列、标量或标签，这
命令水平连接指定的列（行变长）。

示例：wb_command -cifti 合并 输出.dtseries.nii -奇夫提 第一个.dtseries.nii -柱
1 -奇夫提 第二个.dtseries.nii

此示例将采用 first.dtseries.nii 中的第一列，然后是所有
second.dtseries.nii 中的列，并将这些列写入 out.dtseries.nii。

-cifti-合并密集 沿密集维度合并 CIFTI 文件

wb_命令 -cifti-合并密集

- 要合并的维度，ROW 或 COLUMN - 输出 -
输出 cifti 文件

[-cifti] - 可重复 - 指定输入 cifti 文件

- 要合并的 cifti 文件

输入 cifti 文件必须具有沿方向的匹配映射，而不是
指定，并且沿着指定方向的映射必须是大脑模型。

-cifti-成对相关 关联两个 CIFTI 文件之间的成对行

wb_命令 -cifti-成对相关

- 首先输入 cifti 文件- 第二个输入 cifti 文件
- 输出 - 输出 cifti 文件

[-fisher-z] - 将fisher small z 变换（即artanh）应用于相关性

对于中的每一行，将其与中的同一行相关联，并把
结果在同一行，它只有一列。

- cifti-调色板 在 CIFTI 文件上设置调色板

wb_命令 - cifti-调色板

- cifti 输入- 映射模式- 输出 -
输出 cifti 文件

[-column] - 为标量映射选择单列

- 列号或名称

[-pos-percent] - 正数据着色的最小/最大百分比

- 最不积极数据的百分位数- 这
最积极数据的百分位数

[-neg-percent] - 负数据着色的最小/最大百分比

- 最少负面数据的百分位数- 这
最负面数据的百分位数

[-pos-user] - 正数据着色的用户最小/最大值

- 最小正数据的值- 价值
对于最积极的数据

[-neg-user] - 负数据着色的用户最小/最大值

- 最少负数据的值- 价值
对于最负面的数据

[-interpolate] - 内插颜色

- 布尔值，是否插值

[-disp-pos] - 显示正数据

- 布尔值，是否显示

[-disp-neg] - 显示正数据

- 布尔值，是否显示

[-disp-zero] - 显示比最小截止值更接近零的数据

- 布尔值，是否显示

[-palette-name] - 设置使用的调色板

- 调色板的名称

[-thresholding] - 设置阈值

- 阈值设置- 显示阈值内或外的值
- 较低的门槛- 上限

注意：输出文件必须与输入文件不同。

对于标量贴图，默认情况下每个贴图的调色板都会改变，指定 -柱
只更改一张地图。 未指定的调色板设置将从
标量映射的第一列，以及其他映射的现有文件选项板
类型。 这参数必须是以下之一：

MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE

这论据 -调色板名称 必须是以下之一：

PSYCH PSYCH-NO-NONE ROY-BIG ROY-BIG-BL 橙黄色 灰色_Interp_Positive
Gray_Interp clear_brain 视频风格 fidl raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG 红黄蓝浅蓝 FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_蓝色 fsl_黄色 JET256

这论据 -阈值 必须是以下之一：

THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL

这论据 -阈值 必须是以下之一：

THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE

-cifti-包裹映射到标签 从打包文件创建 DLABEL

wb_命令 -cifti-包裹映射到标签

- 输入的分块文件- 取哪个维度
来自，ROW 或 COLUMN 的包裹地图- 具有所需的 cifti 文件
沿密集映射

栏

- output - 输出密集标签文件

此命令将输出一个 dlabel 文件，用于对
另一个密集的文件。

对于 ptseries、pscalar、plabel、pconn 和 pdconn，使用 ROW 将要
工作。

-cifti-包裹 打包 CIFTI 文件

wb_命令 -cifti-包裹

- 要打包的 cifti 文件- 要使用的 cifti 标签文件
用于分割- 映射到parcellate、ROW 或COLUMN
- 输出 - 输出 cifti 文件

cifti 标签文件中的每个标签都将被视为一个包裹，所有行或
地块内的列被平均在一起以形成输出行或列。
如果指定了 ROW，则沿行的输入映射必须是脑坐标，并且
沿行的输出映射将是包裹，这意味着列将被平均
一起。 对于 dtseries 或 dscalar，请使用 COLUMN。

-cifti-减少 沿 CIFTI 行执行还原操作

wb_命令 -cifti-减少

- 要减少的 cifti 文件- 要使用的归约运算符
- output - 输出 cifti 文件

[-exclude-outliers] - 按标准从每一行中排除异常值

偏差- 低于平均值的标准差数量

包括

- 高于平均值的标准差数量

包括

对于每个 cifti 行，将沿行的数据作为向量，并执行
对其指定减少，将结果放入单个输出列中
排。 归约运算符如下：

MAX：最大值 MIN：最小值 INDEXMAX：从 1 开始的索引
最大值 INDEXMIN：最小值的从 1 开始的索引 SUM：将所有值相加
PRODUCT：乘以所有值 MEAN：数据的均值 STDEV：标准
偏差（N分母） SAMPSTDEV：样本标准偏差（N-1
分母）VARIANCE：数据的方差 MEDIAN：数据的中位数
MODE：数据的模式 COUNT_NONZERO：数据中非零元素的个数
data

-cifti-重新排序 在 CIFTI 文件中重新排列包裹或标量/标签图

wb_命令 -cifti-重新排序

- 输入分块的 cifti 文件- 要重新排序的维度
沿、行或列- 包含所需订单的文本文件
转型- 输出 - 重新排序的 cifti 文件

沿指定方向的映射必须是宗地、标量或标签。 为了
pscalar 或 ptseries，使用 COLUMN 对包裹重新排序。 对于 dlabel，使用 ROW。 这
文件必须包含由空格分隔的从 1 开始的索引（空格、
换行符、制表符等），索引数与沿着指定的
尺寸。 这些索引指定哪个当前索引应该在那个
位置，例如，如果当前订单是“ABC D”，而所需的订单是
'DAB C'，文本文件应包含'4 1 2 3'。

-cifti-替换结构 替换 CIFTI 文件结构中的数据

wb_命令 -cifti-替换结构

- 要修改的 cifti - 将哪个维度解释为
单个地图，ROW 或 COLUMN

[-volume-all] - 替换所有卷组件中的数据

- 输入音量

[-from-cropped] - 输入被裁剪到数据的大小

[-discard-unused-labels] - 在 dlabel 文件上操作时，删除任何

标签表中未使用的标签键

[-label] - 可重复 - 替换表面标签组件中的数据

- 替换数据的结构- 输入标签文件

[-metric] - 可重复 - 替换表面组件中的数据

- 替换数据的结构- 输入指标

[-volume] - 可重复 - 替换卷组件中的数据

- 替换数据的结构- 输入音量

[-from-cropped] - 输入被裁剪到组件的大小

您必须至少指定以下一项 -公制, -标签, -体积或 -音量-全部 这
命令做任何事。 输入量必须与输出量一致
-cifti-分离. 对于 dtseries/dscalar，使用 COLUMN，如果你的矩阵是
完全对称，COLUMN 效率更高。 结构参数必须是以下之一
执行以下操作：

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT 小脑 ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDLA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT 皮质
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT 海马_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT 无效 其他 OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-重采样 将 CIFTI 文件重新采样到新的 CIFTI 空间

wb_命令 -cifti-重采样

- 要重新采样的 cifti 文件- 输入的方向
应该重新采样- 包含 cifti 空间的 cifti 文件
重新采样到- 用作模板的方向

重采样空间

- 指定表面重采样方法- 指定一个
体积插值法- output - 输出 cifti 文件

[-surface-largest] - 使用最大权重而不是加权平均

进行表面重采样

[-volume-predilate] - 在重新采样之前扩大体积分量

- 距离，以毫米为单位，扩张

[-surface-postdilate] - 重采样后扩张表面分量

- 距离，以毫米为单位，扩张

[-affine] - 对体积分量使用仿射变换

- 要使用的仿射文件

[-flirt] - 如果仿射是调情仿射，则必须使用

- 生成仿射时使用的源体积
- 生成仿射时使用的目标体积

[-warpfield] - 在体积组件上使用 warpfield

- 要使用的warpfield

[-fnirt] - 如果使用 fnirt warpfield，则必须使用

- 生成时使用的源卷

场域

[-left-spheres] - 指定左表面重采样的球体

- 与当前左侧网格相同的球体

表面

- 一个球体与新的左侧网格对齐

与当前球体

[-left-area-surfs] - 指定左表面做顶点区域

修正依据- 相关的左侧解剖表面
当前

网格

- 具有新网格的相关左侧解剖表面

[-left-area-metrics] - 指定左顶点区域度量来做区域

修正依据- 带有顶点区域的度量文件
当前

网格

- 带有新网格顶点区域的度量文件

[-right-spheres] - 指定右表面重采样的球体

- 与当前右侧具有相同网格的球体

表面

- 一个球体与新的右侧网格对齐

与当前球体

[-right-area-surfs] - 指定右表面做顶点区域

修正依据- 相关的右侧解剖表面
当前

网格

- 具有新网格的相关右侧解剖表面

[-right-area-metrics] - 指定右顶点区域度量来做区域

修正依据- 带有顶点区域的度量文件
当前

网格

- 带有新网格顶点区域的度量文件

[-cerebellum-spheres] - 指定小脑表面重采样的球体

- 一个与当前网格相同的球体

小脑表面

- 带有新小脑网格的球体

注册到当前领域

[-cerebellum-area-surfs] - 指定小脑表面做顶点

基于区域校正- 相关的小脑解剖表面
-

当前网格

- 具有新网格的相关小脑解剖表面

[-cerebellum-area-metrics] - 指定小脑顶点面积度量

做面积校正基于- 带有顶点区域的度量文件
电流

网格

- 带有新网格顶点区域的度量文件

将 cifti 数据重新采样到不同的脑坐标空间。
使用列

重新采样 dscalar、dlabel 或 dtseries 的方向。
重采样两者

dconn 的维度需要运行此命令两次，一次使用 COLUMN 和
一次与 ROW。 如果您正在重新采样 dconn 并且您的机器有大量
内存，你可以考虑使用 -cifti-resample-dconn-内存 避免写作
并重读一个中间文件。 如果没有为表面指定球体
存在于 cifti 文件中的结构，其数据被复制而无需重新采样或
扩张。 扩张是用“最近的”方法完成的，并在
用于表面数据。 在膨胀之前填充体积分量，以便膨胀
不会碰到组件边界框的边缘。

推荐的重采样方法是 ADAP_BARY_AREA 和 CUBIC（三次样条），
除了应该使用 ADAP_BARY_AREA 和 ENCLOSING_VOXEL 的标签数据。

这参数必须是以下之一：

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

这参数必须是以下之一：

ADAP_BARY_AREA 重心

-cifti-resample-dconn-内存 使用大量内存重新采样 DCONN

wb_命令 -cifti-resample-dconn-内存

- 要重新采样的 cifti 文件- 包含的 cifti 文件
要重新采样到的 cifti 空间- 模板的方向
用作

重采样空间

- 指定表面重采样方法- 指定一个
体积插值法- output - 输出 cifti 文件

[-surface-largest] - 使用最大权重而不是加权平均

进行表面重采样

[-volume-predilate] - 在重新采样之前扩大体积分量

- 距离，以毫米为单位，扩张

[-surface-postdilate] - 重采样后扩张表面分量

- 距离，以毫米为单位，扩张

[-affine] - 对体积分量使用仿射变换

- 要使用的仿射文件

[-flirt] - 如果仿射是调情仿射，则必须使用

- 生成仿射时使用的源体积
- 生成仿射时使用的目标体积

[-warpfield] - 在体积组件上使用 warpfield

- 要使用的warpfield

[-fnirt] - 如果使用 fnirt warpfield，则必须使用

- 生成时使用的源卷

场域

[-left-spheres] - 指定左表面重采样的球体

- 与当前左侧网格相同的球体

表面

- 一个球体与新的左侧网格对齐

与当前球体

[-left-area-surfs] - 指定左表面做顶点区域

修正依据- 相关的左侧解剖表面
当前

网格

- 具有新网格的相关左侧解剖表面

[-left-area-metrics] - 指定左顶点区域度量来做区域

修正依据- 带有顶点区域的度量文件
当前

网格

- 带有新网格顶点区域的度量文件

[-right-spheres] - 指定右表面重采样的球体

- 与当前右侧具有相同网格的球体

表面

- 一个球体与新的右侧网格对齐

与当前球体

[-right-area-surfs] - 指定右表面做顶点区域

修正依据- 相关的右侧解剖表面
当前

网格

- 具有新网格的相关右侧解剖表面

[-right-area-metrics] - 指定右顶点区域度量来做区域

修正依据- 带有顶点区域的度量文件
当前

网格

- 带有新网格顶点区域的度量文件

[-cerebellum-spheres] - 指定小脑表面重采样的球体

- 一个与当前网格相同的球体

小脑表面

- 带有新小脑网格的球体

注册到当前领域

[-cerebellum-area-surfs] - 指定小脑表面做顶点

基于区域校正- 相关的小脑解剖表面
-

当前网格

- 具有新网格的相关小脑解剖表面

[-cerebellum-area-metrics] - 指定小脑顶点面积度量

做面积校正基于- 带有顶点区域的度量文件
电流

网格

- 带有新网格顶点区域的度量文件

此命令与运行的作用相同 -cifti-重采样 两次，但使用内存
最多大约是中间文件大小的 2 倍。 这是
因为中间 dconn 保存在内存中，而不是写入磁盘，并且
重采样/膨胀之前和之后的组件必须在内存中
在相关计算过程中同时进行。 如果没有为 a 指定球体
存在于 cifti 文件中的表面结构，其数据被复制而无需
重采样或膨胀。 扩张是用“最近的”方法完成的，并在
用于表面数据。 体积分量在膨胀之前被填充，所以
该扩张不会进入组件边界框的边缘。

这参数必须是以下之一：

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

这参数必须是以下之一：

ADAP_BARY_AREA 重心

-cifti-限制密集地图 从 CIFTI 文件中排除脑标

wb_命令 -cifti-限制密集地图

- 输入 cifti - 改变映射的维度
上、行或列- 输出 - 输出 cifti

[-cifti-roi] - 包含组合 rois 的 cifti 文件

- 作为 cifti 文件的 rois

[-left-roi] - 从左半球使用的顶点

- 左侧 roi 作为度量文件

[-right-roi] - 从右半球使用的顶点

- 正确的投资回报率作为度量文件

[-cerebellum-roi] - 从小脑使用的顶点

- 小脑 roi 作为度量文件

[-vol-roi] - 要使用的体素

- roi 卷文件

写一个修改过的版本，所有脑坐标之外的
指定的 roi(s) 从文件中删除。 如果 -cifti-roi 指定，没有其他
可以指定 -*-roi 选项。 如果不使用 -cifti-roi, 任何 -*-roi 选项不
如果存在于输入文件中，present 将丢弃相关结构。

-cifti-roi-平均 单个 CIFTI 文件中的平均行数

wb_命令 -cifti-roi-平均

- 用于平均行的 cifti 文件- 输出文本文件
平均值

[-cifti-roi] - 包含组合 rois 的 cifti 文件

- 作为 cifti 文件的 rois

[-left-roi] - 从左半球使用的顶点

- 左侧 roi 作为度量文件

[-right-roi] - 从右半球使用的顶点

- 正确的投资回报率作为度量文件

[-cerebellum-roi] - 从小脑使用的顶点

- 小脑 roi 作为度量文件

[-vol-roi] - 要使用的体素

- roi 卷文件

平均指定 ROI 内的行，并写入结果
平均行到文本文件，由换行符分隔。 如果 -cifti-roi 被指定，
-左投资回报率, -正确的投资回报率, -小脑-roi及 -vol-roi 不得指定。

-cifti-rois-来自极值 从极值地图创建 CIFTI 投资回报率地图

wb_命令 -cifti-rois-来自极值

- 输入 cifti - 从顶点的测地线距离限制，以毫米为单位
- 从体素中心的欧几里德距离限制，以毫米为单位- 哪一个
极值图沿的维度，ROW 或 COLUMN - 输出 - 输出
奇夫提

[-left-surface] - 指定要使用的左表面

- 左表面文件

[-right-surface] - 指定要使用的正确表面

- 正确的表面文件

[-cerebellum-surface] - 指定要使用的小脑表面

- 小脑表面文件

[-gaussian] - 生成高斯内核而不是平面 ROI

- 表面高斯核的 sigma，单位为 mm - 这
体积高斯核的 sigma，单位为 mm

[-overlap-logic] - 如何处理重叠的 ROI，默认为 ALLOW

- 解决重叠的方法

[-merged-volume] - 将体积组件视为单个

元件

对于每个地图中的每个非零值，制作一个地图，在该位置周围有一个 ROI。
如果 -高斯 指定选项，然后输出归一化的高斯核
而不是投资回报率。 这论据 -重叠逻辑 必须是允许之一，
最接近，或排除。 ALLOW 是默认值，表示处理 ROI
独立且可能重叠。 CLOSEST 意味着 ROI 可能不会重叠，并且
没有 ROI 包含更接近不同种子顶点的顶点。 排除意味着
ROI 不能重叠，并且任何顶点在一个以上的 ROI 范围内
不属于任何 ROI。

-cifti-分离 将 CIFTI 结构写为公制、标签或体积

wb_命令 -cifti-分离

- 分离组件的 cifti - 去哪个方向
分成组件，ROW 或 COLUMN

[-volume-all] - 将所有卷结构分成一个卷文件

- 输出 - 输出音量

[-roi] - 还输出哪些体素有数据的 roi

- 输出 - 投资回报率输出量

[-label] - 输出指示位置的卷标文件

结构- output - 标签输出量

[-crop] - 将体积裁剪到数据的大小，而不是使用

原始卷大小

[-label] - 可重复 - 将表面模型分离为表面标签

文件- 输出结构- 输出 - 输出标签
文件

[-roi] - 还输出顶点有数据的 roi

- 输出 - 投资回报率输出指标

[-metric] - 可重复 - 将表面模型分离成一个度量文件

- 输出结构- 输出 - 输出指标

[-roi] - 还输出顶点有数据的 roi

- 输出 - 投资回报率输出指标

[-volume] - 可重复 - 将卷结构分离成卷文件

- 输出结构- 输出 - 输出音量

[-roi] - 还输出哪些体素有数据的 roi

- 输出 - 投资回报率输出量

[-crop] - 将体积裁剪为组件的大小而不是使用

原始卷大小

对于 dtseries、dscalar 和 dlabel，将 COLUMN 用于，如果你有一个
对称 dconn，COLUMN 更有效。

您必须至少指定以下一项 -公制, -音量-全部, -体积或 -标签 这
命令做任何事。 输出体积将在空间上与原始体积对齐
位置，无论它们是否被裁剪。

对于每个参数，请使用以下字符串之一：

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT 小脑 ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDLA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT 皮质
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT 海马_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT 无效 其他 OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-平滑 平滑 CIFTI 文件

wb_命令 -cifti-平滑

- 输入 cifti - 高斯表面的 sigma
平滑内核，

单位为毫米

- 高斯体积平滑核的 sigma，在

mm

- 沿着哪个维度平滑，ROW 或 COLUMN - 输出 -
输出 cifti

[-left-surface] - 指定要使用的左表面

- 左表面文件

[-left-corrected-areas] - 要使用而不是计算的顶点区域

它们从左表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-right-surface] - 指定要使用的正确表面

- 正确的表面文件

[-right-corrected-areas] - 要使用而不是计算的顶点区域

他们从正确的表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-cerebellum-surface] - 指定要使用的小脑表面

- 小脑表面文件

[-cerebellum-corrected-areas] - 要使用的顶点区域而不是

从小脑表面计算它们- 修正后的顶点
区域，作为度量

[-cifti-roi] - 仅在感兴趣的区域内平滑

- 要平滑的区域，作为 cifti 文件

[-fix-zeros-volume] - 将体积中的零值视为缺失数据

[-fix-zeros-surface] - 将表面上的零值视为缺失值

data

[-merged-volume] - 跨越皮层下结构边界平滑

输入 cifti 文件必须有一个大脑模型映射到所选维度，
.dtseries 和 .dconn 的列。 默认情况下，不同的数据
结构被独立平滑（即“包裹约束”平滑），所以
接触的体积结构在此边界上不平滑。 指定
-合并卷 忽略这些界限。 表面平滑使用
GEO_GAUSS_AREA 平滑方法。

-*-corrected-areas 选项用于无法避免平滑的情况
组平均表面，这只是对减少的近似修正
组平均表面的结构。 最好对数据进行平滑处理
在可行的情况下，在平均之前对个体进行分析。

这款 -修复零-* 选项会将零值视为缺乏数据，而不是使用
该值在生成平滑值时，但会用
外推值。 ROI 应该有一个沿着列映射的大脑模型，
与输入文件中所选方向的映射完全匹配。 数据
ROI 之外的部分被忽略。

-cifti统计 沿 CIFTI 列的统计数据

wb_命令 -cifti统计

- 输入 cifti

[-reduce] - 使用归约操作

- 还原操作

[-percentile] - 给出百分位数的值

- 要查找的百分位数

[-column] - 只显示一列的输出

- 列索引（从 1 开始）

[-roi] - 只考虑 roi 内的数据

- 投资回报率，作为 cifti 文件

[-match-maps] - 每列输入使用对应的列

从 roi 文件

[-show-map-name] - 在每个输出之前打印列索引和名称

对于输入的每一列，打印一个数字，由
指定的减少或百分位操作。 利用 -柱 只给出一个输出
单列。 利用 -投资回报率 只考虑一个区域内的数据。 正是其中之一
-降低 or -百分位 必须指定。

的论点 -降低 选项必须是以下之一：

MAX：最大值 MIN：最小值 INDEXMAX：从 1 开始的索引
最大值 INDEXMIN：最小值的从 1 开始的索引 SUM：将所有值相加
PRODUCT：乘以所有值 MEAN：数据的均值 STDEV：标准
偏差（N分母） SAMPSTDEV：样本标准偏差（N-1
分母）VARIANCE：数据的方差 MEDIAN：数据的中位数
MODE：数据的模式 COUNT_NONZERO：数据中非零元素的个数
data

-cifti-转置 转置 CIFTI 文件

wb_命令 -cifti-转置

- 输入 cifti 文件- output - 输出 cifti 文件

[-mem-limit] - 限制内存使用

- 以千兆字节为单位的内存限制

输入必须是二维 cifti 文件。
输出是一个 cifti 文件

其中输入中的每一行都是输出中的一列。

-cifti 向量操作 对 CIFTI 文件进行矢量操作

wb_命令 -cifti 向量操作

- 第一个向量输入文件- 第二个向量输入文件
- 要做什么向量操作- 输出 - 输出文件

[-normalize-a] - 对第一个输入的向量进行归一化

[-normalize-b] - 归一化第二个输入的向量

[-normalize-output] - 归一化输出向量（对点无效

产品）

[-magnitude] - 输出结果的大小（对点无效

产品）

对两个 cifti 文件（必须是 3 的倍数）进行向量运算
列）。 任何一个输入都可能有多个向量（超过 3 列），
但不是两者（至少一个必须正好有 3 列）。 这 -震级 和
-标准化输出 选项不能一起指定，或者与一个操作一起指定
返回一个标量（点积）。 这参数必须是其中之一
在以下：

点交叉加减

-cifti加权统计 沿 CIFTI 列的加权统计数据

wb_命令 -cifti加权统计

- 输入 cifti

[-spatial-weights] - 使用顶点面积和体素体积作为权重

[-left-area-surf] - 使用表面作为左顶点区域

- 要使用的左表面

[-right-area-surf] - 为右顶点区域使用表面

- 使用正确的表面

[-cerebellum-area-surf] - 使用小脑顶点区域的表面

- 要使用的小脑表面

[-left-area-metric] - 对左顶点区域使用度量文件

- 包含左顶点区域的度量文件

[-right-area-metric] - 对右顶点区域使用度量文件

- 包含右顶点区域的度量文件

[-cerebellum-area-metric] - 使用小脑顶点的度量文件

地区- 包含小脑顶点的度量文件

地区

[-cifti-weights] - 使用包含权重的 cifti 文件

- 要使用的权重，作为 cifti 文件

[-column] - 只显示一列的输出

- 要使用的列（基于 1）

[-roi] - 只考虑 roi 内的数据

- 投资回报率，作为 cifti 文件

[-match-maps] - 每列输入使用对应的列

从 roi 文件

[-mean] - 计算加权平均值

[-stdev] - 计算加权标准偏差

[-sample] - 从样本中估计总体标准差

[-percentile] - 计算加权百分位数

- 要查找的百分位数

[-sum] - 计算加权和

[-show-map-name] - 在每个输出之前打印地图索引和名称

如果沿列的映射是大脑模型，对于输入的每一列，
在每个表面和所有体素上完成指定的操作，结果
是分开打印的。 对于其他映射类型，操作是在每个映射类型上完成的
列，并打印每个地图的一个数字。 正是其中之一 -空间权重 or
-cifti-权重 必须指定。 利用 -柱 只输出一个
柱子。 利用 -投资回报率 只考虑一个区域内的数据。 正是其中之一 -意思,
-stdev, -百分位 or -和 必须指定。

运用 -和 - -空间权重 （或 -cifti-权重 和一个 cifti 包含
意义相似的权重）等价于对面积进行积分，并且
卷。

-类添加成员

将成员添加到类头 (.h) 和实现 (.cxx) 文件。

[-添加到文件] [-m ]...

如果 -添加到文件 未指定，标头和实现的代码
文件被打印到终端。

如果 -添加到文件 指定，类文件应该在
当前目录并命名。手.cxx。 头文件
必须在其私人部分包含此文本：

// 在此处添加新成员

实现文件必须在其公共部分包含此文本：

// 在此处添加新方法

如果缺少这些文本字符串中的任何一个，则将添加到的代码
文件被打印到终端。

对于每个成员，必须提供三个以空格分隔的文本字符串，并且它们
是成员的名称及其数据类型，以及成员的描述。 如果
说明包含空格，说明必须用双引号 ("") 括起来。

如果数据类型以大写字母开头，则假定为
班级。 在这种情况下，const 和非常量 getter 都会被创建，但不会创建 setter
被建造。 否则，数据类型应该是原始类型，并且两者都是
创建了 getter 和 setter。 请注意， AString 和 QString 被视为
原始类型。

-类创建

创建类头 (.h) 和实现 (.cxx) 文件。

用法：

[-copy] [-event-class ] [-事件监听器] [-no-parent] [-parent
]

配置

-复制

添加复制构造函数和赋值运算符

-事件类

创建 Event 子类时，使用此选项将自动设置
Event 的父类并将给定的事件枚举类型值放入
事件类构造函数的参数。

为了不需要在它前面加上“EventTypeEnum::”。

-事件监听器

实现 EventListenerInterface 以便该类可以侦听事件。

-无父母

创建的类不是从任何其他类派生的。 默认情况下，父类是
插入符号对象。

-父母

指定父（派生自）类。 默认情况下，父类是
插入符号对象。

-现场

实现 SceneableInterface 以便可以恢复类的实例
从和保存到场景。

-场景子类

添加可以被超类调用的方法，以便这个子类可以保存
并从场景中恢复数据。

这个选项应该只在创建一个超类实现的类时使用
SceneableInterface

-类创建算法

创建算法类标头 (.h) 和实现 (.cxx) 文件。

用法：



算法类名

必须以“Algorithm”开头的算法类的必需名称

命令行开关

算法所需的命令行开关。

简短的介绍

双引号内的必需简短描述。

-类创建枚举

创建枚举类型标头 (.h) 和实现 (.cxx) 文件。

用法：



枚举类名

枚举类型的名称。
必须以“枚举”结尾

值的数量

枚举类型中的值数。

自动编号

自动生成与枚举值对应的整数代码。
此参数的值为“true”和“false”。

[枚举名称-1] [枚举名称-2]...[枚举名称-N]

枚举值的可选名称。

如果列出的名称数量大于“number-of-values”参数，则
“number-of-values”将成为名称的数量。 如果名称的数量是
小于“值的数量”，将创建空条目。

-类创建操作

创建操作类标头 (.h) 和实现 (.cxx) 文件。

用法：

[-无参数]

操作类名

必须以“Operation”开头的操作类的必需名称

命令行开关

操作所需的命令行开关。

简短的介绍

双引号内的必需简短描述。

-无参数

如果操作不使用参数，则为可选参数。

-转换仿射 在约定之间转换仿射文件

wb_命令 -转换仿射

[-from-world] - 输入是 NIFTI 'world' 仿射

- 输入仿射

[-from-flirt] - 输入是一个调情矩阵

- 输入仿射- 生成时使用的源卷
输入

仿射

- 生成输入时使用的目标体积

仿射

[-to-world] - 将输出写为 NIFTI 'world' 仿射

- 输出 - 输出仿射

[-to-flirt] - 可重复 - 将输出写为调情矩阵

- 输出 - 输出仿射- 你想要的音量
将变换应用于- 您想要转换的目标空间
音量到

匹配

NIFTI 世界矩阵可以通过矩阵直接用于毫米坐标
乘法，他们用的是NIFTI坐标系，也就是正X就对了，
正Y为前，正Z为上。

您必须准确指定一个 从 选项，但您可以指定多个 -至
选项，以及任何 -至 可以多次指定占用卷的选项。

- 转换纤维方向 将 Bingham 参数体积转换为纤维方向文件

wb_命令 - 转换纤维方向

- cifti 结构标签的数量- 输出 - 输出
纤维取向文件

[-fiber] - 可重复 - 指定光纤的参数体积

- 平均纤维强度- 纤维强度的标准偏差
- θ角- φ角- psi角- 卡宾厄姆
范围- kb宾厄姆参数

从卷文件中获取预先计算的宾汉参数并将它们转换为
格式工作台用于显示。 这参数必须是标签
卷，其中标签使用这些字符串：

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT 小脑 ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDLA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT 皮质
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT 海马_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT 无效 其他 OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-将matrix4转换为matrix2 从 MATRIX2 WBSPARSE 生成 MATRIX4 CIFTI

wb_命令 -将matrix4转换为matrix2

- wbsparse matrix4 文件- 产出 - 总数
纤维计数，作为 cifti 文件

[-distances] - 输出平均轨迹距离

- 输出 - 距离，作为 cifti 文件

此命令从 matrix4 wbsparse 文件中的纤维计数生成 cifti 文件，
以及可选的第二个 cifti 文件。

-convert-matrix4-to-workbench-sparse 将 3 文件矩阵 4 转换为工作台稀疏文件

wb_命令 -convert-matrix4-to-workbench-sparse

- 第一个matrix4文件- 第二个matrix1文件
- 第三个matrix4文件- .fiberTEMP.nii 文件
此轨迹文件适用

至

- 白质体素指数三元组列表

轨迹矩阵

- output - 输出工作台稀疏文件

[-surface-seeds] - 指定表面种子空间

- 种子空间中使用的所有节点的度量 roi 文件

[-volume-seeds] - 指定卷种子空间

- 使用卷映射的 cifti 文件——
沿 cifti 文件的维度以从中获取映射，

行或列

将 probtrackx 的矩阵 4 输出转换为工作台稀疏文件格式。
正是其中之一 -表面种子 和 -体积种子 必须指定。

-转换扭曲场 在约定之间转换 WARPFIELD

wb_命令 -转换扭曲场

[-from-world] - 输入是一个 NIFTI '世界'warpfield

- 输入变形场

[-from-fnirt] - 输入是一个 fnirt warpfield

- 输入变形场- 使用的源音量
生成输入

场域

[-to-world] - 将输出写为 NIFTI 'world' warpfield

- 输出 - 输出扭曲场

[-to-fnirt] - 可重复 - 将输出写为调情扭曲场

- 输出 - 输出扭曲场- 你想要的音量
将 warpfield 应用到

NIFTI 世界扭曲场可以通过采样直接用于毫米坐标
坐标处的三个子体积并将采样值添加到坐标
向量，他们使用的是NIFTI坐标系，即X是从左到右，Y是
从后到前，Z 从下到上。

注意：此命令不会反转扭曲场，要扭曲曲面，您必须
使用扭曲相应体积的扭曲场的倒数。

您必须准确指定一个 从 选项，但您可以指定多个 -至
选项，以及任何 -至 可以多次指定占用卷的选项。

-创建签名距离卷 从表面创建带符号的距离体积

wb_命令 -创建签名距离卷

- 输入表面- 所需输出空间中的体积
（暗淡，间距，原点） - 输出 - 输出音量

[-roi-out] - 输出一个 roi 体积，其中输出具有计算

价值- 输出 - 输出投资回报率

[-fill-value] - 指定一个值放入所有未获得的体素

指定距离- 要填充的值（默认为 0）

[-exact-limit] - 指定精确输出的距离

- 以毫米为单位的距离（默认为 5）

[-approx-limit] - 指定近似输出的距离

- 以毫米为单位的距离（默认为 20）

[-approx-neighborhood] - 用于近似计算的体素邻域

- 从中心到面测量的邻域立方体的大小，在

体素（默认 2 = 5x5x5）

[-winding] - 点内表面测试的缠绕方法

- 方法名称（默认 EVEN_ODD）

计算表面的有符号距离函数。
确切的距离是

通过在任何表面三角形上找到离中心最近的点来计算
体素。 从这些距离开始计算近似距离，使用
具有体素邻域的 dijkstra 方法。 指定的精确值太小
距离可能会产生意想不到的结果。 缠绕方法的有效说明符是
如下：

EVEN_ODD（默认） NEGATIVE NONZERO NORMALS

NORMALS 方法使用三角形和边的法线，或最近的三角形
从该点被射线击中。 这种方法可能会稍微快一点，但只是
对于不穿过自身的封闭表面是可靠的。 所有其他
方法计算垂直射线的入口（正）和出口（负）交叉点
点，如果总数为奇数、负数或非零，则计为内部，
。

-估计纤维宾厄姆 估计来自 BEDPOSTX 样品的纤维取向分布

wb_命令 -估计纤维宾厄姆

- 纤维 1 强度样品- 纤维 1 θ
样品- 纤维 1 phi 样品- 纤维 1
强度样品- 光纤 2 θ 样品——
纤维 2 phi 样品- 纤维 3 强度样品
- 纤维 3 theta 样品- 纤维 3 phi
样品- cifti 结构标签的数量- 输出 -
输出 cifti 纤维分布文件

此命令对每根光纤的宾汉分布进行估计
每个体素中的方向被标记为结构标识符。 这些标签
来自参数，必须具有匹配的标签
以下字符串：

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT 小脑 ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDLA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT 皮质
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT 海马_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT 无效 其他 OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-纤维点产品 用表面法线计算纤维取向的点积

wb_命令 -纤维点产品

- 白/灰边界面- 纤维取向
文件- 从任何表面节点到纤维的最大距离

人口可能是，以毫米为单位

- 对表面进行测试以确定纤维群是否应该

使用

- 输出 - 点积的度量- 输出 - 一个指标
纤维分布的 f 值

对于每个顶点，此命令查找满足以下条件的最接近的纤维群
测试，并计算表面的点积的绝对值
每个纤维的法线和归一化平均方向。 这测试必须
是 INSIDE、OUTSIDE 或 ANY 之一，这会导致命令仅使用光纤
表面内、表面外或不在乎哪些
方向是从表面。 每个纤维群都在单独的输出中
公制列。

-文件转换 更改文件格式的版本

wb_命令 -文件转换

[-border-version-convert] - 写一个不同版本的边框文件

- 输入边框文件- 要写入的格式版本，
1 或 3（2 不

存在）

- output - 输出边界文件

[-surface] - 如果输入是版本 1，则必须指定

- 使用这个表面文件的结构和数量

顶点，忽略其他结构的边界

[-nifti-version-convert] - 编写一个不同版本的 nifti 文件

- 输入 nifti 文件- 写成的 nifti 版本——
output - 输出 nifti 文件

[-cifti-version-convert] - 编写不同版本的 cifti 文件

- 输入 cifti 文件- 要写为的 cifti 版本
- output - 输出 cifti 文件

您只能指定一个顶级选项。

-文件信息 列出有关文件内容的信息

wb_命令 -文件信息

- 数据文件

[-no-map-info] - 不显示支持地图的文件的地图信息

[-only-step-interval] - 抑制正常输出，打印间隔

地图之间

[-only-number-of-maps] - 抑制正常输出，打印地图数量

[-only-map-names] - 抑制正常输出，打印所有地图的名称

列出有关数据文件内容的信息。
只有一个 -只要 选项

可以指定。
没有时列出的信息 -只要 选项存在

取决于数据文件的类型。

-焦点获取投影顶点 获取 FOCI 的投影顶点

wb_命令 -焦点获取投影顶点

- 焦点文件- 与焦点文件相关的表面
- 输出 - 输出度量文件

[-name] - 按名称选择焦点

- 焦点名称

对于每个焦点，在，以及最多的顶点
在该列中对其投影的影响赋值为 1，所有其他
顶点 0. 如果 -芋头 使用时，只会使用一个焦点。

-焦点列表坐标 在文本文件中输出 FOCI 坐标

wb_命令 -焦点列表坐标

- 输入焦点文件- 输出 - 输出坐标
文本文件

[-names-out] - 输出焦点名称

- 输出 - 用于放置焦点名称的文本文件

输出焦点文件中每个焦点的坐标，以及可选的焦点
第二个文本文件中的名称。

-焦点重采样 将项目聚焦到不同的表面

wb_命令 -焦点重采样

- 输入焦点文件- output - 输出焦点文件

[-left-surfaces] - 用于重采样的左表面

- 焦点当前投影的表面- 这
将焦点投影到的表面

[-right-surfaces] - 用于重采样的正确表面

- 焦点当前投影的表面- 这
将焦点投影到的表面

[-cerebellum-surfaces] - 用于重新采样的小脑表面

- 焦点当前投影的表面- 这
将焦点投影到的表面

[-discard-distance-from-surface] - 忽略焦点上方的距离

或低于当前表面

[-restore-xyz] - 将原始 xyz 坐标放入焦点中，而不是

比从unprojection获得的坐标

将焦点从对于结构，然后将它们投影到
. 如果焦点在表面上方或下方具有有意义的距离，请使用
解剖表面。 如果焦点应该在表面上，请使用注册球体
和选项 -丢弃距离表面的距离 和 -恢复-xyz.

-gifti-所有标签到 rois 从 GIFTI 列中的所有标签中获取投资回报

wb_命令 -gifti-所有标签到 rois

- 输入gifti标签文件- 标签图的编号或名称
使用- 输出 - 输出度量文件

输出度量文件对指定输入映射中的每个标签都有一列，
除了？？？ 标签，每个标签都包含所有顶点的 ROI
设置为相应的标签。

-gifti 转换 将 GIFTI 文件转换为不同的编码

用法：



礼物编码

必需的 GIFTI 编码。

输入礼品文件

需要输入 GIFTI 文件名。

输出礼物文件

必需的输出 GIFTI 文件名。

有效的 GIFTI 编码：

ASCII BASE64_BINARY GZIP_BASE64_BINARY EXTERNAL_FILE_BINARY

-gifti-标签-添加前缀 为 GIFTI 标签文件中的所有标签名称添加前缀

wb_命令 -gifti-标签-添加前缀

- 输入标签文件- 要添加的前缀字符串——
output - 输出标签文件

对于除 '???' 以外的每个标签，在前面加上到标签名称。

-gifti-标签到 roi 将 GIFTI 标签变成投资回报率指标

wb_命令 -gifti-标签到 roi

- 输入gifti标签文件- 输出 - 输出指标
文件

[-name] - 按名称选择标签

- 您想要投资回报率的标签名称

[-key] - 按键选择标签

- 您想要投资回报率的标签键

[-map] - 选择要使用的单个标签地图

- 地图编号或名称

对于每个地图, 地图创建于所有地点在哪里
标有或用钥匙给定值为 1，并且
所有其他位置都为 0。正好是其中之一 -芋头 和 -键 必须指定。
指定 地图 只使用一张地图.

-标签扩张 扩大标签文件

wb_命令 -标签扩张

- 输入标签- 要扩张的表面——
以毫米为单位的距离以扩大标签- output - 输出标签文件

[-bad-vertex-roi] - 指定要覆盖的顶点的 roi，而不是

具有未标记键的顶点- 度量文件，正值表示
顶点

他们的价值观被取代

[-column] - 选择要扩张的单列

- 列号或名称

[-corrected-areas] - 要使用的顶点区域，而不是从中计算它们

表面- 修正的顶点区域，作为度量

为所有指定为坏的顶点填写标签信息，直到指定的
与其他标签的距离。 如果 -坏顶点 roi 指定，所有顶点，
包括那些带有未标记键的，都是好的，除了带有
投资回报率的正值。 如果未指定，则只有具有
未标记的密钥是坏的。

-标签导出表 将 GIFTI 中的标签表导出为文本

wb_命令 -标签导出表

- 输入标签文件- output - 输出文本文件

从gifti标签文件中获取标签表，并将其写入文本格式
符合预期 -公制标签导入.

-标签掩码 屏蔽标签文件

wb_命令 -标签掩码

- 要屏蔽的标签文件- 掩码指标- 输出 -
输出标签文件

[-column] - 选择单列

- 列号或名称

默认情况下，输出标签是输入标签的副本，但带有“未使用”
在掩码度量不为正的地方标记。 如果 -柱 被指定，
输出仅包含一列，即指定输入列的屏蔽版本。

-标签合并 将标签文件合并到一个新文件中

wb_命令 -标签合并

- 输出 - 输出标签

[-label] - 可重复 - 指定输入标签

- 使用列的标签文件

[-column] - 可重复 - 选择要使用的单列

- 列号或名称

[-up-to] - 使用包含范围的列

- 要包含的最后一列的编号或名称

[-reverse] - 以相反的顺序使用范围

获取一个或多个标签文件并通过连接构造一个新的标签文件
他们的专栏。 输入文件必须具有相同数量的顶点，并且
相同的结构。

示例：wb_command -标签合并 输出标签.gii -标签 第一个.label.gii -柱 1
-标签 二.label.gii

此示例将从 first.label.gii 和所有子卷中获取第一列
从 second.label.gii，并将这些写入 out.label.gii。

-标签修改键 更改标签文件中的键值

wb_命令 -标签修改键

- 输入标签文件- 带有新旧密钥的文本文件
价值观- 输出 - 输出标签文件

[-column] - 选择要使用的单列

- 列号或名称

应该有“oldkey newkey”形式的行，如下所示：

3 5 5 8 8 2

这将使用键 '3' 更改当前标签以使用键 '5' 代替，5
将使用 8，而 8 将使用 2。键值中的任何冲突都会导致标签
重映射文件中未指定的重映射到其他未使用的
钥匙。 将多个键重新映射到同一个新键，或将同一个键重新映射到多个
一个新的密钥，导致错误。 这不会改变文件的外观
当显示时，它会同时改变数据中的键。

-标签重采样 将标签文件重新采样到不同的网格

wb_命令 -标签重采样

- 要重新采样的标签文件- 球面
标签文件所在的网格

目前在

- 一个球面，与

并具有所需的输出网格

- 方法名称- output - 输出标签文件

[-area-surfs] - 指定表面进行顶点区域校正基于

- 相关的解剖表面

网格

- 相关的解剖表面网

[-area-metrics] - 指定顶点区域度量以进行基于区域校正的

在- 带有顶点区域的度量文件

网格

- 带有顶点区域的度量文件网

[-current-roi] - 在当前网格上使用输入 roi 来排除非数据

顶点- roi，作为度量文件

[-valid-roi-out] - 输出从有效获取数据的顶点的 ROI

源顶点- 输出 - 作为度量的输出 roi

[-largest] - 仅使用权重最大的顶点的标签

给定两个对齐的球面，重新采样标签文件。 如果
方法进行面积校正，正是其中之一 -区域冲浪 or -面积指标 必须
指定的。

这款 -最大的 与 BARYCENTRIC 一起使用时，选项会导致最近的顶点行为，
它使用具有最大权重的源顶点的值。 什么时候 -最大的
未指定，顶点权重根据它们的标签相加
对应，并使用总和最大的标签。

这参数必须是以下之一：

ADAP_BARY_AREA 重心

标签数据推荐使用 ADAP_BARY_AREA 方法，因为它应该是
更好地解析靠近多个标签的顶点，或者在
下采样。

-标签到边框 在标签周围画边框

wb_命令 -标签到边框

- 用于邻居信息的表面- 输入
标签文件- output - 输出边界文件

[-placement] - 设置沿边缘边界点绘制多远

- 从内部顶点沿边的分数（默认 0.33）

[-column] - 选择单列

- 列号或名称

对于每个标签，找到网格上所有跨越标签边界的边，
并通过它们绘制边界。 默认情况下，这是在
输入文件，使用地图名称作为边界的类名。

-元数据-删除-出处 从文件元数据中删除出处信息

wb_命令 -元数据-删除-出处

- 从中删除出处信息的文件——
输出 - 将修改后的文件保存为的名称

删除工作台在处理过程中添加的出处元数据字段。

-元数据字符串替换 替换文件的所有元数据中的字符串

wb_命令 -元数据字符串替换

- 替换元数据的文件- 要查找的字符串
- 要替换​​的字符串和- 输出
- 保存修改后的文件的名称

[-case-insensitive] - 也匹配大小写变化

替换所有出现的在元数据和地图名称中
和.

-公制转换 将度量文件转换为伪造的 NIFTI

wb_命令 -公制转换

[-to-nifti] - 将度量转换为 nifti

- 要转换的指标- 输出 - 输出 nifti 文件

[-from-nifti] - 将 nifti 转换为公制

- 要转换的 nifti 文件- 表面文件使用的数量
节点和结构来自- 输出 - 输出度量文件

此命令的目的是在度量文件和 nifti1 之间进行转换，以便
礼物不知道的程序可以对数据进行操作。 您必须准确指定其中之一
选项。

-公制扩张 扩大度量文件

wb_命令 -公制扩张

- 扩张的指标- 要计算的表面——
以毫米为单位的扩张距离- 输出 - 输出指标

[-bad-vertex-roi] - 指定要覆盖的顶点的 roi，而不是

值为零的顶点- 度量文件，正值表示
顶点

他们的价值观被取代

[-data-roi] - 指定数据所在位置的 roi

- 度量文件，正值表示具有

data

[-column] - 选择要扩张的单列

- 列号或名称

[-nearest] - 使用最接近的好值而不是加权平均值

[-linear] - 沿最强的线性插值填充值

梯度

[-exponent] - 在加权函数中使用不同的指数

- 在 (area / (distance ^ n)) 中使用的指数 'n' 作为

加权函数（默认 2）

[-corrected-areas] - 要使用的顶点区域，而不是从中计算它们

表面- 修正的顶点区域，作为度量

对于所有被指定为坏的度量顶点，如果它们与一个非坏的相邻
带有数据的顶点或在此类顶点的指定距离内，替换
具有数据的附近非坏顶点的距离加权平均值的值，
否则将值设置为零。 无论多小是，扩张将
总是至少使用直接相邻的顶点。 如果 -最近 被指定，它
将使用最近的非坏顶点的值，数据在范围内
的加权平均值。

If -坏顶点 roi 指定，只有在 ROI 中具有正值的顶点是
坏的。 如果未指定，则只有具有数据的顶点，其值为零，
不好。 如果 -数据投资回报率 未指定，假设所有顶点都有数据。

请注意 -更正区域 选项使用更改的近似更正
沿组平均表面的距离。

-公制估计-fwhm 估计度量文件的 FWHM 平滑度

wb_命令 -公制估计-fwhm

- 用于距离和邻居信息的表面——
输入指标

[-roi] - 仅使用 ROI 内的数据

- 用作 ROI 的指标文件

[-column] - 选择单列来估计平滑度

- 列号或名称

估计指标列的平滑度，将估计值打印为标准
输出。 这些估计忽略了顶点间距的变化。

-度量极值 在度量文件中查找极值

wb_命令 -度量极值

- 用于距离信息的表面- 指标
找到极值- 确定的极值之间的最小距离
相同

类型

- 输出 - 输出极值度量

[-presmooth] - 在找到极值之前平滑度量

- 高斯平滑核的 sigma，单位为 mm

[-roi] - 忽略选定区域外的值

- 寻找极值的区域，作为一个度量

[-threshold] - 忽略小极值

- 考虑作为最小值的最大值- 最小的
考虑为最大值的值

[-sum-columns] - 输出极值列的总和而不是每个

单独列

[-consolidate-mode] - 使用局部最小值的合并而不是

大街区

[-only-maxima] - 只找到最大值

[-only-minima] - 只找到最小值

[-column] - 选择一列以在其中查找极值

- 列号或名称

在度量文件中查找极值，这样没有两个相同类型的极值是
在里面彼此的。 极值被标记为 -1 为最小值，1 为
最大值，否则为 0。 如果 -仅最大值 or -只有最小值 被指定，那么它将
忽略不是指定类型的极值。 这些选项是相互排斥的。

If -投资回报率 指定，不仅不使用 roi 之外的数据，而且不使用任何顶点
ROI 的边缘永远不会被算作极值，以防 ROI 削减
跨越梯度，否则会在应该有的地方产生极值
没有。

If -总和列 被指定，这些极值列被求和，并且输出有
具有此结果的单个列。

默认情况下，只有当数据点比其他数据点更极端时，它才是极值
内的数据点从中。 如果 -整合模式 被使用，它
相反，首先找到所有比直接数据点更极端的数据点
邻居，那么虽然内部有任何极值互相取
彼此最接近的两个极值并通过加权平均将它们合并为一个
基于合并到每个中的原始极值的数量。

默认情况下，所有输入列都使用不平滑，使用 -柱 指定一个
要使用的单列，以及 - 预平滑 在找到之前平滑输入
极端。

-度量假相关 比较本地和跨/通过 SULCI/GYRI 的相关性

wb_命令 -度量假相关

- 用于计算测地线和 3D 距离的表面- 这
与 <3D-dist> 相关的度量 - 在每个顶点周围检查的最大 3D 距离
- 用于邻居的最大测地距离

相关

- 用于相邻的最小测地距离

相关

- 输出 - 输出指标

[-roi] - 选择一个有数据的感兴趣区域

- 区域，作为度量文件

[-dump-text] - 转储用于文本文件的原始度量

- 输出文本文件

对于每个顶点，计算测地线范围内的平均相关性
不跨越沟/回的距离，以及与最近的相关性
顶点穿过沟/回。 一个顶点被认为是穿过沟/回，如果
3D 距离小于测地线距离的三分之一。 输出文件
包含这些相关性之间的比率，以及一些额外的地图来帮助
解释一下比例。

-公制填充孔 填补 ROI 指标中的漏洞

wb_命令 -公制填充孔

- 用于邻居信息的表面- 输入投资回报率
公制- 输出 - 输出 ROI 指标

[-corrected-areas] - 要使用的顶点区域，而不是从中计算它们

表面- 修正的顶点区域，作为度量

找出所有未包含在 ROI 中的连接区域，并将其写入
就表面积而言，几乎都是最大的。

-度量查找簇 按表面积过滤集群

wb_命令 -度量查找簇

- 要计算的表面- 输入指标
- 数据值的阈值- 阈值
簇面积，mm^2 - 输出 - 输出指标

[-less-than] - 查找小于的值， 而不是

更大的

[-roi] - 选择感兴趣的区域

- 投资回报率，作为一个指标

[-corrected-areas] - 要使用的顶点区域，而不是从中计算它们

表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-column] - 选择单列

- 列号或名称

[-size-ratio] - 忽略小于给定分数的簇

地图中最大的集群- 最大集群面积的一部分

[-distance] - 忽略距离超过给定距离的集群

最大的集群- 集群离最大集群有多远，
边缘

到边缘，毫米

[-start] - 从 1 以外的值开始标记集群

- 给出找到的第一个簇的值

为足够大的所有顶点输出具有非零整数的度量
集群，其他地方为零。 整数表示集群成员资格（默认情况下，
找到的第一个集群将使用值 1，第二个集群 2 等）。 默认情况下，值
比...更棒被认为是在一个集群中，使用 -少于 至
测试小于阈值的值。 将此作为掩码应用于数据，或
要进行更复杂的阈值处理，请参阅 -度量数学.

-度量梯度 公制文件的表面梯度

wb_命令 -度量梯度

- 计算梯度的表面- 指标
计算梯度- 输出 - 梯度的大小

[-presmooth] - 在计算梯度之前平滑度量

- 高斯平滑核的 sigma，单位为 mm

[-roi] - 选择一个感兴趣的区域来获取梯度

- 采用梯度的区域，作为度量

[-match-columns] - 对于每个输入列，使用对应的列

从投资回报率

[-vectors] - 输出梯度向量

- 输出 - 向量作为度量文件

[-column] - 选择一列来计算梯度

- 列号或名称

[-corrected-areas] - 要使用的顶点区域，而不是从中计算它们

表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-average-normals] - 平均每个顶点的法线与其

在使用邻居计算梯度之前

在每个顶点，直接邻居展开到与顶点相切的平面上
顶点处的表面（特别是垂直于法线）。 梯度是
使用顶点的展开位置和
他们的价值观。 然后梯度由回归的斜率给出，并且
重建为 3D 梯度向量。 默认情况下，采用所有的梯度
列，没有预平滑，在整个表面上，没有平均
相邻表面的法线。

使用时 -更正区域，注意是近似修正。 正在做
在平均/梯度之前在单个表面上平滑是优选的，当
可能，以利用原始的表面结构。

指定 ROI 将限制梯度仅使用来自 ROI 的数据
度量为正，并且在 ROI 度量不为正的任何地方输出零。

默认情况下，roi 指标的第一列用于所有输入列。 什么时候
-匹配列 指定给 -投资回报率 选项，输入和投资回报率指标必须有
相同的列数，对于每个输入列的索引，相同的列
index 用于 roi 指标。 如果 -匹配列 选项 -投资回报率 用来
而 -柱 还使用了选项，roi 指标的列数必须
匹配输入指标，它将使用带有索引的 roi 列
选定的输入列。

向量输出度量的组织方式使得 X、Y 和 Z 分量来自
单个输入列是连续列。

-公制标签导入 从公制文件导入 GIFTI 标签文件

wb_命令 -公制标签导入

- 输入度量文件- 包含值的文本文件
和标签名称- output - 输出gifti标签文件

[-discard-others] - 将标签列表中未提及的任何值设置为

？？？ 标签

[-unlabeled-value] - 设置将被解释为未标记的值

- 未标记的数值（默认为 0）

[-column] - 选择要导入的单列

- 列号或名称

[-drop-unused-labels] - 从标签中删除任何未使用的标签值

表

从具有类似标签的值的度量文件创建新的gifti 标签文件。 您可以
指定空字符串（'' 将适用于 linux/mac） ， 哪个
将被视为空文件。 标签列表文件必须有以下几行
以下格式：



不要在文件中指定“unlabeled”键，假设0表示没有
标记除非 -未标记值 被指定。 标签名称必须在单独的
行，但可能包含空格或其他不寻常的字符（但不是换行符）。
空格从标签名称的两端修剪，但如果它在
标签的中间。 red、green、blue 和 alpha 的值必须是整数
0 到 255，并将指定标签绘制的颜色（alpha 为 255 表示
不透明，这可能是您想要的）。 默认情况下，它将设置新的标签名称
对于列表中未提及的任何遇到的值，名称为 LABEL_#
文件，指定 -丢弃其他人 改为将这些体素设置为“未标记”键。

-公制掩码 屏蔽度量文件

wb_命令 -公制掩码

- 输入指标- 掩码指标- 输出 -
产出指标

[-column] - 选择单列

- 列号或名称

默认情况下，输出指标是输入指标的副本，但带有零
在掩码度量不为正的任何地方。 如果 -柱 指定，输出
仅包含一列，即指定输入列的屏蔽版本。

-度量数学 评估指标文件的表达

wb_命令 -度量数学

- 要评估的表达式，在引号中- 输出 -
产出指标

[-fixnan] - 用一个值替换 NaN 结果

- 用 NaN 替换的值

[-var] - 可重复 - 用作变量的度量

- 表达式中使用的变量名称- 指标
用作此变量的文件

[-column] - 选择单列

- 列号或名称

[-repeat] - 为每一列计算重用一列

此命令评估在每个表面顶点独立。 那里
必须至少是一个 -变量 选项（获取结构、顶点数和
来自) 的列数，即使中指定的不用于
. 所有指标必须具有相同数量的顶点。 文件名是
无效于, 使用一个变量名和一个 -变量 匹配选项
指定一个输入文件。 如果 -柱 选项被给予任何 -变量
选项，仅使用该文件中的一列。 如果 -重复 指定，文件
必须只有一列，或者有 -柱 选项指定。 所有文件
不使用 -重复 必须具有相同数量的要求使用的列。
的格式如下：

表达式由常量、变量、运算符、括号和函数组成，
中缀表示法，例如 'exp(-x + 3) * 规模'。 变量是任何字符串
长度，使用字符 az、AZ、0-9 和 _，但不能采用 a 的名称
名为常数。 目前，只有一个命名常量 PI。 运营商
是 +、-、*、/、^、>、<、>=、<=、==、!=、!、&&、||。 这些行为与 C 中的一样，除了
^ 是求幂，即 pow(x, y)，并且比其他优先级更高
二元运算符（同样，'-3^-4^-5' 表示'-(3^(-(4^-5)))'）。 <=、>=、== 和 !=
运营商有少量回旋余地，相当于百万分之一
被比较值的绝对值中较小的一个。

比较和逻辑运算符返回 0 或 1，您可以使用表达式进行屏蔽
像'x *（掩码> 0）'。 对于所有逻辑运算符，输入被认为是真实的
它大于 0。表达式 '0 < x < 5' 在语法上没有错误，但是
它不会做我们想要的，因为它是从左到右计算的，即 '((0
x) < 5)'，它将始终返回 1，因为比较的两种可能结果都是
小于 5。如果检测到此类型的表达式，则会生成警告。
使用诸如 'x > 0 && x < 5' 之类的东西来获得所需的行为。

元素之间的空白被忽略，' sin ( 2 * x ) ' 等价于
'sin(2*x)'，但 'sin(2*x)' 是一个错误。 不允许隐式乘法，
表达式 '2x' 将被解析为变量。 括号是()，不要用
[] 或者 {}。 函数需要括号，表达式“sin x”是错误的。

支持以下功能：

sin：1个参数，参数的正弦（单位是弧度）cos：1个参数，
参数的余弦（单位是弧度） tan：1 个参数，正切
参数（单位是弧度） asin：1 个参数，参数的正弦的倒数，
弧度 acos：1 个参数，参数余弦的倒数，以弧度为单位
atan: 1 个参数，参数正切的倒数，以弧度为单位 atan2: 2
参数，atan2(y, x) 返回正切的倒数

(y/x)，以弧度为单位，通过两个参数的符号确定象限

sinh: 1 个参数，参数的双曲正弦 cosh: 1 个参数，
参数 tanh 的双曲余弦：1 个参数，是
参数 asinh: 1 参数，参数 acosh: 1 的反双曲正弦
参数，参数 atanh 的反双曲余弦：1 个参数，
参数 ln 的反双曲线正切：1 个参数，自然对数
参数 exp：1 个参数，常数 e 的参数的幂
log：1 个参数，以 10 为底的对数 sqrt：1 个参数，平方
参数根 abs：1 个参数，参数 floor 的绝对值：1
参数，不大于参数round的最大整数：1个参数，
最接近的整数，关系四舍五入

零

ceil：1个参数，不小于参数的最小整数 min：2个参数，
min(x, y) 如果 (x > y) 返回 y，否则 x 最大：2 个参数，max(x, y) 返回 y
if (x < y), x 否则 mod: 2 个参数, mod(x, y) = x - y * floor(x / y), or 0 if
y == 0 钳位：3 个参数，钳位（x，低，高）= min（最大（x，低），高）

-度量合并 将度量文件合并到一个新文件中

wb_命令 -度量合并

- 输出 - 输出指标

[-metric] - 可重复 - 指定输入指标

- 使用列的度量文件

[-column] - 可重复 - 选择要使用的单列

- 列号或名称

[-up-to] - 使用包含范围的列

- 要包含的最后一列的编号或名称

[-reverse] - 以相反的顺序使用范围

获取一个或多个度量文件并通过连接构建一个新的度量文件
他们的专栏。 输入度量文件必须具有相同数量的顶点
和相同的结构。

示例：wb_command -度量合并 输出函数文件 -公制 第一.func.gii -柱 1
-公制 第二个func.gii

此示例将从 first.func.gii 中获取第一列，然后是所有
second.func.gii 中的列，并将这些列写入 out.func.gii。

-公制调色板 设置度量文件的调色板

wb_命令 -公制调色板

- 要修改的指标- 映射模式

[-column] - 选择单列

- 列号或名称

[-pos-percent] - 正数据着色的最小/最大百分比

- 最不积极数据的百分位数- 这
最积极数据的百分位数

[-neg-percent] - 负数据着色的最小/最大百分比

- 最少负面数据的百分位数- 这
最负面数据的百分位数

[-pos-user] - 正数据着色的用户最小/最大值

- 最小正数据的值- 价值
对于最积极的数据

[-neg-user] - 负数据着色的用户最小/最大值

- 最少负数据的值- 价值
对于最负面的数据

[-interpolate] - 内插颜色

- 布尔值，是否插值

[-disp-pos] - 显示正数据

- 布尔值，是否显示

[-disp-neg] - 显示正数据

- 布尔值，是否显示

[-disp-zero] - 显示比最小截止值更接近零的数据

- 布尔值，是否显示

[-palette-name] - 设置使用的调色板

- 调色板的名称

[-thresholding] - 设置阈值

- 阈值设置- 显示阈值内或外的值
- 较低的门槛- 上限

原始度量文件被修改后的版本覆盖。
By

默认情况下，度量文件的所有列都调整为新设置，使用
-柱 选项仅更改一列。 中未指定的映射设置
选项将从第一列中获取。 这参数必须是其中之一
执行以下操作：

MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE

这论据 -调色板名称 必须是以下之一：

PSYCH PSYCH-NO-NONE ROY-BIG ROY-BIG-BL 橙黄色 灰色_Interp_Positive
Gray_Interp clear_brain 视频风格 fidl raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG 红黄蓝浅蓝 FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_蓝色 fsl_黄色 JET256

这论据 -阈值 必须是以下之一：

THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL

这论据 -阈值 必须是以下之一：

THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE

-度量减少 跨公制列执行还原操作

wb_命令 -度量减少

- 减少的指标- 要使用的归约运算符
- 输出 - 输出指标

[-exclude-outliers] - 按标准从每个向量中排除异常值

偏差- 低于平均值的标准差数量

包括

- 高于平均值的标准差数量

包括

对于每个曲面顶点，将跨列的数据作为向量，并执行
对其指定的减少，将结果放入单个输出列中
那个顶点。 归约运算符如下：

MAX：最大值 MIN：最小值 INDEXMAX：从 1 开始的索引
最大值 INDEXMIN：最小值的从 1 开始的索引 SUM：将所有值相加
PRODUCT：乘以所有值 MEAN：数据的均值 STDEV：标准
偏差（N分母） SAMPSTDEV：样本标准偏差（N-1
分母）VARIANCE：数据的方差 MEDIAN：数据的中位数
MODE：数据的模式 COUNT_NONZERO：数据中非零元素的个数
data

-度量回归 从度量文件中回归度量

wb_命令 -度量回归

- 要回归的指标- 输出 - 输出指标

[-roi] - 仅在 roi 内回归

- 用于回归的区域，作为度量

[-column] - 选择要从中回归的单个列

- 列号或名称

[-remove] - 可重复 - 指定要回归的指标

- 要使用的度量文件

[-remove-column] - 选择要使用的列，而不是全部

- 列号或名称

[-keep] - 可重复 - 指定要包含在回归中的指标，但不包含

消除- 要使用的度量文件

[-keep-column] - 选择要使用的列，而不是全部

- 列号或名称

对于每个回归量，从其数据中减去其整个表面的平均值。 每个
然后根据这些和常数项对输入图进行回归。 所结果的
指定的所有回归量的回归斜率 -消除 乘以他们的
各自的回归映射，这些是从输入映射中减去的。

-公制去除岛 从投资回报率指标中删除岛屿

wb_命令 -公制去除岛

- 用于邻居信息的表面- 输入投资回报率
公制- 输出 - 输出 ROI 指标

[-corrected-areas] - 要使用的顶点区域，而不是从中计算它们

表面- 修正的顶点区域，作为度量

查找 ROI 中的所有连接区域，并将除最大区域之外的所有区域归零，在
表面积方面。

-度量重采样 将度量文件重新采样到不同的网格

wb_命令 -度量重采样

- 要重新采样的度量文件- 球面
度量是的网格

目前在

- 一个球面，与

并具有所需的输出网格

- 方法名称- 输出 - 输出指标

[-area-surfs] - 指定表面进行顶点区域校正基于

- 相关的解剖表面

网格

- 相关的解剖表面网

[-area-metrics] - 指定顶点区域度量以进行基于区域校正的

在- 带有顶点区域的度量文件

网格

- 带有顶点区域的度量文件网

[-current-roi] - 在当前网格上使用输入 roi 来排除非数据

顶点- roi，作为度量文件

[-valid-roi-out] - 输出从有效获取数据的顶点的 ROI

源顶点- 输出 - 作为度量的输出 roi

[-largest] - 仅使用权重最大的顶点的值

给定两个对齐的球面，重新采样度量文件。 如果
方法进行面积校正，正是其中之一 -区域冲浪 or -面积指标 必须
指定的。

这款 -当前投资回报率 选项仅屏蔽输入，输出可能会稍微扩大
比较，考虑使用 -公制掩码 使用时在输出上 -当前投资回报率.

这款 -最大的 与 BARYCENTRIC 一起使用时，选项会导致最近的顶点行为，
它不使用加权平均，而是使用源顶点的值
每个目标顶点的权重最大。 这主要是为了
重新采样 ROI 指标。

这参数必须是以下之一：

ADAP_BARY_AREA 重心

对于普通的度量数据，推荐使用 ADAP_BARY_AREA 方法，因为它
与 BARYCENTRIC 不同，下采样时应该使用所有数据。

-从极值度量 rois 从极值地图创建度量投资回报率地图

wb_命令 -从极值度量 rois

- 用于测地距离的表面- 输入指标
文件- 从顶点的测地线距离限制，以毫米为单位- 输出 -
输出度量文件

[-gaussian] - 生成高斯核而不是平坦的 ROI

- 高斯核的 sigma，单位为 mm

[-roi] - 选择要使用的感兴趣区域

- 要使用的面积，作为一个指标

[-overlap-logic] - 如何处理重叠的 ROI，默认为 ALLOW

- 解决重叠的方法

[-column] - 选择要使用的单个输入列

- 列号或名称

对于每个地图中的每个非零值，制作一个地图，在该位置周围有一个 ROI。
如果 -高斯 指定选项，然后输出归一化的高斯核
而不是投资回报率。 这论据 -重叠逻辑 必须是允许之一，
最接近，或排除。 ALLOW 是默认值，表示处理 ROI
独立且可能重叠。 CLOSEST 意味着 ROI 可能不会重叠，并且
没有 ROI 包含更接近不同种子顶点的顶点。 排除意味着
ROI 不能重叠，并且任何顶点在一个以上的 ROI 范围内
不属于任何 ROI。

-公制 rois 到边界 围绕度量 ROI 绘制边界

wb_命令 -公制 rois 到边界

- 用于邻居信息的表面- 输入指标
包含投资回报率- 用于输出边框类的名称
- output - 输出边界文件

[-placement] - 设置沿边缘边界点绘制多远

- 从内部顶点沿边的分数（默认 0.33）

[-column] - 选择单列

- 列号或名称

对于每个 ROI 列，查找网格上跨越边界的所有边
ROI，并通过它们绘制边界。 默认情况下，这是在所有列上完成的
输入文件，使用地图名称作为边界名称。

-公制平滑 平滑度量文件

wb_命令 -公制平滑

- 表面光滑- 平滑的度量
- 高斯核函数的 sigma，单位为 mm
- 输出 - 输出指标

[-roi] - 选择一个感兴趣的区域进行平滑

- 内部平滑的投资回报率，作为一个指标

[-match-columns] - 对于每个输入列，使用对应的列

从投资回报率

[-fix-zeros] - 将零值视为不是数据

[-column] - 选择单列进行平滑

- 列号或名称

[-corrected-areas] - 要使用的顶点区域，而不是从中计算它们

表面- 修正的顶点区域，作为度量

[-method] - 选择平滑方法，默认GEO_GAUSS_AREA

- 平滑方法的名称

平滑表面上的公制文件。
默认情况下，平滑所有输入列

在整个表面上，指定 -柱 仅使用一个输入列，并且 -投资回报率 至
仅在 roi 度量大于 0 的地方平滑，在其他地方输出零。

使用时 -投资回报率, ROI 之外的输入数据不用于计算平滑
值。 默认情况下，roi 度量的第一列用于所有输入
列。 什么时候 -匹配列 指定给 -投资回报率 选项，输入和投资回报率
指标必须具有相同的列数，并且对于每个输入列的索引，
roi 指标中使用了相同的列索引。 如果 -匹配列 选项
-投资回报率 使用时 -柱 选项也被使用，列数必须
roi 和输入指标之间的匹配，它将使用 roi 列与
所选输入列的索引。

这款 -修复零 如果输入值为零，则选项会导致平滑不使用输入值，
但仍将平滑值写入顶点。 这对零很有用
表示缺乏信息，阻止他们降低强度
附近的顶点，同时给零一个外推值。

这款 -更正区域 选项适用于不可避免地要平滑的情况
组平均表面，这只是对减少的近似修正
组平均表面的结构。 最好对数据进行平滑处理
在可行的情况下，在平均之前对个体进行分析。

有效值是：

GEO_GAUSS_AREA - 使用测地线高斯核，并基于顶点归一化
区域以便在不规则表面上更可靠地工作

GEO_GAUSS_EQUAL - 使用测地线高斯核，并标准化假设每个
顶点具有同等重要性

GEO_GAUSS - 匹配来自 caret5 的测地线高斯平滑，但不检查
具有不平等重要性的内核

GEO_GAUSS_AREA 方法是默认的，因为它通常是正确的选择。
GEO_GAUSS_EQUAL 当顶点值的总和更多时可能是正确的选择
有意义的然后是表面积分（值的总和 .* 区域），例如当
平滑顶点区域（总和是总表面积，而表面
积分是顶点面积的平方和）。 GEO_GAUSS 方法不是
推荐，它的存在主要是为了复制用 caret5 完成的研究方法
测地线平滑。

-度量统计 度量文件上的空间统计

wb_命令 -度量统计

- 输入指标

[-reduce] - 使用归约操作

- 还原操作

[-percentile] - 给出百分位数的值

- 要查找的百分位数

[-column] - 只显示一列的输出

- 列号或名称

[-roi] - 只考虑 roi 内的数据

- roi，作为度量文件

[-match-maps] - 每列输入使用对应的列

从 roi 文件

[-show-map-name] - 在每个输出之前打印地图索引和名称

对于输入的每一列，打印一个数字，由
指定的减少或百分位操作。 利用 -柱 只给出一个输出
单列。 利用 -投资回报率 只考虑一个区域内的数据。 正是其中之一
-降低 or -百分位 必须指定。

的论点 -降低 选项必须是以下之一：

MAX：最大值 MIN：最小值 INDEXMAX：从 1 开始的索引
最大值 INDEXMIN：最小值的从 1 开始的索引 SUM：将所有值相加
PRODUCT：乘以所有值 MEAN：数据的均值 STDEV：标准
偏差（N分母） SAMPSTDEV：样本标准偏差（N-1
分母）VARIANCE：数据的方差 MEDIAN：数据的中位数
MODE：数据的模式 COUNT_NONZERO：数据中非零元素的个数
data

-公制-tfce 对度量文件执行 TFCE

wb_命令 -公制-tfce

- 要计算的表面- 运行 TFCE 的指标
- 输出 - 输出指标

[-presmooth] - 在运行 TFCE 之前平滑指标

- 高斯平滑核的 sigma，单位为 mm

[-roi] - 选择一个感兴趣的区域来运行 TFCE

- 运行 TFCE 的区域，作为一个指标

[-parameters] - 设置 TFCE 积分参数

- 集群区域的指数（默认 1.0） - 阈值的指数
（默认 2.0）

[-column] - 选择单列

- 列号或名称

[-corrected-areas] - 要使用的顶点区域，而不是从中计算它们

表面- 修正的顶点区域，作为度量

无阈值聚类增强是一种增加相对值的方法
在标准阈值测试中会形成集群的区域。 这是
通过评估以下积分来完成：

e(h, p)^E * h^H * dh

在每个顶点 p 处，其中 h 的范围从 0 到数据中的最大值，并且 e(h,
p) 是包含阈值 h 处的顶点 p 的簇的范围。 消极的
通过否定数据，运行相同的进程，以及
否定结果。

使用时 - 预平滑 - -更正区域, 注意这是一个近似值
平滑算法内的校正（TFCE 校正是精确的）。 正在做
如果可能，最好在平均/TFCE 之前在单个表面上进行平滑处理，
为了更好地将平滑内核大小与原始特征大小联系起来。

TFCE 方法在：Smith SM, Nichols TE., "Threshold-free cluster
增强：解决平滑、阈值依赖和
聚类推理中的定位。”神经图像。2009 年 1 月 XNUMX 日；44(1):83-98。 PMID：
18501637

-度量到体积映射 将度量文件映射到体积

wb_命令 -度量到体积映射

- 输入度量文件- 使用坐标的表面
- 所需输出卷空间中的卷文件——
output - 输出卷文件

[-nearest-vertex] - 使用离体素最近的顶点的值

中央- 距离表面多远将值映射到体素，以毫米为单位

[-ribbon-constrained] - 使用功能区约束映射算法

- 色带的内表面- 外表面
丝带

[-voxel-subdiv] - 在估计体素权重时进行体素划分

- 细分数，默认为 3

将度量文件中的值映射到卷文件中。
您必须指定

正好是一种映射方法选项。
这款 -最近的顶点 方法使用

离体素中心最近的顶点的值（对于整数值很有用）。 这
-功能区约束 方法使用与中相同的方法 -体积到表面映射,
然后反向使用权重。

-度量向量操作 对度量文件进行向量运算

wb_命令 -度量向量操作

- 第一个向量输入文件- 第二个向量输入文件
- 要做什么向量操作- 输出 - 输出文件

[-normalize-a] - 对第一个输入的向量进行归一化

[-normalize-b] - 归一化第二个输入的向量

[-normalize-output] - 归一化输出向量（对点无效

产品）

[-magnitude] - 输出结果的大小（对点无效

产品）

对两个度量文件（必须是 3 的倍数）进行向量运算
列）。 任何一个输入都可能有多个向量（超过 3 列），
但不是两者（至少一个必须正好有 3 列）。 这 -震级 和
-标准化输出 选项不能一起指定，或者与一个操作一起指定
返回一个标量（点积）。 这参数必须是其中之一
在以下：

点交叉加减

-朝向 roi 的度量向量 找出向量是否指向投资回报率

wb_命令 -朝向 roi 的度量向量

- 要计算的表面- 找到最短的投资回报率
路径- 输出 - 输出指标

[-roi] - 不计算 roi 之外的顶点

- 要在内部计算的区域，作为度量

在每个顶点，沿着到 ROI 的最短路径的起点计算向量。

-度量加权统计 度量文件上的加权空间统计数据

wb_命令 -度量加权统计

- 输入指标

[-area-surface] - 使用顶点区域作为权重

- 用于顶点区域的表面

[-weight-metric] - 使用度量文件中的权重

- 包含权重的公制文件

[-column] - 只显示一列的输出

- 列号或名称

[-roi] - 只考虑 roi 内的数据

- roi，作为度量文件

[-match-maps] - 每列输入使用对应的列

从 roi 文件

[-mean] - 计算加权平均值

[-stdev] - 计算加权标准偏差

[-sample] - 从样本中估计总体标准差

[-percentile] - 计算加权百分位数

- 要查找的百分位数

[-sum] - 计算加权和

[-show-map-name] - 在每个输出之前打印地图索引和名称

对于输入的每一列，打印一个数字，由
指定操作。 利用 -柱 只为单列提供输出。 利用
-投资回报率 只考虑一个区域内的数据。 正是其中之一 -降低 or
-百分位 必须指定，并且恰好是其中之一 -意思, -stdev, -百分位 or
-和 必须指定。

运用 -和 - -区域-表面 （或 -权重度量 具有包含类似指标的指标
data) 等价于对表面积进行积分。 例如，如果
您想在 roi 内找到表面积，请执行以下操作：

$ wb_command -度量加权统计 roi.func.gii -sum -面积表面

中厚度.surf.gii

-nifti-信息 显示有关 NIFTI/CIFTI 文件的信息

wb_命令 -nifti-信息

- 要检查的 nifti/cifti 文件

[-print-header] - 显示标题内容

[-print-matrix] - 输出矩阵中的值（仅限 cifti）

[-print-xml] - 打印 cifti XML（仅限 cifti）

[-version] - 将 XML 转换为特定的 CIFTI 版本（默认为

文件的 cifti 版本） - 要使用的 CIFTI 版本

您必须至少指定一个 -打印-* 选项。

-probtrackx-点转换 将 .DOT 文件从 PROBTRACKX 转换为 CIFTI

wb_命令 -probtrackx-点转换

- 输入 .dot 文件- 输出 - 输出 cifti 文件

[-row-voxels] - 沿行的输出映射将是体素

- 包含体素 IJK 索引的文本文件

用过的

- 具有使用的尺寸和形状的标签卷，具有

结构标签

[-row-surface] - 沿行的输出映射将是曲面顶点

- 在所有使用的节点上具有正值的度量文件

[-row-cifti] - 从 cifti 文件中沿行获取映射

- 从中获取映射的 cifti 文件- 哪个维度
沿着映射，ROW 或 COLUMN

[-col-voxels] - 沿列的输出映射将是体素

- 包含体素 IJK 索引的文本文件

用过的

- 具有使用的尺寸和形状的标签卷，具有

结构标签

[-col-surface] - 沿列的输出映射将是表面

顶点- 在所有使用的节点上具有正值的度量文件

[-col-cifti] - 从 cifti 文件中沿列获取映射

- 从中获取映射的 cifti 文件- 哪个维度
沿着映射，ROW 或 COLUMN

[-transpose] - 转置输入矩阵

[-make-symmetric] - 将半平方输入转换为全矩阵输出

注意：正好一个 -行 选项和一个 -col 必须使用选项。

如果输入文件的索引没有按正确的顺序排序，这
命令可能需要比预期更长的时间。 指定 -转置 将转置
在尝试将其值放入 cifti 文件之前输入矩阵，这是
目前至少需要 matrix2 才能按预期显示它。 如何
cifti 文件的显示是基于哪个 -行 指定选项：如果 -行体素
指定，然后它将显示有关卷切片的数据。 中的标签名称
标签卷必须具有以下名称，其他名称将被忽略：

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT 小脑 ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDLA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT 皮质
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT 海马_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT 无效 其他 OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-设置地图名称 在文件中设置一张或多张地图的名称

wb_命令 -设置地图名称

- 设置地图名称的文件

[-name-file] - 使用文本文件替换所有地图名称

- 包含地图名称的文本文件，每行一个

[-map] - 可重复 - 指定一个地图来设置名称

- 要更改名称的地图索引- 设置的名称
地图

为度量、形状、标签、体积、cifti 标量或
cifti 标签文件。 如果 -名称文件 选项未指定， 地图 选项必须
至少指定一次。 这 地图 选项不能使用时 -名称文件 is
指定的。

-集合结构 设置数据文件的结构

wb_命令 -集合结构

- 设置结构的文件- 要设置的结构
文件到

[-surface-type] - 设置表面的类型（仅当文件是一个

表面文件） - 表面类型名称

[-surface-secondary-type] - 设置表面的次要类型（仅

如果文件是表面文件，则使用） - 表面次要类型的名称

现有文件被修改并重写为相同的文件名。
有效

结构名称的值为：

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT 小脑 ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDLA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT 皮质
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT 海马_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT 无效 其他 OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

表面类型的有效名称是：

未知的重建解剖膨胀非常_膨胀的球形半球形
椭圆平船体

表面次要类型的有效名称为：

无效的灰色_白色中间厚片

-秀场 场景到图像文件的离屏渲染

wb_命令 -秀场

- 场景文件- 姓名或号码（从一开始）
中的场景

场景文件

- 输出图像文件名- 输出图像的宽度
- 输出图像的高度

将场景中显示的浏览器窗口的内容渲染为图像文件。 这
图像文件名应类似于“capture.png”。 如果只有一张图片
渲染，图像名称不会改变。 如果要渲染的图像不止一张，
将在图像名称中插入一个索引：“capture_01.png”、“capture_02.png”
等等

图像格式由图像文件扩展名决定。 图像格式
该系统上可用的有：

bmp ico jpeg jpg png ppm tif tiff xbm xpm

注意：可用的图像格式可能因操作系统而异。

-有符号距离到表面 计算从一个表面到另一个表面的符号距离

wb_命令 -有符号距离到表面

- 用于测量符号距离的比较表面
- 定义有符号距离的参考表面

功能

- 输出 - 输出指标

[-winding] - 点内表面测试的缠绕方法

- 方法名称（默认 EVEN_ODD）

计算参考表面上每个顶点的有符号距离函数
比较表面。 注意：这种关系不是对称的，线来自
顶点到“参考”表面上的最近点（定义有符号的
距离函数）只会与“参考”表面的法线对齐。 有效的
绕线方法的说明符如下：

EVEN_ODD（默认） NEGATIVE NONZERO NORMALS

NORMALS 方法使用三角形和边的法线，或最近的三角形
从该点被射线击中。 这种方法可能会稍微快一点，但只是
对于不穿过自身的封闭表面是可靠的。 所有其他
方法计算垂直射线的入口（正）和出口（负）交叉点
点，如果总数为奇数、负数或非零，则计为内部，
。

-spec 文件合并 将两个 SPEC 文件合并为一个

wb_命令 -spec 文件合并

- 第一个要合并的规范文件- 要合并的第二个规范文件
- 输出 - 输出规范文件

输出规范文件包含任一输入规范文件中的每个文件。

-表面仿射回归 回归同一网格上曲面之间的仿射变换

wb_命令 -表面仿射回归

- 表面翘曲- 与坐标相匹配的表面
- 输出 - 输出仿射文件

使用线性回归计算最小化平方和的仿射
目标表面和扭曲的源表面之间的坐标差异。
请注意，这具有缩小正在扭曲的表面的偏差。 输出
写成 NIFTI 的“世界”矩阵，见 -转换仿射 将其转换为用于
其他软件。

-表面应用仿射 将仿射变换应用于曲面文件

wb_命令 -表面应用仿射

- 要转换的表面- 仿射文件- 输出
- 输出变换表面

[-flirt] - 如果仿射是调情仿射，则必须使用

- 生成仿射时使用的源体积
- 生成仿射时使用的目标体积

对于调情矩阵，您必须使用 -调情 选项，因为调情矩阵不是
对它们所代表的坐标变换的完整描述。 如果 -调情
选项不存在，仿射必须是 nifti 'world' 仿射，可以是
获得 -转换仿射 命令，或 4dfp 套件中的 aff_conv。

-表面应用变形场 将 WARPFIELD 应用于曲面文件

wb_命令 -表面应用变形场

- 要转换的表面- INVERSE 曲场
- 输出 - 输出变换表面

[-fnirt] - 如果使用 fnirt warpfield，则必须使用

- 前向曲场

注意：扭曲表面需要使用扭曲场的 INVERSE
与其对齐的音量。 前向经纱的标题是需要的 -fnirt
选项以正确解释 fnirt 经场中的位移。

如果 -fnirt 选项不存在，warpfield 必须是 nifti 'world'
warpfield，可以通过 -转换扭曲场 命令。

-表面平均 平均表面文件一起

wb_命令 -表面平均

- 输出 - 输出平均表面

[-stddev] - 计算 3D 样本标准差

- 输出 - 3D 样本的输出度量

标准偏差

[-uncertainty] - 计算 caret5 '不确定性'

- 输出 - 不确定性的输出度量

[-surf] - 可重复 - 指定要包含在平均值中的表面

- 要平均的表面文件

3D 样本标准差计算为 'sqrt(sum(squaredlength(xyz -
平均值（xyz）））/（n - 1））'。

不确定性是 caret5 中使用的传统度量，计算为 'sum(length(xyz
- 平均值（xyz）））/n'。

-表面最近的顶点 找到离坐标最近的曲面顶点

wb_命令 -表面最近的顶点

- 使用的表面- 带有坐标的文本文件
- 输出 - 带有顶点编号的输出文本文件

对于每个坐标 XYZ 三元组，找到表面中最近的顶点，并输出
将其顶点编号写入文本文件。

-表面坐标到度量 制作表面坐标的公制文件

wb_命令 -表面坐标到度量

- 使用坐标的表面- 输出 - 的
产出指标

将表面坐标放入 3-map 度量文件中，如 x、y、z。

-表面皮质层 创建近似皮质层的表面

wb_命令 -表面皮质层

- 白质表面- 软脑膜表面
- 放置层的体积分数- 输出 -
输出面

[-placement-out] - 将位置输出为与 pial 的距离分数

变白- 输出 - 输出指标

[-untwist] - 比较方法的临时选项，指定使用旧的

方法

输入表面必须具有顶点对应关系。
输出面

是通过在两个曲面之间放置顶点来生成的，这样封闭的
新的和白色表面的任何小块内的体积是给定的分数
软膜和白色表面之间的同一块的体积（即，
指定 0 将给出白色表面，1 将给出软膜表面）。

-表面创建球体 生成具有一致顶点区域的球体

wb_命令 -表面创建球体

- 所需的顶点数- 输出 - 输出
球

通过有规律地划分二十面体的三角形来生成一个球体，来
尽可能接近所需的顶点数量，并将其修改为
所有顶点的顶点区域非常相似。 生成一对顶点匹配的
左右球体，使用这个命令，然后 -表面翻转-lr 生成
其他领域，然后 -集合结构 在各个。 例如：

$ wb_command -surface-create-sphere 6000 Sphere.6k.R.surf.gii
$ wb_command -surface-flip-lr Sphere.6k.R.surf.gii Sphere.6k.L.surf.gii
$ wb_command -set-struct Sphere.6k.R.surf.gii CORTEX_RIGHT
$ wb_command -set-struct Sphere.6k.L.surf.gii CORTEX_LEFT

-表面切割重采样 重新采样切割表面

wb_命令 -表面切割重采样

- 重新采样的表面文件- 球面
与输入表面的网格

是目前

- 一个球面，与

并具有所需的输出网格

- 输出 - 输出表面文件

给定两个注册的球面，重新采样一个表面文件。
使用重心重采样，因为它通常更适合重采样
表面，并且因为无论如何都需要找出新的拓扑结构。

-表面失真 测量表面之间的失真

wb_命令 -表面失真

- 参考面- 扭曲的
表面- 输出 - 输出失真度量

[-smooth] - 平滑区域数据

- 以 mm 为单位的平滑内核 sigma

[-caret5-method] - 使用 caret5 中的表面变形方法

[-edge-method] - 计算边缘长度而不是区域的失真

该命令，不使用时 -caret5-方法 or -边缘方法, 等价于使用
-表面顶点区域 在每个表面上，用
他们来自的表面上的 GEO_GAUSS_EQUAL 方法，如果 -光滑 被指定，并且
然后使用公式'ln（扭曲/参考）/ln(2)'关于平滑结果。

使用时 -caret5-方法，它使用了 caret5 的表面变形方法，
取平铺面积比率的以 2 为底的对数，然后将这些结果平均为
每个顶点，然后在参考表面上平滑结果。

使用时 -边缘方法， -光滑 选项被忽略，并且在每个输出
顶点是 'abs(ln(refEdge/distortEdge)/ln(2))' 在所有边上
连接到顶点。

-表面翻转-lr 通过 YZ 平面镜像一个表面

wb_命令 -表面翻转-lr

- 要翻转的表面- 输出 - 输出翻转表面

此命令否定每个顶点的 x 坐标，并翻转曲面
法线，这样你就有一个具有相同特征的相反旋向的表面
和节点对应，法线与原始表面一致。 那
也就是说，如果输入表面的法线朝外，则输出表面也将
法线朝外。

-表面翻转法线 翻转表面上的所有瓷砖

wb_命令 -表面翻转法线

- 翻转法线的表面- 输出 - 输出
表面

翻转曲面上的所有三角形，从而翻转曲面法线
其他方向（向内与向外）。 如果您使用仿射变换曲面
具有负行列式或类似翻转表面的曲场，您
最终可能会得到一个法线向内的表面，它可能有显示
问题。 使用此命令将解决该问题。

-表面生成膨胀 表面产生膨胀

wb_命令 -表面生成膨胀

- 解剖表面- 输出 -
输出膨胀表面- 输出 - 输出非常
膨胀的表面

[-iterations-scale] - 可选的迭代缩放

- 迭代规模值

生成膨胀和非常膨胀的表面。 输出表面是“匹配的”
（具有相同的 XYZ 范围）到解剖表面。 在大多数情况下，迭代规模
1.0（默认）就足够了。 但是，如果表面包含大量
节点（150,000），尝试迭代规模为 2.5。

-表面测地线距离 计算从一个顶点到整个表面的测地线距离

wb_命令 -表面测地线距离

- 要计算的表面- 计算测地线的顶点
距离- 输出 - 输出指标

[-naive] - 只使用邻居，不要爬行三角形（不推荐）

[-limit] - 停在一定距离

- 以毫米为单位停止的距离

除非 -限制 已指定，计算距指定的测地线距离
所有其他人的顶点。 结果作为单列度量文件输出，带有
价值 -1 对于未计算距离的顶点。 如果 -幼稚的 是不是
指定，它不仅使用直接邻居，还使用从
爬过共享一条边的三角形对。

-表面测地线rois 在顶点处绘制 GEODESIC LIMITED ROIS

wb_命令 -表面测地线rois

- 要绘制的表面- 到顶点的测地线距离限制，
以毫米为单位- 包含要绘制 ROI 的顶点的文本文件

围绕

- 输出 - 输出指标

[-gaussian] - 生成高斯核而不是平坦的 ROI

- 高斯核的 sigma，单位为 mm

[-overlap-logic] - 如何处理重叠的 ROI，默认为 ALLOW

- 解决重叠的方法

[-names] - 命名文本文件中的列

- 一个包含列名的文本文件，每行一个

对于列表文件中的每个顶点，在输出度量中创建一个列，并且
该顶点周围的 ROI 绘制在该列中。 每个指标列都有零
在测地线距离之外, 默认情况下会有一个
里面的值1.0。 如果 -高斯 选项被指定，里面的值
ROI 将改为形成具有指定 sigma 值的高斯，归一化
因此度量列中非零值的总和为 1.0。 这
争论 -重叠逻辑 必须是 ALLOW、CLOSEST 或 EXCLUDE 之一。 允许是
默认值，表示 ROI 被独立处理并且可能重叠。 最近的
意味着 ROI 可能不会重叠，并且没有 ROI 包含更接近的顶点
到不同的种子顶点。 EXCLUDE 意味着 ROI 不能重叠，并且任何
多个 ROI 范围内的顶点不属于任何 ROI。

-表面膨胀 地表膨胀

wb_命令 -表面膨胀

- 解剖表面- 表面文件到
膨胀- 平滑周期数
- 平滑强度（范围 [0.0 - 1.0]）
- 平滑迭代- 通货膨胀因素
- 输出 - 输出表面文件

通过执行由平滑组成的循环来膨胀表面，然后
通货膨胀（纠正由平滑引起的收缩）。

-表面信息 显示有关表面的信息

wb_命令 -表面信息

- 显示信息的表面

显示有关表面的信息，包括顶点、三角形、边界框、
和间距。

-表面匹配 表面匹配

wb_命令 -表面匹配

- 匹配（参考）表面- 文件
包含将被转换的表面- 表面文件
改造后

输入表面文件将被转换，以便其坐标范围（边界
框）与匹配曲面文件的匹配

-表面修改球体 更改半径并可选择重新设置一个球体

wb_命令 -表面修改球体

- 要修改的球体- 输出球体的半径
有- 输出 - 输出球体

[-recenter] - 通过边界框使球体居中

如果您使用过，此命令可能会很有用 -表面重采样 重新采样一个球体，
这可能会遇到通常不存在的问题
-表面球体项目unproject. 如果球体应该已经围绕
原点，使用 -重新居中 在改变半径之前可能仍然会稍微移动它，
这很可能是不受欢迎的。

如果不接近球形，或不以原点为中心，并且
-重新居中 未使用，则打印警告。

-表面法线 将顶点法线输出为度量文件

wb_命令 -表面法线

- 输出法线的表面- 输出 - 正常
矢量

计算表面文件的法线向量，并将它们输出为 3 列
度量文件。

-表面重采样 将表面重新采样为不同的网格

wb_命令 -表面重采样

- 重新采样的表面文件- 球面
与输入表面的网格

是目前

- 一个球面，与

并具有所需的输出网格

- 方法名称- 输出 - 输出表面文件

[-area-surfs] - 指定表面进行顶点区域校正基于

- 一个相关的表面网- 一个
相关表面与网

[-area-metrics] - 指定顶点区域度量以进行基于区域校正的

在- 带有顶点区域的度量文件

网格

- 带有顶点区域的度量文件网

给定两个注册的球面，重新采样一个表面文件。 如果
该方法进行区域校正，正是其中之一 -区域冲浪 or -面积指标 必须
被指定。 此选项在正常情况下不使用，但提供给
完整性。

这参数必须是以下之一：

ADAP_BARY_AREA 重心

建议对解剖表面使用 BARYCENTRIC 方法，除非它们是
相当粗糙，以尽量减少平滑。

对于切割表面（包括平面图），使用 -表面切割重采样.

不是对球面重新采样，而是 -表面球体项目unproject
建议使用命令。

-表面平滑 表面平滑

wb_命令 -表面平滑

- 表面文件平滑- 平滑强度
（范围 [0.0 - 1.0]） - 平滑迭代-
output - 输出表面文件

通过平均节点与其相邻节点来平滑表面。

-表面球体项目unproject 根据注册变形球体

wb_命令 -表面球体项目unproject

- 具有所需输出网格的球体- 一个
与 sphere-in 对齐的球体- 球体投影到
变形到输出空间- 输出 - 输出球体

的每个顶点预计为获得
重心权重，然后用于从.
这导致了一个具有拓扑的球体, 但坐标偏移
通过之间的变形和.
和必须具有与每个相同的拓扑
其他，但是可能有不同的拓扑。

- 表面到表面的 3d 距离 计算对应顶点之间的距离

wb_命令 - 表面到表面的 3d 距离

- 与参考进行比较的表面- 这
用作参考的表面- 输出 - 输出距离

[-vectors] - 输出位移向量

- 输出 - 输出向量

计算每个曲面的顶点之间的向量差
索引，as (comp - ref)，并输出幅度，以及可选的位移
向量。

-表面顶点区域 测量每个顶点负责的表面积

wb_命令 -表面顶点区域

- 要测量的表面- 输出 - 输出指标

每个顶点获得它所属的每个三角形面积的三分之一。

-表面楔形体积 测量曲面之间的每个顶点的体积

wb_命令 -表面楔形体积

- 内表面- 外表面-
output - 输出指标

计算从一个表面到另一个表面的每个顶点区域的体积。 表面
必须有节点对应。

-单元测试

-体积仿射重采样 使用仿射变换重采样体积

wb_命令 -体积仿射重采样

- 重新采样的体积- 要应用的仿射文件
- 您想要的卷空间中的卷文件

产量

- 重采样方法- 输出 - 输出音量

[-flirt] - 如果仿射是调情仿射，则必须使用

- 生成仿射时使用的源体积
- 生成仿射时使用的目标体积

使用仿射变换对卷文件重新采样。
建议

对于大多数数据，方法是 CUBIC（三次样条），对于标签数据，方法是 ENCLOSING_VOXEL。
参数必须是以下之一：

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

-卷所有标签到 rois 使用卷框内的所有标签制作 ROIS

wb_命令 -卷所有标签到 rois

- 输入卷标文件- 标签的编号或名称
要使用的地图- 输出 - 输出卷文件

输出卷对指定输入帧中的每个标签都有一个帧，其他
比 ？？？ 标签，每个标签都包含设置为
对应的标签。

-体积捕获平面 从平面到体积内插图像

wb_命令 -体积捕获平面

- 要插值的卷文件- 姓名或号码
要使用的子卷- 插值类型- 输出图像的宽度，
以像素为单位- 输出图像的高度，以像素为单位- 渲染值
像黑色- 渲染为白色的值- x 坐标
输出图像的左下角- 底部的 y 坐标
输出图像的左侧- 左下角的z坐标
输出图像- 输出右下角的 x 坐标
图片- 输出图像右下角的 y 坐标
- 输出图像右下角的 z 坐标
- 输出图像左上角的 x 坐标-
输出图像左上角的 y 坐标- z 坐标
输出图像的左上角- 输出 - 输出图像

注意：如果要生成具有 GUI 的所有功能的图像
渲染，见 -秀场.

通过卷文件渲染任意平面的图像，使用简单的
线性灰度调色板。 参数必须是以下之一：

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

-卷复制扩展 将扩展数据复制到另一个卷文件

wb_命令 -卷复制扩展

- 包含要使用的体素数据的卷文件
- 包含要使用的扩展名的卷文件- 输出 - 的
输出量

[-drop-unknown] - 不要复制工作台不理解的扩展

此命令将信息复制到卷文件中，该卷文件不是关键部分
标准标题或数据矩阵，例如地图名称、调色板设置、标签表。
If -丢弃未知 没有指定，它也复制了类似的信息集
通过其他软件。

-卷创建 创建一个空白卷文件

wb_命令 -卷创建

- 第一维的长度- 第二维的长度-
第三维长度- 输出 - 输出音量

[-plumb] - 通过轴顺序和间距/偏移设置

- 一个像 'XYZ' 这样的字符串，它指定哪个索引沿着

哪个空间维度

- 通过增加相关来改变 x 坐标

指数

- y坐标的变化从增加相关

指数

- 从增加相关的 z 坐标的变化

指数

- 第一个体素的 x 坐标- 的 y 坐标
第一个体素- 第一个体素的 z 坐标

[-sform] - 通过 nifti sform 设置

- 通过增加 i 索引来增加 x 坐标
- 通过增加 j 索引来增加 x 坐标- 增加
增加 k 索引的 x 坐标- 第一个体素的 x 坐标
- 通过增加 i 索引来增加 y 坐标
- 通过增加 j 索引来增加 y 坐标- 增加
y 坐标来自增加 k 索引- 第一个体素的 y 坐标
- 通过增加 i 索引来增加 z 坐标
- 通过增加 j 索引来增加 z 坐标- 增加
z 坐标从增加 k 索引- 第一个体素的 z 坐标

创建一个充满零的卷文件。
正是其中之一 -垂直 or -形式

必须指定。

-体积扩张 扩大卷文件

wb_命令 -体积扩张

- 扩张的体积- 以毫米为单位的扩张距离-
使用的膨胀方法- 输出 - 输出音量

[-bad-voxel-roi] - 指定要覆盖的体素 roi，而不是

值为 XNUMX 的体素- 体积文件，正值表示体素
它们在许多情况下都能提供类似的结果。

他们的价值观被取代

[-data-roi] - 指定数据所在位置的 roi

- 体积文件，正值表示具有

data

[-subvolume] - 选择单个子体积进行扩张

- 子卷编号或名称

对于所有被指定为坏的体素，如果它们与非坏体素相邻
数据或在此类体素的指定距离内，替换
坏体素，其值是从附近有数据的非坏体素计算出来的，
否则将值设置为零。 无论多小是，扩张将
始终至少使用面部相邻体素。

默认情况下，具有值为 0 的数据的体素是坏的，指定 -坏体素 roi
如果它们被 roi 选择，则仅将体素计为坏。 如果 -数据投资回报率 是不是
指定时，假定所有体素都有数据。

有效值是：

NEAREST - 使用最近的好体素的值 WEIGHTED - 使用加权
基于距离的平均值

-体积估计-fwhm 估计音量的 FWHM 平滑度

wb_命令 -体积估计-fwhm

- 输入音量

[-roi] - 仅使用 ROI 内的数据

- 用作 ROI 的体积

[-subvolume] - 选择单个子体积来估计平滑度

- 子卷编号或名称

分别估计输入体积在 X、Y 和 Z 方向上的平滑度，
将估计值打印到标准输出。 如果 -子卷 未指定，每个
子体积是单独估计和显示的。

-体积极值 在卷文件中查找极值

wb_命令 -体积极值

- 卷文件找到极值- 最小距离
在相同的已识别极值之间

类型

- output - 输出极值体积

[-presmooth] - 在找到极值之前平滑音量

- 高斯平滑核的 sigma，单位为 mm

[-roi] - 忽略选定区域外的值

- 寻找极值的区域

[-threshold] - 忽略小极值

- 考虑作为最小值的最大值- 最小的
考虑为最大值的值

[-sum-subvols] - 输出极值子体积的总和，而不是每个

单独的子卷

[-consolidate-mode] - 使用局部最小值的合并而不是

大街区

[-only-maxima] - 只找到最大值

[-only-minima] - 只找到最小值

[-subvolume] - 选择单个子体积来查找极值

- 子卷编号或名称

在卷文件中查找极值，这样就不会出现两个相同类型的极值
在里面彼此的。 极值被标记为 -1 为最小值，1 为
最大值，否则为 0。 如果 -仅最大值 or -只有最小值 被指定，那么它将
忽略不是指定类型的极值。 这些选项是相互排斥的。

If -总和子卷 被指定，这些极值子体积被求和，并且输出
具有此结果的单个子卷。

默认情况下，只有当数据点比其他数据点更极端时，它才是极值
内的数据点从中。 如果 -整合模式 被使用，它
相反，首先找到所有比直接数据点更极端的数据点
邻居，那么虽然内部有任何极值互相取
彼此最接近的两个极值并通过加权平均将它们合并为一个
基于合并到每个中的原始极值的数量。

默认情况下，所有输入子卷都使用不平滑，使用 -子卷 至
指定要使用的单个子卷，以及 - 预平滑 平滑输入之前
寻找极值。

-体积填充孔 填充 ROI 体积中的孔

wb_命令 -体积填充孔

- 输入 ROI 体积- 输出 - 输出 ROI 体积

查找不包括在 ROI 中的所有面连接部分，并填充除
最大的一个。

-体积查找簇 按体积过滤集群

wb_命令 -体积查找簇

- 输入音量- 数据值的阈值
- 集群体积阈值，单位为 mm^3 - 输出 -
输出量

[-less-than] - 查找小于的值， 而不是

更大的

[-roi] - 选择感兴趣的区域

- 投资回报率，作为卷文件

[-subvolume] - 选择单个子卷

- 子卷编号或名称

[-size-ratio] - 忽略小于给定分数的簇

地图中最大的集群- 最大集群体积的一部分

[-distance] - 忽略距离超过给定距离的集群

最大的集群- 集群离最大集群有多远，
边缘

到边缘，毫米

[-start] - 从 1 以外的值开始标记集群

- 给出找到的第一个簇的值

为足够大范围内的所有体素输出具有非零整数的体积
集群，其他地方为零。 整数表示集群成员资格（默认情况下，
找到的第一个集群将使用值 1，第二个集群 2 等）。 默认情况下，值
比...更棒被认为是在一个集群中，使用 -少于 至
测试小于阈值的值。 将此作为掩码应用于数据，或
要进行更复杂的阈值处理，请参阅 -体积数学.

-体积梯度 卷文件的渐变

wb_命令 -体积梯度

- 输入音量- 输出 - 输出梯度
量级体积

[-presmooth] - 在计算梯度之前平滑体积

- 高斯加权函数的 sigma，单位为 mm

[-roi] - 选择一个感兴趣的区域来获取梯度

- 取梯度的区域

[-vectors] - 输出向量

- 输出 - 向量作为卷文件

[-subvolume] - 选择单个子体积来获取梯度

- 子卷编号或名称

通过对每个体素进行线性回归来计算体积的梯度，
只考虑它的面邻居，除非面邻居太少。 这
梯度向量由所得线性的偏导数构成
函数，这个向量的大小就是输出。 如果指定，音量
矢量输出与子体积中的 x、y 和 z 分量一起排列为
连续的子卷。

-卷标导出表 从卷中导出标签表作为文本

wb_命令 -卷标导出表

- 输入卷标文件- 标签的编号或名称
要使用的地图- 输出 - 输出文本文件

从卷标映射中获取标签表，并将其写入文本格式
符合预期 -卷标导入.

-卷标导入 将标签卷导入到插入格式

wb_命令 -卷标导入

- 要导入的标签卷- 包含的文本文件
标签的值和名称- 输出 - 输出工作台标签卷

[-discard-others] - 使用标签中未提及的值设置任何体素

列出来？？？ 标签

[-unlabeled-value] - 设置将被解释为未标记的值

- 未标记的数值（默认为 0）

[-subvolume] - 选择要导入的单个子卷

- 子卷编号或名称

[-drop-unused-labels] - 从标签中删除任何未使用的标签值

表

在插入符号 nifti 的标头中创建带有标签信息的新卷
扩展格式。 您可以指定空字符串（'' 将在 linux/mac 上工作）
, 这将被视为一个空文件。 标签列表
文件必须具有以下格式的行：



不要在文件中指定“unlabeled”键，假设0表示没有
标记除非 -未标记值 被指定。 标签名称必须在单独的
行，但可能包含空格或其他不寻常的字符（但不是换行符）。
空格从标签名称的两端修剪，但如果它在
标签的中间。 red、green、blue 和 alpha 的值必须是整数
0 到 255，并将指定标签绘制的颜色（alpha 为 255 表示
不透明，这可能是您想要的）。 默认情况下，它将设置新的标签名称
对于列表中未提及的任何遇到的值，名称为 LABEL_#
文件，指定 -丢弃其他人 改为将这些体素设置为“未标记”键。

-卷标签到投资回报率 将卷标签制作成 ROI 卷

wb_命令 -卷标签到投资回报率

- 输入卷标文件- 输出 - 输出音量
文件

[-name] - 按名称选择标签

- 您想要投资回报率的标签名称

[-key] - 按键选择标签

- 您想要投资回报率的标签键

[-map] - 选择要使用的单个标签地图

- 地图编号或名称

对于每张地图, 地图被创建在所有位置
标有或用钥匙给定值为 1，并且
所有其他位置都为 0。正好是其中之一 -芋头 和 -键 必须指定。
指定 地图 只使用一张地图.

-体积标签到表面映射 将标签卷映射到表面标签文件

wb_命令 -体积标签到表面映射

- 映射数据的卷- 将数据映射到的表面
- output - 输出gifti标签文件

[-subvol-select] - 选择要映射的单个子卷

- 子卷编号或名称

使用封闭体素映射方法将标签数据映射到gifti标签文件。

-体积数学 评估卷文件的表达

wb_命令 -体积数学

- 要评估的表达式，用引号引起来- 输出 - 的
输出量

[-fixnan] - 用一个值替换 NaN 结果

- 用 NaN 替换的值

[-var] - 可重复 - 用作变量的卷文件

- 变量的名称，在表达式中使用- 音量
用作此变量的文件

[-subvolume] - 选择单个子卷

- 子卷编号或名称

[-repeat] - 为每个计算子卷重用单个子卷

此命令评估在每个体素上独立。
那里

必须至少是一个 -变量 选项（从中获取卷空间），即使
中指定的不用于. 所有卷必须具有相同的卷
空间。 文件名在, 使用变量名和 -变量
匹配选项指定输入文件。 如果 -子卷 选项是
给予任何 -变量 选项，仅使用该文件中的一个子卷。 如果 -重复 is
指定，该文件必须要么只有一个子卷，要么有 -子卷
指定的选项。 所有不使用的文件 -重复 必须有相同数量的
请求使用的子卷。 的格式如下：

表达式由常量、变量、运算符、括号和函数组成，
中缀表示法，例如 'exp(-x + 3) * 规模'。 变量是任何字符串
长度，使用字符 az、AZ、0-9 和 _，但不能采用 a 的名称
名为常数。 目前，只有一个命名常量 PI。 运营商
是 +、-、*、/、^、>、<、>=、<=、==、!=、!、&&、||。 这些行为与 C 中的一样，除了
^ 是求幂，即 pow(x, y)，并且比其他优先级更高
二元运算符（同样，'-3^-4^-5' 表示'-(3^(-(4^-5)))'）。 <=、>=、== 和 !=
运营商有少量回旋余地，相当于百万分之一
被比较值的绝对值中较小的一个。

比较和逻辑运算符返回 0 或 1，您可以使用表达式进行屏蔽
像'x *（掩码> 0）'。 对于所有逻辑运算符，输入被认为是真实的
它大于 0。表达式 '0 < x < 5' 在语法上没有错误，但是
它不会做我们想要的，因为它是从左到右计算的，即 '((0
x) < 5)'，它将始终返回 1，因为比较的两种可能结果都是
小于 5。如果检测到此类型的表达式，则会生成警告。
使用诸如 'x > 0 && x < 5' 之类的东西来获得所需的行为。

元素之间的空白被忽略，' sin ( 2 * x ) ' 等价于
'sin(2*x)'，但 'sin(2*x)' 是一个错误。 不允许隐式乘法，
表达式 '2x' 将被解析为变量。 括号是()，不要用
[] 或者 {}。 函数需要括号，表达式“sin x”是错误的。

支持以下功能：

sin：1个参数，参数的正弦（单位是弧度）cos：1个参数，
参数的余弦（单位是弧度） tan：1 个参数，正切
参数（单位是弧度） asin：1 个参数，参数的正弦的倒数，
弧度 acos：1 个参数，参数余弦的倒数，以弧度为单位
atan: 1 个参数，参数正切的倒数，以弧度为单位 atan2: 2
参数，atan2(y, x) 返回正切的倒数

(y/x)，以弧度为单位，通过两个参数的符号确定象限

sinh: 1 个参数，参数的双曲正弦 cosh: 1 个参数，
参数 tanh 的双曲余弦：1 个参数，是
参数 asinh: 1 参数，参数 acosh: 1 的反双曲正弦
参数，参数 atanh 的反双曲余弦：1 个参数，
参数 ln 的反双曲线正切：1 个参数，自然对数
参数 exp：1 个参数，常数 e 的参数的幂
log：1 个参数，以 10 为底的对数 sqrt：1 个参数，平方
参数根 abs：1 个参数，参数 floor 的绝对值：1
参数，不大于参数round的最大整数：1个参数，
最接近的整数，关系四舍五入

零

ceil：1个参数，不小于参数的最小整数 min：2个参数，
min(x, y) 如果 (x > y) 返回 y，否则 x 最大：2 个参数，max(x, y) 返回 y
if (x < y), x 否则 mod: 2 个参数, mod(x, y) = x - y * floor(x / y), or 0 if
y == 0 钳位：3 个参数，钳位（x，低，高）= min（最大（x，低），高）

-卷合并 将卷文件合并到一个新文件中

wb_命令 -卷合并

- 输出 - 输出卷文件

[-volume] - 可重复 - 指定输入卷文件

- 使用子卷的卷文件

[-subvolume] - 可重复 - 选择要使用的单个子卷

- 子卷编号或名称

[-up-to] - 使用包含范围的子卷

- 最后一个子卷的编号或名称

包括

[-reverse] - 以相反的顺序使用范围

获取一个或多个卷文件并通过连接构造一个新的卷文件
来自他们的子卷。 输入卷文件必须具有相同的卷空间。

示例：wb_command -卷合并 输出.nii -体积 第一个.nii -子卷 1 -体积
第二个.nii

此示例将从 first.nii 中获取第一个子卷，然后是所有
来自 second.nii 的子卷，并将这些写入 out.nii。

-体积调色板 设置卷文件的调色板

wb_命令 -体积调色板

- 要修改的卷文件- 映射模式

[-subvolume] - 选择单个子卷

- 子卷编号或名称

[-pos-percent] - 正数据着色的最小/最大百分比

- 最不积极数据的百分位数- 这
最积极数据的百分位数

[-neg-percent] - 负数据着色的最小/最大百分比

- 最少负面数据的百分位数- 这
最负面数据的百分位数

[-pos-user] - 正数据着色的用户最小/最大值

- 最小正数据的值- 价值
对于最积极的数据

[-neg-user] - 负数据着色的用户最小/最大值

- 最少负数据的值- 价值
对于最负面的数据

[-interpolate] - 内插颜色

- 布尔值，是否插值

[-disp-pos] - 显示正数据

- 布尔值，是否显示

[-disp-neg] - 显示正数据

- 布尔值，是否显示

[-disp-zero] - 显示比最小截止值更接近零的数据

- 布尔值，是否显示

[-palette-name] - 设置使用的调色板

- 调色板的名称

[-thresholding] - 设置阈值

- 阈值设置- 显示阈值内或外的值
- 较低的门槛- 上限

原始卷文件被修改后的版本覆盖。
By

默认情况下，卷文件的所有列都调整为新设置，使用
-子卷 仅更改一个子卷的选项。 中未指定的映射设置
选项将从第一个子卷中获取。 这参数必须是其中之一
执行以下操作：

MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE

这论据 -调色板名称 必须是以下之一：

PSYCH PSYCH-NO-NONE ROY-BIG ROY-BIG-BL 橙黄色 灰色_Interp_Positive
Gray_Interp clear_brain 视频风格 fidl raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG 红黄蓝浅蓝 FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_蓝色 fsl_黄色 JET256

这论据 -阈值 必须是以下之一：

THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL

这论据 -阈值 必须是以下之一：

THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE

-体积包裹重采样 平滑和重新采样体积包裹

wb_命令 -体积包裹重采样

- 输入数据量- 标签卷所在的位置
包裹目前是- 包裹应该在哪里的标签卷
- 重采样期间平滑的高斯核 sigma -
输出 - 输出音量

[-fix-zeros] - 将零值视为不是数据

[-subvolume] - 选择单个子卷作为输入

- 子卷编号或名称

平滑并重新采样 cur-parcels 中每个标签内的区域到
新包裹中的相同标签名称。 输出标签区域中的任何体素，但
输入标签区域之外的区域将从附近的数据中推断出来。 这
-修复零 如果输入值为零，则选项会导致平滑不使用输入值，但是
还是给体素写一个平滑后的值，平滑完成后，
检查任何剩余的零值，并用外推值填充它们。

注意：所有卷必须具有相同的尺寸和间距。
要使用

不同的输出空间，见 -体积地块重采样通用.

-体积地块重采样通用 从不同的体积中平滑和重新采样体积包裹
空间

wb_命令 -体积地块重采样通用

- 输入数据量- 标签卷所在的位置
包裹目前是- 包裹应该在哪里的标签卷
- 重采样期间平滑的高斯核 sigma -
输出 - 输出音量

[-fix-zeros] - 将零值视为不是数据

[-subvolume] - 选择单个子卷作为输入

- 子卷编号或名称

平滑并重新采样 cur-parcels 中每个标签内的区域到
新包裹中的相同标签名称。 输出标签区域中的任何体素，但
输入标签区域之外的区域将从附近的数据中推断出来。 这
-修复零 如果输入值为零，则选项会导致平滑不使用输入值，但是
还是给体素写一个平滑后的值，平滑完成后，
检查任何剩余的零值，并用外推值填充它们。
输出volume会使用new-parcels的volume空间，不需要
与输入在同一个体积空间中。

-体积包裹平滑 光滑的包裹分开

wb_命令 -体积包裹平滑

- 音量平滑- 一个标签卷包含
包裹要平滑- 高斯平滑核 sigma，单位为 mm
- 输出 - 输出音量

[-fix-zeros] - 将零值视为不是数据

[-subvolume] - 选择单个子卷进行平滑

- 子卷编号或名称

仅使用来自的数据在标签卷中的每个标签内对卷进行平滑处理
标签内。 相当于运行体积平滑，ROI 匹配每个
单独标记，然后添加生成的卷，但速度更快。

-减量 跨子卷执行缩减操作

wb_命令 -减量

- 要减少的卷文件- 要使用的归约运算符
- 输出 - 输出音量

[-exclude-outliers] - 按标准排除每个时间序列中的异常值

偏差- 低于平均值的标准差数量

包括

- 高于平均值的标准差数量

包括

对于每个体素，将跨子体积的数据作为向量，并执行
指定减少，将结果放入单个输出卷中
体素。 归约运算符如下：

MAX：最大值 MIN：最小值 INDEXMAX：从 1 开始的索引
最大值 INDEXMIN：最小值的从 1 开始的索引 SUM：将所有值相加
PRODUCT：乘以所有值 MEAN：数据的均值 STDEV：标准
偏差（N分母） SAMPSTDEV：样本标准偏差（N-1
分母）VARIANCE：数据的方差 MEDIAN：数据的中位数
MODE：数据的模式 COUNT_NONZERO：数据中非零元素的个数
data

-体积删除岛 从 ROI 卷中移除孤岛

wb_命令 -体积删除岛

- 输入 ROI 体积- 输出 - 输出 ROI 体积

查找 ROI 的所有面部连接部分，并将除最大的部分之外的所有部分归零。

-卷重新定向 更改卷文件的体素顺序

wb_命令 -卷重新定向

- 重新定向的音量- 所需的方向
- out - 重新定向的卷

更改体素顺序和标题间距/原点信息，以便
任何空间点的值不变。 方向字符串看起来像“LPI”，
这意味着第一个索引是从左到右，第二个是从前到后，并且
三是劣于优。 有效字符为：

L 从左到右

R 从右到左

P 后到前

从前到后

我不如上级

S 优劣

-来自极值的体积 rois 从 EXTREMA 地图创建体积 ROI 地图

wb_命令 -来自极值的体积 rois

- 输入音量- 距体素中心的距离限制，单位为 mm
- 输出 - 输出音量

[-gaussian] - 生成高斯核而不是平坦的 ROI

- 高斯核的 sigma，单位为 mm

[-roi] - 选择要使用的感兴趣区域

- 使用地区

[-overlap-logic] - 如何处理重叠的 ROI，默认为 ALLOW

- 解决重叠的方法

[-subvolume] - 选择单个子体积来获取梯度

- 子卷编号或名称

对于每个地图中的每个非零值，制作一个地图，在该位置周围有一个 ROI。
如果 -高斯 指定选项，然后输出归一化的高斯核
而不是投资回报率。 这论据 -重叠逻辑 必须是允许之一，
最接近，或排除。 ALLOW 是默认值，表示处理 ROI
独立且可能重叠。 CLOSEST 意味着 ROI 可能不会重叠，并且
没有 ROI 包含更接近不同种子顶点的顶点。 排除意味着
ROI 不能重叠，并且任何顶点在一个以上的 ROI 范围内
不属于任何 ROI。

-卷集空间 更改体积空间信息

wb_命令 -卷集空间

- 输入音量- 输出 - 输出音量

[-plumb] - 通过轴顺序和间距/偏移设置

- 一个像 'XYZ' 这样的字符串，它指定哪个索引沿着

哪个空间维度

- 通过增加相关来改变 x 坐标

指数

- y坐标的变化从增加相关

指数

- 从增加相关的 z 坐标的变化

指数

- 第一个体素的 x 坐标- 的 y 坐标
第一个体素- 第一个体素的 z 坐标

[-sform] - 通过 nifti sform 设置

- 通过增加 i 索引来增加 x 坐标
- 通过增加 j 索引来增加 x 坐标- 增加
增加 k 索引的 x 坐标- 第一个体素的 x 坐标
- 通过增加 i 索引来增加 y 坐标
- 通过增加 j 索引来增加 y 坐标- 增加
y 坐标来自增加 k 索引- 第一个体素的 y 坐标
- 通过增加 i 索引来增加 z 坐标
- 通过增加 j 索引来增加 z 坐标- 增加
z 坐标从增加 k 索引- 第一个体素的 z 坐标

写入卷文件的副本，间距信息更改为
指定的。 不会发生体素数据的重新排序。 正是其中之一 -垂直 or
-形式 必须指定。

-音量平滑 平滑卷文件

wb_命令 -音量平滑

- 音量平滑- 高斯平滑核 sigma，
以毫米为单位- 输出 - 输出音量

[-roi] - 仅从 ROI 内的数据平滑

- 用作 ROI 的体积

[-fix-zeros] - 将零值视为不是数据

[-subvolume] - 选择单个子卷进行平滑

- 子卷编号或名称

体积的高斯平滑。
默认情况下，平滑所有子卷

无 ROI，如果给定 ROI，则只有 ROI 体积中的正体素有其值
使用，所有其他体素设置为零。 平滑非正交体积将
显着变慢，因为操作不能分成
不扭曲内核形状的一维平滑。

这款 -修复零 如果输入值为零，则选项会导致平滑不使用输入值，
但仍将平滑值写入体素。 这对于零很有用
表示缺乏信息，阻止他们降低强度
附近的体素，同时给零一个外推值。

-音量统计 卷文件的空间统计

wb_命令 -音量统计

- 输入音量

[-reduce] - 使用归约操作

- 还原操作

[-percentile] - 给出百分位数的值

- 要查找的百分位数

[-subvolume] - 只显示一个子卷的输出

- 子卷编号或名称

[-roi] - 只考虑 roi 内的数据

- 投资回报率，作为卷文件

[-match-maps] - 每个输入子卷使用对应的

来自 roi 文件的子卷

[-show-map-name] - 在每个输出之前打印地图索引和名称

对于输入的每个子卷，打印一个数字，由
指定的减少或百分位操作。 利用 -子卷 只给出输出
对于单个子卷。 利用 -投资回报率 仅考虑区域内的数据。
正是其中之一 -降低 or -百分位 必须指定。

的论点 -降低 选项必须是以下之一：

MAX：最大值 MIN：最小值 INDEXMAX：从 1 开始的索引
最大值 INDEXMIN：最小值的从 1 开始的索引 SUM：将所有值相加
PRODUCT：乘以所有值 MEAN：数据的均值 STDEV：标准
偏差（N分母） SAMPSTDEV：样本标准偏差（N-1
分母）VARIANCE：数据的方差 MEDIAN：数据的中位数
MODE：数据的模式 COUNT_NONZERO：数据中非零元素的个数
data

-音量-tfce 对卷文件执行 TFCE

wb_命令 -音量-tfce

- 运行 TFCE 的卷- 输出 - 输出音量

[-presmooth] - 在运行 TFCE 之前平滑音量

- 高斯平滑核的 sigma，单位为 mm

[-roi] - 选择一个感兴趣的区域来运行 TFCE

- 运行 TFCE 的区域，作为一个卷

[-parameters] - 设置 TFCE 积分参数

- 集群体积指数（默认 0.5） - 阈值的指数
（默认 2.0）

[-subvolume] - 选择单个子卷

- 子卷编号或名称

无阈值聚类增强是一种增加相对值的方法
在标准阈值测试中会形成集群的区域。 这是
通过评估以下积分来完成：

e(h, p)^E * h^H * dh

在每个顶点 p 处，其中 h 的范围从 0 到数据中的最大值，并且 e(h,
p) 是包含阈值 h 处的顶点 p 的簇的范围。 消极的
通过否定数据，运行相同的进程，以及
否定结果。

该方法在：Smith SM, Nichols TE., “Threshold-free cluster
增强：解决平滑、阈值依赖和
聚类推理中的定位。”神经图像。2009 年 1 月 XNUMX 日；44(1):83-98。 PMID：
18501637

-体积到表面映射 将体积映射到表面

wb_命令 -体积到表面映射

- 映射数据的卷- 将数据映射到的表面
- 输出 - 输出度量文件

[-trilinear] - 使用三线性体积插值

[-enclosure] - 封闭体素的使用值

[-cubic] - 使用三次样条

[-ribbon-constrained] - 使用功能区约束映射算法

- 色带的内表面- 外表面
丝带

[-volume-roi] - 使用音量 roi

- 卷文件

[-voxel-subdiv] - 在估计体素权重时进行体素划分

- 细分数，默认为 3

[-output-weights] - 将顶点的体素权重写入体积

文件- 获取体素权重的顶点数，从 0 开始
- 输出 - 写入权重的体积

[-myelin-style] - 使用来自髓鞘映射的方法

- 用于此的皮质带的 roi 体积

半球

- 皮质厚度的公制文件- 以毫米为单位的高斯核
用于加权范围内的体素

[-subvol-select] - 选择要映射的单个子卷

- 子卷编号或名称

您必须准确指定一种映射方法。
封闭体素使用

顶点位于内部的体素的值，而三线性执行 3D 线性
基于顶点每一侧的体素的插值
位置。

带状映射方法从顶点的邻居构造一个多面体
每个表面，并估计这个多面体的体积下降
在任何附近的体素内，用作采样的权重。 体积 ROI 为
可用于排除表面通过的体素的部分体积效应，以及
将导致映射忽略在
面具。 细分数字指定它如何近似
通过将每个体素分成 NxNxN 块来对多面体相交进行体积处理，以及
检查每个部分的中心是否在多面体内部。 如果你有
非常大的体素，如果输出为零，请考虑增加它。

髓鞘风格方法使用 caret5 髓鞘映射命令的一部分来执行
映射：对于每个表面顶点，使所有体素都比厚度更接近
位于带状 ROI 内的顶点，距离厚度值不到一半
从顶点沿表面法线方向，并应用高斯
具有指定 sigma 的内核以获取要使用的权重。

-体积矢量操作 对卷文件进行矢量操作

wb_命令 -体积矢量操作

- 第一个向量输入文件- 第二个向量输入文件
- 做什么向量操作- 输出 - 输出文件

[-normalize-a] - 对第一个输入的向量进行归一化

[-normalize-b] - 归一化第二个输入的向量

[-normalize-output] - 归一化输出向量（对点无效

产品）

[-magnitude] - 输出结果的大小（对点无效

产品）

对两个卷文件进行矢量操作（必须是 3 的倍数）
子卷）。 任何一个输入都可能有多个向量（超过 3
子卷），但不能同时包含（至少一个必须正好有 3 个子卷）。 这
-震级 和 -标准化输出 选项不能一起指定，或与
点操作。 这参数必须是以下之一：

点交叉加减

-体积扭曲场重新采样 使用 WARPFIELD 重新采样音量

wb_命令 -体积扭曲场重新采样

- 重新采样的体积- 要应用的曲场
- 您想要的卷空间中的卷文件

产量

- 重采样方法- 输出 - 输出音量

[-fnirt] - 如果使用 fnirt warpfield，则必须使用

- 生成翘曲场时使用的源体积

使用变形场对卷文件重新采样。
推荐的方法是

CUBIC（三次样条）用于大多数数据，ENCLOSING_VOXEL 用于标签数据。 这
范围必须是以下之一：

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

-体积加权统计 卷文件上的加权空间统计

wb_命令 -体积加权统计

- 输入音量

[-weight-volume] - 使用卷文件中的权重

- 包含权重的卷文件

[-subvolume] - 只显示一个子卷的输出

- 子卷编号或名称

[-roi] - 只考虑 roi 内的数据

- 投资回报率，作为卷文件

[-match-maps] - 每个输入子卷使用对应的

来自 roi 文件的子卷

[-mean] - 计算加权平均值

[-stdev] - 计算加权标准偏差

[-sample] - 从样本中估计总体标准差

[-percentile] - 计算加权百分位数

- 要查找的百分位数

[-sum] - 计算加权和

[-show-map-name] - 在每个输出之前打印地图索引和名称

对于输入的每个子卷，打印一个数字，由
指定的操作。 如果 -重量-体积 没有指定，每个体素的体积是
用过的。 用 -子卷 只为单个子卷提供输出。 利用 -投资回报率 至
仅考虑区域内的数据。 正是其中之一 -意思, -stdev, -百分位
or -和 必须指定。

运用 -和 也完全不需要 -重量-体积 等价于积分
卷。

-wb稀疏合并密集 沿密集维度合并 WBSPARSE 文件

wb_命令 -wb稀疏合并密集

- 要合并的维度，ROW 或 COLUMN - 输出
- 输出 wbsparse 文件

[-wbsparse] - 可重复 - 指定输入 wbsparse 文件

- 要合并的 wbsparse 文件

输入的 wbsparse 文件必须具有沿非方向匹配的映射
指定，并且沿着指定方向的映射必须是大脑模型。

-zip-场景文件 压缩场景文件及其数据文件

wb_命令 -zip-场景文件

- 用于制作 zip 文件的场景文件- 名字
压缩文件时创建的文件夹的

解压缩

- out - 将创建的 zip 文件

[-base-dir] - 指定所有数据文件所在的目录

其中，这将成为 zipfile 目录结构的根
- 目录

如果 zip 文件已经存在，它将被覆盖。
If -基础目录 是不是

指定时，包含场景文件的目录将用作基本目录。
场景文件必须只包含相对路径，外部不得有数据文件
基本目录。

-zip 规格文件 压缩规格文件及其数据文件

wb_命令 -zip 规格文件

- 要添加到 zip 文件的规范文件- 名字
压缩文件时创建的文件夹的

解压缩

- out - 将创建的 zip 文件

[-base-dir] - 指定所有数据文件所在的目录

其中，这将成为 zipfile 目录结构的根
- 目录

如果 zip 文件已经存在，它将被覆盖。
If -基础目录 是不是

指定时，包含规范文件的目录将用作基本目录。
spec 文件必须只包含相对路径，不能有数据文件在外面
基本目录。 不检查 spec 文件中的场景文件是什么文件
他们引用，确保场景文件引用的所有数据文件也是
由规范文件引用。

使用 onworks.net 服务在线使用 wb_command