这是名为 CRISPR-Offinder 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 CRISPR-offinder-1.0.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 CRISPR-Offinder 和 OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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CRISPR-Offinder
商品描述
总结:设计高效、特异的 CRISPR 小向导 RNA (sgRNAs) 是 CRISPR 技术成功应用的关键之一。 重要的是,已经发现了越来越多具有不同原型间隔区相邻基序 (PAM) 的新型 RNA 引导的核酸内切酶。 因此,迫切需要开发一种通用工具来设计 sgRNA,以满足不同 RNA 引导的 DNA 核酸内切酶的需求。 为此,开发了名为“CRISPR-offinder”的灵活 sgRNA 设计程序。 这个新程序最重要的特性是它支持所有已知的 PAM 类型,以及客户定义的 PAM。 此外,CRISPR-offinder 可以根据脱靶位点数在基因组中寻找候选 sgRNA 并对其进行排序,也可用于设计单个或成对的 gRNA。 CRISPR-offinder 可作为命令行程序免费使用或通过我们的网站访问。
可用性:CRISPR-offinder 可在以下网址免费获得 http://crispr-offinder.com/ or http://crispr.igenetech.com/.
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/crispr-offinder/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。