这是名为 FastQC 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 v0.12.1sourcecode.zip 下载。 它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 FastQC with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
截图:
快速质控
描述:
FastQC 是一种质量控制分析工具,旨在发现高通量测序数据集中的潜在问题。 它的目标是提供一种简单的方法来检查来自高通量测序管道的原始序列数据的质量。 它通过对一个或多个 fastq 或 bam 格式的原始序列文件运行一组模块化分析来做到这一点。 然后它会生成一份总结结果的报告,并突出显示图书馆可能出现异常的任何区域。 然后,这应该将您引导到您的数据可能存在问题的地方,并允许您在进行任何进一步分析之前采取必要的步骤来纠正它。
FastQC 不依赖于任何特定类型的测序技术,因此它可用于查看各种实验类型的文库(基因组测序、ChIP-Seq、RNA-Seq、BS-Seq 等)。
項目特色
- 从 BAM、SAM 或 FastQ 文件导入数据
- 提供突出潜在问题区域的快速概览
- 用于快速评估数据的汇总图表
- 将结果导出为 HTML
- 可以离线使用
程式语言
爪哇岛
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便通过我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。