这是名为 FishingCNV 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 FishingCNV_1.5.3.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 FishingCNV 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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钓鱼CNV
商品描述
FishingCNV是麦吉尔大学开发的一款软件工具,是一种综合分析高通量外显子组测序数据中罕见拷贝数变异的工具。 输入是基因组分析工具包 (GATK) 生成的标准覆盖文件,输出是包含假定 CNV 的文件。
该程序有 2 个不同的版本
* GUI版本(FishingCNV_X.XXzip)
* 命令行版本(FishingCNV_X.X_pipeline)
浏览我们的文件以查找不同的版本。
产品优势
- 图形用户界面
- 匹配测试/对照(例如癌症/肿瘤)的 CNV 分析
- 非匹配样本的 CNV 分析
- 控制集中的批量效应移除
- 可以在 Excel 中查看制表符分隔的输出
- 额外的输出文件可以在 IGV 中可视化
- 每个染色体的分布图和异常值图
目的
科学/研究,教育
用户界面
Java秋千
程式语言
爪哇,S/R
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/fishingcnv/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。