这是一个名为 Hamstr 的 Linux 应用程序,可以在 Linux 在线运行,其最新版本可以下载为 hamstr.v13.2.6-bin-lib.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 Hamstr 的应用程序,可免费在 Linux 中在线运行 OnWorks。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
Hamstr 在 Linux 上在线运行
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商品描述
HaMStR 已移至 https://github.com/bionf/hamstr 它现在是 HaMStR-OneSeq 包的一部分。HaMStR 是一种基于轮廓隐藏马尔可夫模型的工具,用于在 EST 或蛋白质序列数据中进行定向直系同源搜索。 该程序采用预定义的直向同源序列核心组(核心直向同源物)和一组来自搜索分类群的序列作为输入。 HaMStR 然后在两步策略中结合基于 pHMM 的搜索和通过 BLAST 的反向搜索,以使用来自搜索分类群的新序列扩展核心直系同源组。
目的
学术/科研
程式语言
Perl的
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/hamstr/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。