这是名为 MAGeCK 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 Broadgpp-brunello-library-corrected.txt.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 MAGeCK 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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魔法师
商品描述
基于模型的全基因组 CRISPR-Cas9 敲除分析 (MAGeCK) 是一种计算工具,可从最近的基因组规模 CRISPR-Cas9 敲除筛选技术中识别重要基因。
有关说明和文档,请参阅 wiki 页面。
MAGeCK 由来自 Dana-Farber 癌症研究所/哈佛大学公共卫生学院的 Xiaole Shirley Liu 博士实验室的 Wei Li 和 Han Xu 开发,并由国家儿童医学中心的 Wei Li 实验室维护。 我们感谢 Claudia Adams Barr 创新基础癌症研究计划和 NIH/NHGRI 对开发 MAGeCK 的支持。
項目特色
- 筛选分析中最流行的计算算法
- 超过 400 次引用和 60 万次下载
- 在全基因组 CRISPR-Cas9 敲除实验中筛选基因的简单、易于使用的流程
- 包含易于上手教程的完整文档
- 灵敏度高,误发现率低
- 积极维护具有新功能和错误修复的源代码
- 来自开发者和用户社区的支持
- 一组生成出版物标准图的可视化功能
目的
学术/科研
程式语言
蟒蛇,C
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/mageck/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。