这是名为 mitoMaker 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 mitoMaker_1.0rc2.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 mitoMaker 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
Ad
米托制造商
商品描述
Mitomaker 是一个管道包装器、结果分析器和自动注释器，用 Python v2.7 编写，在其他程序的帮助下，构建、分析、寻找最佳构建和注释目标基因组（如线粒体和叶绿体）。 它可以与其他目标一起使用，例如特定基因或转录组，即使这不是它的主要目标，也不是经过彻底测试的。
在我研究的实验室中多次尝试构建不同的线粒体基因组后，一条通用的管道开始出现：使用 MIRA 或 SOAPdenovo-Trans 组装读取，寻找与密切相关的物种匹配的支架/重叠群，检查是否所有存在预期的基因组特征（因为线粒体非常保守），检查组装是否可能已经环化（因为它是环状 DNA）。 如果缺少某个功能，或者它没有循环化，请尝试使用不同的汇编器参数（主要是 k-mer）再次组装。 冲洗并重复，直到找到最佳构建。
項目特色
- 生物信息学
- 质体构建自动化流水线
- 基因组分析仪
- 质体组装
目的
学术/科研
用户界面
控制台/终端
程式语言
Python
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/plastidmaker/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便通过我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
