这是名为 Opera 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 OPERA-LG_v2.0.6.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 Opera with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
Opera
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商品描述
Opera(Optimal Paired-End Read Assembler)是一个序列汇编程序(http://en.wikipedia.org/wiki/Sequence_assembly)。 它使用来自双端或长读取的信息来优化排序和定向从鸟枪测序读取组装的重叠群。一个名为 OPERA-LG 的更新版本已经过重新设计,具有用于组装大型复杂基因组的功能。
Song Gao、Denis Bertrand、Burton KH Chia 和 Niranjan Nagarajan。 OPERA-LG:高效且精确的大型、富含重复序列的真核基因组的支架,并具有性能保证。 基因组生物学,2016 年 10.1186 月,doi:13059/s016-0951-XNUMX-y。
宋高、宋永健、尼兰詹·纳加拉詹。 Opera:用高通量双端序列重建最佳基因组支架。 计算生物学杂志,2011 年 10.1089 月,doi:2011.0170/cmb.XNUMX。
产品优势
- 具有性能保证的组装
- 大型复杂基因组的组装
- 支持第三代测序数据(PacBio、Nanopore)
- 重复序列的组装
- 提高内存和运行时效率
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/operasf/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。