这是名为 Universal-mer 的 Windows 应用程序,其最新版本可以作为 Universal-MerV1.0.0.zip 下载。 它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并使用 OnWorks 在线运行名为 Universal-mer 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器,但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后,您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux,这是 Wine 上的一个花哨界面,可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法,但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层,可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上,Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows,以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序,而实际上不需要 Windows。
SCREENSHOTS
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环球梅尔
商品描述
Universal-Mer 是一种 k 聚体计数工具,可同时计算所有可能的 k 大小。 与典型的 k 聚体计数工具相比,该程序可以一次性汇总 1 聚体到 l 聚体的精确计数结果,其中 l = 输入序列中最长重复子串的长度,现在最大长度设置为 100000-梅尔斯。 该程序可以准确报告所有重复(freq>1)和唯一(freq = 1)mer的数量,以及序列的所有可能子串的数量,而不会切断任何低频mer。
输入文件可以是文本或fasta格式。输入字母现在只有{A, C, G, T}。 输入文本文件将被视为 fasta 格式,没有描述行。 在完成对 k-mer 所有可能长度 k 的统计并建立数据库后,用户可以在菜单中选择任意大小的 k 来统计直方图、转储 k-mers、查询子串、汇总所有可能的 k。
产品优势
- 总结不同的重复和独特的 1-mers 到 l-mers,其中 l = 重复的最长长度
- 计算 k 聚体的直方图,其中 1<=k<= 输入序列的长度
- 计算规范 k 聚体的直方图,其中 1<=k<= 输入序列的长度
- 转储 k-mers,其中 1<=k<= 输入序列的长度
- 转储规范 k 聚体,其中 1<=k<= 输入序列的长度
- 查询输入序列中任意 k 大小的 k 聚体,其中 k<=200000。
- 查找输入序列的最长重复子串。
用户界面
控制台/终端,命令行
程式语言
C
分类
该应用程序也可以从 https://sourceforge.net/projects/universal-mer/ 获取。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。