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bp_mrtransp - 云端在线

在 OnWorks 免费托管服务提供商中通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器运行 bp_mrtransp

这是 bp_mrtransp 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

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bp_mrtrans - 实现从蛋白质到 mrna 坐标的比对转换器

概要


用法:
bp_mrtrans -i 输入文件 -o 输出文件 [-if 输入格式] [-of 输出格式] [-s cDNA
序列数据库] [-sf cDNA 序列格式] [-h]

商品描述


该脚本会将蛋白质对齐转换回 cDNA。 松散地基于比尔
皮尔逊的 mrtrans。

选项是:

-o 文件名 - 输出文件名 [默认 STDOUT]
-of format - 输出序列格式
(多序列比对)
[默认飞利浦]
-i 文件名 - 输入文件名 [必需]
-if 格式 - 输入序列格式
(多序列比对)
[默认集群]
-s --seqdb 文件名 - cDNA 序列数据库文件
-sf --seqformat - cDNA seq db 格式(平面文件序列格式)
-h - 这个帮助菜单

使用 onworks.net 服务在线使用 bp_mrtransp


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