这是 bp_oligo_countp 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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bp_oligo_count - 寡核苷酸计数和频率
概要
用法:bp_oligo_count [-h/--help] [-l/--length OLIGOLENGTH]
[-f/--格式SEQFORMAT] [-i/--in/-s/--序列SEQFILE]
[-o/--out 输出文件]
商品描述
此脚本计算给定长度的所有寡核苷酸的出现次数和频率。
可用于确定哪些引物对核酸的频繁引物有用
用于随机标记。
请注意,此脚本可以通过使用 compseq 程序来运行,该程序是
浮雕。
配置
默认的序列格式是 fasta。 如果没有给出输出文件,将打印结果
达到标准。 所有其他选项都可以交互输入。
信息反馈
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您的意见和建议最好发送到 Bioperl 邮件列表。 您的参与
非常感谢。
[电子邮件保护] - 一般讨论;一般交流
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - 关于邮件列表
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解析度。 错误报告可以通过网络提交:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
著者 - 查尔斯 C. Kim
电子邮箱 [电子邮件保护]
历史
写于 2 年 2001 月 XNUMX 日
提交 bioperl 脚本项目 2001/08/06
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使用 onworks.net 服务在线使用 bp_oligo_countp