这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令 Correct_abundances,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
right_abundances - 运行基因组丰度相似性校正步骤
概要
right_abundances 名字
商品描述
运行相似度校正步骤。
注意:虽然可以手动运行读取映射器或创建相似性
手动创建矩阵,我们强烈建议使用提供的 Python 脚本“run_mappers.py”
和“create_similarity_matrix.py”。
配置
名字:名称文件的文件名; 纯文本名称文件每个应包含一个名称
线。 该名称在整个算法中用作标识符。
-h, - 帮帮我
显示此帮助信息并退出
-m 斯马特, --相似度矩阵=SMAT
相似性矩阵文件的路径。 相似度矩阵必须使用相同的
NAMES 文件。 [默认:./similarity_matrix.npy]
-s 山姆, --samfiles=SAM
指向由映射器创建的 SAM 文件的模式。 名称占位符
是“%s”。 [默认:./SAM/%s.sam]
-b 开机, --bootstrap-样本=BOOT
设置引导样本的数量。 使用 1 禁用引导[默认值:100]
-o 出去, - 输出=OUT
包含结果的纯文本输出文件。 [默认:./results.txt]
使用 onworks.net 服务在线使用correct_abundances