这是 createChemistryHeader 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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createChemistryHeader.py - 使用 PacBio 测序化学创建 SAM 标头
信息
商品描述
用法:getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_文件 BAS_文件
[BAS_文件...]
输入对齐文件 输出标头文件
createChemistryHeader 创建一个 SAM 标头,其中包含由
颤动。
阵地 参数:
输入对齐文件
由 BLASR 生成的 SAM 或 BAM 文件。
输出头文件
将使用化学信息创建的 SAM 或 BAM 头文件的名称
已加载。
可选 参数:
-h, - 帮帮我
显示此帮助信息并退出
-调试
输出详细的日志信息。 (默认:假)
--bas_文件 BAS_文件 [BAS_文件 ...]
包含对齐的读取的 bas 或 bax 文件
输入对齐文件。 也可以是 bas 或 bax 文件的形式。 (默认:无)
使用 onworks.net 服务在线使用 createChemistryHeader