这是命令 dbSwiss,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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dbSwiss - 创建 Swiss-Prot 数据的 DBM 版本
概要
/usr/share/librg-utils-perl/dbSwiss [选项]
/usr/share/librg-utils-perl/dbSwiss --datadir /data/swissprot --infile
/数据/swissprot/uniprot_sprot.dat
/usr/share/librg-utils-perl/dbSwiss [--help] [--man]
商品描述
dbSwiss 创建 Swiss-Prot 数据的 DBM 版本。 这个程序是替换
splitSwiss.pl. splitSwiss.pl 将 Swiss-Prot 记录保存在单独的文件中,导致超过
13 万个相对较小的文件需要很长时间才能创建和同步。 dbSwiss 代替
将每条记录保存到为快速检索而优化的 DBM 数据库中。
配置
-d,--数据目录=径
数据库文件目录,默认:'/mnt/project/rost_db/data/swissprot'
-调试
--nodebug
--first20
--nofirst20
只处理前 20 条记录,用于调试
- 帮帮我
-i, --infile=径
Swiss-Prot 数据平面文件,默认:
'/mnt/project/rost_db/data/swissprot/uniprot_sprot.dat'。
- 男人
- 安静的
--安静
不打印进度状态
- 回过头再读
--无回读
存储后读取记录并打印它们
- 桌子
数据库表的名称以及数据库文件的基本名称,默认值:
'dbswiss'
- 版
-w,--工作目录=径
可选的工作目录。 如果未定义,则自动创建和删除。
通过 onworks.net 服务在线使用 dbSwiss