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dicomtonifti - vtk-dicom CLI

商品描述

用法：
双十二 -o file.nii file1.dcm [file2.dcm ...]

双十二 -o 目录 --批处理 文件 1.dcm [文件 2.dcm ...]

opţiuni:
-o
输出文件（或目录，如果 --批处理).

-z - 压缩
压缩输出文件。

-r --递归
递归到子目录。

-b --批处理
一次做多个系列。

-s - 沉默的
不要回显输出文件名。

-v --详细
详细的错误报告。

-L --跟随符号链接
递归时遵循符号链接。

--fsl 格式化轴向图像以用于 FSL。

--重新格式化为轴向
将图像重新格式化为轴向。

--无切片重新排序
切勿对切片重新排序。

--无行重新排序
永远不要重新排列行。

--无列重新排序
永远不要对列重新排序。

--无重新排序
切勿对切片、行或列重新排序。

--无qform
不要在 NIFTI 文件中包含 qform。

--无变形
不要在 NIFTI 文件中包含一个 sform。

- 体积 N
将音量设置为输出（从 0 开始）。

- 版
打印版本并退出。

--构建版本
打印源代码和构建版本。

- 帮帮我 dicomtonifti 的文档。

该程序会将 DICOM 系列转换为 NIfTI 文件。

它读取 DICOM 位置和方向元数据，并使用此信息来
为 NIfTI 头生成 qform 和 sform 条目，从
DICOM 坐标系到 NIfTI 坐标系。

默认情况下，它还会重新排列图像的列，以便具有更高的列
指数更靠患者的右侧（或在矢状图像的情况下，进一步
前）。 同样，行将被重新排列，以便具有更高索引的行
上（或轴向图像前）。 最后，它将重新排序切片，以便
列方向、行方向和切片方向遵循右手定则。

也可以通过以下方式将图像重新格式化为轴向方向
--重新格式化为轴向 option 此选项与 no-reordering 互斥
选项。 生成的方向矩阵将是单位矩阵。

如果输出 NIFTI 文件要与 FMRIB FSL 包一起使用，则使用 --fsl
重新格式化图像以匹配标准 FSL 方向的选项：轴向图像与
切片从下到上排列，列数从右到左增加，
并且行数从后到前增加。 这也将转换数据
如有必要，键入从无符号 16 位到有符号 16 位。

如果选择批处理模式，可以从 DICOM 构建带有“-o”的输出文件
属性，通过在大括号内提供属性名称。 例如，考虑
以下内容：“{PatientID}-{StudyDate}/{SeriesDescription}-{SeriesNumber}.nii”或
类似于产生分层目录结构的东西。 中使用的属性
路径应来自以下列表：

患者 ID、患者姓名、患者出生日期、患者性别、研究 ID、研究描述、
StudyDate、StudyTime、StudyInstanceUID、SeriesNumber、SeriesDescription、
SeriesInstanceUID、Modality、AccessionNumber。

这是一个批处理模式的例子，它递归到子目录并压缩
输出文件，将结果放在当前目录中：

./obj-x86_64-linux-gnu/bin/dicomtonifti -brz -o {系列描述}-{系列编号}.nii
/path/to/dicom/文件

使用 onworks.net 服务在线使用 dicomtonifti